Flavobacterium capsici: RN605_02665
Help
Entry
RN605_02665 CDS
T10574
Symbol
ccsA
Name
(GenBank) cytochrome c biogenesis protein CcsA
Organism
fcj Flavobacterium capsici
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Cytochrom_C_asm
ResB
OppC_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WNM22273
UniProt:
A0AA96J621
LinkDB
All DBs
Position
complement(565112..568234)
Genome browser
AA seq
1040 aa
AA seq
DB search
MEKKIYAFLFSTRLMAVLFIGYAIAMIFGTFIESKYNTDTARIWIYNSWWFEAIHVFFLI
NFFGNIKRYKLYKKEKWATLLLHLSFIFIIVGAAITRYISYEGMMPIREGEISNRMYSDK
NFLTVFVDGEYEGSVKRRTIEKSLLLSPVADNSFLINKKFGEIPFEISYKNYVLDAKEVI
KEDEKGVLYLKLVESGDGTRHEHWLKEGEVQNIHNLLFALNKPTDGAVNINTIDNTIVTP
FDGQFMRMADKFQGKVTKDSVQALMYRSLYNLGGTQFVLPEAAKKGFKTFEASGNYKPKQ
HDDALTLIIRSGGEEKEITLVGSKGKQGEPVMVKLGKLDFTLMFGSKVYELPFKLKLNDF
IADKYPGTEKSYSAFESKVTVIDSANKFDARIYMNHILDYRGFRFFQASFDQDEKGTVLS
VNHDFWGTTITYIGYFLLFFCMMAILFVKNTRFADLKKKLETVKKKKAKLLSILLILSTT
LSFSQENHSHKQNTFNYKDSILKYKVPEAQADRFGRLVIQDDGGRMKPINTFSSELLRKV
SHNDTYEGMNSDQVFISMKQFPFAWMEIPLVYVKKDNDSIRKLIGVEPKQKLIPFAAFFD
KDGNYKLAPYLDEAYKTANPNQFEKDFVETDKKINLLNSALFGSILKIYPVPNDKNNKWV
SNLELNQPTGTALDTIKAAFPLYLQYLAKGTSTKEYAGANMMLEGMEKFQMKYGREVMPS
MEKVNYEILYNKYDVFKKLPYWYISLAILMFVLVISQIFKDRKFLRVSINVLHVLIGLCF
ALHTVGLIARWYISGHAPWSNAYEAIVYVAWATMFFGLAFDRKSKLTVASSAFVTAMILT
AAYANWIDPEIANLQPVLNSYWLMIHVAVIVASYGPFALGFILGFVSLLLMFFTNEKNKV
KMDLNIKELTYINEMALTVGLVMLTIGNFLGGQWANESWGRYWGWDPKETWALISIMVYA
FVIHARFVPGMKSRWIFNLMAMFAFMSILFTYYGVNFHLVGLHSYASGEAKSLAWIYEMA
IGISVVGILTYPKFKKYYKK
NT seq
3123 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaaaaaaaatatacgcgtttcttttctccacacgtttaatggcagttttatttata
ggttatgccatagccatgattttcggaacctttatagaaagcaaatacaatactgatacc
gctcgaatttggatatacaattcgtggtggtttgaagctatacatgtgttctttttaatt
aatttcttcggaaatattaaacgatacaaactctacaaaaaagaaaaatgggcaacatta
cttttgcacctttcttttatttttatcattgtaggcgcagctattactcgttacattagt
tatgaaggaatgatgcccattcgtgaaggcgaaatttcaaatagaatgtattcggataaa
aactttttgaccgtttttgtagatggagaatatgaaggaagcgtgaaaagaagaacaatt
gaaaaatcattattactttctccagttgctgacaattcatttttaattaataagaagttt
ggtgaaattccttttgaaattagctataaaaattatgtccttgatgcaaaagaagtaatc
aaagaagatgaaaaaggtgttttatatttaaaactggttgaatctggcgatggtactcga
catgaacattggctgaaagaaggcgaagttcaaaacattcataatttactttttgcttta
aataaaccaactgatggtgcggttaatataaatacaattgacaatactatagttactcca
tttgatggtcaatttatgagaatggctgataaatttcaaggaaaagttactaaagattca
gtccaagccttgatgtatcgttcgctttataatcttgggggaactcaatttgtattgccc
gaagcagctaaaaaaggatttaaaacttttgaagcttcaggaaattataagccaaaacaa
catgacgatgcattgactttaattataagatctggtggcgaagagaaagagataacactt
gttggttccaaaggaaaacaaggtgaaccagttatggtaaaacttggtaaacttgacttt
actttaatgtttggaagtaaagtttatgaactgccattcaaattaaaattaaatgatttt
atagctgataaatatcccggaacagaaaagagttattctgcgtttgaaagcaaagtcaca
gtaatagattcggctaacaagtttgatgcaagaatttatatgaatcatattttagattat
agaggtttcagatttttccaagcatcatttgaccaagatgaaaaaggaacagtactttca
gtaaatcatgatttttggggaacaaccataacttacattggttatttcttattgtttttt
tgcatgatggcaattctttttgtaaaaaatactcgttttgctgatttgaaaaagaaatta
gaaactgttaaaaagaaaaaagcaaaattactttcaatactacttattttaagtactact
ttgagcttttcgcaagaaaaccattctcataaacaaaatacttttaactataaagattct
attctaaaatataaagttcccgaagcacaagctgatcgatttggtagattagtcattcaa
gatgatggtggtagaatgaagccaatcaatactttttcttctgaattattgcgcaaggta
agtcataatgatacttatgaaggaatgaattctgaccaggtttttatttctatgaaacaa
tttccgtttgcttggatggaaattccgctagtttatgttaaaaaagacaatgacagtatt
cgtaaattaataggagtagagccaaaacaaaaattaattccttttgctgctttttttgat
aaagatggaaattacaaattagcgccatatttagatgaagcttataaaactgctaatccg
aatcaatttgagaaagactttgtagaaactgataaaaaaatcaatttattgaattctgct
ttgtttggaagtattttgaaaatttatccagttccaaatgataagaataacaaatgggtt
tctaatctagagttgaaccaaccaacgggaaccgctttagacactataaaagcagctttt
ccattataccttcaatatttagcaaaaggtactagcacaaaagaatatgctggtgcaaac
atgatgctcgaaggtatggaaaaattccaaatgaagtatggaagagaagtcatgccgagc
atggaaaaagttaattatgaaatactatataacaaatatgatgtgttcaagaaattacct
tattggtacatttcattagctattttgatgtttgtattagttataagtcaaatttttaaa
gatcgaaagtttttaagagtttctataaacgtattacatgttcttataggtttgtgtttt
gctttgcataccgttggattaatagctcgttggtatatttcgggtcatgcaccttggagt
aatgcttatgaagctattgtttatgttgcttgggcaacaatgttttttggtttagcattt
gatagaaaatctaaattaactgtcgcatcatctgcatttgtcacagcaatgatattaaca
gctgcttatgcaaactggatagatccagagattgcaaatcttcaaccagttttaaattct
tattggttaatgattcacgttgctgtaatagtagctagttatggtccatttgcattaggt
ttcatacttggatttgtttcgttattacttatgtttttcacgaatgagaaaaataaagtt
aaaatggatttaaacatcaaagaactaacctatattaatgaaatggcgttgacggttggt
ttagttatgttgaccattggaaactttcttggtggtcaatgggctaatgaaagttgggga
agatattggggttgggatccaaaggaaacttgggcattaatcagtataatggtttatgct
tttgtaattcacgcacgttttgttcctggaatgaaaagccgttggatttttaacttgatg
gcaatgtttgcctttatgtctattctatttacatattatggtgttaatttccatttagta
ggtttgcattcttatgcaagtggtgaagcaaaatctttggcatggatatatgaaatggca
attggtatttcagttgttggaatattaacttatccgaagtttaaaaagtattataaaaaa
taa
DBGET
integrated database retrieval system