KEGG   Flavivirga abyssicola: Q4Q34_17995
Entry
Q4Q34_17995       CDS       T09912                                 
Name
(GenBank) PKD domain-containing protein
Organism
fay  Flavivirga abyssicola
SSDB
Motif
Pfam: PKD_4 SprB PKD PKD_5 CHU_C Ig_3 InlK_D3
Other DBs
NCBI-ProteinID: WVK13111
LinkDB
Position
4282010..4288093
AA seq 2027 aa
MRKGYFLTAISFFIISLSFFALNHSDLKNTIKTDSLKAHKKVKTSLPPSATISGTTQVCR
NDTQPQITFTGSGGNAPYTFTYNIGGSNLTVTSTGNTATVGVNTTSVGSFTYQLVSVRDG
SNDTSSANGTATVTVSEPTVDFTFNNDGACSGTSVNFTSSATGNGPFTYSWSFGDGSTST
NTNPSHTFTSLGCGFQNSNVTLTVTDTNGCSNSITKPVSIQQKPRLEFEDIDNRFDPFNN
CGNNTTDPSFTINVGISNVSSACINSYDVDWGDGSPVETNVTFPATHTYTQLGSFNMDIT
GRGSNCDNTVTYLVKNSSNPTGAIVNPGNTVNLCIPTSPIDFAIGSWGTNAPDTTYLVDF
GDGAVENYTQAQLESSTYYNAADPANSQNFPIPHTYTESSCPSSYTVFLNISTSCGQTNL
TAGPIIILRKPEVDFEAPPISCVNSTVQFNNTSTGGYSNNCSVNDGYYWDFGDSTTSTLR
NPSHVYTSPGTYTVSLYGENSCGTTNIITETICIEPQLTAAFTLNTNNGCAPLGIQTTNT
TNLASSCGGETYLWEVSYTSGFCGTAPATWNFTNGTDENSAAPRINFVTAGTYTLTLTTT
NACGNSTTSETIEVKQPPTATINAISNFCGSASINPVANVTSCAPASETLTYSWSFPGGS
PASSSTLNPGTINYPTPGNYQITFNVTSSCGTTTDTEDFIVNPIPTITNTNLAQTICSGT
DTNQVPLTSDITGTTYNWTATAPAGVTGFIASGSTDTIPVQTIFNSNSTSQDVTYVITPS
VGGCSGTPANLVITVDPAPSFTSQPQSETICLNGPINQLSVAVNGPGTPTYQWYSNTINN
NTTGTIITGETSATYTPPNNPVGVTFYYCVVSFSSGSGCNEITSDTARIEIVNGIQIDTN
PIVSQNICIGGDINTTLSVVHSGGTGTITYQWYSNTTNSNTGGTVITGANSSSYTPPTFT
VSGNYYYYVTITPNGSGCSPITSNTSEVIVVDDPILTTQPIASQTLCEGTTPQDLQAAAT
GGSGTTYNYQWYSNTTNSNSGGTLITGATNATFTPPTNIVGTLYYYCIITQSDPGCSVTS
NTSSVTVNQAPSFSSHPLSETICSGETFNTLSVSYSNGVGTPTYQWYSNTVDNNATGNIL
TGETASTFIPPSGSIGRVYYYATITFSSGGCTQITSQTAELIVNQTPSISDTSLTICSGI
NFNIIPDSTGGDTVPTGTQYIWTTPVISPAGTITGASNEITPQNNISQTPINNTANPATV
TYTVTPISGNCTGTDFTITVTVNPSISITRNLTNSRCYLSNTGTIEITISGGIPFTTGPP
YQISWTGPNGYTNSNEDISNLEPGNYAVTINDEGDCPFTDTFTILEPEELIFSSISFDPE
TISCFGADDGSINIDIYGGTTPYTYNWTRNGNPFSNTEDLSNLGPGDYQITVTDANNCTP
IVQNFQIIEPPVLDVSLVNQVDIICFGDATGAININTIGGRQIEISTGVFDYSYSWTGPN
GYTSNLQNLSGLFAGTYHLTVTDKSGCTDTLEVILDQSDEIIIDYSTTEIECYGNNNASI
TIDNISGGNPPYTIQWSTLGSGPVQNNLSAGTYIITITDDTNCEKQATVIIDEAPEFSIN
PTVANVSCYGENDANIALNLVGGIAPVTLVWNDDASAGVERNNLSPGTYSVTITDATPCI
ISETFVISEPDPLELSAVTTDALDCDNANSGAINLTVTGGTLPLSYSWSNGETTEDLDAI
PPGTFSVVITDANGCEISNNWTVNRFDPLTIDVETITDFDCITRHVEQTFVARVTGGIPP
YQISWSSGTISGANNEIMNTDQDGLAIVSVIDSFGCSTNFSHNVDIPVLGDAGFELNSIG
YTSFGIYSKKDPIQFTNTAIGDYISILWDFGDGNFSNEENPEHTYTTEGGYIIKQTVTYP
FGCIYEKIITLSVEKGYSLMMPNAFTPNNDNINDFFNPAFVGLNNMVLDIYDTWGSLIYS
EKGDDIDGWNGKINDADAENGNYYFKFSAKTFYGETITKEGPVVLIK
NT seq 6084 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaggaagggttattttcttacagctatttctttttttataatcagtctttcattcttt
gctttaaatcactctgatttaaaaaatacaataaaaacagattcattaaaagcgcacaaa
aaagtcaaaacttcacttccgccgtctgctactatttccggaacaacgcaggtttgcaga
aacgatacacaaccgcaaataacgtttacagggtctggaggtaatgcaccatacacattt
acctataatattggaggttctaatctaactgtaacatctactggaaatacagcaacagta
ggtgtaaacactaccagtgttggttctttcacttatcaactggtatctgttcgggatggt
tccaatgacacatcatctgcaaatggtacagcaactgtaaccgttagtgaaccaacagta
gattttacttttaacaatgacggtgcctgctcaggaacttctgtgaatttcacgtcaagt
gccaccggaaatggtccatttacctacagttggagttttggagatggaagtacgagtact
aacaccaatccttctcatacttttacttctttggggtgtgggtttcaaaattccaatgta
acacttacagtaactgatactaatggttgtagtaattccataaccaaacctgtttcaatt
cagcaaaaacccagattagaatttgaggatatagacaacaggtttgatccgtttaataac
tgcggaaacaatactacagatccttctttcactattaatgttggaataagtaatgtttcc
tcagcttgcataaactcatatgatgtagactggggagatggaagtcccgttgaaaccaat
gttacatttccagctacacacacttacacacagttaggttcttttaatatggacataaca
ggaagaggcagtaactgtgataatacagttacttatttagtaaaaaactctagcaatccc
acaggtgctattgtaaaccccggaaatactgtaaatttatgtattcccacctctccaatt
gattttgctattggttcttggggaactaatgctccggacacaacatatctggttgacttc
ggggatggggcagttgaaaattacacccaagcccaattagaaagctctacatattataat
gcagcagatcctgcaaattctcaaaatttcccaatacctcatacctatacagaatccagt
tgtcccagcagttatactgtttttttgaatatttccacatcatgcgggcaaacaaactta
acagctggtcctattattattttaagaaaacctgaagtcgattttgaagctccccctatt
agttgcgtgaattctacagtgcaatttaataatacatcaacaggaggctacagtaataat
tgtagtgttaatgatggctattattgggactttggagacagcacaacatctacattaaga
aatcctagtcatgtatacacttcccctggtacatacacagtttctctttacggcgaaaac
tcctgtggcactacaaacatcattactgaaacgatatgcatagagcctcagttaacagct
gctttcacattaaataccaataatggttgtgcaccgcttggaatacaaactacaaacaca
acaaacctagcgtcaagctgtggtggtgaaacgtatctttgggaagtttcttatacttcc
ggtttttgcggtaccgctcctgccacctggaatttcaccaatggaaccgatgaaaactca
gcagcaccaagaataaattttgtaactgccggaacttatacattaacacttacgactaca
aatgcctgtggcaatagtacaacttcagaaaccatagaagtaaaacaacctcctacagcc
accattaatgccatttcgaatttttgcggctcagcaagcataaaccctgtagcaaatgtg
acgagctgtgcgcctgcatcagaaactttaacatacagttggagcttccccggaggctca
cctgccagttcaagtaccttaaacccaggcaccataaattatcctacaccgggcaactac
caaattacatttaatgttacaagtagttgtggcaccacgacagataccgaagactttatt
gttaacccaattccaacaataacgaatactaacttagcacagactatttgttctgggacc
gacacaaatcaagtgccattaacgtcagatataactggcacaacatacaattggacagct
actgcccctgccggtgtaacagggtttatagcctctggtagtacagatacaattccagtt
cagactatttttaattccaatagcacatcacaagatgtcacttatgttataacaccttct
gttggtggttgctccggaacacctgcaaaccttgtcataacagttgatcctgctccctct
ttcactagtcagccacaatcggaaactatttgtttaaatgggcctataaaccagctctct
gttgctgttaatggccctggtactccaacgtatcaatggtatagcaatactattaacaat
aatacaacaggaactattataacaggcgaaacatcagcaacatacactcccccaaataat
ccggttggagtaaccttttattattgtgttgtatccttttcatctggttctgggtgtaat
gaaataacctctgatacggcccgtatagaaattgtaaacggtattcaaattgatacaaat
cctatagttagccaaaatatttgtattggcggtgatataaatactacattatctgtcgtt
cactctgggggtaccggaactattacataccaatggtattcaaatacaaccaattccaat
acaggagggactgttattactggagcgaacagttccagttacacacctcccacttttact
gtctcaggtaattactattattatgtaactataactccgaacggaagtggttgtagtcca
ataaccagtaacacctctgaagtcattgtagtagacgatcctattcttacaacccaacct
atagcctctcaaacattatgcgaaggtacgacaccacaagacttacaagcggcagctacc
ggaggatctggaaccacatataactaccaatggtacagtaatacaaccaatagcaactct
ggtggcactctaataaccggagctacgaatgcgacctttacacctcctacaaatattgta
ggtacattgtattactactgtattattacacaatctgatccgggttgtagtgttaccagt
aatacttctagtgtgactgttaatcaagcgccttcattttcgtctcatcccttgtccgaa
actatttgctctggtgagactttcaatacgctatcagtctcttactctaatggtgttgga
acacccacttatcaatggtattcaaatacggtagacaataacgcaacaggaaacatttta
accggagagaccgcttctacctttatccctccctcaggatctattggtagagtttattat
tacgcaaccattacgttttcttctggcgggtgtactcaaattacatcacaaacagcagaa
cttatagtcaatcaaacccctagtatttcagacacatcattaaccatctgtagtggtatt
aacttcaatattattcctgattccactggtggagacacagttcctaccggaacccaatat
atctggacaactcctgtaataagtcccgcaggtaccataacgggagcctctaatgaaatc
accccgcaaaacaatattagccagacaccaataaataatacagctaatccagctacagta
acttatacagtaactcctatatccggtaattgcactggaacagattttactattactgtt
actgttaacccttcaatcagtattaccagaaacctgaccaatagtagatgctatctttct
aatacaggaactattgaaataactattagtggaggtattccttttacaactggtcccccg
tatcaaatatcatggactggtcctaatggatacaccaattccaatgaagatatttctaat
ttagagcctggtaattatgctgtaacgataaatgatgaaggcgactgtccttttacagat
acatttaccattctcgaacctgaggaacttatttttagctctattagttttgatccggag
actatttcctgtttcggtgctgatgatggctctataaatattgatatttatggaggtacc
accccttatacatataactggacacgaaacggaaatcccttttccaatacagaagattta
tcaaatctaggtcccggagattatcaaatcacggttaccgacgcaaacaattgtacacct
atagttcaaaattttcagattatagagcctcctgtattggatgtaagcctagtaaatcaa
gttgatattatttgttttggtgatgctacgggtgctattaatattaacactataggagga
agacaaatagaaatatctactggagtttttgattattcttattcatggacagggccaaac
gggtacacaagtaacctccaaaatctgtcaggattatttgctggaacataccatttaact
gtaactgataaatctggttgtacagatacattagaggttattttagatcaatctgatgaa
attattatagattattccacaaccgaaattgaatgctatggaaacaataatgcttctata
actatcgacaatatttcgggaggtaatccaccttataccatacaatggagtacgcttggt
tctggacctgtacagaacaatttatctgccgggacttatattattacaattacagacgat
accaattgtgagaaacaagcaactgttattatagatgaagctccggagttttcaattaac
ccaactgtagcgaatgtctcctgttatggagagaatgatgccaacattgccttaaatcta
gttggaggtatcgccccggtaacacttgtttggaatgacgatgcttctgccggtgtagaa
cgaaacaatttaagtccaggaacttattctgtaactattacagatgccaccccttgtatt
atatcggaaacctttgttatttcagaaccagatccgttagagttatctgctgttacaact
gatgctttagactgtgataatgctaatagcggagctattaatttaacagtaactggaggc
actcttccgttaagttattcatggtctaacggtgaaactaccgaagacttagacgctatc
cctcctggtactttttcagttgtgattaccgatgctaatggatgtgaaatatcaaacaat
tggacagttaacagatttgatccgcttactattgatgtagagactattaccgattttgat
tgtataactcgacatgtagaacaaacttttgttgccagagttaccggaggtatccctccc
tatcaaataagttggtcaagcggaacaattagtggtgctaataatgaaattatgaatacc
gatcaggatggtttagcaattgttagtgttattgatagttttggatgctcaacaaacttt
tcacataatgtggatattcctgttcttggcgatgcaggtttcgaactaaattccattggt
tatacctcttttggaatatattcaaaaaaagaccctattcaatttacgaatactgctata
ggtgattacatttctattctttgggattttggagatggtaatttttccaatgaagaaaac
ccggagcatacttacactactgagggaggctatataataaagcaaactgtcacgtaccct
tttggttgtatttatgaaaaaatcatcacgttatctgttgaaaaaggatatagccttatg
atgcctaatgctttcacaccaaataacgataatataaatgattttttcaatccagcattt
gttgggttaaacaatatggttttagatatctatgacacctggggaagtttaatctattcc
gaaaaaggagacgatattgatggctggaacggtaaaataaatgatgctgatgcagaaaac
ggtaattattactttaaattttccgctaagactttttatggagaaaccattacaaaagaa
ggccctgttgtattaattaagtag

DBGET integrated database retrieval system