Flavobacteriaceae bacterium UJ101: UJ101_02647
Help
Entry
UJ101_02647 CDS
T04720
Name
(GenBank) swarming motility protein SwrC
KO
K18989
multidrug efflux pump
Organism
fbu
Flavobacteriaceae bacterium UJ101
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
fbu00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
fbu02000
]
UJ101_02647
Transporters [BR:
fbu02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
UJ101_02647
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
DUF3438
DUF5354
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
APD08145
LinkDB
All DBs
Position
2979355..2982876
Genome browser
AA seq
1173 aa
AA seq
DB search
MSDQNTKKEKQFGLSTWAINNRMTIYVMMALFLFMGESAYYNMARENFPEIIETKIYVSS
LYAGNTAEDVEKLITDPLEEELKNISNVVEVTSTSQEDYSIITIEFDENISVESAKQKVK
DEVDVVVADPDWPLSNGAKVEPNVFDLNMSEEQAIMNINLYGDYTTKQLKDYAELLQDEI
ETIPEIKEASIRGAQELEVEVAVDIYKMMGANVSFDNVINAINNGNLTVSGGNLISNKQR
RNIRVIGEIERPSDLENFVVKSQNGAVYLKDIATISFKEEDKTTYAREMGNQVVMLDVKK
RSGKNMVDAVEQVYEKIKEGEETYLPSDLKITVANDQKDRTVNQVDDLVNNIIFGVILVV
GVLMFFLGFRNALFVGFAIPMSMFISFMILQMLGFTLNTMVLFAMVMGLGMLVDNGIVVV
ENVYSLMDERGMSAKEAAIQGVSEIAFPIIISTATTVAAFIPLGLWPGTMGQFMIYFPKT
LSIVLGSSLFVAIFFNSMLTAEFMKTEEGKITNKALFLYTAILVGTGVLAILFGKLGSGV
FGFGALLIFAAVFLWLYRFLLEPAANFFQNRILTWMERVYKSFLSFALKGWHAIAFLIGT
FALLVFSIMLVGMAQPKVEFFPENKPNQIITYIEYPQGTDIEKTNAITKDVEKKIFDVLK
QYTDDDGYNYMVESAVSQVGEGAGNPQTDGGSTAEMPHKGKITVSMREYKYRRGVDSEDI
QKQIQEAVKGYPGVSITVEKDAAGPPAGYPVNIEITGNDYDELIITANDIKNYIENTGVD
GIEDLRLDVTKSKPGIQVEVDRKKAGELGVAVGQVGLQIRRSLYGEKSGTYKKDGDDYDI
YVRFNEENRYNINSLFNQQIVFRDQLSGQLKQVPLSAVTEKKNVSSFTAIKHRDLKRVVT
VYSDVLPGYNATEIVNQLKGELKGFKTPNGVKFSFTGEMEEQEDNMMFLLSALASGLGLI
MLLLVFQFNSISKPTIIMIAIFLSFIGVFLGLVISGKPFVIMMTMMGIISLAGIVVNNGV
VLLDYTELLISRKKHELQIPENIMLPKEHIYDAIVAGGVSRLRPVLLTAITTVLGLMPLA
VGLNIDFFGLFKNLNPNIYFGGDNVIFWGPLAWTVIYGLTFATFLTLIIVPVMYYLVNQL
KLWYRGKQEKKKRRSKFDDYFDDKAETGLDSIR
NT seq
3522 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtgatcaaaataccaaaaaagaaaaacaattcggtttatctacttgggcaattaat
aatcggatgaccatttatgtcatgatggctttgtttctttttatgggagaatcagcctat
tataatatggcacgagaaaatttccccgaaataattgaaaccaaaatatacgttagttca
ttatatgctggaaatacagctgaagatgttgaaaaactaattaccgatccactagaagaa
gaattaaagaatatttcaaatgtggtagaagtaacctctacctcacaagaagattattct
attataacgattgagtttgatgaaaatatttcagttgaatcagctaaacaaaaagtaaaa
gatgaagtagatgttgtagtagcagatcctgattggcctttatctaatggtgcaaaagtt
gaacctaatgtgtttgatttaaacatgtcagaagaacaagccattatgaatattaatttg
tatggtgattatacaaccaaacaattaaaagattatgcagaattactacaagatgagatt
gaaacgattcctgaaattaaagaagcgagtattcgtggagctcaagaattagaagtagaa
gtggcagttgatatttataaaatgatgggagctaatgttagtttcgataacgttatcaat
gccattaataatggaaacctaaccgtctcaggaggaaatttaatttctaataaacaacgt
cgtaatattcgagtaattggagaaattgaaaggccatctgatttagaaaattttgttgtt
aaaagtcaaaacggtgctgtttatttaaaagatattgcaaccatttcttttaaagaggaa
gataaaacaacctatgctcgagaaatgggaaaccaagttgtgatgctggatgtaaaaaaa
cgttcaggaaaaaacatggtagatgctgttgaacaggtgtatgaaaaaattaaagaagga
gaagaaacctatttaccttctgatcttaaaattactgtagccaacgatcaaaaagatcga
accgttaaccaagtagatgatttagtaaacaacattatttttggtgtaatattggttgta
ggagttttgatgttctttttaggttttagaaatgccttatttgttggttttgcgattcca
atgtcaatgtttatttctttcatgattttacaaatgttaggatttacgttgaacacaatg
gttttatttgctatggtgatgggactgggaatgcttgttgataatggaattgtagtagta
gaaaatgtttattcattgatggatgaaagaggaatgtctgcaaaagaagctgctattcaa
ggagtaagcgaaattgcctttcctattattatttcaacagcaacaacagtggcagccttt
attcctttaggattatggcctggaacaatggggcaatttatgatttatttccctaaaact
ttatctattgtattaggctcctctttatttgtagcgattttcttcaattcgatgctaaca
gccgaattcatgaaaacagaagaaggaaaaataaccaataaagccttatttttatatacc
gctatcttagttggaacaggtgtattagctattctttttgggaaattagggtctggagta
tttggttttggagcattgttaatttttgcagctgtctttttatggttgtatcgattttta
ttagaaccagcagccaatttcttccaaaatcgtattttaacatggatggaacgtgtatat
aaaagctttttaagttttgctttaaaaggatggcacgctattgcattcttgattgggaca
tttgcattattagttttttcaattatgttagttggaatggctcaaccaaaagttgaattt
ttcccagagaataaacccaaccaaattattacttatatagaatatccacagggaactgat
attgaaaaaaccaacgctatcacaaaagatgtagaaaagaaaatctttgatgtattgaaa
caatatacagatgatgatggatataattatatggttgaatcagctgtatcacaggtagga
gaaggagcagggaatccgcaaacagatggaggatctaccgctgaaatgcctcataaaggg
aaaattaccgtttctatgcgagaatacaagtatcgaagaggtgttgattcagaagatatt
caaaaacaaattcaagaagctgtaaaaggatatccaggcgtttccattacagttgaaaaa
gatgcagcaggacctccggctggttatccagtgaatatcgaaatcacaggaaatgattac
gatgagttaattattacagcgaatgatataaaaaattatattgaaaatacaggagtagat
ggtattgaagatttacgcttagatgtaaccaagtcaaaaccaggtattcaagttgaagta
gatcgtaaaaaagcaggtgaattaggtgttgctgtaggacaagttggattacaaattcgt
cgttcactttatggtgaaaaatcggggacttataaaaaagatggtgacgattatgatatt
tatgttcgatttaatgaagaaaatcgttataatatcaattcattattcaatcaacaaatt
gtatttagagatcaactctcagggcaattgaagcaagttccattatctgcagttacagaa
aagaaaaatgtatcttcatttacagctattaaacaccgtgatttaaaacgagttgtaaca
gtttactcagatgtattaccaggatataatgctactgaaattgtaaatcaattaaaagga
gaactaaaaggatttaaaaccccaaatggtgtaaagtttagttttacaggagaaatggaa
gaacaagaagataatatgatgttcttattatcagctttagcatcaggattaggtttgatt
atgttattattggtattccaatttaattctatttcaaaaccaacgattattatgattgct
attttcttgagttttatcggagtattcttagggttggttatttcaggaaaaccatttgtt
attatgatgacaatgatgggaattatttcactggcaggaattgtggtgaataatggagta
gtattattggattatacagagcttttaatttcgcgtaaaaaacacgaattacaaattcct
gaaaatattatgcttcctaaagaacatatatacgatgctattgtagcaggaggggtttcg
cgtttgcgtccggtattgttaaccgccattactactgttttaggactaatgcctcttgct
gtaggattaaatattgatttctttggattatttaaaaatttaaatcctaatatctatttt
ggaggagataacgttattttctggggacctttagcatggactgtaatttatggtttaact
tttgctacatttttaactttaattattgttcctgtaatgtactatttagttaatcaatta
aaattatggtatagagggaaacaagaaaagaaaaaaagacgctcaaaatttgacgattat
tttgatgataaagcggaaacaggtcttgattctattagataa
DBGET
integrated database retrieval system