Flavobacterium branchiophilum: FBFL15_0723
Help
Entry
FBFL15_0723 CDS
T01625
Name
(GenBank) Superfamily II DNA/RNA helicase
Organism
fbr
Flavobacterium branchiophilum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SNF2-rel_dom
Helicase_C
ResIII
DEAD
SWIM
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CCB68831
UniProt:
G2Z658
LinkDB
All DBs
Position
844913..848575
Genome browser
AA seq
1220 aa
AA seq
DB search
MDFNYIDDYIDENCEFIIENRAKKINTFLIEQSKHGFVFKCKGSAGNLYEIHIDITPQLV
SDTTCNCPYDYDGICKHIVASLMSLKKMLISGVVTFYQPDMEYENTDSMSKPKLKGHEIL
LINDLIPIKELDRRISKSYYANKEYLIEQVTRTSIKTRSNNWNSIGQTFTFNPENQILSS
SCSCTSAQKWCEHRLYALEKFVSVYDVAFFSAEYINNSIEEHLKVFGFSIHEPYEDFFDV
VFTPKGLRVVSKFQNVLPSEQVVSNTNPEQAILAQLPTNTAAASLQKGIGLCFEKNNSNF
FSLFPILGKYNKAKTDFSSGIEELQYFNLEYNIDDLITTEDQFFVLNVLKLSNLIQKNKE
ITFEYIVKLMTVFTKIIPELPQRFLYSNRPNDSYARKNLSPLVFNQPEIKLFFVLTETDM
FYNLKAKIRIDDNNFNINAQKLVLSPLFIFEGQNVYPITNADLSYHILTYADTPETNYFK
RDFERFNENILIPLSKKFEIQQKIFKKNKQTTPNKPLEKHVYIKDLDGAYILFDAFVQYD
KQLVPLFSNEMLLHKNQENITYLERDESFEDQFMDEIKSLHPDFENQNQLFYLTPEQLFD
NYWMLQATEKMKLMGFKVFGANDLKSFKYNMNKPVISIGLKSDIDWFDLELQISFGNQKV
DLKELQKSYIKKSNFVALSDGTVGILPEDWLQKFGNYFKAGEIKKNSIQISNYQFGIIDE
LYHEVESKPSFLKELFEKKQRLQHLSEIANVASPKGLQVKLRDYQQHGLNWLVFLHQNQL
GGCLADDMGLGKTLQTIAFLQYLKTTQKAKTPSLIIAPTSLIFNWINEIEKFCPTLKVLP
FVGSGRATSTAEFKKYNIVISTYGSLLNDIEFLKDYVFNYVILDESQAIKNPNSKRYKAV
RLLQSFNKLTLTGTPIENNTFDLYAQLNFLNPGLLGSMSHFKSQFSDTIDKEKDVESSVL
LSKIIAPFVLRRTKEQVAKELPDKTESVIYCDMSKEQRKVYEAFKDKYKDYLLNKIDENG
VAKSQMYILEGLTKLRQICNSTELINDDVDYGNYSAKLEILIETIKEKTGNHKILVFSQF
VKMLQIVRKRLDDEQITYEYLDGQTQNRQQNVNNFQTNSSVRVFLISLKAGGTGLNLTEA
DYVFIIDPWWNPALENQAIDRCYRIGQTKQVMAYRMICRDTIEEKIVSLQTKKKAVASSI
ISIDDEKKSFNIDEVKELFG
NT seq
3663 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattttaattacattgacgattacattgatgaaaattgtgagtttatcatcgaaaat
cgagccaaaaaaatcaatacttttttgattgaacaatctaagcatggatttgtttttaaa
tgtaaaggaagtgcaggcaatttatatgaaattcatattgacataaccccacaattggtt
agtgatactacttgcaattgtccgtatgattatgacggaatttgtaagcacattgtagca
tcattgatgtcgttgaaaaaaatgttaattagtggcgtagtaactttttatcaaccagac
atggaatatgaaaataccgacagtatgagcaaacccaagttgaaggggcatgaaatatta
ttgatcaacgacttgataccaataaaagaattggatagaagaattagtaaaagttattat
gccaacaaagagtatctgatagagcaagttactagaacatccataaaaacccgatcgaat
aattggaacagcattggtcaaacatttacttttaatcctgaaaatcaaatattaagctct
tcttgtagctgcacatctgcccaaaaatggtgtgaacaccgcttatatgctttagaaaaa
tttgtgtctgtgtatgatgtggctttttttagtgctgaatatatcaacaatagcattgag
gagcatttgaaagtatttggattttcgattcacgagccgtatgaagatttttttgatgtg
gtttttacaccaaaaggacttcgagtggtatctaaattccaaaatgttttgccaagcgaa
caagtagttagcaatacaaaccccgaacaggcaattttagctcaactgcctaccaacaca
gccgccgcttcgttgcaaaaaggtattggtttgtgttttgaaaaaaacaattcaaatttt
tttagtttatttcctattttgggcaaatacaacaaagctaaaaccgatttttcatcaggc
attgaagaattacaatattttaatttagaatataatattgacgatttaataactactgaa
gaccaattttttgtattgaacgtgctaaaattatcaaatttaattcaaaaaaacaaagag
attacttttgaatatatcgttaaattgatgacagtatttacaaaaattataccagaattg
ccccaacggtttttgtatagcaacagaccaaatgattcgtatgctcgaaaaaatttatcc
ccattggtgtttaatcaacctgaaatcaaactcttttttgtgcttacagaaacagacatg
ttttataatttaaaagccaaaattcggattgatgacaataattttaatataaatgctcag
aaattggtgctttcgcccctttttatttttgaaggccaaaatgtttatccaataactaat
gctgatttgtcttatcatattttgacttatgcagacacacccgaaacgaattatttcaaa
agagattttgaacgttttaatgagaatattttgattccattgtctaaaaagtttgaaata
caacaaaaaattttcaaaaaaaacaaacagactacacccaacaaaccactcgaaaaacat
gtttatatcaaggatttagacggtgcgtatattctttttgatgcatttgttcagtacgat
aagcaattggtccctttgttttcaaacgaaatgttgttgcacaagaatcaagaaaacatc
acttatttggaacgtgatgagtcttttgaagaccaatttatggatgaaattaaaagtctt
caccccgattttgaaaatcaaaatcagctgttttatttgacacccgaacaattgtttgac
aattattggatgcttcaagctactgaaaaaatgaaattgatgggattcaaagtttttgga
gccaatgatttgaaatctttcaaatataatatgaacaaacctgtcatcagtattggatta
aaatcggatattgattggtttgatttggaattgcaaattagttttggaaaccaaaaagta
gatttgaaagaattgcaaaaatcgtatatcaaaaagtctaattttgttgccttgagcgat
ggcactgtaggaatattacccgaagattggcttcaaaaatttggaaattatttcaaagcg
ggcgaaatcaaaaaaaatagtattcaaatatccaattatcaatttggcattatcgacgaa
ttgtatcatgaagtggaaagtaaaccctcgtttttaaaagaattatttgaaaaaaaacag
cgtttgcaacacctttcagaaattgccaatgtggcctcgcctaaaggattgcaagtaaaa
cttcgtgattatcagcaacatggactcaattggctcgtttttttgcatcaaaaccagttg
ggtggttgtttggcagacgatatggggcttggcaaaacattgcaaactattgcttttttg
caatacctcaaaactacccaaaaagccaaaactccctcgttgataattgctcccacttcg
ttgatttttaattggattaatgaaatagaaaaattttgcccaacactcaaagttttgcca
tttgtagggtcgggtagggctacatctacagcagaatttaaaaagtataacattgttata
tctacttatggttctttgcttaatgatatagaatttctgaaagattatgtatttaattat
gttattttagatgaaagtcaggccattaaaaaccctaattccaaaagatataaagccgtt
cgattgctacaatcgtttaacaaacttaccctaacgggtacaccaatagaaaacaataca
tttgatttgtatgctcaattgaattttttaaatccaggattattgggaagcatgagccat
tttaagagtcaattttcagacactatcgacaaagaaaaggacgttgaaagctctgtattg
ttgagcaaaattattgccccttttgtattgagaaggaccaaagagcaagtggccaaagaa
ctgccagacaaaacagaaagcgttatttactgtgatatgagcaaagagcaacgcaaagta
tatgaggcatttaaggataaatacaaagattatttgttaaataaaatagacgaaaacggt
gtagccaaatcgcaaatgtacatcctagagggtttaacaaagttacgtcaaatatgcaat
tcgacagaactcatcaacgacgatgttgattatggaaactattctgcaaaactcgaaata
ttaatagaaactattaaagagaaaacaggaaatcataaaatattggttttttcgcaattt
gtaaaaatgcttcaaatagttcgtaaaaggttagacgacgaacaaattacatacgaatat
ttggatggtcagacccaaaaccgacaacaaaatgtaaataactttcaaaccaattcctcc
gttagggtgtttttgattagcttgaaagctggcggcacaggacttaatttgaccgaagcg
gattatgtttttatcatcgatccatggtggaatcctgcgttagaaaaccaagctatagac
cgttgttatagaattggacaaaccaaacaagttatggcctatcgcatgatttgcagagat
actatcgaagaaaaaatagtaagcttgcaaaccaagaaaaaagctgtagcctccagcatc
atcagtatcgacgacgaaaaaaaatcgtttaacatagacgaagtcaaagaattgtttgga
taa
DBGET
integrated database retrieval system
