Frederiksenia canicola: A4G17_02295 Help Entry A4G17_02295       CDS       T06481                                  Name (GenBank) hypothetical protein   KO K21449   trimeric autotransporter adhesin Organism fcl  Frederiksenia canicola Brite KEGG Orthology (KO) [BR:fcl00001]  09180 Brite Hierarchies   09183 Protein families: signaling and cellular processes    02000 Transporters [BR:fcl02000]     A4G17_02295 Transporters [BR:fcl02000]  Other transporters   Pores ion channels [TC:1]    A4G17_02295 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  YadA_head YadA_stalk Trp_ring YadA_anchor ESPR TAA-Trp-ring Motif Other DBs NCBI-ProteinID:  QIM64363 UniProt:  A0AAE6X4W2 LinkDB All DBs Position 477625..486222 Genome browser AA seq 2865 aa AA seqDB search MNKIFKVIWHHATQSWVVTSELSKAHGKTASTATAGESNLQINGIYKAGFVYTAIASAIL MVSGQVFATDLVTGTTASSGDDNYCSYNSESESVICGDASTSTVKTYETKKAKSIVIGKG TTNNGESNVAMGLSATTEGTASVAIGNAAKATFDQSVSIGQNAEASGRWDVSIGRFAGMG ATAPAPTKEGAKPKEAEGRNIAIGDAALKNGLDVNNNIAMGTSAGEGVKGARNVMLGTYV NSAEAISRAKSNKSTDTEINAKTRTVGTQTITYVEVENAVAIGHRALATKIGATAVGQQA QGFGTTSTAVGNSSRALGDNSVAMGNTANAGAGGAIAIGLHANYQPSVAASADGSTPKID SAYKTTGANSVAIGVRTNATSNHSIAMGTESKALAQGAVAVGSESKTEGVNATAIGQVAH AKGQNSFAGGNDSHAIGLSSVALGDGAGKGAMTTEEYKAGNYAKAASGNSSTAVGAYSKS KGEGGTAVGVSADAQDYRTVAVGAFSTAVSKSSVAIGDAAYAQVEDSIAIGRNVRTEYLP ADLALNNEGRGDREGMIAIGSEKTKASGKAAISIGRNAQGIGRGTVALGDASKALEGQGV AVGAQANVASGAAGGIAIGSLAKSEKHVAIAIGSESIAKVSHGVALGAKSVADVAANQVG SDPLSAATDKNNTTWTSTHAAVSVGNGTTVTRQITSVAAGTQDTDAVNVAQLKAAGFVLN TAADGGNANNSTPAGATGAADNKIANGESLTLKAGKGITLAQNGAEVKISTDLSAEDKIH YYSVNTTDTGDETNFNNDGAKAIDSVAAGVRVKTTQKNSVAIGSDVLADGAESLALGNKV KAIGLGATSIGNNSKAEAEGAQAFGQSSTATGVNSAAIGRLATASGNRASAFGVGNTASG ESSFAGGDKSKASGTATIAIGLNARASETNTVSIGRLSGSEGVDLANKGTNADITSRTNA GKTSANGLLSGTNVGNEAGHGTINNQYGVNIGNQAGSGGYNSYYGEGVSIGNKAGAVDKT NVAVKAEMERVSTERGAATGVIITGNTNTAISSRAGINTLGHDNVAIGKEAGGYTSGNAN IAIGRHAGRASKLNTPNNENSRVIDANAFSNARNTISMGEWANASANDAMALGSRAQATL ANNVAIGSNSVDRAATLEDSAKVNGILYAGFAGNEKADGSARTAGEISVFSVGSKHNERQ IVNVAPGNISATSTDAINGSQLYMVANNLRHNMPVIYTKEDGTPLDNREDGCYNTVTGGK CDSSTPVIASMSAPRTDKNTKDGTTTPVVLTNVQHTLTDTYSSTVDPRNPNGTAVTITKS QSAPTLYDAKNANPDWKFQNAATIRDVLNTGWNLQNNGLPKDFVKPYDTVNFVDGTGTTV VVESDGASSTVKVNTLVELVDAEGNPVKKAKDGKFYKPADIGADGNPTAGAKAVENPQVN LVNPTATAGNETKSPIQLGNLAAGTNTLDGTSTLEGKPLVKVGDDYYRPEDLDANGKPLS GKTNVPVVTLPNPNSAFAGLADLATSNPNNAVTVSDLRKMGWVLSGQAEDGSDYAKAIKN ADQVKFVGKGLANVTIGQNAETGAQEITFDVKQGEVIKEGEGTAKIDGQPTEVVKAPDGK YYKKSDIDPTTGEPKPNVAPLTDEQVATIKNNGNGLVTGHKVAEAIQKSGWTVGKAEAEE AFEVTYTNADEKVNPNDNVRFADGKNTVASLGTVKKLDADGKVVTTTVVKVDVDLPVDFK YTDATGKEYVKANDGKFYAKNEVGVDGFPSISAQPLTDDQVSELKKGAQLTDGVNANGQP NNGYTAKDPIQVAVQQAAEKAVKDTLAADPAATPETIAAAVKTATDKARVEAIKANPEAK DTVTAGTGGVNLDNVAWAEKPDQAVNKDQLDQTVNKSGFFVEQNGESTIAGQPTEKVTPN DTVNFANGANTLVTAETKRDEATGADKTTVTVNVNGLPLTYTTKDATGKDVPVAKVGDKF YQVGADGKPTGEALTPEQVKNLSTNLVNPEAGKGEIGAPSQLGNVANGANTFVAPQVDGK DIKLANDGKWYKESDVGANGKPTDTATAIDPAKAAEALKATPNGGLVDFEKSNPNNAATV GDLQNLGFNIGTSENGYTDQVRNNTKVDFVGDKKFITVEGSTNKDTGAREIKIALKEGDV IKPNEGIATIDGQPTEVVKTPDGNYYKKSDIDPTTGEPKPGVQPLTQAQKDTVVNNGDGL VTGHKVAEALQKSGWTVGKADAAEAAKVDYNHTPDTPEKVNPDDEVRFADGKNTQVSLGT VKKVDNEGKVVTTTTVKVDVDLPIDFKYTDATGKEFVKANDGQFYAKDDVNPDGSVKKPT DPAAQAPKALKPEEVAKLNKGAQLTNGLGKDTPKYEVKDPVAAAAEKAVADTLAANPQAT PADILKAVDAAKAAAIKANPNAKDEITKGTGGVNLDNVAWAEKPDQAVNKDQLDQTVNKS GFFVQQNGESTNGKGKPTEKVTPNDVVDFTNGANTVVTAETTRDEKTGVDTTKVSVHVNG LPLTYTTKDASGKDVPVAKVGDKFYQVGADGKPDMTKPADVNALSTNLVNPAAPNGEIGK PSQLGNVANGANTFNAPVVDGEKIKLANDGKWYKESDVGANGKPTDTATAIDRTKAKDAL GTAGNGGLADFANSNPNNAATVGDLQNLGFVIGTADDKYKDQVRNNSRVEFASGNKNATV TGSTLADGTRQVKVTISDNPVFNTIQVGGDKGPKVGSTSTGDLSVSKADGSAARITNVAP GVNGTDAVNVNQLNQGLGDVHKRINKTNKDLRGGIAGSNAAAGLPQVYLPGKSMVAAAAG TYKGESAVAVGYSRASDNGKVILKLQGNANTRGDFGGSVGVGYQW NT seq 8598 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgaacaaaatttttaaagtgatttggcatcacgcaacgcaaagctgggtagtaacgtca gaactcagcaaagctcacggtaaaacggcctcaacagccacagcaggtgaatctaactta caaatcaacggtatctataaagcaggctttgtttataccgcaattgcatcggctatttta atggtgagtggtcaagtgtttgccactgatctagtaacaggtactacagctagctcagga gacgataactattgttcttataatagtgagagtgaaagtgtcatttgtggtgatgcaagt acaagtactgttaaaacgtatgagactaaaaaagcgaaatcaatagtaattggcaaaggc actacaaataacggcgagagcaatgtggcaatggggctatctgcaaccactgaaggtact gcatctgttgctattggtaatgctgctaaagcaacattcgatcaatcggtctctattgga cagaatgcagaggcaagtggtcgttgggatgtgtctattggtcgttttgctggtatggga gcaactgctccagctccaacaaaagaaggagcaaaacctaaagaagctgaaggacgtaac attgccattggtgatgcggcacttaaaaatggtttagatgttaataataatatcgcaatg ggtacgagtgcaggtgaaggtgttaaaggtgctcgcaatgtaatgttgggtacttatgtt aactctgccgaggcaatttcaagagctaagtctaataaatcaacggatacagaaattaat gctaaaacaagaacagtaggtactcaaactattacttatgttgaagttgaaaatgccgtc gccattggtcaccgtgctttggctactaaaattggagcaacagcagttggtcaacaagcc caaggctttgggacaacatcgacggcggtgggtaattcttcccgtgctttaggagataat tccgttgcgatgggtaatacagctaatgctggtgctgggggagcgattgctattggttta catgctaactatcaaccttctgttgcagcatctgctgatggatcaactccaaaaatcgat tcagcatataagacaactggagcaaactcagttgcaattggtgtacgtactaatgctacg tcaaatcattcaattgcaatgggtactgagtctaaagcattagctcagggtgctgtggca gtcggttctgaaagtaaaacagaaggggttaatgcaaccgcgataggtcaagtagctcat gcaaaaggtcaaaactcgtttgctggtggtaatgactcacatgcaattggtctatcttca gtagcacttggtgatggtgctggtaaaggtgctatgactacagaagagtataaagcgggt aattatgctaaagctgcatctggaaatagctcaacagcagttggcgcatattcaaagtct aaaggagagggcggcaccgctgttggtgtatctgcagatgcacaagattatcgtacagtt gcagttggtgcattcagtacagcagtatctaaaagctcagtcgctataggtgatgcagct tatgcacaagtagaagattcaattgctattggccgtaatgtgagaacagagtatctacca gctgatctagctttaaataatgagggtagaggcgatcgtgaagggatgattgcaataggt tccgaaaaaaccaaagcatctggtaaagcagcaatttcaattggtcgtaatgctcaaggt attggtcgtggtactgttgcattaggtgatgcttctaaagcactagaggggcaaggggtt gccgttggtgctcaagctaatgttgcaagcggtgctgcaggtggtattgcaattggttct ttagctaagtcagaaaaacatgttgcaattgcaatcggttctgagtctatcgctaaggta agccatggtgtagcactaggtgctaagagtgttgcagatgttgctgcgaaccaagttggt agcgatcctttatctgcagccacagataaaaataatactacttggacctctactcatgct gcagtgtcagttggtaatggtacaaccgtaacccgtcaaattacttctgttgcagctggt acacaagatacggatgcggtgaatgtggctcaattaaaagcagcaggctttgtattaaat acggcagctgatggtggcaatgcaaataactcaactccagctggagcaacgggtgcagct gataataaaatcgccaatggtgaatctcttactttaaaagcgggtaaaggcattactttg gctcaaaatggagctgaagttaagattagcacagacttatctgctgaagacaaaatacat tattatagtgtgaataccacagacacaggggatgagactaactttaataatgatggagct aaagcgatagattctgttgctgcgggtgtgcgtgttaaaacaacacaaaaaaactccgtt gctatcggtagtgatgttcttgcagatggtgcagaatcattagctttaggtaataaagtg aaagctatcggcttaggtgcaacctctattggtaataacagcaaggcagaggcagaaggt gctcaggcatttggtcaaagctcaacagcaacaggtgtaaattctgctgcgattggtcgt ttagcaacggcaagtggtaatcgtgcttctgcatttggtgtgggtaataccgcttctgga gaatcatcatttgctggcggcgataagagtaaagcatctggtacagcgactatcgctatt ggtttaaatgcaagagcctcagaaactaatacagtttctattggtcgcctatctggttca gaaggtgttgatttggctaataaaggtactaatgccgatatcactagccgaacaaatgca ggtaaaacaagtgctaatggtttattaagtggtacgaatgttggtaatgaagcaggacac ggtactatcaataaccaatatggtgtaaatatcggtaatcaagctggtagtggtggctat aacagttactacggtgaaggtgtgtctatcggtaacaaagccggtgcagtcgataaaacg aatgtagcagttaaagcagagatggaaagagtttctacagaaagaggtgctgcaactggc gtgattataacgggcaataccaatactgctatttcatcaagagcaggtatcaatacgtta gggcacgacaatgttgcaattggtaaagaagctgggggttacacttcaggtaatgccaat attgcaattggacgccacgcagggcgcgcaagcaaattaaatacgccgaataatgaaaat tctagagtcattgatgcaaacgcattctccaatgcccgtaatactatttctatgggggag tgggcaaatgcttctgctaatgatgcaatggctttaggttctcgtgcacaagcaacactt gcaaataatgttgcgatcggttctaactctgttgaccgtgctgcaaccttagaagatagt gcgaaagtgaacggcattttatatgcaggttttgcaggaaatgaaaaagctgatggttca gctagaactgcgggtgaaatcagcgtatttagcgtaggctcaaaacataatgagcgtcaa atcgtgaatgttgcacctggtaatatttctgcgacatccactgatgcaatcaatggtagc caactttatatggtagcaaataacttgcgtcacaatatgccagttatttataccaaagaa gacggtacaccattagataaccgtgaagatggctgttataacaccgtaacaggtggtaaa tgtgatagctcaacaccagttatcgcctcaatgagtgcaccaagaacggataaaaataca aaagatggcacaacaacacccgtagtattaactaatgtccaacatacattaacagatacg tatagctcaactgttgatccacgtaatccaaatggtacagcagtaacgattactaaatcg caatcagctccaacactatacgatgcaaaaaatgcaaacccagactggaaattccaaaat gcagctacaattcgtgatgtattaaatactggttggaatttacaaaataatggcttgcca aaagactttgttaaaccatatgacacagtgaactttgtagatggcacgggtacgacggta gtagtggagtctgatggggcctcgagcacagtgaaagtgaatactttagttgagcttgtc gatgcagaaggtaaccctgttaagaaagcgaaggatggtaagttctacaaaccagctgat attggtgctgatggtaacccaactgctggggctaaagcagttgaaaatccacaagtgaat ttagtgaatccaactgcaacagcaggtaatgaaactaaatcaccaattcagttaggtaac cttgctgcaggaacaaacacgttagatggaacatcaacgttagagggtaagcctctagtt aaagtgggtgatgattactacagaccagaagacttggatgctaatggtaaaccattatca ggtaaaactaatgttcctgttgtgactctccctaatcctaattcggcgtttgcaggctta gctgatttagcaacatcaaatccaaataatgcggtaaccgtttctgacctaagaaaaatg ggttgggtattatctggtcaagctgaagatggatcagactacgcaaaagcaattaaaaat gcagatcaagtgaagtttgttggtaaaggtcttgctaatgtaacaattggtcaaaatgca gagactggtgctcaagaaataaccttcgatgtaaaacaaggtgaagttatcaaagaaggt gaaggtaccgcaaaaattgatggtcaaccaacagaagttgtgaaagctccagatggcaaa tactacaaaaaatcggatattgacccaacaacaggtgagccaaaaccaaatgtagcacca ctaaccgatgagcaagttgcaaccattaaaaacaatggtaacggtctagtgactggccac aaagtggcagaagctatccaaaaatcaggttggacagtaggtaaagcagaggctgaagaa gcgtttgaagtcacttatactaatgcagatgaaaaagtgaacccgaatgataatgttcgc tttgcagatggtaaaaacacagtagcgtctttaggtactgtgaagaaattagatgcggat ggcaaagttgttactacgactgttgtgaaagtggatgtcgatttaccagttgatttcaaa tataccgatgcgacaggcaaagagtatgtgaaagcaaacgatggtaagttctatgcgaaa aatgaagttggtgttgatggcttcccaagcatcagtgctcaaccacttacagatgaccaa gtttctgaattgaagaaaggtgctcagcttactgatggggtaaatgcaaatggtcaacca aacaatggctatactgcaaaagatccaattcaagttgcagtacagcaagcagcagaaaaa gccgttaaagatactttagccgctgatccagcagcgacaccagaaactattgcagccgca gtaaaaacagctacggataaagcgcgtgtagaagcgattaaagcaaatcctgaagcgaaa gatacggtgactgcaggtacaggtggtgtgaacttggataacgttgcatgggcagaaaaa cctgaccaagcggtaaacaaagaccagttagaccaaactgtcaacaaatcaggcttcttt gtagagcaaaacggtgagtcaactatcgcaggtcaaccaactgagaaagtcacgccgaac gacacggtaaactttgcaaatggtgcgaatacccttgtgacagcagaaaccaagcgtgat gaagcaacgggtgctgataagacaacagttacagtcaatgtaaacggcttaccacttact tacacgaccaaagatgcaacaggcaaagatgtacctgtggcaaaagtgggtgataagttc taccaagtgggtgcagacggtaaaccaacaggtgaagccttaacaccagagcaagtgaaa aacttatcaactaacttagtgaacccagaagcgggtaaaggcgaaattggtgcaccatca caattaggtaatgttgcaaatggtgcaaacacctttgttgcgccgcaagtagatggcaaa gacatcaaactcgctaacgacggtaaatggtacaaagaaagtgatgttggagctaacggt aaaccaacagataccgcaaccgctattgacccagcgaaagcagcagaagcacttaaggca acacctaatggtggtttagtagatttcgagaaatctaacccgaacaacgcggcgacagta ggcgacttacaaaaccttggctttaacattggtacttcagaaaacggttataccgaccaa gtacgcaacaatactaaagtggactttgtcggcgataagaaatttatcaccgtagaaggt tcaaccaataaagacacaggtgctcgtgaaatcaagattgccttgaaagaaggcgatgtt atcaagccaaatgaaggcattgcaaccattgatggtcaaccgactgaagtagtgaaaacc ccagatggcaactactacaaaaaatcagacattgacccaacaacaggtgagcctaaacca ggtgttcaaccattaacacaagcacagaaagacactgtggtgaacaatggtgatggttta gtgactggtcacaaagtcgcagaagcattgcaaaaatcaggctggacagtgggtaaagcg gatgcagcggaagcggcaaaagtggactacaaccatacaccagacacgccagagaaagta aatcctgatgacgaagtacgtttcgcagatggtaagaacacccaagtgtcactgggtacg gtgaagaaagtggataacgaaggcaaagtagtcacaaccaccacagtgaaagtggatgtg gatttaccaattgacttcaaatacaccgatgcaaccggcaaagagtttgtgaaagcgaac gacggtcagttctacgcgaaagacgatgtgaacccagatggctctgtgaaaaaaccaact gacccagcggcacaagcaccgaaagcgttgaaaccagaagaagtggcgaaactcaacaaa ggggcacagctcactaacggtcttggtaaagacacgccgaagtatgaggtgaaagaccca gttgcagcggcagctgaaaaagcggtcgcagatactttggcagctaacccacaagcaacg ccagcggacatcttaaaagcagtagatgcagcgaaagcagccgcaatcaaagcaaatcca aatgctaaagatgaaatcaccaaaggtacaggtggtgtgaacttggataatgttgcctgg gcagaaaaaccagatcaagcggtgaacaaagatcagttagatcaaacagttaacaaatca ggcttctttgtacaacaaaatggtgagtccaccaacggtaagggtaaaccgactgaaaaa gtgaccccgaacgatgtggttgatttcaccaatggtgcaaatacggttgtaacagcagaa acaacacgtgatgaaaaaacaggtgtggatacaaccaaagtttctgtacacgtaaatggt ttaccacttacctacacaactaaagatgcaagtggtaaagatgtgcctgtagcgaaagtg ggagacaagttctaccaagtgggtgcagatggcaaaccagatatgactaaacctgcggat gtgaatgcattaagcactaacttagtgaacccagcggcaccgaatggtgaaattggtaaa ccatcacaattaggtaatgttgcaaatggtgcaaacacctttaatgcaccagttgttgat ggtgagaaaattaaactcgctaacgacggtaaatggtacaaagaaagtgatgttggagct aatggtaagccaacagataccgcaaccgctattgaccgaacaaaagcgaaagatgcttta ggtacagcaggtaacggtggtttagcggattttgcaaactctaacccgaacaatgcagcg accgtgggtgatttacaaaacttaggctttgtgattggcacagcagatgacaaatacaaa gatcaagtgcgtaataacagccgtgttgagtttgcaagtggcaacaaaaatgcaacggtc acaggttcaacgctggctgatggcacacgtcaagtgaaagtaaccatttcggataatcca gtatttaacactattcaagttggtggagataaaggtccgaaagttggctcaacatcaacg ggtgacttatctgtgagtaaggctgatggctctgcggcacgtattaccaatgttgcacca ggtgtaaacggcactgatgcagtgaacgtaaaccaacttaaccaaggtttgggtgatgtt cataaacgcattaataaaactaacaaagacctccgtggtggtatcgctggttcgaatgcc gcagcaggcttaccacaagtttacttaccaggtaaatcaatggtggcagctgcagcaggt acctataaaggcgaaagtgcggtggctgtaggttactcacgtgcaagtgacaacggtaaa gttatcttgaaacttcaaggtaatgcgaatactcgcggagacttcggtggatctgtgggt gtaggttaccaatggtaa

DBGET integrated database retrieval system