Flavobacterium channae: LOS89_07215
Help
Entry
LOS89_07215 CDS
T08502
Name
(GenBank) T9SS type A sorting domain-containing protein
Organism
fcb
Flavobacterium channae
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
DUF7619
LRR_4
Por_Secre_tail
CHU_C
DUF3124
LRR_EndoS
LRR_8
LRR_LRWD1
DUF3244
CLIPPER
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UGS22568
LinkDB
All DBs
Position
complement(1565793..1568156)
Genome browser
AA seq
787 aa
AA seq
DB search
MKKLYFLSFLIIGFLGNAQIVNIPDANFKAKLLSASPSNQIASTSSLVYNSMNGTWGVYS
YNVIDSNNDGEIQVSEAQAIKWLDVSNSNISNISGIEAFINLEHLSCLSNQLTSINIQNL
TNLVQFNCSNNQLTSLNLQSLTNLKSVWCSDNQISNLNLQGLLNLRLLNANNNQLAQINI
EDLESLEILFIQNNLLTNFSAHDLTNLNSIICSYNQINSISVQGLLNLEYFRCNSNQLTS
LNVDELTKLKELDCDSNFITTLNIENLSKLEYLKCSSNQLLSLFLKNGNESSCTLDFFSN
PNLNFICADAEEIDYVQQQCLYSFIPDCNVNDYCSFTPGGTFYEISGNTKLDSNNNGCDA
SDINYSNLNFSITDGTNAGSLIVNQTGNYNIPVSAGNHTITPNLENPSYFNIFPTSFTVD
FPTQTSPFTQDFCVTANGVHHDVEVVLIPTVPARPGFDANYKLIYRNKGNQIENGSISFT
FDDTRLDYVLSNPVFNSSAVNNFTWNYTNLQPFETREIGIVFNVNSPMETPAVNIGDQLD
FLAQITPFTNDEVQNDNISALKQIVVGSYDPNDKTCLQGETITPSEVGKYVHYLIRFENT
GTYPAENIVVKDMIDLNKFDIATLIPLKSSHDFFTRINGNKVEFIFENINLDFNDATNDG
YVLFKIKTKPTLVLGDTFTNNANIYFDYNFPITTNTYTTTVAALSSQDFDFGTYFTLYPN
PAKDVLNIQAKQGIQLNSIEIYNQLGQIVMAVTNNVNAIDVANLASGTYFVKVNSEKGSA
NAKFVKE
NT seq
2364 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaactttactttttgtcctttttgataattggttttttaggtaatgctcaaatt
gtgaatatacctgatgctaattttaaagcgaagttgttgagtgcgagcccgagtaatcag
attgcgtcaacaagttcattagtttacaattcgatgaatggtacttggggtgtttatagt
tacaatgttattgattcaaataatgatggtgagatacaagtgagtgaggctcaggctata
aaatggctagatgtttcaaattcaaatatttcaaatatttcaggaatagaagcatttatt
aatttggaacatttatcttgtttaagtaatcaattaacttcaataaacattcaaaatttg
actaatttagtacagtttaattgttctaacaatcaattaacttcattaaatttacaatct
ttaactaatctaaaatctgtatggtgttctgataatcaaatttcaaacttaaatcttcaa
ggattactaaatctacgattattaaacgcaaataataaccaattagcacagattaatata
gaagatttagaaagtttggaaatcctttttattcaaaataatttactaacgaattttagt
gctcatgatttaaccaatttgaactctataatatgtagttataatcaaattaattctatt
tctgttcaaggattgttaaatttagaatattttagatgcaattcaaatcaattaacatca
ttaaatgttgatgaattaacaaaacttaaagaattggattgtgattcaaattttattaca
actttaaatattgaaaacttgtcaaagttagaatatttaaaatgtagttcaaatcaatta
ctaagtttatttttaaaaaatggaaatgaaagttcgtgtactttagatttttttagtaac
ccaaacttaaattttatttgtgcagatgctgaagaaattgattatgtgcaacaacaatgt
ttatattcatttattcctgattgcaacgtaaacgattactgctctttcacaccaggagga
acattctatgaaatttcaggcaatacaaaactcgattcaaacaacaatggttgtgatgct
tcggatatcaattattccaatttaaatttttcaattactgatggaactaatgctggttct
ttaattgtaaaccaaacaggaaattataatataccagtttccgcaggaaatcatactata
actccaaaccttgaaaaccctagctattttaatattttcccaactagttttactgttgat
tttccaacacaaacaagtccgtttacgcaagatttttgtgtaacagctaatggagttcat
catgacgttgaagtagtgttgattccaacagttccagctcgtccaggttttgatgctaat
tataaactgatttatcgtaacaaaggaaatcaaattgaaaatggaagtatttcatttact
tttgatgatacaagattggattatgttttgtctaatccagtttttaatagttcagcagta
aataatttcacatggaattatactaatttacaacctttcgaaactagagagattggaatt
gtttttaatgtaaattctccaatggaaacacccgcagttaatatcggtgatcaattggat
tttcttgctcaaattacgccttttacaaatgatgaagtgcaaaacgataatatttctgct
ttaaaacaaattgtagttggttcatacgatccaaacgacaaaacgtgtttacaaggagaa
acaattacgccaagtgaagttgggaaatatgtgcattatttaattcgttttgaaaacacg
ggtacttatcctgctgaaaatattgtagtaaaagacatgattgatttgaataagtttgat
attgctactttaattccattaaaaagtagtcatgatttttttaccagaattaatggaaat
aaagtagagttcatttttgaaaacatcaatttagattttaatgatgcaactaatgatggt
tatgtgttatttaaaattaaaacgaaaccaactttagttttaggtgatactttcactaac
aatgctaacatttactttgattataatttcccaattacaacaaatacatatacaacaaca
gttgctgctttaagctctcaagattttgattttggaacttattttactttatatcctaat
ccagcaaaagacgttttaaatattcaagcaaaacaaggtattcaattgaattcaatcgaa
atctataatcaattaggacaaattgtaatggcggttactaataatgtaaatgcaattgat
gttgcaaatttagcttcaggaacgtattttgtcaaggtgaactctgaaaagggtagtgct
aatgcgaagtttgttaaagaatag
DBGET
integrated database retrieval system
