Flavobacterium cyclinae: LOS86_10110
Help
Entry
LOS86_10110 CDS
T08416
Name
(GenBank) MATE family efflux transporter
KO
K26939
MATE family, multidrug efflux pump
Organism
fcc
Flavobacterium cyclinae
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
fcc00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
fcc02000
]
LOS86_10110
Transporters [BR:
fcc02000
]
Solute carrier family (SLC)
SLC47: Multidrug and Toxin Extrusion (MATE) family
LOS86_10110
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MatE
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UGS20375
LinkDB
All DBs
Position
2150997..2152367
Genome browser
AA seq
456 aa
AA seq
DB search
MNFSDYSKEFSQNLKLAYPIILGMLGHTIVGIVDNIMVGKLGPTELAAVSLGNSFVFIAM
SLGIGFSTAITPLVAESDGKNDVAGGRSAFHHGLYLCTILGVALFSLIFFAKPLIAFMGQ
PEDVVEMAKPYLDIVGFSLIPLIMYQAYKQFADGLSETKYSMWATIIGNITNVTLNYFLI
YGIWIFPELGIVGAAIGTIASRFVMLGFMHYMMNLKPKFHPYFKGFSLKEIKKEVNQKII
KIGMPSAMQMFFEVALFTGAIWLCGMIGTTSQAANQIALSLASMTFMFAMGLSVTAMIRI
GNQKGLNDFVTLRRVAISIFLLTILIEVVFALLFVLLHTSLPYIFVDINDIKNLTENLEV
IAISANLLLVAAVFQISDGLQVVVLGALRGLQDAKIPMYITFVAYWVIGFPISIYLGLET
ELKAVGVWIGLLAGLTAAAIFLYIRFNYLTKKLIKN
NT seq
1371 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaacttttccgactactctaaagaattttcacaaaacttaaaactcgcctaccctatt
attttaggaatgttaggtcataccattgtgggaattgtggataacatcatggtcggaaaa
ttaggtccaacagaattagcggcggtttcattaggaaacagttttgtcttcattgctatg
tcattaggaattggattttcaacagccattacgcctttagtagcagaatctgatggaaaa
aatgatgtcgctggtggtcgttcggcttttcatcatggattgtatttgtgtacaatctta
ggtgtggcactattttctttaatcttttttgccaaaccgttaatcgcttttatgggccaa
cccgaagatgtggtagaaatggcaaaaccctatcttgatatcgttggtttttcgttaatt
ccgctaattatgtatcaagcgtacaaacaatttgctgatggattgagcgaaacaaaatat
tcaatgtgggcaaccattattggaaatattaccaacgttacattaaactattttttaatc
tacggaatttggatttttcctgaattaggtattgttggtgcagctattggaactatcgct
tctcgttttgtgatgttaggttttatgcactacatgatgaatttaaaaccgaaattccat
ccgtattttaaaggatttagtttgaaagaaattaagaaggaagtcaaccaaaaaatcatc
aaaattggaatgccttctgctatgcaaatgttctttgaagtagcattatttactggagct
atttggttgtgcggaatgattggaactaccagtcaagctgccaatcaaattgcattgagt
ttggcatcaatgaccttcatgtttgccatgggattaagcgtaactgccatgattcgtatt
ggaaatcaaaaaggattgaacgattttgttacacttcgaagagtagcaatttccattttt
ttattaacgatacttattgaagtagttttcgccttgttatttgtactattacacactagt
ttaccttatattttcgtagatatcaacgatattaaaaacctaaccgaaaacttagaagta
atcgcaatttcagctaacttacttttagtagcggctgtttttcaaatttccgatggcttg
caagtggtggttttaggagcacttcgtggcttacaagatgcgaaaattccaatgtatatt
acgtttgtagcgtattgggtaattggatttcctatttctatttatttaggattagaaacc
gaattaaaagctgttggtgtgtggattggacttttagccggattaacagcagccgcgata
tttttgtatattcgctttaattacttaacgaaaaaattgattaaaaattaa
DBGET
integrated database retrieval system