Flavobacterium ammonificans: SHINM13_04680
Help
Entry
SHINM13_04680 CDS
T08737
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
Organism
fao
Flavobacterium ammonificans
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Plug
TonB_dep_Rec_b-barrel
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BDB56172
LinkDB
All DBs
Position
540934..542982
Genome browser
AA seq
682 aa
AA seq
DB search
MKKLLFFIVAFSTQLYSQTTDTVAKKEKVKLELDEVVVSGTLKPMRRLQTPVPVEIITAT
FLKQNPTANIFDALQNVNGLRPQNNCNVCNTGDIRINGLDGPYTMVTIDGMPIVSALGTV
YGLSGIPNSMIDRIEVVKGAASTLYGSEAVGGLINIITKRPKTVPTITADIFSTSWLETN
IDLGYRANFGKKVDALIGVNYFKYNHPVDNNNDNFTDLSLQDRVSLFSKLNFSRKSQKEL
SLVSRYLYEDRWGGEMQWNKGFRGGNEVYGESIYTSRYEFLGKYELPVQEKMYFQFSIIG
HDQNSVYGNSTFLANQKIAFGQFLWDKNWKNNSFLFGSAFRYQYYNDNTPATNNANHSKI
YSLFAQDEITFSDKTSTLLGLRYDYNSAHGSIVTPRFAFKYKPTPNDILRFNFGTGFRVV
NLFTEDHQALSGARDVILTSNLEPETSYNVNFNYLKKYSLTNAGVINLEFSSWYTYFTNR
IFANYDLNPDQIVYDNLNGYSKIFGLSSNVDWITPFGLKASLGASYFDPLTMQDDQRFVP
LFTEKFSVNWAVSYEIPSWHLAIDYTGNLTGPMRLPLLGPLDPRRETSLPFSIQNIQFTF
KKIHNLEIYTGIKNLLNWTPNRNNPFLIARANDPFDKNVQFDPNGNVVPTVDNPYGLTFD
PTYAYGPNQGIRFFAGLRFHID
NT seq
2049 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaactattgttttttattgttgccttttctactcaactatatagtcaaacaact
gacaccgttgcaaaaaaagaaaaagtgaaactagagctcgacgaagtggttgtttctggt
acgcttaaaccaatgcggagattacaaactcctgtcccagtagaaataataacagctaca
tttttaaaacaaaatcctaccgcaaatatctttgatgcattacaaaatgtaaatggcttg
cgtccgcaaaacaattgtaatgtttgtaatactggcgacattcgcatcaatggtttagac
ggtccctacacgatggtaactattgatggcatgcccatcgtgagtgccttaggaacagtt
tacggcttatccggaatacccaactcgatgattgatagaatagaagtggttaaaggcgct
gcctcaactttatatggaagtgaagcggtcggaggattgatcaacataattaccaaaaga
ccaaaaacggttccaactattacagccgatattttctccacttcctggttagaaaccaat
atcgatttagggtatagagctaattttggcaaaaaagtagatgcgctaattggagtaaac
tattttaaatacaaccatcctgttgacaacaataatgacaatttcaccgacctctccttg
caggatcgagtttcactattttcaaaattaaattttagcagaaaatctcaaaaagagctc
agcttggtttctcgttatttatatgaggaccgatggggcggtgaaatgcaatggaataaa
ggttttagaggaggaaacgaagtatatggagaaagtatttatacttctcgttacgaattt
cttgggaaatatgaactccctgttcaagaaaaaatgtatttccaattctcaattattggt
catgatcaaaattctgtatatggcaattctacatttcttgctaatcaaaaaattgctttt
ggacaattcctttgggataagaattggaagaacaattcatttctttttggaagcgccttc
agataccaatactataatgacaatacgcctgctactaacaacgcgaatcattctaaaatt
tacagcctatttgcacaagatgaaattactttttcagacaaaacaagtactctccttgga
ctgcgttatgattacaattcagcacatggctctatagtaacccctcgttttgcttttaaa
tacaagcccactcccaatgatattttacgattcaattttggaaccggttttagagtagtt
aacctttttaccgaagatcatcaagcattatctggagcgagagatgtcatattgacctct
aatcttgagccagaaacatcgtataacgtaaattttaactacctgaaaaaatacagctta
acaaatgctggagtcattaatttagaattttcttcttggtacacctattttacgaatcgg
atttttgccaattatgatttgaatcccgatcaaattgtatacgataatttgaacggctat
tctaaaatttttgggcttagctcaaatgtagattggatcacaccattcggtctaaaagcc
agtcttggcgccagctattttgatcctttaacaatgcaagacgaccaaagatttgtaccc
ctttttacagaaaaattttcggttaactgggctgttagttatgaaattccgtcttggcat
ttagccattgattacactggaaatcttactgggccaatgcgtttgcctctacttggtcca
cttgatcctcgtcgagaaacttctcttccatttagtatccaaaacatccaatttacattt
aaaaaaattcataatttggaaatctacacggggataaaaaatttactaaactggacgcct
aatcgcaacaatccgtttttaattgctcgtgccaacgatccttttgacaaaaatgtgcaa
tttgatcctaatggcaatgtggtaccaactgttgacaatccttatggtttgacattcgat
ccaacttatgcttatggccctaaccaagggattcgcttttttgctggactacgatttcat
attgactaa
DBGET
integrated database retrieval system