Abyssalbus ytuae: MQE35_04065
Help
Entry
MQE35_04065 CDS
T08292
Name
(GenBank) SusC/RagA family TonB-linked outer membrane protein
Organism
fbm
Abyssalbus ytuae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CarbopepD_reg_2
Plug
TonB_dep_Rec
CarboxypepD_reg
SMUBP-2_HCS1_1B
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UOB18471
UniProt:
A0A9E7A2B1
LinkDB
All DBs
Position
complement(991028..994147)
Genome browser
AA seq
1039 aa
AA seq
DB search
MKVNNFWMMLVFLLLGFSLTLAQEKLITGNVTDDLDLPLPGVNVFIKGTSTGTQTDFDGT
YSISAAPGQVIVFSFIGQMTEERTVGQSNVINVQMTEDTQALEEVVVTALGIERKPKELS
YSVQEVGGEEVNKTKAVNAATVMVGKVSGLQVNTTNNGVNPNTRVVLRGNRSLLGNNEAL
IVIDGYPSSRGVLDRINPSDIADISVLKGANASALYGSDAANGVILISTIKGKGKLNLTY
TTSYQEESVSYMPELQDKFGAGGFPDGTLYPLENVNWGPRFDGRLVEASETYEDGRVWLV
PFTPIKDNHKNFFNRGSTVRHGLTVQGGDDISDFMFSLDQTNVKGIVPKDTYNRTNVRLK
ASRNFEKFEIGGNFSFFRSHANVVSDVGGRQGRPLYWNVLNTPLHIPITEMKNWRTGEFT
RNEVSYYRFYENPYFIVDTQREKTDYQEFTIIAHMKYDFTDWLNLNWRGGYTGGSENFKR
ELGAFTYAFHVPHPYSEMDPYGASVYDETSNTTRFNSDVILNITKDIDEHFSVNANIGQN
IRLTTYKAVNVSGENLIIPDFYNVSSRTGDLAGGEESQLYRKAGVYGDLTIGFNDYLFLN
VTARNDWSSALPKDEQSYFYPGGGISFVVSDAFPGIKGDKGLSYLKASFNITETGNDPRP
YVTNPVFYAPNDNSANYDDEPYSFPYGSTVGLAQSYRESAPDLNPEFTTAYEAGLEFGLF
KSRLNGNITLYQTNTTDQIVPINIAPSSGATSIWTNIGEIQNQGIEIDLLAKIFRNKDFK
WEVGVNYSGFKSEVLSLTGGVNMVDIGGFSTAQIVAEVGKPYPQIRTTAYERDDQGRVIV
GDDGDPIQSSELVTQGKTTPDYIIGLNTNIQFKNFSFYAVADYRTGHVFYNSIVDALEFT
GLTKHSASSNREPFIFPNSSYSDGNGGYVANTDRPTSSGGNSFWDAYNDVKENYVTDATT
LKIREVALTYNFDEHLMDKIGLQNLSIGVFGRNLFTFRPAENVYTDPEFNFTTGNAIGVG
TQSQTPPTRQYGITLTAKF
NT seq
3120 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaagtaaacaacttttggatgatgctggtgtttttgctacttgggttttcattaaca
ctggcgcaggaaaaattaataaccgggaatgttaccgatgatttggatcttccgcttccc
ggtgtaaatgtgtttattaaaggaacttctaccggaacacaaacggattttgacggaact
tactccatttctgcagccccggggcaggttattgttttttctttcattggtcagatgacc
gaggagcgaacagttggacagtcaaatgttattaatgtgcaaatgactgaagatacccag
gcactggaagaagtggtggttactgccctgggaattgaaagaaagcctaaggagttatcc
tattcggtgcaggaagttgggggagaagaggtaaacaaaaccaaagctgtaaatgcagcc
actgtaatggtaggaaaagtttccggcttacaggtaaatactaccaataacggagttaac
cccaatacacgtgtggtacttaggggaaacagatccttgttagggaataatgaagcatta
attgttattgacggttatccttcttccaggggggtacttgacaggattaacccaagcgac
attgccgatataagtgtacttaaaggggcgaatgcctcggctttatacggttctgatgca
gcaaacggtgttatccttatttcaactataaaaggtaaaggaaaattaaatcttacttat
actacttcctaccaggaggaaagtgtatcatatatgcccgagcttcaggataaatttgga
gccggtggttttcccgacggaacactttacccgttggaaaacgtaaattggggccccagg
tttgacgggcggctggttgaagccagtgaaacctatgaagatggcagagtttggctggtg
ccttttacccctattaaggataaccataaaaacttttttaacagggggtctaccgtgcgt
catgggctaacagttcagggaggtgatgatatcagtgattttatgttctctcttgatcag
accaatgtaaaaggtattgttcctaaagatacttataaccgaaccaacgttagattaaaa
gcaagcagaaactttgaaaaatttgaaataggaggaaatttttccttcttccggtctcat
gcaaatgtggtttctgatgtagggggcagacagggcaggcctctttactggaatgtatta
aatactcctttacatattccgattacagaaatgaaaaattggagaacgggtgagtttaca
agaaacgaagtttcttattacaggttttatgaaaatccctattttattgtagatactcaa
agagaaaaaaccgattaccaggagtttaccattatagcccacatgaaatacgattttaca
gactggttaaatttgaactggagaggtgggtatactggcggatctgaaaattttaagcgg
gaattaggtgcttttacctatgcatttcatgtccctcatccgtattccgaaatggacccc
tatggtgccagcgtatatgatgaaacaagtaatactacccggtttaacagtgatgttatc
ctgaatattacaaaagatattgatgaacatttctcggtaaatgcaaatatcgggcaaaat
atccgtcttactacttataaagcggtgaacgtatcgggtgagaaccttataattcccgac
ttttataatgtttcctcccgtactggtgatctggccggaggagaagaatctcagctttac
agaaaagcaggtgtatacggcgaccttacaattggttttaatgattacctgtttttaaat
gtaacggcaagaaatgactggtcttctgccttacccaaagacgaacaatcttacttttat
cctggaggagggatttcatttgtagtgagcgatgcatttccggggattaagggagataag
ggactcagttatttaaaagccagttttaatattaccgaaacaggaaatgacccccggcct
tatgtgactaatcctgttttttatgcgcctaatgataatagtgcgaactatgatgatgaa
ccttatagttttccttatggcagtacagtggggttggcacaatcttacagagaatcggct
cctgacctgaatcctgaattcaccactgcttatgaagccggtttagagtttggtttattt
aaaagcaggttaaatggtaatattactttataccaaaccaacactaccgatcaaattgtg
cctataaatattgcaccttcatccggggccactagcatatggaccaatattggcgaaatt
caaaatcagggtattgaaattgatttgctcgctaaaatcttcagaaataaagattttaaa
tgggaggtaggggttaattattcaggttttaaatcagaagtactctccttaaccggcggt
gtgaatatggtagatatcggaggtttttctactgctcaaattgtagcagaggttggaaaa
ccttatccgcaaataagaactaccgcttatgaaagagatgaccagggaagggtaatagta
ggagatgacggagaccctatacaaagcagtgaattagttactcagggaaaaacaactcct
gattatataatcgggttaaataccaacattcaatttaaaaattttagcttttatgcagta
gccgattaccgaaccggccacgtattttacaacagtattgttgatgcccttgaatttacc
gggcttaccaaacatagtgcaagctcaaaccgcgaaccttttatttttccgaattcttct
tattctgatggaaatggagggtatgtagccaataccgatcgtccaacttccagtggaggt
aactctttttgggatgcgtataatgatgttaaagaaaattatgtaactgatgcaactacc
ttaaaaataagggaagtagcacttacttataattttgatgagcatttgatggataaaata
ggtttacaaaacctttctataggggtgttcggaagaaacctgtttacattcaggcctgct
gagaatgtgtatacagatcctgaattcaactttactaccggtaatgccattggtgtcggg
acacaatcccagactccacccacaagacagtatggaattactttaactgctaaattttaa
DBGET
integrated database retrieval system