Flavivirga abyssicola: Q4Q34_13745
Help
Entry
Q4Q34_13745 CDS
T09912
Name
(GenBank) SpvB/TcaC N-terminal domain-containing protein
Organism
fay
Flavivirga abyssicola
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SpvB
TcdB_toxin_midN
TcdB_toxin_midC
RHS_repeat
FG-GAP_3
FG-GAP
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WVK12283
LinkDB
All DBs
Position
3253431..3261188
Genome browser
AA seq
2585 aa
AA seq
DB search
MENNLEERNTGKQNSTPNNVDLLSKENPTQSNAIEIPSISLPKGGGALKGIDEKFEVNPS
NGTAGFSIPFPVSPGRNGFSPSINLSYNSGVGNSIFGIGWSIGLPSIKRKTDKELPKYQD
TNSSEDTFVFSGIEDLVPFLEEGGTEAWKIKEYVDNGYKIKRYRPRIESGFSRIEKISHP
DHGIYWKVTSGNNQVTFYGKSNNYKISNPIDEERIYEWLPEFSYDNKGNYTYYEYKTENL
DNVPDTIYNKNRTSGLAPFTNRYLKRIKYGNQKPYYPDTEMPYDFEKPIDDLCAFELVLD
YGEHDEDQPTLEEINTQKWKYRSDAFSSYRSGFEIRTNRLCNRVLMFHTFPELNAGTPTL
VRSLDFEYLSSEALKEKTDRPAELTYLVSIVQKGYILKPDNTYSVKALPKMTFDYQWLNW
NTETKTVSEDNLVNAPVGVSGNYQWVDLYSEGINGILTEQANALFYKSNLGEDKQGHVHF
SQAKSIIPKPAFLGITEGILQLQDLEANGQKQVVVNAPGQQGYFELNDEEEWQPFKTFLK
ELRIDVRNPNVRMLDLNGDGRPDVVLSDQGAFTWWGNKGKIGYDNAELVPKSYNEESGPA
IVFQDQKQSIFLADMTGDGLTDIVRIINGEICYWANMGYGRFSAKVTMENAPWFDAPELF
NPQYLNLADISGTGVTDIIYLGKNKFSAYLNFSGNAWSDATFIDPFFSTEKPNKITVTDL
LGNGTSCMVWSSELPGYKHAPMRYIDLMGGIKPHIMKSYENGFGKKVEVEYRSSTSYYLE
DKRNGTPWITKLPFPVQCVSKSIITEEITKVRFATKYSYHHGYYDHGEREFRGFGSVEQL
DSEYFEVFEKTGASNVVTKEHHQPPVLTKTWFHTGAFLDKKKILTQFKKEYWYEIFKEKG
FDVEPIEYELPDATLSVAENITNLDVDSLEVEECIEALRACKGMVLRRETFALDAEDEND
LEQIKKQLTPYNVTTHNCDIQLLQQKHQNKHAVYIVRESEAITYAYERNPEDPRIAHKLN
IEIDEYGNIVESASVVYPRIQTEDLLKDAPTDSVAARNAKQHARNEQQKRWITYSVNDFT
NDITTPQNYLLRKGWQNKTYEVTGMTPAEDIFTIDDFKNSLNSLPEIEYQKKPEEGIVQK
RLIEHIKTKYYNDTLSAPLLDGQLGVFGVNYENYQLAYTPNLLQSIYTPTDYSQEFEVTE
SDMLEAKYYQEDTNWWVRSGTIQFFNIGETFEDIKERFLNPISYTNPFGTKTEVFYDPLF
IFVNRTLDPLGNESQVLEFNYRTLSPTKMRDFNDNIASVIMNELGFVKAGAIEGKDTNND
KIGEEADNLIGIAEIADNAEQSLIDSFFEIAQVHDVCNYAELQSVAKDLLKSASSCMIYN
FNQKPTVAASIIREQHALENLDSPIQISFEYSDGLGNVAMTKVQAEPGIAKKAIQLDNEE
WDIEEVDTVNQLRWIGNGRTVLNNKGNPIKQYEPYFSVSPMHEDAAGLVETGVTPIIYYD
AVGRSIKTEFPNGTFTKVEFDAWKYNSYDANDTVKNSDWYVARMTLADTNAEKKAALKTE
THHETPSCVILDTLGRLVLTIDKNKYPNASDQIIEEQYYTYVDIDIEGNAHAIIDARGNI
VMEYQYDLLGHRVAQKSMDAGKRWMFNNVLGSPVKLWDEHKHEFHYTYDILQRPLDKWAR
GGEGTVPMQVLYRKIVYGEGLPNDKQNNLRGNIAQTYDTAGKVISESYDFKGNRLASTRI
FAQEYKNIPNWDVPNPDDLLEGAAYTFTSSAEYDALNRPVKQIQPDGSEHIPFFNAARFL
ERVDVKKGTSTNTYVQNINYDAKGQRTEITYGNDTKTDYTYDPDTFRLTTLKTSKKEGEP
LQDLKYTYDPIGNIVEIKDQAIPTVFYNNQKITGRNEYTYDALYRLIVANGREQSTNMAD
FAAGDNWGDSHAKFNLATNDPMAMHGYVQRYRYDTVGNILQTKHIAGAHSWTRDYVYETK
NNRIKSTEVGEYTLNYEHHPIHGYITKIPHLPLMQWNFKEELAATSKQVRTDGGTPETTY
YVYDGSGRRVRKVTENAADEGNTPSLKNERIYLGNYEVYRDQNGLERETLHIMDDQTRIA
MIDTETEPRMFLGLPVGRTTPVQTVRYNLSNHLGSSTLELDEHANVISYEEYHPFGTTAY
QAQNSAIKAAAKRYRYTGMERDEETGLEYHKARYYIPWLGRWLNSDPLGMIDGANLYKYG
RNNPIKLVDINGTESIDLGLYEVVEDMPESFFSFTGNRGDLEAVRHAIDEADEIRFHLDD
IDEDRLLRQVENIADAVEEFGDDIDELERFLQRTDSFTAYEFYEVVGDQEVLDKVEFFEG
GSRVPQERIDNLKSNFGDLVGDGGPRATRRSGGPGGGDGPGGGGSNGDGGGTRGGGTPGG
DGSPPRGNGPGGSHASARATAPDAPDVPRTRVRTPGRAPKVKGGIIIGALIAGVVLLATG
DVYAAGQSVNPAAETTDAVVEGGDAGDVALGILSDIWYATPPGMIHGLGNLNQAAMDASH
FPAPEGWVEQQVEQGRNPFCALCHGPNAPARQQPGETSLFTDFDTFQTETDREALEAFVR
SLESR
NT seq
7758 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaaataatttggaggaaagaaataccggtaaacaaaactcaacgccgaataatgta
gatctgttgtcaaaagaaaaccctacacagtctaatgctatagaaataccttccatttca
ctcccaaaaggaggaggggcactaaaggggatagatgagaaatttgaagtgaatccttca
aatggcacagcaggatttagtattccttttcctgtttctcctggtagaaatggtttttca
ccatctataaacttaagttataattcaggagtaggaaacagtatattcggtattgggtgg
agtattggcttaccatcaataaaaagaaaaacagataaggaattacctaaatatcaagac
acaaatagctcagaagatacttttgttttttcaggaatagaggatttagtaccattttta
gaagaaggaggtacagaagcatggaaaatcaaggaatacgttgataatggttataaaata
aaaaggtatcgtccacgtatagaaagtggtttttcaaggattgaaaaaataagtcatccg
gaccatggtatatattggaaggtgacatctggtaataatcaggtgacattttatggtaaa
agcaataattacaagatttcaaatcctattgatgaggaaagaatttatgaatggttacct
gaattttcgtatgataataaaggtaattatacatattacgaatataaaacagaaaacctt
gacaatgtaccagataccatatataataaaaacagaactagtggtttggctccgtttaca
aatcggtatcttaaacgtataaaatatggaaatcaaaaaccatattatccagatacggaa
atgccatatgattttgaaaaaccaatagatgatctatgtgcattcgagttggttttagat
tatggggagcatgacgaagatcagccaactctggaggaaattaatacgcaaaaatggaag
tatcgctcggatgcattttcttcctatagatcaggttttgaaatacgaacaaacagatta
tgtaatcgggtattaatgtttcacacctttccagaactaaatgcgggtactcccacgtta
gtacgctcattggactttgaatatttatcttcagaagcattaaaagaaaaaacagataga
cctgccgaacttacctacttagttagtattgtccaaaaagggtatatactaaaaccagac
aatacgtattcggttaaggcactgcctaaaatgacttttgattaccagtggcttaattgg
aatacagagactaaaacagttagtgaagacaatttggtgaatgcgcctgttggggtttca
ggaaattatcaatgggttgatttatatagcgaggggattaatggtattctaaccgaacaa
gccaatgcattattttataaaagtaacttaggagaagataaacaaggacacgtacatttt
tcacaagcaaaatccattattccaaaaccagcatttttgggtattacagaagggatcctg
caattacaagatttagaagctaatggacaaaaacaggttgttgtaaatgcaccagggcaa
caaggttattttgaattaaacgatgaggaagaatggcagccctttaaaacatttttaaaa
gaattacgcatagatgtgcgtaatcccaatgtccgtatgctagatcttaatggtgatggg
agaccagatgttgttttgagcgatcaaggtgcttttacatggtggggaaataaagggaaa
ataggttacgataatgcagagttagttccaaaatcatacaacgaagagtcagggccagca
attgtgtttcaagaccaaaagcaaagcatttttttagcagatatgacgggcgatgggctt
actgatattgtacgcataatcaatggagaaatatgttattgggcaaatatggggtatgga
agatttagtgccaaagtcactatggaaaatgctccctggtttgatgctccagagttattt
aatcctcaatatttaaacctagcagatataagcggtacaggtgtaacggatatcatttac
ctcggaaaaaataaattcagtgcatatcttaattttagtggaaatgcctggagtgatgcg
acatttatagatccttttttttcgaccgaaaaacctaataaaataaccgttaccgattta
ttaggaaatggaacatcctgtatggtatggtcttcggaattgccaggatacaagcatgca
cccatgcgatatatagatcttatgggaggcataaaaccccacattatgaaaagttatgaa
aacgggtttggcaaaaaagtagaagtagaatataggagttcaacatcttactatttagaa
gataagcgtaacggaacaccctggattaccaaattaccatttccagtacaatgtgtgagt
aaatctataataactgaagaaataacaaaggtgcgttttgccacaaagtactcgtaccat
catgggtattatgatcatggagaacgagaatttagagggtttggaagtgttgaacaactg
gatagtgagtattttgaagtatttgaaaaaactggggctagtaatgttgtaacaaaagag
catcatcagccacctgtacttacaaaaacatggtttcatacaggggcctttttggataag
aaaaaaatactcacccagtttaagaaagaatattggtacgaaatttttaaagaaaaagga
tttgatgttgaacccatagaatatgaattacctgatgcgacgctttcagtggcagaaaac
ataaccaatttggatgtagattcgctagaggtagaagaatgtatagaagctctaagagcc
tgtaagggtatggtacttcgcagagaaacatttgctttggatgcagaagacgagaatgat
ttagaacagataaaaaaacagctaacaccatataatgtaacaacacataattgcgacatt
cagttgttacagcaaaagcaccagaataagcatgctgtttatattgtaagagaaagtgaa
gccattacttatgcatacgaacgtaatccagaagaccctcgtatagcccataagctaaat
atagaaatagacgaatatggaaatattgtcgaatctgcctctgttgtatatcctcgtata
caaacagaagaccttcttaaagatgccccaacagattcggtggccgctcgaaatgcaaag
cagcatgctcgaaacgaacagcaaaaacgatggataacatattcagtcaatgattttaca
aatgatatcaccactcctcaaaattatttgctaagaaaaggctggcaaaacaaaacatac
gaagtaactggtatgacgcccgccgaggatatttttaccattgatgattttaagaacagt
ttaaattcacttccagagattgaatatcaaaagaaaccagaagagggtatagtccaaaaa
aggcttatagaacatataaaaacaaaatactataacgataccctatctgctcccttatta
gatggacaattaggtgtttttggagtgaattatgaaaactatcagttggcatatactcca
aatcttttgcaaagtatttataccccaacggactactcacaagaatttgaagttaccgaa
tcggatatgcttgaagctaaatattatcaagaggatactaattggtgggtgaggtctgga
acgattcaattttttaatattggagaaacgttcgaagatattaaagaacgctttcttaat
ccgatttcttacacaaacccatttggtacaaaaacagaagtgttttatgatccgttattc
atatttgttaacagaacattagaccctttaggaaatgaaagccaggtcttagagtttaat
tatcgcacactttcgccaacaaaaatgcgcgattttaatgataatatcgcttcagttatt
atgaatgaactggggtttgtaaaagcaggggcaattgaaggtaaagacacaaataatgat
aagataggagaagaggcagacaaccttattggtattgctgaaatagcagacaatgctgaa
caatctttaatagacagcttttttgaaattgctcaggtacatgatgtttgtaactatgca
gaattacaaagtgtggcgaaagatttattgaaatcggcgagcagttgtatgatatacaat
tttaatcaaaaaccaactgtagcagcaagtattattagagaacaacacgctttggaaaat
ctggatagtcctatacaaataagttttgaatatagtgatggtttaggaaatgttgctatg
accaaagtacaggcagaacccggtatagctaaaaaggcaattcagcttgataatgaagaa
tgggacatagaagaggtagataccgttaatcagttacgttggataggtaatggacgaacc
gttttaaataataaaggaaatcctataaaacaatacgagccctatttttcagtatctccc
atgcacgaagatgctgcaggactggttgaaacaggcgtaacgccaataatatattatgat
gctgtagggcgctccataaaaactgaatttccaaatggaacttttactaaagtagaattt
gatgcatggaaatacaattcttatgatgcgaatgatacggttaagaatagtgattggtat
gtagcacgaatgactttagccgatactaacgcagaaaaaaaagcagcattaaaaaccgaa
acgcaccatgaaacaccctcatgtgtcattttagatactttaggaaggcttgttttaacc
atagataagaataaatatcccaatgcaagtgaccaaataatagaagaacaatattatacg
tatgtagacattgatattgaaggtaatgcacatgctataattgatgctagaggtaatatc
gtaatggaatatcaatacgatcttttgggacatagagttgcacaaaagagtatggatgca
gggaaacgatggatgtttaataatgtattaggtagtccagtaaaactgtgggacgaacat
aaacatgagttccattatacatatgacatattacagcgacctttagataaatgggcaaga
ggaggagaaggcacagttcctatgcaagtgctgtacaggaaaatagtatatggagaaggt
ctacctaatgataagcaaaacaatttaagaggcaatatcgcacaaacctatgatactgct
ggtaaggtgatttctgaaagttatgactttaaaggaaaccgcttagcatccacacgaata
tttgcacaagagtataaaaatatacctaattgggatgtccccaatccggatgaccttctt
gaaggagcggcctatacctttacatcaagcgcagaatatgatgccttaaaccgtcctgta
aaacaaatacagccagatggtagcgagcacataccattttttaatgcagcaaggtttctt
gaaagagttgatgtaaaaaaaggaactagtacaaacacttatgttcaaaatataaattat
gatgctaaaggacaacgtacagagataacctatggcaatgacacaaaaactgattataca
tatgatcccgatacatttagacttaccacactaaaaacatccaaaaaagaaggagaaccg
ttgcaagatctaaaatatacttatgacccaattggaaatattgtagagattaaagatcaa
gccatccctacagtattttataataaccaaaaaatcactggacgaaatgaatatacttat
gatgctctatacaggcttatagttgccaatggtagagagcaaagcacaaacatggcagat
tttgctgctggtgataattggggcgatagtcatgcaaaatttaaccttgctacgaatgac
cctatggctatgcatgggtacgtacaacggtatagatatgacacagtaggcaatattttg
caaacaaaacatatcgcaggtgcacattcctggactcgggattatgtatacgaaaccaaa
aataatcgtatcaaaagtacagaagtaggcgaatatactttaaactatgagcaccatcca
atacatggctacatcaccaaaataccacatctacctttgatgcagtggaattttaaagaa
gaattagccgcgacttccaaacaagtacgtaccgatgggggtactcctgaaaccacatac
tacgtatatgatggttcaggacgtagagttcgtaaggtaaccgagaatgcggctgatgaa
ggcaatacaccttcactaaaaaacgaacgaatttatttagggaattatgaagtataccga
gatcaaaatggattagaacgtgaaacactacatatcatggacgatcaaacacgtattgcc
atgattgatacggaaaccgaacctagaatgttcttaggtcttccagtaggcagaactacc
cctgtacaaaccgtacggtacaacttaagtaatcatttagggtcatcaactctggagctc
gacgagcacgcgaatgtcattagttatgaagaataccatccctttggtactacagcgtat
caggcacaaaactcagctatcaaagcagccgcaaagcggtatcgctatacaggaatggaa
cgtgatgaagaaacgggattagaatatcataaggcgcgatactatataccgtggttaggt
agatggctaaacagtgatccgttgggaatgattgatggagccaacttatataaatatggc
aggaataacccaataaagttggttgatatcaacgggactgaaagtattgacttaggctta
tacgaagtcgtagaagatatgccggaatccttcttctcttttacgggtaatagaggtgat
ttagaagctgtgcgtcatgcaattgatgaggccgatgaaatacgatttcatttggatgat
atagatgaggatagacttttgcgtcaggttgaaaatattgctgacgcagtagaagaattt
ggcgatgacattgatgaattagagcgatttcttcaacgtaccgattcatttacggcttat
gagttctatgaagtagtaggagatcaagaggtattggataaagttgaattttttgaggga
ggttctcgggttccacaggaaagaattgataatctaaaaagcaattttggggatttagta
ggggatggtggtccgagagccacaagaagaagtggcggtcctggtgggggtgatgggcct
ggagggggaggctcaaatggtgatggtggaggtactcgaggaggaggaactccagggggc
gatggtagcccaccaagaggtaatggtcctggtggaagccatgcatcagcaagagctact
gctccagatgcgcccgatgttccaagaacacgagtacggacaccaggaagagcaccaaaa
gtaaaggggggtattattattggggcacttattgcgggcgttgttttattagctaccgga
gatgtctatgcagcaggtcaatctgtaaatcctgcagcagaaacaacagatgccgttgtg
gaaggaggtgatgctggagatgtcgccttagggatattaagtgatatatggtatgcaaca
ccacctggaatgattcacggtttaggtaatctaaatcaggcagcaatggatgcatcacat
tttcctgcccccgagggttgggtagaacaacaggttgaacagggaagaaatccattttgt
gcactttgccatgggcctaatgcccctgccagacaacaaccaggagaaacgagtctattt
accgattttgatacgttccaaactgaaactgatagagaagcattagaggcttttgtaaga
tcgctcgaatcaagataa
DBGET
integrated database retrieval system
