Flavobacterium arcticum: DVK85_00460
Help
Entry
DVK85_00460 CDS
T05621
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K20276
large repetitive protein
Organism
fat
Flavobacterium arcticum
Pathway
fat02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
fat00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
DVK85_00460
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CHU_C
GBD_T9SS_assoc
Y_Y_Y
Big_2
SprB
Ig_7
BiPBP_C
fn3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AXG72783
UniProt:
A0A345H873
LinkDB
All DBs
Position
complement(86825..91609)
Genome browser
AA seq
1594 aa
AA seq
DB search
MNKNTLFLYTLLLIVGNTFSYATTFVPVNDECGNATVLTVNSGQSCTSIATTSFSAATVS
PEGNTCTVATTGDIWYQFVATSTSHTVSLSNFTGTPQPVAMVIYEGADCSTFTQVYCSIN
NVINATSLTVGETYKLRLYFNTTTPSLTATTFSVCVTTPPPPSDNNQSDCVITTINFDFE
SPAPPPVTNYPIFLNHNVVQGWRTTASDQMMEFWPVPNYENVPAYSGNQFIELNANLVSG
VYQDYQTPEVTTFSYGFAHRGRQGTDTCQLLAGPPGGPYTPVGASVTTSNTAWSYNTGTY
DVPAGQTVTRFIFQSVSSVGGASVGNYLDAITFTANNGILSPNPYYMDCGDLIASVEAAG
TGTWMAHSDNPSTTTITDASSNSTTISGFTSEGLYYYDWVTQYCVTTLEISFSGDSVPPP
VVANVVYCQGETATALTAEVLPGNTASWFAGAPPVPSTAVVGTTNYYVSQVAPTGCESIA
ALIVVTVNGLGDPVTDFTLPASVCFGSTEVQPQPATGFTAGGTYTAESGLTIDAVTGEID
PATSTPGDYNVVYTVVANSCNTAGNSSVPITIDPVPGTPDFTLVQPDCFITTGTITINSP
LGADYTYSIDGTNYQPEAVFTTVPSGTYTLYVQNATGCITEYDSAIIDPVLVTPIVPDVA
IAQPTCTVATATVTVNAPIGAQYTYSINDIDYQSSTVFNDVVSGNYTITVQNTDGCMNTT
NILVNPQPPTPPTPDVVITQPDCDVLSGILTVSSPIGTEFTYSIDGINYQASTVFSGLSQ
GSYSVTVMNSFGCSSTSGNFDIDLAPVPVPTPQVSVIQPTCTVATGTITIDAPVGTQYTY
SINGIDYQSSTIFNDVLPDTYTITIQNTDGCMATTSIQVNSQPPTPPVPNVVVTQPSCSA
LLGTLTVNFPVGAGFTYSIDGVNYQASNVFSGLLQGSYSIIAMNSFGCSSTSATYNIDAP
LTPVPSPQLSAVQPDCSTALGTIAVSSPLGASYTYSIDGITFQSGILFTGLIPGTYTILV
KNADGCIAGSSISVYPAPDMPAIADVTVSQPDCGSATGTITVNSPTGVGLTYSIDGINFQ
PNPVISGLAQGSYTLTVKNNVGCISVTNPIIISSSLTIPQQPVITAIQPTCDTPTGTITV
TSPIGAGLTYSIDGINYQSNTDFTGLTPGMIYNVTVQNAVGCTVMSLPLTIHNAPEVPAV
PTLNVVQTDCDNSRGLITVDAPVGEGIKYSINNISFQPSPVFTNLVPGIYTITVRNLDGC
TASDTVEIYPQLATSDPGIIDGPLQVCETSTAQFTNATIGGTWSVSNEDRATISDTGELT
AISSGNVIVYYTVQNPNECAAVAELSVWIVGAPRPQLFDTFICLDIETGEYANAELNTGL
SIDQYSFVWYNGSTELPNTDGYITVTEPGEYSVDVTNIALGCTGSATAIVSVSSQAIVNV
VVGEDFNRRQSITITVLGGSGDYEYQLNDGAFQDEAIFTGIEQGEYSVTVRDKNGCGSST
EVIYALNYPRFFSPNGDGVRDTWFIEGLRGRSNTNIYIFDRYGKVVGSVIPGTVGWDGTF
DGEILPATDYWFTISYISSDGNSKEFKAHFSLIR
NT seq
4785 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataaaaatactttgtttttatatactctacttcttatagtagggaatactttttcc
tatgcaacaacttttgttcctgtaaatgatgagtgtggtaatgctacagtactcacagta
aactctgggcaaagttgtacaagtatagctacaacatctttttctgctgccacagtttca
ccagagggcaatacatgtactgttgctacaacaggcgatatttggtatcagtttgtggca
acatcaacatcacatacagtatctctttctaattttactggcacaccccaaccagtagca
atggtaatttatgaaggagcagattgtagtacttttactcaggtatattgcagtattaat
aatgtaataaatgctacttcacttactgtaggagaaacatataaactaagactttatttc
aatacaacaactccttcgcttacagcaacaacatttagtgtgtgtgttactacaccgccg
ccgccatcagataataatcagtctgactgtgttattacgacaattaattttgattttgag
tccccagcccctcctcctgtaactaattaccctatttttcttaatcataatgtagtacag
ggttggcgtacaacggcatcagaccaaatgatggagttttggcctgttcctaattatgaa
aatgtaccagcttatagtggtaatcagtttatagaacttaatgcaaatttagtgtcaggt
gtatatcaggattaccaaacaccagaagttacaaccttttcttatggttttgcccatcgc
ggtcgtcagggtacagatacttgtcagcttttagcaggaccaccaggcggtccttatact
ccagtaggagcctctgtaactacaagtaataccgcatggagttataatacaggtacatat
gatgtgcctgccggacaaaccgtgactcgttttatatttcaatcagtttctagtgtagga
ggcgcgagtgtaggtaattatcttgatgctataacctttacagctaacaatggtatactt
tcgcctaacccgtattatatggattgtggagatttaatagccagtgtagaagcagcaggt
acaggtacatggatggcacatagtgataacccgtcaactaccacaataaccgatgcatca
agtaatagtacaactatatcaggttttacttcagaaggactttattattatgattgggtt
acacaatattgtgttactacactcgaaatatcattctcaggagactctgtaccaccacct
gtagtagcaaacgtagtgtattgccaaggcgaaacagctactgcacttacagcagaggta
ttaccaggaaatactgctagttggtttgcaggcgctccacctgtacctagtaccgctgta
gtaggaactactaattattatgtaagtcaggtagcacccactggatgcgaaagtattgca
gcgcttatagttgttacagtaaatggtcttggtgaccctgttaccgattttacattgcct
gcatcagtatgttttggcagtaccgaagtgcagccacagcccgcaacaggatttactgca
ggaggtacttataccgccgaaagtggtcttactatagatgctgtaacgggagaaatagat
cctgctacaagtacccctggtgattataacgtagtttatacagttgttgctaactcttgt
aatacagctggtaatagcagcgtaccaataactatagatccagtaccaggtacacctgat
tttacattagtgcagcctgattgttttataactacaggtactataactataaacagccca
ttaggagcagactatacctatagtatagatggaactaattatcagccagaagctgtattt
acaacagtaccatcgggtacatatacgctttatgtgcaaaatgctacaggttgtatcaca
gaatatgactctgcaattatagatcctgtattggtaacacctattgttcctgatgtagct
atagcacaacctacttgtacagtagcaacagcaacagttactgtaaacgctccgatagga
gctcaatatacctatagtattaatgatatagattatcagtctagtacagtgtttaatgat
gttgtatcaggtaattatactataacagtacaaaacaccgatggttgtatgaatactact
aatatattagttaacccacaaccacctacaccacctacaccagacgtagttataacacaa
cccgattgtgatgttctctcaggcatattaacagtaagctcgcctataggtacagagttt
acttatagtatagatggtataaattatcaggcgagtactgttttttctggactttctcaa
ggtagttattcggtaacagtaatgaatagttttgggtgttcctctacttcaggaaatttc
gatatagatttagcccccgtaccagtacccacaccacaagtttcggtaatacagcctact
tgtacagtagctacaggaacgattactatagatgctcctgtaggtacacaatatacctat
agtattaacggtatagattatcagtctagtactatttttaatgatgtcttgccagatacc
tataccataacaatacaaaatacagatggctgtatggctacgaccagtatacaggttaat
tcgcagccgcctacaccgcccgtacctaatgtagttgtaacacaacctagttgtagcgca
cttttaggaacattaacggtaaactttccagtaggagcaggttttacatatagtatagat
ggtgttaattatcaggcaagtaatgtgttttctggacttttacaaggtagttattcaata
atagcaatgaatagtttcggatgttcctctacttctgctacttataatatagatgcacca
ttaacacctgtaccatcgccacagctttcggcagtacaaccagactgctctacagcatta
ggtactatagcagtgagttcgcctttaggagcatcatatacttatagtatagatggtatt
actttccagagcggaatattatttacagggctcatacctggcacatatactattttggtt
aaaaatgcagatggctgtatagcaggttcttctattagtgtatatcctgcacctgatatg
ccagcgatagctgatgttacagtatcgcaacctgattgtggttcggctacgggtacaatt
acagtaaacagtcctactggagtaggtcttacttacagtatagatggtattaattttcaa
ccaaaccctgtaatttcaggtttagcacaaggtagttatactctaactgtaaaaaataac
gttggttgtatctctgtaactaaccctataattataagctcttcgctaacgataccacaa
caacctgttattactgcaatacaacctacttgcgatacgccaacaggtactattacagtt
acatcgccaataggggcgggacttacttatagtatagacggaataaattatcaatcgaat
actgattttacaggtttaacacctggaatgatttacaatgtaacagtacaaaatgctgtg
gggtgtacagtaatgtcattgcctttaacgatacataacgctcccgaggtaccagctgta
cctaccctaaatgtagtgcagactgattgcgataattcgagaggtcttataacggtagat
gcaccagtaggagaggggattaaatacagtataaataatatatcttttcagccaagtcct
gtttttactaacctagtaccaggaatatatactataacagtaagaaatttagatggttgt
actgctagtgatactgtagagatataccctcagttagcaacttcagaccctggtataata
gatggacctttgcaggtttgtgaaacaagtacagcacagtttacaaatgccactatagga
ggaacgtggtcagtaagtaatgaagatagagctaccataagcgatacgggcgaattaaca
gctatttcatcgggtaatgtaattgtatattatacagtacaaaatcctaatgaatgtgct
gcagtagccgagttatctgtttggatagtaggtgcaccaagaccacaactttttgatact
tttatatgtcttgatatagaaacaggagaatatgctaatgctgaattaaatacaggactc
tcgatagaccaatatagttttgtttggtataatggcagtacagagttgcccaatacagat
ggatatattacggtaactgaaccaggagaatatagtgtagatgtaaccaatatagcatta
gggtgtacgggtagtgctacagcaattgtatcggtatcttctcaggcaatagtaaatgta
gtagtaggcgaagactttaaccgtaggcagtcaataaccattactgttttaggaggttca
ggtgattatgaatatcaactgaatgatggtgcttttcaagacgaagctatatttacaggt
atagaacaaggagagtatagtgtaactgtgagagataaaaacggttgtggctcttctact
gaagtaatatatgcactaaattatccacgcttctttagccctaatggcgatggtgttcgc
gatacttggtttatagaagggttaagaggtagatcaaatactaatatttatatatttgat
agatatggtaaagtagtagggtctgttatacctggtacagtaggttgggatggcacattt
gatggcgaaattctcccagctacagattattggtttaccatttcttatatttcatctgat
ggtaacagtaaagagtttaaagctcatttttctttaatacgataa
DBGET
integrated database retrieval system