Flavobacterium cyclinae: LOS86_12620
Help
Entry
LOS86_12620 CDS
T08416
Name
(GenBank) T9SS type A sorting domain-containing protein
Organism
fcc
Flavobacterium cyclinae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Alpha-amylase
Por_Secre_tail
Big_7
TcfC
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UGS20848
LinkDB
All DBs
Position
2767054..2769945
Genome browser
AA seq
963 aa
AA seq
DB search
MKKQVLFILSLLIGFCVQAQVTITPSSFNANDQITITVSTAAQSCNQMGTSPAKVYMHAG
IGDDTNAFGFSVVGNWGQDDSVGLMTNNGDGTWSITLTPSTYFGLNATQEANATKLGMVF
RNANGSQTLKLPPSCGDFIFNVGTFQVNLTSPAINSSTIINSGGNLSISATNTGGNASYN
LKANGTSINTNVTSSYSFNHTNITSNTNYELEVTLGATTITRRFSVIVNPGSTAQAIPSG
LVNGINYNPSDNTKATLVLEAPGKDFVYVAGSFNNYMPDATFAMKKDPSSNKFWLELTGL
TPGADNTYQYWVVDQTPIANSPVLVKVADPCSKLVLSPYDDPWIPSTTFPNLPAYPTGQE
REVTWFKTGTTPYNWQVTNFTKPNKDKLVVYELLIRDFDADRNFQDVIDRIQYFKDLGIN
AIQLMPIMEFEGNESWGYNTAFHMALDKFYGTPEKFKELVDLCHQNGIAVILDIAFNHAF
GRNPMVRMWMNDPDGDGWGGPASDNPYFNTTARHSYSVGDDFNHSSTLTRDYVKQTVKYW
IEEFKIDGFRWDLTKGFTQNCSGGDDACTNAYQQDRVDVLKDYADYCWSLDNDHYVIFEH
LGTDGEEQQWANYRIGEGKGIMMWGEMYTQYKELAMGYATQNISRMSHTSRGFTGKRLIG
YPESHDKDRMMYEAITYGNGAGAFPVNGNLTNALNRMGAIGATSILVPGPKMIWHFGELG
NNQSIYTCSNGTVNDESSFFPGDCKLDTKEQVQWTENWLADPRRTSILSDWSKMIKLKTT
EPVFMGDHAISPDANNVKQRIYIYDNSIPTSQLRNVVVIANFSVANLTINPSFPTDVYTY
PMTWYDLMNNNAPVVINNPTDVISVNSGRFRVFGNQPSTLSSNDFETIQNTISIYPNPSK
NSFAISQDAEKIEIYNIAGQLVNTYNNVTKNQQIDSSNLETGLYLVKITDINGISQTQKM
LKE
NT seq
2892 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaacaagtactttttattttatccctattaattggattttgtgttcaagcgcaa
gtaacaattacacctagtagctttaatgctaatgatcaaattactatcactgtctcgact
gcagctcaatcatgtaaccaaatgggaacttcgcccgcaaaagtttatatgcatgctgga
attggtgacgatactaatgcttttggtttttctgttgttggaaattggggtcaggatgat
tcagtcggattaatgactaataacggagatggcacatggagtataactcttacgcctagt
acctattttggtttaaatgccacacaagaggcaaatgccactaaattaggaatggtattt
agaaatgccaatggaagtcaaactttaaaactacctccatcttgtggagatttcatattt
aatgtaggtacttttcaagttaatttaacttcaccagctatcaatagtagtaccattatt
aactcaggtggaaatctttctatttctgcaacaaatacaggtggaaatgcaagttataat
ttaaaagcaaatggaactagcattaatacaaatgttacttcaagctattcatttaatcat
actaatatcacttctaatacaaattacgaactagaagttacacttggtgctactactatt
actcgaagattttcagttattgtaaatccaggtagtacggctcaagcaatcccaagcgga
ttagtaaatggtattaactataacccatctgataacacaaaagcaactttagttttagaa
gcacctggaaaagattttgtttatgttgcaggtagtttcaacaattatatgccagatgct
acttttgccatgaaaaaagatccaagttctaataaattttggttagaacttactggatta
actccaggagctgacaacacctatcaatactgggttgtagatcaaactcctattgcaaat
tctcctgttttagtaaaagtagcagatccttgctctaaattggtactatcgccatatgat
gacccatggattccaagtacaacttttccaaacttacctgcttatccaacagggcaagaa
cgcgaagttacatggttcaaaacaggtacaactccttataattggcaagtaacaaatttc
actaaaccaaacaaagacaaattagttgtatatgaattgcttatccgtgattttgatgct
gatagaaattttcaagatgtaatagatagaatacaatattttaaagatttaggtattaat
gctatccaattaatgccaatcatggaatttgaaggcaatgagagctggggatacaataca
gctttccatatggcattagataaattttatggaactccagaaaaatttaaggaattagtt
gatttatgccatcaaaatggaattgcagttatacttgatattgcatttaaccatgcattt
ggtagaaacccaatggtgcgtatgtggatgaacgaccctgatggtgatggttggggcgga
cctgcatcggataatccatattttaatacaacagcaagacatagttatagtgttggggat
gattttaatcattcttctactctaactcgtgattatgtaaaacaaacagtaaaatattgg
attgaagaattcaaaattgatggttttagatgggatttaactaaaggttttactcaaaac
tgtagtggtggtgatgatgcatgtacaaatgcatatcaacaagaccgtgtagatgtatta
aaagactatgcagattattgctggtctttagataacgatcattacgtaatatttgaacat
ttaggtactgatggtgaagagcaacaatgggctaattacagaattggagaaggtaaagga
atcatgatgtggggagaaatgtatacccaatataaagaattggctatgggttatgcaaca
caaaacatttctagaatgtcgcatacaagtcgtggatttacaggaaaaagacttattgga
tatcctgaaagtcatgacaaagacagaatgatgtatgaagcaattacctatggaaatgga
gcaggagcttttccagtaaatggaaatttaactaatgctttaaaccgaatgggagcaatt
ggagctacaagtattttagtgcctggaccaaaaatgatttggcactttggtgaacttgga
aacaatcaatccatctatacttgttcaaacggaacagttaacgatgagagttcatttttc
ccaggagattgtaaattagataccaaagaacaagtacaatggacagaaaattggttagct
gacccaagaagaacttctatcttgagtgactggtcaaaaatgattaagcttaaaactacg
gaacctgtttttatgggagatcatgccataagtcctgatgctaataatgtaaaacaacgt
atttatatctatgacaatagcatacctacgtcacaattaagaaatgtagtggtaattgct
aatttttctgtggctaacttaactattaatccaagtttcccaacagatgtttacacttac
ccaatgacatggtatgatttaatgaacaataatgctccagtggtgataaacaatccaaca
gatgttattagtgtgaattctggaagatttagagtttttggtaaccaaccttctactcta
tcatcaaatgattttgaaactatccaaaacaccatttctatttatccaaatccttcaaaa
aacagctttgctatttctcaagatgctgaaaaaatagaaatctacaacattgcagggcaa
ttagtgaacacttacaataatgtaactaaaaaccagcaaatagatagctcaaatcttgaa
actggtctatatttagttaagataaccgatataaatggtataagccaaacacagaaaatg
ttaaaggaataa
DBGET
integrated database retrieval system