Flavobacterium acetivorans: LNP19_03370
Help
Entry
LNP19_03370 CDS
T10181
Name
(GenBank) OmpA family protein
Organism
fav Flavobacterium acetivorans
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
OmpA
TSP_3
DUF748
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UFH36088
LinkDB
All DBs
Position
complement(749817..751232)
Genome browser
AA seq
471 aa
AA seq
DB search
MKHLNKLLVAVLMTMGLSSHAQDSNNPWAISFGANAVDTRTSAGGGNGWLDRHFSQPFAV
KDNWNILPSVSYLSVSKYIGDNFSFGVAGSVNKIDKYVMRDTNGALMVTNPGDLMYYGID
ATIKYSFMNLINSKVIDPSLSVGGGYTFFGDSSYGTLNPGAGLTFWLTENVGLELATKYK
KSFGDREDASGTPDAPTHFQHSAGIIFKFGGKDTDGDGIYDKDDACPEVAGLKEFQGCPD
TDGDGIPDKDDACPDVAGPKELNGCPDTDGDGIADKDDACPDVAGLASLKGCPDTDGDGI
ADKDDKCPTVKGPKENGGCPWPDTDGDGVLDKDDACPTVPGPASNKGCPEVSAEVMKQLN
DYGKVILFDSGKSTFKKQSYTVLKSIADILKEYPNSNFMIEGHTDSDGSNALNQSLSENR
AAAVKNYLIENGIDASRLRSTGYGETKPIDSNKTAKGKANNRRVEVSLIKE
NT seq
1416 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaacatcttaacaaacttttagttgctgtattgatgactatgggattaagttctcac
gcacaagatagtaacaacccgtgggctatctcctttggagcgaatgccgtagacactaga
acaagtgctggtggtggtaacggatggttagaccgtcatttctcacaaccatttgctgtg
aaagacaattggaacatacttccttctgtatcatatctaagtgtatcgaaatacatagga
gataatttctcttttggagttgctggttcagtaaacaaaattgacaagtatgtaatgaga
gatactaatggtgcattaatggttactaatccaggagacttgatgtattatggaattgat
gctactatcaaatatagcttcatgaacttaattaactctaaagtaattgatccgtcttta
tctgttggaggaggttatactttctttggagatagtagttatggaacattaaatccagga
gctggtttgacattttggcttactgaaaatgttggtttagaacttgctacaaagtataaa
aaatcatttggagacagagaagatgcttctggtactccagatgctccaactcactttcaa
cattctgctggtatcatcttcaagtttggaggtaaagatactgacggagatggtatttat
gataaagatgatgcttgtccagaagttgctggtttaaaagaattccaaggttgtcctgat
actgatggagatggtattccagacaaagatgatgcttgtccagatgttgcaggtccaaaa
gaattaaatggatgtcctgatactgacggagatggaatcgctgataaagatgatgcttgt
ccagatgttgctggtttagcttctttgaaaggatgccctgatactgatggagacggaatt
gctgataaagacgacaaatgtcctacagtgaaaggtccaaaagaaaacggaggttgccca
tggcctgatactgatggagatggcgttttagacaaagatgatgcttgtcctacagttcct
ggtccagcaagtaacaaaggttgtcctgaagtttcggctgaggttatgaaacaattgaac
gattatggtaaagtaattttgtttgattctggaaaatctactttcaaaaaacaatcttat
actgttttgaaatcaatcgctgatatcttgaaagaatatcctaattcaaactttatgatt
gaaggacatactgatagcgatggaagtaatgcattaaaccaatctttatctgaaaacaga
gctgcagcggttaaaaattacttaattgaaaacggtattgatgctagcagattaagatct
actggttatggtgaaactaaaccaattgatagcaacaaaactgctaaaggaaaagctaac
aacagaagagttgaagtttctttaatcaaagaataa
DBGET
integrated database retrieval system