Flavobacterium branchiophilum: FBFL15_0487
Help
Entry
FBFL15_0487 CDS
T01625
Name
(GenBank) Protein of unknown function precursor; putative adhesin
KO
K20276
large repetitive protein
Organism
fbr
Flavobacterium branchiophilum
Pathway
fbr02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
fbr00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
FBFL15_0487
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CHU_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CCB68606
UniProt:
G2Z5A0
LinkDB
All DBs
Position
complement(573293..579859)
Genome browser
AA seq
2188 aa
AA seq
DB search
MLKKIILHMFLMSFVSFYGQSITVNTTTYTVPQLVQNVLFGATAQNSCAGGVTNITWSTG
SNFNSTNGIGYFQNTNPNFPLANGVILSTGNVLSAAGPNSGTQSNGSGNWPGDTQLFNYI
DGLGIDADLNSYNNATVLEFDFVPFSSSMSFDFLFASEEYGTFQCDFSDAFAFFLTDVTA
GTAPINLALVPNTNTPIAVTTIRNNANNNACPSANSQYFGLFNGGTAATTASNNFNGQTV
KMTAQSAVVPFNNYHIKLVIADRNDSQYDSAVFLGGGSFNVGTADISGTGIYSNTHSFLI
AEGNAVCPNKTLQLKASATPIPNITYTWEKNNVVLPGETSYNLTVTTEGTYKANLIFSPT
CIQSDECVVEYNSELDLTTPTATQSTICQSSSTFNLNQFVPIILNGLSAADYEVFFYTSS
ANAQAGTNHITNLNAYPGTDNQTIYVSVTDLIGSNCTEYRQFQLHINPLSDAVVSGTATV
NLNSSSPSVTFTGSGGVAPYTFTYNINGGTSQQITTTTGNSVSITVPTNTLGVFNYNITS
VTSANNCPKAVSQTATVTVLSLPTATIAGTTATCLNDASPNITFTGANGVAPYTFTYNIN
GGANQTVSTTTGNSVTVAAPTTSAGTFAYNLVSVADSGSPSQSQTQSGTATITVNNPVNA
GTDGTTTVCITDTTSINLFSLITGEQTGGVWTRTSGTGGTFTAASGTFVPTNATNSTFVY
TLTAASPCVDDSSQVTVNISPASNAGTDGSTTVCENSTTAINLFDLITGEQSGGVWSRTS
GTGGTFTAASATFVPTNATNSTFTYTITGTSPCPDDSSLATVNVNAVANAGTDGNTTICV
DATAAVNLFSLITGEQTGGVWTRTSGVGGTFNATTGTFTSSLGATTSQFKYTVAGSAPCL
DDFSMATININEVPNAGTDGILTICETSTTTINLADILLGEQSGGVWTRTSGTGGTFNAA
AGTFVPAPGASSSFTYTVAGVAPCVDDTALATVTILSAPAFNTPVALQVCDDNNDGVACF
TLSNATPQITNNNASLTVTYHVTLTDAQTGEQPLPNTYCNITTPFSQTIYVRIFDPLAPA
CFSTSSLQLIVNPRPIPNVNLTDYVLCDNTAPTNDGIETFDMHAKDAEIANGLIGTVIKY
YSSLADAQNQTNALPNFYTNTTSPNQQTVYFRIQYPGTGCFSIGNFKLIVKPLPLVPSSF
TSMTLCDANAPLGFENFDLTSQITTLLNGQTGMNVTFYPSLPDANANTNAILPANWSSYT
NVSAYSQTLGIKLTNVITGCSNISTMDLIVNPLPMPVVPTTPLAICDTNQNGQYFFDLTT
LTANILAGALNVTITYHETLSDAQTGSYPIANPQHYENSGALVQFIYASAVNQYGCRKAI
TIELNVNIAPIVPGSGSIANLTKCDQTDSNNQDGLTLFDLTQQTAGLLALQTSAASNYTV
TYHLTQADALTGANPIVNAAAYYNISNPQTIWASIKRNSTNCRNITRFDLIVNLPLALTI
PTALSVCDTDANPNDQFYTFDLTLKNNEITQGLTGYTVTYYPSYSNPQTGTPIANPTAYT
NTTPFAQTLGVMVTNNATGCKSWTKLDIRVLPIPTPRTTGIPSLGTQCAYNYTDPNNPLD
VPLSVFNLTVNATYIMNGDPNLILRYFRSYAEATAVPPVNEILNPTAAAVAGDVWIRVEN
TRTDYQGQHCFVMVKQTLTVNPRPTVATLPVYKICDDNSDGLAQFDLQPKIALLLGTSQL
PANFTLTFHALQTEAQNGTNALPLLFTNTTPHSQTIYVRIVNNATGCTNEIGTLTLIVED
RARATGPQNFATCDNYGDPYDGIGKVDLTQFDGLILNGQDPATFVLSYFTNPTDLANDTN
ALTLVQAQNYVTPAPSSAGVNPVLSTIYVKVTNTNNIYLPKCTDFTTINIKIERYPNPII
QTNNGYNYICVDYLTKKVVRPLTLDSQVTGDYTYVWYVKEGAAVPQVIPGATGATYTIEN
GDISVNDAVRTFSVKVISNSTLGCTTTSVGFDVYQSGPAAPIAGVSYTITNAFESNQIIE
ATVAGYGTYLYSLDDGPQQVSPKFENVSLGSHTLWVWDIEGGNQSCDPYTILDVETIDYP
HFFTPNGDGFNDTWNITGLKSQPNTKIYIFDRNGKLLKQLSATSVNQNEGWDGTLNGAQL
PSTDYWFTVDYIEKTLAKQFKAHFSLKR
NT seq
6567 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttaaaaaaaatcatattacacatgtttttgatgagttttgtatctttttacgggcaa
tcaataacggttaacacaacaacatatacagttccacaattggttcaaaatgtattattt
ggtgccacggctcaaaatagttgtgcgggaggtgtaaccaatatcacttggtccacaggg
tcaaattttaattcaacaaatggaattggttatttccaaaataccaaccctaattttcca
ttagcaaatggtgttattttaagtacaggcaatgtgctttcggctgcgggtccaaattct
ggcacacaatctaacggttctggtaattggcctggcgatactcaattattcaattacatt
gacggtcttggaattgatgcagatttaaatagttacaataatgctactgtattggagttt
gattttgtccctttctcttcatcaatgagtttcgactttttatttgcttcagaagagtac
ggtacttttcaatgtgatttttctgacgcttttgctttttttcttacagatgtaactgcg
ggaactgctcctataaatttagcactcgttcctaataccaatacacctattgcagtaacc
actattagaaataatgcaaataataacgcttgtccgtcggcaaattcgcaatattttggt
ttgttcaatggtggaactgctgcaacaactgcctcaaacaattttaatggacaaacggta
aaaatgacagcacaatctgcggtggtacctttcaataattaccatatcaaattggtaata
gccgacagaaatgacagtcaatacgattcagcggtatttttaggcggcggtagtttcaat
gtaggtactgcagatatttctggaacgggcatatattcaaatacccatagttttttaatt
gcagagggcaatgctgtatgtcctaataaaaccttacagttaaaagcaagtgctacaccc
attcccaatattacctatacatgggaaaaaaacaacgttgttttgcctggcgaaaccagc
tacaatttaacggttacaacagaaggtacttataaagccaatttaatttttagtcctacc
tgtatccaaagtgatgaatgtgtggtagaatacaattctgaactagatcttaccaccccc
acagcaacacaatcaactatatgtcagtctagtagtacatttaatttgaatcagtttgta
ccaatcatcctcaatggattgtcagcggctgattatgaagtatttttctatactagtagt
gccaatgctcaagcgggtaccaatcacattaccaatttgaatgcttatccgggaacagac
aatcaaacaatttatgtatctgtaaccgatcttataggttcaaattgtacggaataccga
caatttcaattacacatcaaccccctttccgatgccgttgtaagcggtacggctactgta
aacttaaacagcagcagtccgtcggttacttttacggggagtggtggcgtagctccttat
acgtttacctataatattaatggaggcacaagccaacaaataaccactactactggcaat
agcgtgtccataactgtgcctaccaatactttaggggttttcaattacaacataacaagt
gttaccagtgccaataactgccctaaagcggtgagtcaaacggctacagttactgtttta
tcgttgccaacagctactattgctggcacaacagccacttgtttgaacgacgcatcacct
aatattacttttacaggtgccaatggcgtagctccttacacttttacatacaatattaat
ggaggtgccaatcaaaccgttagcaccactacgggcaattctgtaacagtggctgcacct
acaacttcagcaggaacttttgcttacaatttggtatctgttgccgattctggaagtcca
tctcaaagtcaaacccaatctggaacggccaccattacagtaaacaaccctgtaaacgca
ggtaccgatggtactaccacagtttgtattacagataccaccagcatcaatttgttcagc
ttgattacaggcgaacaaacaggcggcgtttggaccagaaccagcggcacgggcggtact
tttacggctgcatcgggtacttttgttcctaccaatgctaccaatagcacctttgtttat
acattaactgccgcttcaccttgtgttgatgattcaagtcaagttactgtaaacatcagt
ccagcatccaatgccggcaccgatggcagcactacggtttgcgaaaacagtaccactgct
atcaatttatttgatttgattacaggcgaacaatcgggtggcgtttggagcagaaccagc
ggtacgggtggtacttttacggctgcatcggcaacttttgtgcctactaatgctaccaat
agcacctttacttataccattacgggtacttctccgtgtccagacgattccagtttggct
actgtaaatgttaatgcggtggccaatgcaggtaccgatggcaacaccaccatttgtgtt
gatgctactgctgctgttaatttattcagtttgattacaggcgagcaaacaggcggggtt
tggaccagaaccagcggggttggtggtactttcaatgccacaacgggtacttttacctct
agtttgggggctacaacaagccaattcaaatatacagtggccggtagcgctccttgttta
gacgattttagtatggccaccatcaacatcaacgaagtgcccaatgccggtacagacggt
atactaaccatttgcgaaaccagcaccactaccatcaacttggcagacattttgttgggc
gaacaatcaggcggggtttggacaagaacctctggcacaggtggcacattcaatgctgct
gccggtacatttgtgccagctccaggggcttcgagcagttttacttacaccgttgcaggt
gtagctccttgtgtggacgacacggctctggccacggttaccattttatcggctccagcc
tttaacacacccgttgcccttcaggtttgtgatgacaataacgacggtgttgcttgtttt
acgctaagcaatgctacaccacaaattaccaacaacaacgcctctttaaccgttacttac
cacgtaacgctaaccgatgctcaaacaggcgagcaacccttgcccaacacctattgcaac
attaccacacctttttctcaaaccatatatgtacgaatattcgatcctttagctcctgct
tgtttctctacaagctccttgcaactgattgtcaatccgcgtccgattccaaatgtgaat
ctgaccgattatgtgctttgcgacaacaccgctcctacaaacgatgggattgaaactttt
gacatgcacgccaaagatgctgaaattgccaatggccttattggaacggttatcaaatat
tacagctccctagccgatgctcaaaaccaaaccaatgctttacctaacttttataccaat
accactagccccaaccaacaaacggtttatttcagaatacaatatcctggaacgggttgt
tttagtattggcaattttaaattaattgtaaaaccattaccccttgtaccttcgagcttt
acatcaatgaccctttgcgatgctaacgctccgttgggatttgaaaattttgacttgacc
agccaaattaccacccttttgaatggacaaacaggcatgaatgttactttttatcctagt
ttgccagatgccaatgccaataccaatgccattttgccggccaactggagcagttatacc
aatgtatcggcatattcacaaaccttgggtataaaattaaccaatgtcattacaggttgt
tccaatattagcaccatggatttgattgtcaatccgttgcctatgcctgttgtaccgaca
acacctttggccatttgcgataccaatcaaaatggacaatacttttttgatttgacaacc
cttacggccaatattttggcgggtgctctaaacgttaccattacttaccacgaaaccttg
agcgatgcccaaacgggatcttatcctattgccaatccgcaacattatgaaaacagtggg
gctttggtacaatttatttatgccagtgccgtaaaccaatacggttgcagaaaagccatt
acgatagaattgaatgtcaatattgcaccaattgtgcctggttctggaagtattgccaac
ttgacaaaatgcgatcaaaccgatagcaacaaccaagatggtttaaccctttttgatttg
acccaacaaacggcaggtttattagccttgcaaaccagtgccgctagcaactatactgtt
acttatcatttgacacaagccgatgccctaacgggtgccaatccaattgtaaatgcagct
gcttattacaacataagcaacccgcaaaccatttgggccagcatcaaacgaaacagcacc
aattgtagaaacattacccgctttgatttgattgtcaatttgcctttggctttgactatc
cctacggctttgagtgtttgcgacaccgatgccaatccaaacgaccagttttataccttt
gatttgacccttaaaaacaacgaaattacccaaggtttgacgggctataccgtaacatat
tatccaagttacagcaacccgcaaacgggaacacctattgccaatccaacggcttatacc
aacaccacaccatttgctcaaacgctgggtgtaatggttaccaacaatgctactggatgc
aaaagctggaccaaactcgacataagagtcttgccaataccaacaccaagaacaacgggt
attcctagcctaggtactcaatgtgcttacaattacaccgatcccaacaacccgttggat
gtgccattgtcggttttcaatttgacggttaatgctacttatattatgaatggcgatccg
aacttgatcttgaggtatttccgttcttatgcagaggcaacagccgtgcctcctgtaaac
gaaatcctgaacccaacagccgccgccgtggctggcgatgtgtggattcgtgtagaaaat
acccgaacagattaccaagggcaacattgttttgtgatggtaaaacaaacactaacggta
aacccaagaccaactgtggctacattgcctgtttataaaatttgtgacgacaacagcgat
ggtttggctcagtttgatttgcaacccaaaatagctttattattaggcacatcgcagttg
cccgctaactttacccttacctttcatgccttgcaaaccgaggcacaaaatggaactaat
gctttgccgttgttgtttaccaacactacgccacacagccaaaccatttatgtaagaatc
gtaaataatgccacgggttgtaccaacgaaattggcaccctaacccttattgtagaagac
agagccagagccactgggcctcaaaattttgcaacctgcgacaactatggcgatccttat
gacggtattggcaaagttgatttgacacaatttgatggtctaatactcaatggccaggat
cctgctacttttgtattgtcctattttacaaaccctaccgacttggccaatgacaccaac
gcattgactttggttcaggctcaaaattacgttacgcctgccccaagtagtgcgggtgta
aaccctgtgttgtccacgatatatgtaaaagtaaccaacaccaacaatatttatttgcca
aaatgtacagattttacaaccatcaacatcaaaatagagcgttatcctaatcctatcatc
caaaccaataatggctacaactacatttgtgtggattatttaaccaaaaaagtagtaaga
ccccttacgctagacagtcaggtaacgggcgattatacctatgtgtggtatgtcaaggag
ggagcggccgttccgcaggtaatacctggagctacgggggctacatacaccatcgaaaac
ggggacatctctgtgaatgatgccgtaagaacatttagtgtcaaagttattagcaacagt
actttgggctgcacgactacctctgttggttttgatgtatatcaatcagggccagcggct
ccaatagctggggtgtcttatacgataaccaatgcttttgagagcaatcaaattatagag
gccaccgtagcgggttatggaacttacttgtacagcctagacgatgggccacaacaggtg
agtcctaaatttgaaaatgtgagccttggctcgcacaccctttgggtatgggacattgag
ggaggaaatcaaagttgtgatccttacacgatattggatgtagaaaccattgattatccg
cacttttttacaccaaatggcgatggatttaatgatacatggaatattacgggtttaaaa
tcgcaacctaacacaaaaatttatatctttgaccgcaacggaaaactactcaaacaattg
agtgctacctctgtaaatcaaaacgaaggttgggacggaaccctaaacggagcacaactc
ccttccacagattactggtttacagtagattatattgaaaaaactttagctaaacaattt
aaagcccatttctcacttaaaagataa
DBGET
integrated database retrieval system