Flammeovirgaceae bacterium: D770_19555
Help
Entry
D770_19555 CDS
T04058
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
fbt
Flammeovirgaceae bacterium
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Laminin_G_3
CHU_C
Big_9
Cadherin_5
Cadherin_4
Ig_7
Laminin_G_2
Sialidase
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AHM62162
LinkDB
All DBs
Position
4682581..4687497
Genome browser
AA seq
1638 aa
AA seq
DB search
MAQTVSTRNNYTGIWSQRASWEQNWGGIQNPSPLPEAQINLYGYISVGIYGATASLELPS
SANAVLNVYDTLRIHGSLIIGNYALLNIAPGGVLIVHGLYNQYNTARLTNKGTMIIKGDF
NIGNSAGPTESTGKIYVGEKVSPGARFLNPKTLADLALEHPVTHYFALSNVTASHCAGIN
SGTLSFSGTASSIVRWESSTDYFRSNVKHIANTSTQLVYSNLVRTTTYRVYYNAGNGIFL
YSNGATIMVEQPSSGGEISGTAEICTPGTPVTLTLSKHIGTVKRWEWSADNFATSPQSLT
TSAETITTDQLSTTTFVRVVLQSGSCGEVVSPTFKITAYSSANAGLIKGTAAICPGSNSG
TLTLENRNGDVIRWEVSNDAFAADIRPVSNTSDILTFSGLSRTTWYRAVVAAGGSCPVIY
TAPFEVTYLQDLTESQLAVAESQLPENGLLAYFPFINNAYDASGNQNHGLVAGATPAPDR
FGRENNAYHFNGVDDYITTSKQFPAPGPNEFSLSIWFKTSSTTGGKLIGSGTSQNGMSAQ
YDRHLYLNNLGQLYFGIYRPELQPDGAKIINSEEKYNDNIWHHAVATLSADGMKLYVDGA
LKASDARYTIAEDYSGYWKIGFDNTNNWPDAPTSHYFSGSLDDVYIYNRALSPVEILQLH
TISNGPFCEGANVQLRAVTVPGATYQWSGPGGWSSVLQNPVLNNVSAAQGGAYAVKVTVN
ACEFTGSTNVNLVPSLAGTIITSQASVCRGTNAGTLKLENYDGQIIRWESSADNFTSNKI
DIVHAGAEMSFENLTVTTSYRARVKHTTCGERYSAVTTVEVVEPSLGGTLDGAASVCKGT
NSGTLTLSGHRGQIQHWEFSNDGFVNHSESIAHTEPTYTFSNLASSRWYRAVVKNGECGV
AASTAVKIMVTEIVGGTVSGPAQVCEGSASGTLQLQGHIGTIKRWEKSNDGFKNNIQSIA
STQAQYTFADLSSDTWFRAVVSNAECGEQASAAHVVRAEQLSLGGTITGTSNVCTGTNTG
MLTLAGYRGKILRWEYSTDEFVSHIQAVANTSTIHTFSNLSQSRWYRAVVQNGSCAIAYS
ELFKITAAELAGGAISGPAVICQDANDGQLTLQDNFGEIVRWESSTDNFAENTQTVAHTA
ATYNFGRIAATTWFRAVVGNAECGETFSASWRVETEQPSLGGNLGGVTSFCSSTNSGSLQ
LLNQRGTILRWEASADNFISDVQILNHTAATYAYSNLSKTTSYRVAVQNGSCTAVYSSVA
TITLDAPSAAGVVSGTATVCWGENSGNLQLESKLGAVIRWERSADNFTTITPIASTENTI
SYQNLTTTTAYRAVVQNGSCPPVFSQPATITVKPQLEAGRITGSKVVVSGSNSGELQLEG
YSGTILFWEASTDGFVAHAERIENTTAVQHFQDLTQSTWYRAALQSDDCAPVYAQAAKIT
VNHAPLAQPDYFEVEEEQYTPSVSVLQNDSDPDGNGLRVVPVQLQTAAGGTAAINSDGFL
TYQPTAHYIGMDSLRYTVCDGVTGAELCSEAVIVLDVRLPLPGLIVYQGVSPNQDNSNDY
WRIEHIERYPENLVRLYDRFGALVFEQQGYNNTDKIFTGQGNKGLRPGGNELPEGTYYYK
ISTSANAPELQGYIVLKK
NT seq
4917 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcccaaacagtcagcacgcgtaataactatacgggcatctggagccaaagagcttcc
tgggagcagaactggggtggcattcagaacccaagcccactcccggaggcacagataaac
ctgtatggctatatttcggtaggtatctatggtgccacggccagtctggagctgccctct
tcagccaatgctgttttaaatgtttatgataccctacgtatccatggcagccttatcatt
ggcaactatgcgcttctgaatattgctcccggaggtgttttaattgtgcatggcttgtac
aatcagtataataccgccaggctcactaataaaggcactatgatcatcaagggcgatttt
aacatagggaatagcgccgggcccactgagagtactggaaaaatatatgttggtgaaaaa
gtgtctcccggggcaagatttctcaatcctaaaaccctggccgacctggccctggagcat
ccggttacacattattttgccctttcaaatgtaacagccagccattgtgcaggtattaac
agcggtacccttagcttttcaggaacagccagtagtattgtgcgctgggagtccagtaca
gattacttcaggagtaatgtaaagcatattgccaatacctccacccagctggtttatagc
aacttagttcgcacaaccacctaccgggtctattataatgccggcaatggcatatttctc
tactctaatggtgcaaccattatggtggagcaaccctcttcaggaggtgaaataagcgga
actgcagagatctgtacgccaggcaccccggtaacgcttacccttagcaaacacatcggt
acggttaagcgctgggaatggagcgccgataactttgcaacaagcccacagtcactaacc
acctctgcagaaactattaccactgatcagctaagcacaactacctttgtgcgtgtggtt
ctgcaaagcggaagctgtggtgaggtagtgagtccgacctttaaaattactgcttactcc
tccgcaaatgcaggtctaattaaaggtactgctgctatctgtccgggaagtaacagcggc
accttaacactcgaaaacagaaatggagatgtgattcgctgggaggtgtctaatgatgct
tttgccgcagatatccgccctgtttcaaataccagtgatattctgacgttctcaggcctt
agccgtaccacctggtacagggcagtagttgctgcaggaggctcttgcccggtaatatac
acagccccttttgaagtaacctacctgcaggaccttacagaaagtcagctggcagtagca
gaaagccagcttccagagaatggcctgctggcgtattttccattcataaacaatgcctac
gatgcctccggcaatcagaatcatggtttagtggctggagctactcccgctcccgatcga
tttgggcgggaaaataatgcctaccactttaatggtgtggatgattatatcacaacaagc
aaacagtttccggcccccggtcccaacgaattttccctcagcatctggtttaaaacaagc
agcactacaggtggcaagctgattggttcaggtaccagtcaaaatggaatgagtgcccag
tacgacaggcacctgtacctgaataacctggggcagctgtactttggtatctatcggccg
gagctgcaaccagacggggccaaaataataaattcagaagaaaagtataacgacaatata
tggcatcatgctgtagccacactttctgccgatggcatgaagttgtatgtggatggtgcc
ctgaaagcctcagatgcgcgctatacaatagcagaagactatagcggttactggaaaatc
ggctttgataatacgaacaactggcctgatgctcccaccagtcattatttttccggttca
ctggatgatgtctacatctataacagagccctaagccccgttgaaatcttgcagctgcac
accatcagcaacggtcccttctgcgaaggagcaaatgttcagctgcgggctgtaacagtt
cccggtgccacttaccagtggtctggtccggggggctggagttcagtgctgcaaaatcct
gttttgaacaatgtttcagcagcccagggcggtgcctatgcagtaaaagtaactgtaaat
gcctgtgagtttactggcagcaccaatgtaaaccttgttccttcattggcaggaaccata
ataaccagccaggctagtgtgtgccgcggtactaatgccggtacacttaaactggagaat
tatgacgggcagattatccgctgggaaagttcagcagataattttaccagcaataagata
gacatagtgcacgcgggtgctgagatgagctttgaaaacttaacggttactaccagctac
agagcgcgtgtaaagcatacaacatgtggtgaaagatattctgctgttacaaccgtagag
gttgtagagccaagcctgggcgggacacttgacggcgcagccagtgtctgtaaaggaacg
aacagcggcacacttacactgagcggccacaggggacagattcagcactgggaattttct
aacgatggttttgtaaaccacagcgaaagtattgcccataccgaaccaacttacaccttt
agcaaccttgccagcagccgctggtacagggcagtggtgaaaaatggtgagtgtggggtt
gctgccagcacagcggttaaaataatggtaacagaaattgtcggtggcacagtgagtggt
cctgcgcaggtgtgcgaaggcagcgccagcggcaccttacagctgcaggggcatatcggt
accattaagcgctgggaaaagagtaatgatggttttaagaacaacattcagagtattgcc
agcacacaggcccagtacacctttgccgaccttagcagcgatacctggttcagggcagtt
gtaagcaatgcagaatgtggcgagcaggcctccgccgcacatgtggtaagggccgagcag
cttagcctgggtggtaccattaccggaacctctaatgtttgtacaggtacgaataccgga
atgctgacactggcaggctatcggggtaagatcctgcgctgggaatactctacagatgag
tttgtatcgcatattcaggcagtagccaataccagtaccatccataccttcagcaacctg
agccaaagccgctggtacagggctgtagtgcagaatggtagctgtgccattgcctacagc
gaattatttaaaataaccgcagccgagctggcaggaggtgccataagtggccctgctgtt
atttgccaggacgcaaatgatggccagcttacactgcaggataattttggagaaatagtt
cgctgggagagcagcaccgataattttgccgaaaacactcagactgttgcccatactgct
gccacttataactttggtcgtattgccgctaccacctggttcagggcggtagttggaaat
gcagaatgtggagaaacattttctgcaagctggcgggtagaaacagaacagccaagcctg
ggtggtaacctgggtggtgtaacaagtttttgctcatcaaccaacagcggcagcctgcag
ctcctgaatcagcggggtactattcttcgctgggaagcctctgctgataattttatatct
gatgtacaaatcttaaaccatacggcagccacctatgcctatagcaatctttcgaaaact
acctcttaccgggtggcagtgcaaaacggaagctgcacagccgtttactccagtgtggct
accattactttagatgcaccatcagcagcaggggtagtctccggaactgccacagtgtgc
tggggtgaaaacagcggtaacttacagctggaaagtaaactgggtgcagtgatcagatgg
gagcgttctgccgataattttactacgattacaccaatagccagcactgaaaataccatc
agctaccagaatctaaccacaactactgcctacagagcggtggtgcaaaatggtagttgc
ccgccagtatttagccagccggcaaccataaccgttaagccacaattagaggctggcagg
ataactggcagcaaggtagtggtgagcgggtccaacagcggcgaattacaactggagggg
tatagcggcaccattcttttctgggaggcctctacagatggttttgttgcccatgcagaa
cgcattgagaatacaacagctgttcagcactttcaggacctgacacagtctacctggtac
agagctgcattgcaaagtgatgattgtgcaccggtttatgcacaagctgcaaaaataact
gtaaaccatgccccccttgctcagcccgattattttgaggtagaggaagagcagtacact
ccttcagtttcggttttacaaaacgattccgaccctgatggtaatggcctaagggtggtg
ccggtgcagttgcagactgctgctggcggaacggcagccattaacagcgatggatttctc
acctatcagccaactgcacattatatagggatggattccctgcgctataccgtatgcgat
ggtgtaacgggagcagagctttgttcagaggcagttattgtgctggatgttcgcctgcca
ctccctggtttgatcgtataccagggtgtatctccaaatcaggataacagcaatgattac
tggcgcatagagcatatagaacgttacccggaaaacctggtgcggctgtacgatcgtttt
ggtgcgctggtatttgagcagcagggttataacaatacagataaaatttttacaggacag
ggaaataaaggtttgaggcccggaggcaacgagctgcccgaaggtacctattactataaa
atcagtacctcggccaatgcgccggaattacagggatatatcgtgcttaagaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
