Flavobacteriaceae bacterium UJ101: UJ101_00286
Help
Entry
UJ101_00286 CDS
T04720
Name
(GenBank) capsular polysaccharide biosynthesis protein CapD
Organism
fbu
Flavobacteriaceae bacterium UJ101
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Polysacc_synt_2
Epimerase
GDP_Man_Dehyd
RmlD_sub_bind
3Beta_HSD
C2185-like_N
CoA_binding_3
PglD_N
NAD_binding_4
NAD_binding_10
CoA_binding
adh_short
KR
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
APD05838
LinkDB
All DBs
Position
complement(303357..305315)
Genome browser
AA seq
652 aa
AA seq
DB search
MIKKVLNNYSKKYLSVWVILAFDLILVFGLYIFSFLLRYRFDFGILENEFYWLYIGWGGL
VAKAFVITAVYAIFFLSFKTYRGILRHTTIHEAYVILKSCFFSVVVLLSFSLIIHFLFSR
YLNEHKDSVLYLPKIVLVLHSLGVIAALLIYRIIIKEVFTKYFKSQVAENYKVIIYGAGS
SGMVTLNALKNDFNTVYNIIGFIDDDPNKVGKKIEEFTIFNRKKGFEKIISEEVDQIIIS
IQNLDTIKKREIIKECLKFDLEIKDVPPVENWINEELTTNQIKKVKVEDLLGRKPIKLDS
QNIFDEVKGKTILVSGAAGSIGAEIVRQLIYFEPKKIIGIDQAESFLYDLQVEIKTNAPQ
LFELIDFVIANVKEKDRLEEIFDQYNPDIIYHAAAYKHVPLMENFPFEAFNVNVVGTKNL
ADLAVAHNVSKFVMVSTDKAVNPTNVMGATKRIAEIYTQSLQEIQNNTHFITTRFGNVLG
SNGSVIPLFKKQIETGGPVTLTHKDITRYFMTIPEACNLVLEAGAMGIGGEIFVFDMGDS
IKIYDLAINMIKLSGLEPFVDIDVKEVGLRPGEKLYEELLNSKENTLPTHHKKILIAEIR
KESNALTNDLIQKMQLLNRNQEFELIKLMKEIVPEFKSNNSRFELLDKENEN
NT seq
1959 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgataaaaaaagttttaaataattactcaaagaagtacctatcagtatgggttatttta
gcttttgacttaattttagtttttgggttatatatattctcatttttattacgatatcga
tttgattttggaattttagaaaacgaattttattggttgtatattggatggggaggactt
gtagcaaaagcttttgttataacagctgtatatgccattttctttctttcttttaaaaca
tatagaggtattttaagacatacaacaattcatgaagcctatgttattctaaaatcatgc
tttttttctgtagtagttttattgtccttttcattaataattcattttttatttagtaga
tatttaaatgaacataaagattctgttttatatcttccgaagattgttttggtattacat
tcattaggtgttatagcagcattattaatttataggattattataaaagaagtctttacc
aagtattttaaaagtcaagtggctgaaaattataaagttattatctatggagcaggatca
tcaggtatggtaaccttaaatgcattaaaaaatgattttaatacagtatataatattatc
ggttttattgacgatgatcccaataaagtaggtaagaaaattgaagaatttacaattttt
aatagaaaaaaaggttttgaaaaaattataagtgaagaagttgatcaaattattatttca
attcaaaatttagatacaataaagaaaagggaaattataaaagagtgtttaaagtttgat
ttagaaataaaagatgtacctccagtagaaaactggattaatgaggaattaacaacaaat
caaattaaaaaagtaaaagttgaagatcttttaggaagaaaacctattaaattagatagc
caaaatatttttgatgaagtaaaaggtaaaacaattttagtctctggagccgcaggttcg
ataggagctgaaattgtaagacaattaatttactttgaacctaaaaaaattattggaatt
gatcaagcagaatcttttttatatgatttacaagttgaaattaaaacaaatgccccccaa
ctttttgaactgatagattttgtaattgcaaatgtaaaagaaaaggatcgattagaagaa
atatttgatcaatacaaccccgatattatttaccatgctgcagcatataaacatgttcca
ttaatggagaattttccatttgaagcatttaatgtgaatgttgtaggaactaaaaattta
gctgacttggcagtagctcataatgttagcaaatttgtgatggtatcaactgataaagcg
gttaatccaaccaatgttatgggagcaaccaaacgtattgcagaaatttatactcaaagt
cttcaagagatccaaaataatacacatttcataacaacacgttttggaaatgttttagga
tcaaatggctcagtaataccactttttaaaaaacaaatagaaacaggaggtccagttact
ttaacacataaagatattacacgatattttatgacaatacctgaagcgtgtaatctagtt
ttagaagcaggagcaatgggtataggaggtgagatctttgtgtttgacatgggagatagt
attaaaatatatgatttagcaattaatatgataaaattatctggattagagccttttgtc
gatattgatgttaaagaagttggtttacgacctggtgaaaaattatatgaagaattgtta
aattcaaaagaaaatacattacctactcatcataaaaaaattctcatagcagaaatacgt
aaagaaagtaatgctttaactaatgatttaattcaaaaaatgcaactattaaatagaaac
caagaatttgaattgataaagttaatgaaagaaattgttcctgaatttaagagtaataat
tcaaggtttgaattattagataaagagaatgaaaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
