Flagellimonas alginolytica: ABTP35_05570
Help
Entry
ABTP35_05570 CDS
T11189
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor domain-containing protein
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
faj Flagellimonas alginolytica
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
faj00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
faj02000
]
ABTP35_05570
Transporters [BR:
faj02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
ABTP35_05570
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
CarbopepD_reg_2
OMP_b-brl
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XHB42722
LinkDB
All DBs
Position
complement(1268130..1270550)
Genome browser
AA seq
806 aa
AA seq
DB search
MQNLKSTLTLFLSFFALITYAQEVTVLDADTGVPIDNIAIFNKDQSKSTITNVNGKSDLD
AFARNEKITFKHISYEPYTTTKAQIYRRGNRVYLHLKTEELEEVVMSVSKWEQQKKHIPQ
KIETIDARNIAFANPQTSADLLQNSGKVFVQKSQLGGGSPMIRGFATNRILLSVDGVRMN
NAIFRGGNLQNVISIDPFSIKKTEVTFGPGSVIYGSDAIGGVMNFYTQKPRFSFADSLVF
SGKLDYRFASANNENTAHVDINIGKQDWASYTSFTFNHFDDLKMGEHGPESYLRNNYVVR
ENGEDVLITNNDPKKQVGSGYDQINFLQKFTYRPNSTWNYDLGLYYSETSNFPRYDRLIR
PGRDGTGLRSAEWYYGPQKWFMGNFQITQKGKNKFYDGIKLTTAYQFFEESRHDRDFQGL
ELYSTEEKVDAVSVNLDFENKKIGNLHLYYGAEYVFNKVHSNGSMRNIETEATEETASRY
PDGSTWQTLAGYVNGEYQLKPNFTLLSGVRYSQVWVDASFSNTHYSFPFDEADIVTGALT
GSLGLSWFPRSDWQVTLNGSTGFRAPNIDDIGKIFDSEPGSVVVPNPDLEPEYAYNGELG
LRKNFNDVLVLKGATYYTYLVDALVRRNFTFNGETEIEYNGEPSNVQAIQNAAKAYVYGF
EFGVEAFFNENLSLNSNLTLTEGIEEDDDGTDSPSRHAAPTFGDVHLIWQNQKLKADIFL
NYNGEVSSDDLALSEQSKTYMYASDANGNPYSPSWYTLNFRSQYQITNALKATMSLENMT
NQRYRMYSSGIASPGTNLVLGIGYVF
NT seq
2421 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaaaacctaaaatcaaccttaaccctattcctttcgttttttgcgcttatcacttat
gcccaagaggtaaccgttttagatgccgataccggtgtgcccatagacaatatcgccata
tttaacaaagatcaatccaagagcactataaccaatgtgaacggaaaaagtgacctggat
gcttttgcccgtaacgaaaaaataacctttaaacatattagttacgagccttataccaca
acaaaagcacagatctatcgtcggggcaatagggtgtacctacacttaaaaacagaagaa
ttggaagaagttgttatgtccgtgtccaaatgggaacaacaaaaaaagcacataccccag
aaaatagaaactattgatgcacgaaacattgcttttgccaatccgcagacctccgccgat
ctattgcagaacagcggcaaagtatttgtgcaaaaaagccaattgggagggggtagccca
atgatcaggggttttgcgaccaaccgtattttattgtcggtagacggtgtacgtatgaac
aacgccatatttagaggaggaaaccttcagaatgtaatttccatagacccgttctccata
aaaaagacagaggtgacctttggtcctggttccgttatatatggaagcgatgctattggc
ggcgtaatgaacttttacacacaaaaaccacgtttttcctttgcggacagcttggttttt
tccggtaaactggattatcgatttgcatcggcaaataatgaaaacacggcgcatgtagat
attaatatcggaaagcaagattgggcatcctataccagttttacctttaatcattttgat
gatctaaagatgggtgaacatggcccagaatcctatttacggaacaattatgtggttcgt
gagaacggagaagatgtattaattaccaacaatgaccccaaaaaacaggtaggttccggc
tacgatcagatcaacttccttcaaaaatttacttacagacccaacagtacttggaactat
gatctgggactgtattattcggaaacttccaattttccccgatatgatagattgataaga
cctggccgtgatggcactgggcttcgttctgcggaatggtactatggtccacaaaaatgg
tttatgggaaatttccaaataacccaaaaaggaaaaaataaattctacgatggaataaaa
ctcaccacggcctatcaattttttgaagaaagtaggcacgacagggattttcaaggtctg
gaactctattcaaccgaagaaaaggtggatgcagtctcagtaaatttagattttgaaaac
aaaaaaataggaaatcttcacttgtactatggggccgaatatgttttcaacaaagtacat
tccaatggcagtatgcgtaatattgaaacagaggctacggaagaaacagcatccaggtat
cccgatggttcaacttggcagaccctggctggttatgtaaacggagagtaccagctaaaa
ccgaactttactttattgtcaggagtgcgatatagtcaggtatgggtagatgcttctttt
agcaacacccactattcctttccttttgatgaagccgatattgtaacaggggcactaacg
ggaagtttgggacttagttggtttcctaggtccgattggcaagtaactttaaacgggtca
acaggatttcgcgcgcccaatatcgacgatatcgggaagatatttgattctgaacctggt
tccgtagtggttcccaatccagatctggaaccggagtatgcctataatggcgaattggga
ttaaggaaaaacttcaacgacgttctagtactaaaaggagcaacgtattacacctatctg
gtagatgcattggtaagaaggaattttacgttcaatggcgagacggaaatagagtacaat
ggtgaacccagcaatgttcaggctatccagaatgccgctaaggcctatgtgtatggattt
gaatttggggtggaagctttttttaatgaaaacctatcgttgaattccaatttaacattg
accgaaggaatcgaagaagatgacgatggaaccgatagtccatcgcgacatgccgctcca
acttttggggatgtgcacttaatatggcaaaaccaaaaattaaaagcagacatatttcta
aactataatggggaggtaagtagtgatgatttggcattgtcggaacaaagcaaaacgtat
atgtatgccagcgacgccaatggcaatccgtattccccctcttggtacaccttgaacttt
aggtcgcaatatcaaatcaccaatgcactaaaggccaccatgagtttggaaaacatgacc
aatcaacgttaccggatgtattcttcgggaattgcttcccccggaaccaatttggtgttg
gggatagggtatgtgttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
