KEGG   Flavobacterium ammonificans: SHINM13_06270
Entry
SHINM13_06270     CDS       T08737                                 
Name
(GenBank) SusC/RagA family TonB-linked outer membrane protein
Organism
fao  Flavobacterium ammonificans
SSDB
Motif
Pfam: CarbopepD_reg_2 Plug CarboxypepD_reg TonB_dep_Rec MetallophosN Poly_export
Other DBs
NCBI-ProteinID: BDB56331
LinkDB
Position
745653..748751
AA seq 1032 aa
MLAQAQIKGTVTSKEDGVPLPGASVIVSGTKQGTTTDFDGKYVLNGVSKDATLMISYIGY
KTFKISVNSQTTINVQLESDMAQLNEVVLTGYSKQRKVDVTGAISVVDIGAIQGQGMSSG
NAMQALQGRVPGLFVEKTGDPTGAASNILIRGISTLGDNSPLYVIDGVPTKRSEVFASLN
PESIESIQVLKDASASSLYGSRAGNGVIVVSTKSGGKKERVTVSFNSNTSIQSEKKQRYE
MMNSLQRGQVLYQASINDGVDPNSGYGSIYNFDWNGNFKNPVLNSITPKPFVGGDENVPV
GDTDWQDVMYEKGFVYNNEVTISANSEKSSLMMNFGYLKNTGMLKHTNYDRYSAKINGST
KLFNDKVRVGVNTQFFTSNETLVSPDVGSAPTTGLAITLAPTIPVYDSKGEFAGPIGAGY
SDRNNPLLMQYLNRWDNADKNSFFGNVFAEIDILKGLKFRTNAGLDFSDFKRKDIERKVN
NGFIVRGNNRLIIDTNKFSSVVFSNTLNYDLEIGKNHKITTLLGYEYIRNDFDTFVAQAD
DFPFETEDFFVLNAATGARTSRGISTANTTLSQFGKINYAYSDRYLASFTLRRDGSSRFG
ENTRFGIFPATTVGWRISNEDFFKKNDIVSSLKLRAGYGIVGNQEIGDGARFGLFETRYG
PNQNVFSPDFFNIYYNVGTAYDINGNNTGTLPSGFVRIQSENKDLKWEETAEYNYGVDFS
LFKNNITGSFDYYTKKTTDILRAPRTIATQGEGANTVLNIADTEGRGWELALAYDKTFDN
GFKLGISTNVSHFTDKITKLNKGGETDFGGTVENSILGRSLFSIFGYRSDGLFQSQEDVN
NSPTQSLARPGSIKYVDINGDGVINVDDRDWLGTTLPKFEYGVTINLAYKNFDVSLFGSG
VASRIGQDPYVFFNNFVSGRENGGVGLLNAWTPDNKNTNVPAATLAFNDTRTSDYTFRKN
SYFKLRNLQIGYSLPKDFIARIGNISSARFYLQGENLLWIAHKDYIGPDPERTDVNRIPV
PTVLSLGFNLNF
NT seq 3099 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgttggcacaagcacagataaaaggtactgttacctcaaaagaggacggagtaccattg
cctggagcttcagttattgtatctggtacaaagcaaggtaccacgacagattttgacgga
aaatacgttttaaatggcgtatcaaaagacgctacattaatgattagctatattggctat
aaaacatttaaaatttcagtaaatagtcaaactacaattaatgttcaattagaaagcgat
atggcgcaactaaatgaagttgtgttaactggatattctaaacaacgtaaagtagatgta
actggggctattagtgttgtagatattggagcaattcaaggacagggtatgagttctgga
aatgcgatgcaggctttacaaggacgtgttccaggactttttgttgaaaaaacaggagat
ccaacaggtgcggctagtaacattttaattcgtggaattagtactctaggagacaacagc
cctctttatgtgattgatggagttccaaccaaaaggtcagaagtttttgcgagtttgaat
cctgaatcaatagagtcaattcaagtgttaaaagatgcatcagcatcatctctttatgga
tctagagcaggtaatggtgttattgtagtctctactaaaagtggaggtaagaaagagcgt
gttacggtaagctttaactcaaatacatccattcaatctgagaaaaagcaacgttacgaa
atgatgaactcacttcaaagagggcaagttttatatcaagcgtcaataaacgatggagta
gatccaaattcgggttatggttcaatttacaattttgattggaacggaaatttcaaaaat
cctgtgttaaacagcataacaccaaagccatttgttggtggggatgaaaatgtaccagtt
ggagatactgattggcaagacgtcatgtatgaaaaaggtttcgtttataataatgaggta
actatttctgcaaattctgaaaaatcatccttaatgatgaatttcggctatttaaagaat
acaggaatgttaaaacataccaattatgacaggtattccgcaaaaataaacggtagtaca
aagttatttaacgacaaagttagagttggcgttaatacacagttttttacttctaatgaa
actttagtttctccagatgttggtagtgctccaactacaggtttagcaattactttagct
ccaacaattccagtttatgatagtaagggtgaatttgctggtcctattggagcgggttat
tccgatagaaataatccattgttaatgcaatacttaaatcgatgggataatgctgacaaa
aacagtttttttggtaatgtcttcgcagaaattgatattttaaaaggtttaaagtttaga
acaaatgcaggtttagattttagcgattttaaaagaaaagatattgaacgtaaagtaaac
aatggttttattgttagaggtaataatcgtttaattattgatactaataagttttcaagt
gttgtattttctaatactttaaactatgatttagaaatagggaaaaaccataaaattaca
accttattaggttacgagtatattagaaatgactttgacacatttgtagcgcaagcggat
gatttcccttttgagacggaagacttttttgttttaaatgcagctactggagctagaaca
tccagaggtatctcaactgcaaatacaactctttcacaatttggaaaaattaattatgct
tattcagacagatatttggcatcatttactttacgccgtgatggttcttctcgatttggt
gagaatactcgatttggtatttttcctgcaacaactgttggttggagaataagcaatgag
gacttttttaagaaaaacgatatcgtttctagtttgaaattaagagctggttatgggata
gtaggtaatcaagaaattggtgatggtgctcgttttggtttattcgaaacaagatatgga
cctaatcaaaatgtattttcaccagacttttttaatatctattataatgtaggaacagca
tatgatattaatggaaataatacaggaacattgccttcaggatttgtaagaattcaatca
gagaataaagatttaaagtgggaagaaacagcagaatacaattatggtgttgatttctct
ttatttaaaaataacattacgggttcatttgattattacaccaaaaaaactacagatatt
ttacgtgctcctagaacaattgcaacgcaaggtgaaggtgcaaatactgtattaaatatt
gctgatacagaaggacgtggttgggaattagcattagcttatgacaaaacttttgataac
ggttttaaattagggatttcaaccaatgtatctcattttacagataaaataacgaagctt
aataaaggaggagaaacagattttggaggtaccgttgaaaattcaattcttggacgttct
ttattctccatttttggatatagatctgacggtctttttcaaagtcaagaagatgtaaat
aatagtccaacccaaagtttggctagaccaggaagtattaaatatgttgacattaacggc
gacggtgttataaacgtagacgatagagattggttaggcacaacactacctaaatttgag
tatggagttacaattaacttagcgtacaagaatttcgacgtatctttatttggatcaggt
gttgcaagtcgtataggtcaagatccgtatgttttctttaacaattttgtgtccggtaga
gaaaatggaggtgttgggctcttaaatgcgtggactccagataataaaaatacaaatgtt
cccgctgcaactttagcttttaatgatacaagaacttcagattatacatttagaaaaaat
tcttatttcaaattaagaaatttacaaattggatattctttaccaaaagattttattgct
agaattggtaatatttcaagtgctagattttatttacaaggagaaaatttactttggata
gcacacaaagattatatcggtccagatccagaacgaacagatgtaaatagaataccagtt
ccaacggtcctttctttaggatttaacttaaacttttaa

DBGET integrated database retrieval system