Flavobacterium alkalisoli: FUA48_16600
Help
Entry
FUA48_16600 CDS
T06875
Name
(GenBank) T9SS type A sorting domain-containing protein
Organism
fak
Flavobacterium alkalisoli
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Beta_helix
Por_Secre_tail
Chlam_PMP
BKACE
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QEE51135
UniProt:
A0A5B9FW23
LinkDB
All DBs
Position
3663348..3666479
Genome browser
AA seq
1043 aa
AA seq
DB search
MFNDMDKKSTLLKIIIVVCLFLGVSANAQVYTVINSNNSGAGSLRQAVLDATAGSTINFA
ITTNNNTITLSSSITIDKELIINGNGDDATIISGGNSNSIFVITDASMVTINNISFTGGA
ASDNGGALSISGTDVLINNSSFTNNTASGATAGMGGGAIYITGMSDVTINASTFTGNEAD
GTAGSGGAILVGTGSNLTVNDCVITGNAAGRAGGGIEGNSGAGTTITLTDVTLNNNMTGS
SPGNGGGLHITGAGNTVITGGTVNNNMAAAEGGGLWNGSGMMTIEGTVISGNTASGAGAD
QGGGGIYNLSGMLMINAETVISNNTADGASGSGGGILNDVGGTLTITEAEIIGNVSNRAG
GGIEDNSGMAGAVTLNDVTISNNTTNNSPGNGGGLHVTGMGNIIINGGVVSGNEAGAEGG
GLWNGSGTMNIDGTLITNNIASGAGADQGGGGIYNLNAGTLVIANATISNNTADGTLGSG
GGILNDVGSQLTVTDSEISGNMAIRAGGGIEDNSGTSTIILTNVNLSGNSVSGPPGNGGG
LHITGSGSATITGGMVNNNSASLQGGGLWNGSGTMIITNVMIENNEAEGNAATDGGGGVF
NVSGMVQISDSTISGNLATGTSGSGGGIFSGAGMVTIDDTSITLNSANRAGGGIEIVDGD
LTINTSFLNENNVSGSAGAPNPGNGGALHISGAAMVEINGGTVNLNVAAREGGGLWNQNG
SIMTVNNVTIDGNVAAGVAADDGGGGIFNNGGTLNVNASTISNNSATGLLGQGGGIHINA
GSANVVKTTISGNTSLTNGGGIYNNAELMINANTITLNSATISGGGISNNSMMAPTVANT
IVAGNLSVVAGADIYAEGEMVNSMGYNLVGIAEAEAYVSAETDISGSLTTPLEIELLALG
DNGGDTFTHKLGCPSAAADMGDPNDNSQDQLGQDVFNGRRDIGAYESQETCSLDTEDFVA
SVNRSMVYPNPSVNGVFNLELAQEHGSNAQIAVYDLATGKLVMEMQANGMIAEVGMQQFA
SGTYVMQIVSDTATETHKLIIGR
NT seq
3132 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttaatgatatggacaaaaaatctactcttttaaaaattattatagtagtatgcctt
ttccttggagtttcagccaatgctcaggtatatactgtaataaattccaataacagtggc
gcggggtcactgcgacaggcagtactggatgctacggcgggaagtacaattaactttgca
ataaccaccaataacaacactattacacttagtagttcaataactattgataaggaactt
attataaacggtaatggagatgatgctactattataagtggcggaaacagcaacagtatt
tttgttattacagatgcatcgatggtaaccattaacaatatatcttttacaggcggtgcc
gcatcagataatggtggggcactttctatatcaggtaccgatgtacttataaacaacagc
tcctttactaacaatacggcaagtggtgctacagccggcatgggtggtggcgccatttac
attacagggatgagtgatgttactattaacgcatcaacctttaccggtaacgaggccgat
ggcacagcaggtagcggaggagctattctggtaggtacaggaagtaaccttaccgtaaac
gactgtgtaattacaggtaatgctgccggtcgtgcaggtggtggtatagagggcaactca
ggtgcagggactaccattacccttaccgatgttacacttaacaataacatgacaggatca
agccccggtaatggcggcggactacatattaccggagcaggaaatactgtaattacagga
ggtaccgtaaataataatatggcagcagccgaaggcggcggactttggaacggaagcggt
atgatgaccatagaaggtactgtaataagcggaaatactgccagtggtgcaggtgccgat
caaggtggtggaggtatttacaaccttagcggtatgcttatgataaatgccgaaacagtt
ataagtaacaatactgccgatggtgcttcaggttcaggaggtggtatacttaacgacgta
ggtggtacacttaccattaccgaagccgagattataggcaatgtgtctaatcgcgcaggc
ggtggtatagaagataattcagggatggcaggtgctgtaacattaaatgatgttactatc
tcaaacaatacaacaaacaattcgcctggtaacggtggcggacttcacgtaaccggaatg
ggtaatattatcataaatggcggtgtggtttccggaaacgaggcaggagctgaaggtggt
ggtttatggaatggttcgggaaccatgaacatagatggaacacttataacaaacaatatt
gctagtggtgcaggagccgatcagggcggtggtggtatctacaaccttaatgcaggtact
cttgtaatcgctaacgctacaattagtaacaacactgcagacggaacactgggcagtggc
ggtggtatacttaacgatgtaggatcgcagcttactgttaccgattccgaaatttcagga
aacatggctatcagagctggtggtggtatagaagacaactcaggtacaagcacaattata
cttaccaatgtaaaccttagcggaaactcagtatccggccctccgggtaatggtggtggt
ctgcacataaccggatctggtagtgcgaccattacaggcggtatggttaacaataactct
gcttcgctacagggcggtggtttatggaacggaagcggaaccatgattattaccaatgta
atgattgaaaataacgaagccgaaggtaacgcagctacagatggcggtggtggtgtattt
aatgtgagtggtatggttcaaatttcagacagtaccatttcgggcaatcttgctacagga
acaagcggcagcggcggcggtatttttagcggagctggtatggtaaccatagacgataca
agtattacgcttaacagtgctaaccgtgcaggtggtggtattgagattgtggacggagat
cttactataaatacatcattccttaatgaaaataatgttagcggaagtgcaggtgctcct
aatccggggaatggtggtgcactacacattagtggtgctgctatggtagaaattaacgga
ggtactgtaaatctaaatgttgctgcacgtgaggggggcggactttggaatcagaacgga
agtataatgactgtaaacaacgtaaccatagatggtaacgtagctgcaggagtagctgcc
gatgacggtggcggaggtatatttaataacggaggtacattaaatgtaaatgcttctaca
atatcaaataacagtgctaccggattattgggacaaggtggcggtatacatataaatgca
ggttctgcaaatgtggttaaaaccactatatcgggcaatacttcactaacaaacggaggt
ggtatttataacaatgccgaactgatgataaacgctaataccataaccttaaactcggct
actataagcggtggtggtatatctaacaactctatgatggctcctactgtagcaaatact
attgtggcaggaaacctttcggttgtagcgggtgccgatatatatgccgaaggcgaaatg
gtaaactcaatgggatataaccttgtgggtatcgccgaagcagaagcttatgttagtgct
gagaccgatatttcaggatcattaactactccattagaaattgaacttttagcattaggt
gataacggaggggatacttttacacataaactgggatgcccaagtgcagctgccgatatg
ggagaccctaacgacaactctcaggatcagttaggtcaggatgtatttaacggtcgcagg
gacattggtgcttatgaatcgcaggaaacctgctctttagatacagaagactttgtagca
tctgtaaaccgaagcatggtataccctaatccatcggttaacggagtatttaatcttgag
ttggcacaggagcatggcagcaatgcacaaatagccgtatatgaccttgcaacaggcaaa
ctggttatggaaatgcaggcaaacggaatgattgccgaagtgggtatgcagcaatttgca
tctggtacttatgtaatgcagattgttagcgatacagctaccgaaacccacaaacttatt
attggaaggtaa
DBGET
integrated database retrieval system
