Flavobacterium ammoniigenes: GENT5_17940
Help
Entry
GENT5_17940 CDS
T08752
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
fan
Flavobacterium ammoniigenes
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Big_9
Cadherin_4
Cadherin_5
Cadherin_3
Por_Secre_tail
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BDB55489
UniProt:
A0ABM7V7E9
LinkDB
All DBs
Position
complement(2020556..2025238)
Genome browser
AA seq
1560 aa
AA seq
DB search
MKKYLLITLLMLGTNLFAQNNLTVNVNGIKANDSIRIIVQKSAEKLLKKWVKYNSSGTST
VQFNVDNGKWALIIDATGYTFPSSTVINIPETNNATVTLTPLLNTNYIYNWKDDDSYAGH
ATQVYVNEPSTLVVLNNTVSIPNDYSSVKLRNEFGIILSNDRSKWSSEDSFRLYSMLKTL
PLQTFGEGSVLNFEKGENVKAIFYLTDQEQFKDINIVNVNGVKHVTVSQSAFTYASPQIG
ILDGIKTKFYSKRLNHAILNYYTDFGSNEQNVDIIAQEKYGFRFMKSNLETQNLMHEDAS
NFQEFFNEEKIEILSMFEELPEGFHKQEGLKYLVRRVNGQDHPIYTTAAAIAWTSFNTIE
FMSKTFNNTEINSVVRRLILHEKSHFLWAYAFDSVLKKDWSDLGGWFQDPTSSSGWSTYN
TTEFVTEYAHEKNPDEDMAESIATYILNPDLLLSRSVRKYEFIRDRIMHGTRYKAQIRED
LTFMVYNLFPDYTYPGKIIGSTINVEGSANDDKVVKFEFKLNSKDPKIDGASVGYIRLAS
SIGTIHDLWLTPKNGSVDSTLVGTTTFSKHEKSGYWNLVSLRIEDPVGNSRFENTSSFGF
KLYIENPLEDITPPKWQYNLKSELVQGKFDPNGQNTSDNVNGLQMQAIKYSYDYYDNSPM
DRSITRIYFPKLDNSNAQKYEEQIQGKPIINAAKSYKNDYNSIKHFEMHLVIPEYFPSGY
YSVSQLNSSDIAGNYTNVYMVKDTANFYIKPGKLDIFKDIRDSLYVKTNFPDYIAPEIDL
NRINVIAKPTNPLSPDGETRVDISLLIRDLSDFPTHESGAKLVRYVLRDPLGIEHSYSSW
NDNMLLNYYSLKPDGNSEWNLINLDILLPKGSPPGKWGISSMQTVDRAGNFRNYSFVEIV
RFDVIESDVKLDEALVATITSKVVNSKNVSSISAEISCKPCQGNKYVYQVYSLLGGNVVR
GEGIFTSNFISLNSINLTGVLDGIIKLTVQVTDNQNQLIATTTTDYTKDTVLPKGYYLKS
NLQDSGSSNIDSIVFKVLAENVDLNGTYKVLFEQNSTTNKQFDIKSSSTSIPSISIEGVI
TQTEIVLNNLNISSLKDGVFSSSILITDPNGNEGVPIKKYFYKLDGKISILNKTTPVNDF
IEVDEGKVSGVLKNGSDNLLYNDFKLNTNLIPIIVTNPINGTVTLNSNGTFSYVHNGSET
TKDSFTYKVNDGTSDSDIATVTITINPVNDAPVALSDQITIKNGETATLLSGGITSVLTN
DTDAENNTLTAVRVTNPVNGTLTLNSNGTFTYVHNGSNTITDSFTYKVNDGSVDSNIATV
NISIEAFSLPFDNFTIITKSETCSGKNNGEISIKATQSFNYTATINNKVYNFVNNSLIVP
DLTAGEYNVCINITGKTFPHCYTLTIGKGGSLTGKTSGVSSNKVAIEITEGSAPFEVLLN
GKSKFTTDHTLFELDVNVGDVVMVKSAIACEGIYSKVISDLPNSYMAYPNPTKGSFEISM
STELKEIYIELYSIKAELISKGVYPVVNQKIQLNLDNQTSGTYIAKVYTAIPTSLIIIKN
NT seq
4683 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaatatttattgattacattattgatgcttggtactaatttatttgctcaaaat
aatttgaccgtcaatgtaaacggaataaaagcaaacgattctatccgaattattgttcaa
aaaagtgcagaaaaattattaaaaaaatgggttaagtataattcttcgggtacttcaacg
gttcaatttaatgtagataacggaaaatgggcattgataatagatgcaactggatacact
tttccttcttctacggttatcaatattcctgaaacaaataatgccacggttactttaacg
cctctattaaacacaaattatatctataattggaaagatgacgatagttatgcaggtcat
gcaacacaagtgtatgtaaatgagccttcaactttagtagtattaaacaatacggtttca
ataccaaatgattattcgtcagttaaactaaggaatgagtttggtataattttatctaat
gatagatcaaaatggtcaagtgaagatagtttcagattatattcaatgcttaaaacgttg
ccattgcaaacatttggggaagggagtgtgctcaattttgagaagggtgaaaatgtcaaa
gctattttttatttaacggatcaagaacaatttaaagacatcaatattgtcaatgtaaac
ggggttaaacatgttaccgttagtcaatccgcatttacctatgcaagtccacaaataggg
attttggatggaattaaaacgaagttttattctaaaagattgaatcatgctattttaaat
tattatactgactttgggtcaaatgagcaaaatgtagatataatagcacaagaaaaatac
ggatttaggtttatgaaatcgaatctagaaacccaaaatttaatgcatgaagacgcgtct
aattttcaagaatttttcaatgaagaaaaaattgaaatactctctatgtttgaggaattg
ccagagggatttcataaacaagaagggcttaaatatttagtaagaagagtaaatggacaa
gatcatcctatttatacgactgcagctgcaattgcttggacaagttttaatactatagaa
tttatgagtaaaacttttaataacacagaaataaatagtgttgttagaagattaatttta
catgagaaatctcattttttatgggcatatgcttttgatagtgtattaaaaaaagattgg
tctgatttgggaggttggttccaagatcctacctctagttcaggatggtctacttataac
acaactgaatttgttactgaatatgcacatgaaaagaatccagatgaagatatggctgag
tcgattgctacttacatattaaatccagatttattgctatctagatcagttcgaaaatat
gagtttattcgagacagaattatgcatggaactcgttataaagcccaaattagagaagat
ttgacctttatggtttataatttatttcctgattatacttatcctggaaaaataattgga
tcaacaattaatgttgaaggaagtgcaaacgatgataaagttgtaaaatttgaatttaaa
ttgaactcaaaagatccaaaaattgacggagcttctgttggatatatacgattagcatcc
agtataggtactattcacgatttatggttgactccgaaaaatggttcagtcgattccact
ttggttggaacaactacatttagtaaacatgaaaaaagtggttattggaatttagtatca
ttaaggattgaagatcctgttgggaattctcgttttgaaaatacttcttcatttgggttt
aaattatatatagaaaatcctctagaagatataaccccacctaaatggcaatataattta
aaatcagaattagttcaaggaaaatttgatccaaatggtcaaaatacttcagacaatgtc
aatggattgcaaatgcaagcgataaaatattcctacgattattatgataatagtccaatg
gatcgaagtataactagaatttattttccaaaattagacaattcaaatgctcaaaaatat
gaggagcaaatccaaggaaaacctatcattaatgcagctaaatcgtataaaaatgattat
aattcaatcaaacattttgaaatgcatttagttattccagaatattttccttctggttat
tactctgtttcacaattgaattctagtgatattgcgggcaattatactaatgtttatatg
gtaaaggatactgctaatttttatattaaacctggaaagttagatatatttaaagatata
agagatagtttatatgtcaaaactaattttcctgattatattgcccctgaaatagattta
aatcgaattaatgtaattgctaaaccaactaatcctttgtctccagatggtgaaactaga
gttgatatttctttattaataagggatttgtcagatttcccaacccatgaatccggtgca
aaattagtacgatatgtattgcgtgatccattgggtattgagcatagttacagtagttgg
aatgataatatgctactaaattattatagcttaaaaccagacggaaattcagaatggaat
ctgatcaatctcgatattttactacctaaaggttcccctccgggtaagtgggggatatct
tctatgcaaacggttgatagagctgggaatttcaggaattattcatttgtagagattgtt
agatttgatgtgattgaatcagatgtaaaattagatgaagctcttgttgcaacaatcaca
agtaaagtagtcaattcaaaaaatgtaagttcaattagcgcagaaattagttgtaaaccc
tgtcaagggaataaatatgtttatcaagtatatagcctattaggtggtaatgtagtaaga
ggcgaaggaatatttacctccaattttatttcgttaaactctattaacttgacgggagtt
ttagacggtattattaagttaacagttcaggttactgataaccaaaatcaacttatagcg
acaacaacgactgattataccaaagatacagttctgcctaaaggatattacttaaaatca
aatctacaagattctggttcaagcaatattgattcaattgtgtttaaagtgctagccgaa
aatgtagatttaaatgggacatataaagtcttatttgaacaaaattccacaactaataaa
caattcgatattaaaagttcatctacttcaattccttctatttcaatagagggcgtaata
actcaaaccgaaatagtattgaataatttaaatattagtagtttaaaagacggagtattt
tcatcatcaatactgataaccgatccaaatgggaatgaaggagtaccaattaaaaaatat
ttctataaacttgatggtaaaatatcaatactgaacaaaactactccggttaatgatttt
attgaagttgatgaaggtaaagtttcgggggtattaaagaatggatctgataatttgtta
tataatgattttaaattaaatactaatttaataccaattattgttaccaatccaattaat
gggacagtaactcttaatagtaatggaacatttagttatgttcataatggatctgaaacc
acaaaagatagttttacttataaagttaatgatggaacatcggatagtgatatagcaact
gttactataacaattaatcctgtaaatgatgctccagtagctttatctgatcagattaca
attaaaaatggtgagacagcaacattattatctggaggaattacgagtgttctaacaaac
gacacagatgctgaaaataatactttaacagctgttcgtgttactaatccagttaatgga
actttaacactcaatagtaatggaacctttacctatgttcataatggttcaaatactatt
accgatagttttacttataaagtaaatgatggaagtgtagatagtaatattgcaacagta
aatattagtatagaagcatttagtttgccattcgataattttactattattactaaatct
gaaacatgctcaggaaagaataacggtgaaattagcattaaggctactcagagttttaat
tatacagctactatcaataacaaagtttataattttgtaaataattctttgattgtacct
gatttaacagcaggggagtataatgtttgtatcaatattacggggaaaacattcccacat
tgttataccttaacaattggtaaaggtggttcgttgacaggaaaaacatcaggagtttcg
tctaacaaagtggcaattgaaattacagagggtagcgcaccctttgaagtactgttgaac
ggtaaatcaaaatttacaaccgatcacaccctatttgaacttgatgtcaatgttggtgat
gtggtaatggtcaaatcagcaatagcttgcgaaggtatttattcaaaagtaatttcggat
cttccaaatagttatatggcgtatccaaatcctaccaaaggctcatttgaaattagtatg
tctaccgaattgaaagagatctacatagaattgtattcaatcaaagcggaattaatatct
aaaggtgtttatccagtagtaaaccaaaagatacaattaaatttagacaaccaaacgagc
ggaacttatattgctaaagtatacactgctatacctacaagtttaatcataatcaaaaat
taa
DBGET
integrated database retrieval system
