Flavobacteriaceae bacterium AU392: D1817_06720
Help
Entry
D1817_06720 CDS
T09691
Name
(GenBank) OmpA family protein
Organism
fbq
Flavobacteriaceae bacterium AU392
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
OmpA
TSP_3
OMP_b-brl
DUF748
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AXT19576
LinkDB
All DBs
Position
complement(1479552..1480871)
Genome browser
AA seq
439 aa
AA seq
DB search
MRSFVLLITVIACSLNFQETHAQDALNKWSITLGLNAVINPVRVDLPNEIDRFETFNLDP
AGFKLNVSRYLGAGFSFGAVGSINNVDTNDNSGDELAYISVDGAFKYNLSKGLIFRPYLT
TGGGYSWLDDVGAPTANGGIGFNIFITNNFGVNVEGIYKYTFRSTGVQHQQYSAGLIYKF
GAKDKDKDGIKDDEDDCPDEFGLLKFNGCPDTDGDGVKDSEDACPDMAGLKELNGCPDTD
GDGIKDLEDECPEIAGPKNLRGCPDSDGDGVPDKFDSCPDIKGATNNRGCPIPDTDNDGV
DDSKDKCPNQAGPANNAGCPIQKAKDQLVFKRITFEYGKVGLTQDNKTILDEIATTINLN
SGKIFHIAGHADNTFSDEHNLNLSRQRAEIVKNYLVQKGVDEARLTVKGYGETRPLDPND
TESDEARAKNRRVEIFQLN
NT seq
1320 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagatcatttgttctactaataactgttatcgcatgtagtttaaattttcaagaaaca
catgctcaggacgcattaaataaatggagtattaccttaggccttaatgccgtaataaat
cctgttagagttgatttacctaatgaaatagatcgttttgaaacatttaatttagatcct
gctggatttaaacttaatgtttctagatatttaggagctggattctcatttggagccgtt
ggttctattaataatgttgatactaacgataactcaggagatgaattagcatatatttca
gtagatggagcgtttaaatataatttaagtaaagggttaatatttagaccatatctaact
actggtggaggttattcttggttagatgatgttggagcgccaacagcaaatggcggtata
ggttttaatatttttattactaataattttggagttaatgtagaaggtatttataaatat
acttttagaagtacaggagtacaacatcaacaatattcagctggtttaatctacaagttt
ggagctaaagataaagataaagatggtattaaagatgatgaagatgattgtccagatgaa
tttggcttattaaaatttaatggttgcccagatacagatggtgatggtgttaaagattct
gaagatgcatgtccggatatggctggtttaaaagaattaaatgggtgtccagatacagat
ggtgatggtattaaggatttagaagatgaatgccctgaaattgctggtccaaaaaactta
agaggctgcccagattcagatggagacggagttccagataaatttgatagttgccctgat
attaaaggagcaaccaataataggggttgtccaataccagatacagataatgatggtgtt
gacgatagtaaagataaatgtcctaatcaagctggacctgcaaacaatgctggttgccct
attcaaaaagctaaagatcaacttgtttttaaaagaataacttttgaatatggaaaagta
ggacttactcaggataataaaacaattttagatgaaattgctactaccataaatttaaat
tctggaaaaatatttcatattgctggacatgcagataatactttctctgatgagcataat
ttaaatttatctaggcaaagagctgaaatcgttaaaaactatttagttcaaaaaggagta
gacgaagctcgattgactgtcaaaggttatggagaaactaggcctttagatccaaatgat
acagaatctgatgaagctagagcaaaaaatagaagggttgaaatatttcagcttaattaa
DBGET
integrated database retrieval system