Flavobacteriaceae bacterium AU392: D1817_05215
Help
Entry
D1817_05215 CDS
T09691
Name
(GenBank) ABC transporter ATP-binding protein
KO
K18890
ATP-binding cassette, subfamily B, multidrug efflux pump
Organism
fbq
Flavobacteriaceae bacterium AU392
Pathway
fbq02010
ABC transporters
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
fbq00001
]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
D1817_05215
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
fbq02000
]
D1817_05215
Transporters [BR:
fbq02000
]
ABC transporters, eukaryotic type
ABCB (MDR/TAP) subfamily
ABCB-BAC subgroup
D1817_05215
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_membrane
ABC_tran
SMC_N
AAA_22
RsgA_GTPase
Zeta_toxin
DEAD
MMR_HSR1
DUF87
AAA_29
AAA_30
Dynamin_N
AAA_23
bpMoxR
AAA_18
AAA_16
AAA_28
2TM
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AXT19291
UniProt:
A0A3A9US88
LinkDB
All DBs
Position
1167351..1169120
Genome browser
AA seq
589 aa
AA seq
DB search
MAKKGEGVFDISLFKRLFKFIKPYQFVFYVTFFAVIGLSVFGAARPYVLQQAIDNNIEKQ
LTEGFLLYIVIILSLLVLEVVCNLLFIYYATWLGQSVVRDIRVKLFKHILGFKMKYYDNS
SIGVLITRAVSDMERIGDIFSQGLFMIFSDLLKMAVVGVVMFYMNWRLSIIVFCTLPIVI
IATKIFQRFMKKAFEEVRTEVSNLNSFVQERVTGMKILQLFTRESIESKNFKAINERHKK
GWLKTVWYNSIFFPIAELLSSIALGLVVWYGGADIIKGTSITTLGNLTAFVMFIPMIFRP
LNQIANKFNTLIMGMVAADRVFKILDTSANIEDTGKATAGHFKGDIVFKNVKFSYVENEE
VLKGISFNVKAGSTIAIVGSTGAGKSTVINLLNRFYDINSGDILIDNTNINTVTLSSLRQ
QIAVVLQDVFLFADTILNNITLNNPEIHENQVIEAAKQIGIHDFIMSLPNGYHYNVKERG
VMLSSGQRQLISFLRAYVTNPSILILDEATSSVDSYSEQLIQDATDKITENRTSIVIAHR
LATIKKADNIIVMDAGKIVEQGTHDELLNVDNGYYKNLYEVQFMKEEVA
NT seq
1770 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctaaaaaaggagaaggtgtttttgatataagtctttttaaacgattatttaagttt
attaagccttatcaatttgtgttttatgttacattttttgctgttataggattatcagtt
tttggagcagcaagaccatatgtattacaacaagcaattgataataatatcgagaaacag
cttacagaaggatttctgttatatattgttataatacttagcttgttagtgttggaagtt
gtttgtaacctcttatttatttattatgcaacttggctaggacaatctgtagttagagat
ataagagtaaagttatttaaacacatccttggttttaaaatgaaatattacgataattct
tcaataggagttttaattactagagctgtgtctgatatggagcgaattggagatattttt
agtcaaggactttttatgatatttagtgatttacttaaaatggcagtagtaggtgtcgtt
atgttttatatgaattggcgtttgagtattatagtattttgcacattgcctattgtgatt
attgctaccaaaatttttcaaagatttatgaaaaaagcctttgaagaagtacgtacagaa
gtgtctaatttaaattcgtttgtgcaggagcgcgttacaggaatgaaaattcttcaatta
tttacaagagaaagtatagaatctaaaaattttaaagccattaatgagcgtcacaaaaaa
ggttggctaaaaacagtttggtataattcaatatttttcccaattgcagaattattatcc
tcaattgcattagggttagtagtatggtatgggggagcagatattattaaaggaacatcc
ataactacattaggtaatcttactgcttttgtaatgtttataccaatgatttttagacca
ctgaatcaaatcgcgaataaatttaatactttaataatgggtatggtagctgctgatcgt
gtttttaaaattttagatacttcggcaaatatagaagatacagggaaagctaccgcaggt
cattttaaaggagatattgtatttaaaaatgtgaagttctcgtatgttgaaaatgaagag
gttttaaaaggaatttcttttaatgtaaaagcaggatctacaattgcaattgtaggctct
acaggggcgggaaaatctacagttattaatttattaaatcgtttttatgatattaattct
ggcgatattttaatagataatactaatattaataccgttacattaagttcgttacgtcaa
caaatagcagttgttttacaagatgtatttttatttgcagacactatattaaataatatt
acccttaataatccggagattcatgaaaatcaggttatagaagcagccaagcagataggc
attcatgattttattatgagcttgccaaatgggtatcattataacgtaaaagaaagagga
gtaatgttatcgtcaggacaacgacaattaatttcttttttaagagcatatgttaccaat
ccgagcatattaattttagatgaagcaacttcttctgtcgattcttattcagaacaactg
atacaagatgcaacagataaaattacagaaaatcgtacgtctattgtaatagcacatcgt
ttagctacgattaaaaaagcagataatattattgttatggatgccggtaaaatagtagag
caaggtactcacgatgagcttttaaatgttgataacggttattataaaaacttatatgaa
gtgcaatttatgaaagaagaggtggcttaa
DBGET
integrated database retrieval system
