Francisella cf. novicida Fx1: FNFX1_0561
Help
Entry
FNFX1_0561 CDS
T01937
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K20265
glutamate:GABA antiporter
Organism
fcf
Francisella cf. novicida Fx1
Pathway
fcf02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
fcf00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
FNFX1_0561
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
fcf02000
]
FNFX1_0561
Transporters [BR:
fcf02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
FNFX1_0561
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
AA_permease_2
AA_permease
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEB27509
LinkDB
All DBs
Position
complement(560204..561613)
Genome browser
AA seq
469 aa
AA seq
DB search
MEQIISSKKFGLVRLIMINIIAVDSLRNISITAQAGWIVITFYILAGIFFLVPCALLTAE
MSTGSSQENGGIYIWVKKAFGKRLGFLVIWLQWVYNLVWFPSICGFFAGVIAYVIAPLTG
QDANHLVANPWYMISMSLVMFWSATAINLFGIKTSSTVSTLGAIIGTLLPMFIIIIIAII
WSMSHTAEIVAPKISDFIPSGNNISSWALFITVMFSLFGLEMSAIHAANVKNAKKNFPRA
LLISGSVILGSLILSNIAVILVSSQLQIGDVDIVTGLMVSFHYFFSQINMPWMTYIIAVT
LIFGAFTTTSAWIMGLSRAFMVVSNDNILPQIFGRTNKNDAPDTMLITQALVFTVFCFSY
IFMPSVNEAYWYLSDLTAQLAVIAYILMFITAVKLKISSPLEEGQYEICKGSFGTILMAL
LGCFGCLVAIIVGFIPIDNMAMSVFNFDMMLIVGIVITLIIPAVITIKK
NT seq
1410 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaacaaattattagtagtaaaaaatttggtcttgtcagactaataatgataaatatt
atcgctgtcgatagcttaagaaatatctctataacggctcaagcaggttggatcgttata
actttctatattttagctggaattttcttcttggttccgtgtgcgctactaaccgcagaa
atgtctactggctcctcacaagagaatggtggtatctatatctgggttaaaaaagcattt
ggcaaaagactaggatttttagttatctggttacagtgggtttacaacttagtttggttt
ccatctatttgtggattcttcgctggagttattgcttatgtcatagcacctttgaccgga
caagatgctaatcacttagttgctaatccttggtatatgatatcaatgagtttagtaatg
ttttggagtgccaccgcaattaacttatttggtatcaaaacatcaagtactgtaagtaca
cttggagctattattggtacacttttaccaatgtttattatcataataatagcaataata
tggtcgatgtctcatactgctgaaattgttgcgccaaaaatttctgattttattccatcg
ggtaataatatcagtagctgggctttatttataactgtaatgtttagccttttcggttta
gaaatgagtgctatacatgcagcaaatgtcaaaaatgctaagaaaaattttcctcgtgcc
ctgctaatttcaggatctgtaatattaggatctttgattttatcaaatattgcggtgata
ttagtaagtagccagttacagattggtgatgttgatatagttacaggtctaatggtttct
ttccactacttctttagtcagattaatatgccatggatgacttatataatcgcagtaacg
ctgatatttggcgcatttacaacaacatcagcttggattatgggattatctagagctttt
atggttgttagtaatgacaacatcttgccacaaatatttggtaggacaaataaaaatgat
gctcctgatactatgcttattacccaagcacttgtttttacagtattttgcttctcatat
atatttatgccatcagtaaatgaagcatattggtatcttagtgatttaactgcacagtta
gcagttatagcatatatcttgatgtttattacagctgtaaagctaaaaattagctcacca
cttgaagaaggtcaatacgaaatatgtaaaggttcttttggaactattctaatggcattg
ttaggttgttttggttgtttagtagcgataattgtcggatttattcctatagacaatatg
gcaatgtcagtttttaatttcgatatgatgcttattgtaggaattgttattacactaatt
attccagcagttataaccattaaaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system