Flavobacterium ammonificans: SHINM13_17330
Help
Entry
SHINM13_17330 CDS
T08737
Name
(GenBank) multidrug ABC transporter ATP-binding protein
Organism
fao
Flavobacterium ammonificans
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_membrane
ABC_tran
SMC_N
AAA_22
AAA_16
Zeta_toxin
DEAD
IstB_IS21
RsgA_GTPase
DUF87
AAA_29
AAA_18
ATP-synt_ab
AAA_15
nSTAND3
AAA_23
AAA_24
Cytidylate_kin
AAA_28
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BDB57437
LinkDB
All DBs
Position
1995500..1997287
Genome browser
AA seq
595 aa
AA seq
DB search
MPRFKENDLPKSKITLSALQKAKLIFQFSGKHLWKFYVGLFFLLLTGGTALAFPKLMGLL
VDCVNNKETAQANFIALSLLGILFMQSIFSFFRLSLFVNFTENTLANLRLALYSNLVKLP
MSFFSQKRVGELNSRISSDITQIQDTLTSTIAEFLRQFILIIGGIALLATESFKLTLLML
SVVPLVAVAAVIFGRFIRSYSKKVQDKVAESQVIVEETMQGISIVKAFANEWYEIARYKT
QIKEVIQIAIKGGKYRGYFASFIIFCLFGAIVAVVWYGVQLSIAGEMSVGQLISFVLYST
FVGASFGGIAELYAQIQKAIGATERVFELLDETPEKIQGTTAHQSIEKIKGNVNFKNVAF
KYPSRKEMEVLKDVSFTAQFGQKIAIVGPSGAGKSTIASLLLRFYSIAEGSIEIDNKNIY
DYDLEQLRGNMSIVPQDVILFGGTIRENIAYGKPNATEEEILAAAQQANAYNFIESFPEK
LDTIVGERGVKLSGGQRQRIAIARALLKNPSILILDEATSSLDSESEKLVQEALEILMEG
RTSIIIAHRLSTIRSADQILVLDKGIIAEKGTHQELIALDNGIYKNLSNLQFSNS
NT seq
1788 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgccacgatttaaagaaaacgatttgccaaaatcaaaaattaccttaagcgcccttcaa
aaagcaaaactcatatttcaattttcagggaaacacctttggaagttttatgtaggttta
tttttcttattgctaactggaggtaccgctttggctttcccaaaattaatgggattactc
gtagattgtgtcaataataaagaaactgcacaagccaattttatagcactgagtttactt
ggaatattgtttatgcaatctattttttcgttttttagattgtctttatttgtgaatttt
accgaaaacactttagctaatcttcgcttggcattgtatagtaatttggttaaacttcct
atgtcattcttttctcaaaaacgtgtaggtgaattgaatagccgaatcagttcagacatt
acccaaattcaagatacattaacctctacaattgcagagttcctaagacaattcattctt
attattgggggtatcgctttattggctaccgaaagtttcaaacttactttattaatgctt
tctgttgttcctttggttgcagttgcagcagttatatttggtcgatttataagaagttat
tctaaaaaagtacaagacaaagtagctgaaagccaagtaattgttgaagaaactatgcag
ggaattagtattgtaaaagcatttgctaacgaatggtacgaaattgctcgatataaaacg
cagataaaagaagtaattcaaattgcgattaaaggtggtaaataccgtggctactttgct
tcgttcattatattttgcctttttggtgctatcgtggccgtggtttggtatggagttcaa
ttaagcatcgcaggcgaaatgagcgtaggtcaattaatctcgtttgttttatattctact
ttcgtaggggcttcttttggtggtattgccgaattgtatgcacaaattcagaaagcaatt
ggtgctactgaacgtgtttttgaattattagacgaaactcccgaaaaaatacaaggtaca
acagcacaccaatccattgaaaaaataaaaggaaatgtcaattttaaaaatgtagccttt
aaatatccttctagaaaagaaatggaagtgttaaaagacgtgagttttaccgctcaattt
ggacaaaaaattgctattgtaggtcctagtggtgctggaaaatctacaatagcttctctt
ttattgcgattctattctatcgcagaaggaagtatcgaaattgacaacaaaaatatttac
gattacgatttggaacaattacgtggcaatatgagtattgttcctcaagatgttattttg
tttggcggaaccattcgtgaaaacattgcctatggtaaaccaaatgctactgaagaagaa
attttagccgcagcccaacaagctaatgcctacaattttatagaaagcttccctgaaaaa
ttagatactattgttggagaaagaggtgtgaaattatcgggaggtcaaagacaacgcatt
gcaattgcaagagccttattgaaaaatccaagtatattaatattagacgaagccacttct
tcattagacagtgaaagtgaaaaattagttcaagaagcgctcgaaatcttgatggaagga
agaacaagtatcattatcgcacaccgtttatcaaccattcgctcagcagatcaaattcta
gtattagacaaaggtataattgctgaaaaaggtactcatcaagaattaatagctttagat
aatggaatctataaaaatttaagtaatcttcaatttagtaattcataa
DBGET
integrated database retrieval system
