Flavobacterium ammonificans: SHINM13_07770
Help
Entry
SHINM13_07770 CDS
T08737
Name
(GenBank) copper transporter
KO
K18989
multidrug efflux pump
Organism
fao
Flavobacterium ammonificans
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
fao00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
fao02000
]
SHINM13_07770
Transporters [BR:
fao02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
SHINM13_07770
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
SecD_SecF_C
MMPL
TEBP_OB2-like
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BDB56481
LinkDB
All DBs
Position
complement(943850..947314)
Genome browser
AA seq
1154 aa
AA seq
DB search
MSHQNKEFGISSWAVDNRVTVYILTFIIVIAGLTAYINMPREDFPEIIENKIYISSVFPG
NSAEDVEKLVIKPLEKQIKNISGVDKVTSSSFQDYGMIIAEFSDDVSVEQAKQKIKDKVD
NAKADTDWPNMDNGSKVEPNVFELNISEEVPILNINLQGNYTTQQLKKYGELLQDDIEEI
SEIKKVDILGVDDKEVEIAVDIFKMTAAQVTFDDIQNAVKYENMTLSGGNLTSQGSRNNI
RIVGEFKNPKELENIIVKSFGGTVYLKNIATVSFKEKEKTTYAREKGTEVVMLNVKKRSN
QNMISAIDQVKEKVALAQETYLPKNLKVELTSDQSSRVEHQVDELSNHIIFGIILVMIVL
MFTMGLRNSLFVGAAIPLSMMIAFAILSMFGLTLNTMVLFGLVMGLGMLVDDGIVVVDNV
YANMQKGMTRIQASKVGIGEIAWPVISSTATTLMAFLPFALWPGTMGKFMKYFPITLTVT
LTGSLFVAMVINAAMTGGSMALEDKNIKKKSLHFYTILFIALGILFAVPGNIYDSKLLRG
LGHLLLISVGLMWLYYWKIFQWTQDFQYSFFPKMEEKYKIFLAKILSGKVAWKAFGGIIV
LLIFSFVLLGIFPRKVLFFPDNIPNQVITYIEYPQGTSIEKTNKATLFVEKQIIQILEKY
VEPGTDQNFMAESIISQVGVGAGNPNVDAGSASETPFKGKVTVSFSEFKFRKGINTSVIL
EEIRAKVTGIAGATVTVEKDANGPPAGYPISIQLTGADYEQMLKEADRMIAFIDSKNIPG
IEKLSIDINKESPELEVKVDRANAGSMGISTGQLGFNLRRSVYGQEISTYKEGDDDYNIV
MRMQDDQRKNENILFNQSMTFRNPNNGQIMQVPISAVSNTEKTNTYNQIKRKNYKRIMTI
YSNVLTGYNGDEITKQIKEELNSYNLPKSVSYSFSGVQEEQGKNQSFLMYALFLALAGIT
IIIVLQFNSVSKTMIIMFTVLLSFSGVFYGYVIANMDFVILMTMMGIISLAGVVVKNGIV
LMDFFVLLLDKKVADKQLESHDDLSLEEIKEVIIESGKSRLRPVLLTALTAILGLIPLAI
GLNFDFFTLVTDFNPHFFMGGDNVMFWGPLAWTIIFGLTYATVLTLIMVPVMFYLVKRTK
YWLRDRRNQDTIGE
NT seq
3465 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcacatcaaaataaagaattcggcatttcaagttgggcagttgacaatcgcgtcacg
gtctatatcttgacttttataattgtcattgcaggtttgactgcatacattaatatgcct
cgagaagattttcctgaaatcatcgaaaacaaaatttacatctcatctgttttcccagga
aactcggctgaggatgtagagaaattggtgattaaaccgcttgaaaaacaaatcaaaaac
atcagtggagttgataaagtcacttccagttcatttcaagattacggaatgattatcgct
gagttttcagatgatgtttcggtagaacaagccaaacaaaaaattaaagacaaagtagat
aatgccaaagcagataccgattggccaaatatggacaatggtagcaaggtggagcctaat
gtgtttgaattaaacatctctgaggaagtgccaattttgaacatcaacttgcagggtaat
tacaccacgcaacagttaaaaaaatatggtgaattattacaagatgatatcgaagaaatt
tcagagatcaaaaaagtagacattttaggtgttgatgataaagaagttgaaatcgctgta
gacatctttaaaatgactgctgctcaagttacttttgacgacattcaaaacgcagtgaaa
tatgaaaatatgacactttcgggtggaaatttaacttcgcaaggatcacgtaataacatt
cgaattgtaggagaatttaaaaacccaaaagagttagaaaacattattgtaaaatccttc
ggcggaactgtttatcttaaaaacattgctacggtgagtttcaaagaaaaagaaaaaacc
acctatgctcgtgaaaaaggaacggaagtagtgatgctgaacgttaaaaaacgttccaat
cagaatatgatttccgcaattgatcaggtaaaagaaaaagtagctttggcgcaagaaact
tatttgcctaaaaacttaaaagtagaattaactagcgaccaatcgtctcgagtagaacac
caagtagatgaattgtccaaccatattatttttggaatcattctcgtaatgattgtgttg
atgtttactatgggattgcgtaactctttatttgttggtgctgccattccattatctatg
atgattgcttttgccatcttatctatgtttggtttaaccctaaacactatggtgcttttt
ggcttagtaatgggattaggaatgttggtggatgacggtattgtggttgtagataatgtt
tatgccaatatgcaaaaaggaatgactcgaattcaagcttctaaagtaggaattggagaa
attgcttggccggtaatttcgtcaacagcaaccactttgatggcctttttaccttttgcc
ctttggccagggacaatgggtaaattcatgaaatatttcccaataacattgacagtaact
ttaacaggatctttatttgtagcaatggtaatcaacgctgctatgacgggaggttctatg
gcgttagaagataaaaacatcaagaaaaaaagcttgcatttttacaccatactattcatt
gctttaggaattctatttgccgttcctggaaatatatatgacagcaaactattaagaggt
ctaggacatttattgctaatttcggtaggattgatgtggttgtattattggaaaattttc
caatggacccaagattttcagtacagctttttcccaaaaatggaagaaaaatacaaaatc
ttcttagcaaaaattttatctggaaaagtcgcttggaaagccttcggcggaattattgtc
ttattaattttttcatttgtgcttttaggaattttcccaagaaaagtattgttctttcct
gataatattccaaatcaagtgattacttacattgaatatcctcaaggaacttcaatcgaa
aagacgaataaagctactttatttgtggagaaacaaatcatccagatattagagaaatat
gttgaacctggtacggaccaaaactttatggcggaatcaattatttcgcaagtaggggtt
ggtgctggaaatccaaatgtagatgctggttcagcctctgaaacgccattcaaaggaaaa
gtgacggtgagtttctccgaatttaaattcagaaaaggcatcaacacttcggtgatttta
gaagaaattagagctaaagtaactggaattgctggcgctactgtaaccgttgaaaaagat
gctaacgggccgcctgcagggtatccaattagcattcaattaaccggtgctgattatgag
caaatgttgaaagaagcagatagaatgattgcttttatcgattctaaaaacattcctggt
atcgaaaaattaagtatcgacatcaacaaagaaagcccagaactagaagtaaaagtagat
cgtgccaatgcaggaagtatgggtatttctactggacaattaggtttcaacctaagacgt
tcggtgtatggacaagagatttcgacttataaagaaggagatgatgattacaatatcgtg
atgcgtatgcaagacgatcaacgtaaaaacgaaaacatccttttcaaccaatcgatgacg
ttcagaaacccaaataatggacaaattatgcaagtccctatttctgctgtttctaatact
gaaaaaaccaatacttataatcagataaaaagaaagaattacaaacgaatcatgaccatt
tattcgaatgtacttacaggatataatggagatgaaataacgaaacaaattaaagaagaa
cttaacagttataatcttccaaaaagtgtgagttattcattctcaggagttcaagaagaa
caaggtaaaaaccaaagtttcttgatgtacgcgttatttttagccttagcgggtattact
attatcattgtgttgcaatttaattcagtttcaaaaacgatgattattatgtttactgtg
ttattaagctttagtggtgtattttatggttatgtaattgcgaatatggattttgtaatc
ctaatgactatgatgggaattatctcattggctggagttgtagtgaaaaacggaatcgta
ttaatggatttcttcgttttattattggacaaaaaagttgccgataaacaattagaaagc
cacgatgatttaagtttagaagaaattaaagaagtgattatcgaatcaggtaaatcaaga
ttacgtccagtattgttaactgctttaaccgccatcttaggattaattcctttggctatc
ggattgaactttgacttctttactttggtaaccgatttcaaccctcatttctttatgggt
ggagataacgtaatgttctggggacctttggcttggaccattatctttggattgacttac
gcaactgttttaactttaataatggtgcctgtaatgttctatttagtgaaacgaactaaa
tactggttacgtgaccgtagaaatcaagatacaataggagaataa
DBGET
integrated database retrieval system