Flavivirga abyssicola: Q4Q34_09205
Help
Entry
Q4Q34_09205 CDS
T09912
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
fay
Flavivirga abyssicola
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
fay00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
fay02000
]
Q4Q34_09205
Transporters [BR:
fay02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
Q4Q34_09205
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
CarbopepD_reg_2
Plug
CarboxypepD_reg
CooC_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WVK15204
LinkDB
All DBs
Position
2173673..2176549
Genome browser
AA seq
958 aa
AA seq
DB search
MSKFLQFKLFLTLLFFIPVMAFSQQVSGTVTDGETNLPLAGANIIIKGTSTGAISDFDGN
FTLTVEGFPVTLVVSSVGYDTQEVNVSSSQKVTIALKEGVALDEVLLIGSRNPSRTAVDT
PVPVDVIDISELTSQGPQVNLNQILNFVAPSFTSNTQTISDGTDHIDPASLRGLGPDQVL
VLINGKRRHNSSLVNVNGTFGRGSVGTDLNAIPSGAIQRLEVLRDGAAAQYGSDAIAGVI
NIVLNSNVNELTLNMTTGANFTKNANDQTGGVDGETVNISANYGIPLGEKGGFINFTGDF
DFREDYGRMKEWEGNVFNLYNTVERFANNDGYNLSDLLDDDVADVIQYANAAGINLGGAS
TKADLQPILEADNTDAELAARGLVRSDFNMRVGQSEVRGGRFFANLSLPLDDNGTELYSF
AGTSSRKGNSAGFYRLPNQSRTYTPAYINGFLPEINSTITDKSFAVGIKGKINDWNVDLS
NTWGKNAFLYTIGNTFNASFQNASPVTFDAGGFNFMQNTVNLDINQFYDDIFSGLNVAFG
AEYRLENYEIEAGEEASYSRYTAEGQVITLASQQASQDFFGNSRPGGSQVFPGFSPNNEL
SRGRSSIAGYFDLEADFSETFLASFATRFEDYSDFGSTINFKLATRVKASDNVNVRAALN
TGFRAPSLHQLNFNSTSTIFDQNGNPVEVGTFANDSRVAKILGIPELKEETSQSISLGFT
AKIPNANLTVTVDGYFVGIDDRVVYTGQFSGAAIAAELAQANASAASFFANAIDTESKGL
DIVITHKANIGTNANLKSDLSGTFSKTKKVGPIKASQVLEDAGLVSTYFPEDSRVYLEEA
VPRTKINLTNNFTTGKFNVFLRNVYFGEVTEATTNVDRQQVFGTKVVTDLSFGYKASESL
TLTVGANNLLDIYPDRAAEVLSDGGTNRSSGRFDWSRRAQQFGIGGRFLFARLSFKLK
NT seq
2877 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagcaaatttttacaattcaaattgtttttaacactgttattttttatacctgtaatg
gctttttcgcaacaggtttcaggtacggtaacagatggcgaaacaaatttgcctttagca
ggggcaaacattattattaaaggaactagtacaggggccatttctgattttgatggaaac
tttactttaacggtagaaggcttcccggtaactctggttgtctcttccgtagggtacgat
acccaagaagttaatgtgtcttcttctcaaaaggtcacgatcgctttaaaggagggtgtt
gctttagatgaggtgcttttaattggatcgagaaatccaagtagaactgctgttgataca
cctgttccggtagatgttattgatatttccgaattaacatctcaaggtccgcaagtgaat
ttaaatcagattttaaattttgtggcaccttcattcacgtctaatacacaaacaatttct
gatgggactgatcatattgatccagcatcattaagaggattagggccggatcaagttctt
gttttaattaacggaaaacgaagacataattcatctttggttaatgttaatggaactttt
ggacgtggtagtgtaggaaccgatttaaatgctattccatctggagccattcagcgatta
gaagttttacgtgatggtgctgcagctcaatatggatcagatgccattgccggagttatt
aatattgtactaaacagtaatgtaaatgagcttactttaaatatgactacaggagccaat
tttacaaagaatgccaatgatcaaacagggggtgtagatggagaaaccgttaatattagt
gctaattatggtatacctttaggagaaaaaggtggatttataaactttacgggtgatttt
gattttagagaagattacggtagaatgaaggaatgggaaggcaatgtttttaatctttat
aatactgttgaaagatttgctaataatgatggttataacttatcagatttattagatgat
gatgtggccgatgttatacaatatgctaatgctgctggaattaatttggggggagctagt
actaaagcagatttgcaacctattttagaagctgataatacggatgcagaattggctgcc
agaggactggttagaagtgattttaatatgcgtgttgggcaatctgaagtaagaggggga
cgcttttttgctaacttatcgttgccattagatgataatggaactgaactatattcattt
gcaggaacaagttccagaaaaggaaactctgcaggcttttatagattgccgaatcaaagt
agaacatacactccagcatacatcaacggttttttaccggaaataaattcaaccattaca
gataaatcttttgctgttggaattaaaggtaaaataaatgactggaatgtagatttaagt
aatacctggggaaagaatgcttttttatatactattggaaatacctttaatgcctctttt
cagaatgcatctccagtaacatttgatgcaggcgggtttaactttatgcagaataccgtt
aacttagatatcaaccagttttatgacgatatttttagtggacttaatgtcgcttttgga
gcagaatatagattggaaaattatgaaatagaagcaggagaagaagcctcatactcaaga
tatacagcagaaggccaagtgattaccttagcatctcaacaagcatcacaggactttttt
ggtaattccagacctggtggttctcaagtatttccagggtttagtcctaataatgaatta
tctagaggacgtagtagcattgcaggatattttgatttagaagctgatttttctgaaact
tttttagccagttttgctacccgctttgaagattattcagatttcggatcaactattaac
tttaagttagcaactagagtaaaagccagtgacaatgttaatgttagagccgcattaaat
actggttttagagcgccttctttacatcagttaaactttaattctacgtcaaccatattt
gatcaaaatggaaacccagtagaagttggaacatttgctaatgatagtagagttgcaaaa
atattaggaataccagaattaaaagaagaaacgtctcaaagtataagtttaggatttact
gccaaaatacctaatgcgaatttaactgtaacggttgatggttattttgtaggcatagac
gatcgtgtggtttatacaggacagtttagtggtgctgccattgctgcagaattggcacag
gcgaatgcctcagcagcatcgttctttgccaatgccattgatactgagtctaaaggttta
gatattgttattacacacaaagccaatataggaacgaatgcaaatttaaaatctgattta
tctggaacgttttcaaaaactaaaaaagtaggccctataaaagcctctcaggttttagaa
gatgcaggtttggttagtacttactttccagaagatagtagagtttatctagaagaagca
gtaccacgtactaaaataaacttaactaataactttactacaggaaagttcaatgtgttt
ttaagaaatgtgtatttcggagaggtaactgaagccacaaccaatgttgataggcagcaa
gtttttggaacaaaagtagttactgacttatcttttggttataaagcttcagaaagttta
acattaacggtaggagcgaataacttattagatatctatccagatagagctgccgaagtt
ttatctgatggaggcactaacagaagcagtggtcgttttgattggtctaggcgtgcacag
caatttggaataggcggacgatttctttttgccagacttagctttaagttgaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
