Flavobacterium cyclinae: LOS86_01420
Help
Entry
LOS86_01420 CDS
T08416
Name
(GenBank) efflux RND transporter permease subunit
KO
K07003
uncharacterized protein
Organism
fcc
Flavobacterium cyclinae
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
fcc00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09194 Poorly characterized
99997 Function unknown
LOS86_01420
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MMPL
Patched
Sterol-sensing
ACR_tran
SecD_SecF_C
VP1_VP3
TMCO5
HTH_40
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UGS21313
LinkDB
All DBs
Position
complement(294941..297352)
Genome browser
AA seq
803 aa
AA seq
DB search
MLKWLSTSFWDYIASRILRNRVFLLVLVLLFTIFMGFQWKNMRFTFTEANLLPDDHEVNL
QYNSFLEKFGEEGNLIVLGFNDKDFFNEKNIKAWEKFIGEIKKDKSVELSLSIEDLKILH
KDTLNQKFKLVPFINNDSISNNYLKEKEKEFFNDLPFYEGMLFNKESGAVRFAIYMDKKI
VNTPARKKFIEKHLNQERISAFEEETGLDLRVSGMPYIRTLNANSIISEIGLFVGAALGI
TSLLFFFFFRSFRATMISMFVVIIGVMWSFGTLGLLHYEITVLTAIIPPLIIVIGIPNCI
FLINKYQQEIKNHGNKAKSLQRVISKVGNATLLTNLTTAAGFGTFIFTDSKLLKEFGVVA
SLNIVFLFILCLIIIPIVYSYMPMPKEKHLAHLGKNYMAKFIHWIENTIRHHRIAVFSVA
IVILVMGIIGIYQIKISGSIIEDMPKKAPFFKDILFYEKEFDGVMPLEIVIDTKKPKGAL
KSVTLKRIEELQETIEEIPELSKPVSLVNLVKYAKQAYYNGNPEFYELPTKQEEAFILSY
IKNSTQKGNENMLKSYVDSTGQYARITTFMRDIGTDKMKKIEERLQDKINHIFPNERYTV
SLTGKAYVFEKGTHYLIDNLVQSLLFAIVLISLLMAYMFRSVKMIIVSLLPNILPLIMTA
GLMGFLGIPIKPSTILVFSIAFGISVDDTIHFLAKYRQELKAYDWKIKRSVYATLKEAGI
SMFYTSVVLFFGFSVFTLSDFGGTVALGGLVATTLLFAMLSNLILLPALLLSLDKTIANQ
EEFLEPTLDILAEDIEEENSNEK
NT seq
2412 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttaaagtggttaagtaccagtttttgggattatattgctagtagaattttaagaaac
cgcgtttttttattagttcttgtattactatttacaatttttatgggatttcagtggaaa
aacatgcgttttacctttactgaagctaatttattacctgatgatcatgaggtaaaccta
caatacaattcctttttagaaaaatttggtgaagaaggaaatctaattgttttaggattt
aacgacaaggatttttttaatgaaaaaaacatcaaagcttgggaaaaatttattggtgaa
attaaaaaagacaaatcagttgaactttcattgtctatagaagatttaaaaattttacat
aaagacactcttaatcaaaaatttaaattagttccttttatcaataacgatagcatatca
aacaattatttaaaagaaaaggaaaaagaatttttcaatgatttacctttttatgaaggt
atgctgtttaacaaggaaagtggcgctgtacgttttgcaatttacatggataaaaaaatt
gtaaacactcccgccagaaaaaaattcattgaaaaacatctaaatcaagaaagaatttca
gcctttgaagaagaaacaggattagatcttcgtgtttcaggaatgccttatataagaact
ctaaacgcaaatagtattattagtgaaattggattgtttgttggggcagcacttggaatt
acttcgttattatttttctttttctttagaagttttagagccactatgatttccatgttt
gttgtaattattggggtaatgtggtcatttggaacacttggtttgctacattatgaaatc
accgttttaacagccattattccaccattaattattgtaatcggaatccctaattgtatt
ttcttgattaacaaataccaacaagaaattaaaaaccacggaaataaagctaaatcttta
caacgagtaatttcaaaagtaggaaatgcaactctattaacgaacttaactacagcagca
ggttttggaacttttatttttaccgatagtaaattattaaaagagtttggagttgttgca
tcgcttaatattgttttcctatttattctgtgtttgattattattcctattgtttatagt
tatatgccaatgccaaaagaaaaacacttagcgcatttgggtaaaaattatatggctaaa
tttattcattggattgaaaacacaataagacaccatagaattgctgttttttcagtagca
attgtaattttagtaatgggaattattgggatttaccaaattaaaatttcgggaagtatt
attgaagatatgcctaaaaaagcacctttcttcaaagatattttattttacgaaaaagaa
tttgatggtgtaatgcctctagaaattgtcattgacacaaaaaaaccaaaaggagcttta
aaatcagtaacgttaaaacgaatcgaagaacttcaagaaaccattgaagaaattcctgaa
ttatcaaaacccgtttctctcgttaatttagtaaaatacgctaaacaagcttattataac
ggaaatccagaattttacgaattacctacaaaacaagaagaagcatttattttatcctac
attaaaaattccactcaaaaggggaatgaaaacatgctaaaaagctatgttgatagtaca
ggtcaatatgcccgaattacaacattcatgcgtgacataggaaccgataaaatgaagaaa
atagaagaacgtttacaagataaaatcaatcatatttttccaaatgaacgttatacggtt
tcgctaacaggtaaagcgtatgtatttgaaaaaggaacccattatttaattgataattta
gttcaatcattgctttttgctattgttctaatttcattattaatggcatacatgttccgt
tctgtaaaaatgataattgtttctttattacctaatattttgccattgattatgacagct
ggattaatgggatttttaggaattccaattaaaccctcaactatattggtatttagtatt
gcattcggaatttcggtagatgataccattcactttttagccaaatatcgacaagaatta
aaagcgtacgattggaaaataaaacgctctgtttatgccactttaaaagaagcgggtata
agtatgttttacacctctgttgtattgttttttgggttctctgtatttacgctttctgat
tttggcggaactgtcgcattaggtggtttagtagctacaaccttactttttgctatgtta
tctaatttaatattacttcctgcattattattatctttagataaaactattgctaatcaa
gaagaattcttagaaccaacactagatattttagcagaagatattgaagaagaaaattca
aacgagaaatag
DBGET
integrated database retrieval system
