Frederiksenia canicola: A4G17_07810
Help
Entry
A4G17_07810 CDS
T06481
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K21449
trimeric autotransporter adhesin
Organism
fcl
Frederiksenia canicola
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
fcl00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
fcl02000
]
A4G17_07810
Transporters [BR:
fcl02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
A4G17_07810
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
YadA_stalk
YadA_head
Trp_ring
YadA_anchor
ESPR
TAA-Trp-ring
Phage_T7_tail
DUF4450
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QIM65355
LinkDB
All DBs
Position
1617857..1627477
Genome browser
AA seq
3206 aa
AA seq
DB search
MNKIYKVIWSQVANAFIAVSELASARGKTKSVSNSDGVSPSDNTQTFKLTKLALLSSIVF
ALPSYVTATEVNADTLNVTGTATFNGNATFNNGITTNTLTVGGKNVATEEQITNLTNQLN
SKANNTELNTLKTTVEGKANQTDLTALQGTVATKASQADLTTLQATVATKANQTDVTALQ
NNKADKSALTTLSNTVTNNQNQFNALNTLFNTLELTSTYSGIKYFRANSTGPDATATGTN
ALAAGSSSKATGNNAVAVGHNAEAKDKETVAVGHNTTAKADMSITIGSGSYTEDTAKKGV
AIGNKSRVGSKKDGDVTYDGGSTYVIGDGESSVAVGDNAIARGNRNIAIGKDSVTANKDA
DTAFAEDSIAIGTAAKTIASSKAIALGNEAKVEKKADFALAIGNQATSSAQKAVAIGPNS
QAIGDSAIAVGSTARASTRAVAIGENTNAASSSSVAIGQLAQALPEKTISIGLNAGKGQA
SDATGTKNSHINIGEEAGENVDGQGNIGIGAGAGSNVIGKVNIALGQHAGKFIVNSPETL
GENIAIGNNANTYTSATAIQRATAVGSQTKAGQDSTALGYNANASSKQSVAIGFNASIKG
ESGVAIGFSASSDANNVALGSSSVAKEKSATSYLTAKPSSSVVSVGNQNLDTPLLRRIVN
VADGADDQDVVTVAQLKRASSDVTNNLNQLINNLPQNQNNGINYDVVPPPADSGATAGIT
LKQNTRISNVADAKTEKDAVNYGQMLAYVNSTTTHYFSVNDGGITRGNKDNSKATGELSM
AIGQSVAAIAERSIAIGNNANAHGVGSIAIGTKYIGSAELDDGVADRSSETNAAIANNKY
QYGLAIGAGANTEGHNSIAIGSLAATSNKDITKGNVDRAIALGYFARSSAEKANAIGDRA
IANSLKGNAFGSEAFSGAESANAIGTLANATGTNSIAFGTHTKVTGTNSGSIGYAGVLGD
TNATVVSGSGTYSLGNTNDDISANESGVFGNNNVLKAKENVRIVGNQNIIGNVTTTTPSG
AAPVNELKNIQVSGYENTISSGNKLANDLSGLFVYGHHNTVANIDDPDSQEEVKIIDSTV
IGANNTLNAKGNSFFVLGNNVTTTQDNSVYLGDGASAHVAKSASSSGMETYTTRTDNHSG
HTFAGGKPVGVVTVGATGTERRIQNVAAGLVDAESTDAINGSQLYALTRPLRFGGDNSTI
SNQDSGIPAGDQNVIARSSNQAMDIKGGENNDANLTTLNDKNIGVIVRDTNSMEVKLAKN
LKGLESANFGTGNDLTTINKDGITIKNPNKSDVSLTDNGLNNGGNKVTNVANGDVNSTST
DAINGSQLHEVKTVVESKLSSFTVGADKDATATGIVIDKDNARFDIVGKDNGKVTTVVEG
NKVTVDLTQEAKDSLAKADSALQNVVSNDPNLTATKNGGTITLDFSDTPTFKGVTAGTGV
NQVVLDDNGVNVGGKTYISNAGLNANNEVITNVASNLPVINDNTAAANQPHNGTKTQTKP
NNVVITNAATVGDVLNAGFNLQTNGTATDFVKPYDTVNFADGTGTTVTSETDGNKTTFKV
NVDAQKLAETAQLPVVYTKADGTKVYKHADGNFYTDPTDKTNKVELADIIASMQGADSST
TNPTTLANVQAGKKDTDAVNVSQLKGAVDALGGGAAVNPDGTIKAPTYNITNPANDSVKQ
ANNVGDALNSLNDAVNSPLSFGGDTGADVTRKLGQKVSVVGGVTDETKLSSGNIGVVANG
NDKLEVKLAKNLTGLSSAEFQDAAGNTTTVNGNGVTITPANQADPTKTVSLTKDGLNNGG
NQITNVATGANTFNAPVVDGEKIKLANDGKWYKESDVGANGKPTDTATAIDPAKAAEALK
ATPNGGLVDFANSNPNNAATVGDLQNLGFNIGTSENGYTDQVRNNAKVDFVGDKKFITVE
GSTNKETGTREVKISLKEGDIINKDEGTATIDGQPTEVVKAADGKYYKKSDIDPTTGLPF
VDPKSNQPRADITPLTDDQVATIKNNGNGLVTGHKVAEALQKSGWTVGKAEAEEAFEVTY
TNADEKVNPNDNVRFADGKNTVASLGTVKKLDADGKVVTTTVVKVDVDLPVDFKYTDATG
KEYVKANDGKFYAKNEVGVDGFPSISAQPLTDDQVSELKKGAQLTDGVNANGQPNNGYTA
QDPIQVAVEKAAKDAVAKTLQDNPQATPEQIAAAVKTATDRARVDAIKANPEAKDTVTAG
TGGVNLDNVAWAEKPDQAVNKDQLDQTVNKSGFFVEQNGESTIAGKPTEKVTPNDTVNFA
NGANTLVTAETKRDEATGADKTTVTVNVNGLPLTYTTKDATGKDVPVAKVGDKFYQVGAD
GKPDMTKPADVNSLSTNLVNPAAPNGEIGKPSQLGNVANGANTFDAPVVDGEKIKLANDG
KWYKESDVGANGKPTDTATAIDPAKAAEALKATPNGGLVDFEKSNPNNAATVGDLQNLGF
NIGASENGYTDQVRNNAKVDFVGDKKFINVEGATKADGTREIKISLKEGDVIKPNEGIAT
IDGQKTEVVKTPDGNYYKKSDIDPTTGEPKAGATPLTQAQKDTVVNNGDGLVTGHKVAEA
LQKSGWTVGKADAAEAANVDYNNKSEKVNPDDKVSFADGKNTQVSLGTVKQEDKDGKVVT
TTTVKVDVDLPIDFKYTDATGKEFVKANDGKIYAKDQVGADGKPNGNATPLADAEVAKLN
KGAQLTNGLGKETPKYEVKDPIAAAAEKAVADTLAANPQATPADILKAVDAAKAAAIKAN
PNAKDEITKGTGGVNLDNVAWAEKPDQAVNKDQLDQTVNKSGFFVQQNGESTNGKGKPTE
KVTPNDVVDFTNGANTVVTAETTRDEKTGVDTTKVSVHVNGLPLTYTTKDASGKDVPVAK
VGDKFYQVGADGKPDMTKPADVNALSTNLVNPAAPNGEIGAPSQLGNVANGANTFVAPQV
DGKDIKLANDGKWYAADQVDPNGSAKANAKAIDAAKAKDALGTAGNGGLADFANSNPNNV
ATVGDLQNLGFVIGTADDKYKDQVRNNSRVEFASGNKNATVTGSTLADGTRQVKVTISDN
PVFNTIQVGGDKGPKVGSTSTGDLKVSKADGSAARITNVAPGVDNNDAVNVGQLKGAVNN
INNHVNKINKDLRAGIAGATAISFLQRPNEAGKSIISVGMGSYKAESAVAVGYSRNSDNN
KISIKVGAGLNSRGDVNFGGSVGYQW
NT seq
9621 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataagatatacaaagttatctggagccaagtagctaatgcatttattgctgtttct
gagttagctagtgctagaggaaaaactaagtctgtcagcaatagtgatggtgtaagccct
tcggacaatacacaaacatttaaattaaccaaacttgctcttctatcttccatagtattt
gcactcccaagctatgtcactgcgacggaagtaaatgctgacacattaaatgtaactgga
acagctacctttaatggaaatgcaacatttaataatggaataaccaccaacactctaact
gttgggggaaaaaatgttgctacagaagagcaaattactaatttaacgaatcagttaaac
agtaaagctaacaatacagagttaaatacattgaaaacaactgtagagggtaaagctaat
caaactgatttaacagcattacaaggcacagtcgcaactaaagcaagtcaagcggattta
acaaccttgcaagccactgttgcaaccaaagccaaccaaacagatgtaactgctttgcaa
aacaacaaagcagataaatccgcattaaccaccctatctaatacggttactaataatcaa
aatcaatttaatgcactaaatacattattcaacacattagaattaacatcaacctattca
ggaatcaaatattttcgtgcaaattcaactggaccagatgcaactgcaacaggaacaaat
gctcttgcagcaggctcaagttctaaagctactggcaataatgctgtggctgttggtcac
aatgcagaagctaaagataaagagactgtggctgttggccataacactactgccaaagca
gacatgtctattacaattggttcaggttcatatactgaagatacggctaaaaaaggagtt
gccattggtaataaatcacgagtaggctcaaaaaaggacggggatgttacttatgatggt
ggctcaacctatgtaattggtgatggtgaaagttccgttgctgtgggtgacaatgctata
gctcgtggtaatcgtaatatcgctattggtaaagattctgtaactgcaaataaagacgct
gatactgcttttgcagaagacagcattgctataggtacagccgcaaaaacaattgcaagt
agtaaagctattgcattaggtaatgaagcgaaagtcgagaaaaaagccgactttgctcta
gcaattggtaatcaagccacctcgtctgctcaaaaagcagttgctattggtccaaattct
caagcaataggcgattcagctattgccgtaggttctactgctagagcatcaacaagagct
gttgcaattggtgaaaatactaatgcagcatcttcaagcagtgttgctattggtcaactc
gctcaagcgttaccagaaaaaaccatttctattggtttaaatgctggtaaaggtcaagct
tccgatgcaacaggaaccaaaaattcccatatcaatattggtgaagaagctggtgaaaat
gtagacggtcaaggaaatatcggtattggtgcaggagcaggctccaatgttatcggcaaa
gtaaatattgcattaggtcagcacgctggtaaatttattgttaactctccagaaacacta
ggcgaaaatattgcgattggtaataatgcaaatacctataccagtgcaacagcaatccaa
cgtgcgacagctgttggttcacaaactaaagcaggtcaagattctacagctctaggttac
aatgctaatgcatcttcaaaacaatctgttgctattggtttcaacgctagtatcaagggc
gaaagcggtgttgcaattggttttagtgcaagctcagatgcaaataatgttgctttaggt
agtagctcagtagctaaagaaaaaagtgcaacaagctacctcacagctaaaccatcaagt
tcagtagtctctgttggtaatcaaaatttagatactccccttcttcgtcgaatcgtaaat
gttgcggatggtgcagacgatcaagatgtagtaaccgttgcacaattaaaacgagcctca
tctgatgtcactaacaatttaaatcaacttatcaataatctaccacaaaaccaaaataat
ggtatcaattatgatgtggttccacctccagcagatagtggagctactgcaggtattaca
ttaaagcaaaatactcgtatctccaatgttgctgatgctaagacagaaaaagatgctgtt
aattacggtcaaatgctagcatatgtaaatagcactacaacacattattttagtgtgaat
gatggtggtattacgagaggtaataaagataattcaaaagcaactggtgaattatcaatg
gcaattggtcaatctgtagcagcaattgctgaacgtagtattgcaattggtaacaacgca
aatgcacacggagtaggttctattgctattggcactaaatatatcggctccgctgagtta
gatgatggtgttgcagatagaagtagtgaaactaatgctgcaattgcaaataacaaatat
caatatggtctagctattggtgcaggagcaaatactgaaggacacaattcaattgcaatt
ggtagtttagcagccacatcaaataaagacattaccaaaggtaatgttgatcgtgcaatt
gcacttggttattttgctcgctcatctgctgaaaaagcaaatgctattggtgatagagca
attgctaactcactaaaaggtaatgcatttggtagtgaagcattctctggcgctgaatca
gctaatgccattggtactcttgctaacgcaacaggaactaattctattgccttcggtacc
catacaaaagttacaggaaccaactctggtagcatcgggtatgctggcgtattaggtgat
acaaatgcaactgtagttagtggctctggtacttattctctcggtaatactaacgacgat
atttctgctaatgaaagtggtgtatttggtaataacaacgtattaaaagcaaaagaaaat
gttcgtattgtaggtaatcaaaatatcatcggaaatgtaaccactaccacaccaagcgga
gctgctcctgttaatgaacttaaaaacattcaagtatctggttatgaaaatactatcagc
agtggcaataaacttgctaatgatttaagtggtttatttgtttatggacaccacaataca
gttgcgaatattgatgatcctgattcgcaagaggaagttaaaattatagattctacagtt
atcggtgcgaacaataccttaaacgcaaaaggtaacagtttctttgtacttggtaataat
gtcacaacaacacaggataattccgtttatttaggtgatggagcctccgcccatgtagct
aagtcagcttcatcatccggaatggaaacctatacaacaagaacggataatcattctgga
catacatttgcaggaggcaaacctgtaggtgttgttaccgttggtgccactgggacagag
cgtagaattcaaaatgttgcggctggattggttgatgctgaaagtactgatgctatcaat
ggtagccaactttacgctttaactcgtccattacgttttggaggagataactccaccatc
agcaatcaggatagcggtattccagctggagatcagaatgttatcgcccgaagctctaac
caagcaatggatattaaaggtggagaaaataatgatgcaaatcttactactctaaatgat
aaaaatattggtgttattgttcgtgacactaactcaatggaagttaagttagctaaaaac
ctaaaaggattagaaagtgctaattttggtacaggcaatgatttaacgactattaataaa
gacggcattaccattaaaaaccctaacaagtcagatgttagtttaactgataatggactt
aataatggtggtaacaaagttactaatgtggctaatggtgatgtcaattcaacctctact
gatgccataaatggtagccaattacacgaggtaaaaactgttgtagaaagtaagttaagt
tcatttactgtaggtgcagataaagatgcaacagctacaggtattgttattgataaagac
aatgcacgttttgatattgttggtaaggataatggaaaagtaaccactgtagtagaaggc
aataaagtcacggttgatttaactcaagaggcaaaagatagtttagcgaaagcagattct
gcactacaaaatgtggtatctaatgaccctaacttaaccgcaaccaaaaatggtggcacc
attacattagacttctctgatacaccaacctttaaaggtgtaacagcaggcactggcgta
aaccaagttgtattggatgacaacggtgttaacgttggtggaaaaacgtatatctctaat
gctggtttaaatgcgaataatgaagtaatcactaacgttgcttctaatttaccagttata
aatgataatactgcagcagctaatcagccacataatggcacaaagacacaaacaaaacca
aacaatgttgttataactaatgcagcaaccgttggtgatgtactaaatgcaggctttaat
ttacaaacaaatggtacagcaacagactttgttaaaccttacgatacagtgaattttgct
gatggcactggtacaacagtaacaagtgaaacagatggtaataagacaactttcaaggtg
aatgttgatgctcagaaattggcagaaacagcacaattgcctgtggtttacactaaagca
gatggtactaaagtctataaacacgctgatggcaatttctacacagatccaacggataaa
acaaacaaagtcgaacttgcagatattattgcctctatgcaaggtgctgatagttcaaca
actaacccaactacattagcaaatgtccaagcaggtaaaaaagatactgacgcagtaaat
gtaagccaactgaaaggtgcggttgatgcgttaggtggtggtgctgcggttaacccagac
ggcacaattaaagcaccaacttataacatcactaaccctgcaaatgattcagtgaaacaa
gcaaataatgtaggcgatgcattaaatagcttaaatgatgcagtaaatagcccattatct
tttggtggtgatactggtgctgatgtaacccgtaaacttggtcaaaaagtaagtgtggtt
ggtggtgttacagatgaaacaaaattatcaagcggtaacataggtgttgttgcaaatggc
aacgataaactagaggttaaacttgctaaaaatttaacagggctttctagtgcagaattc
caagatgccgcaggtaacacaacaaccgtaaatggtaatggtgtaacgattacgcctgct
aatcaagcagatccaaccaaaacagtatctttaaccaaagatggcttaaataacggcggt
aatcaaattactaacgttgcaactggtgcaaacacctttaatgcaccagttgttgacggt
gagaaaattaaactcgctaacgacggtaaatggtacaaagaaagtgatgttggagctaac
ggtaaaccaacagataccgcaaccgctattgacccagcgaaagcagcagaagcacttaag
gcaacacctaatggtggtttagttgattttgcaaactctaatccaaataacgcggcaaca
gtaggcgacttacaaaatcttggctttaacattggtacatcagaaaatggttataccgac
caagttcgtaacaatgccaaagtagactttgtaggcgataagaaatttatcactgtagaa
ggttcaactaataaagagactggtacacgtgaagtcaagatttccttgaaagaaggcgat
atcatcaataaagacgaaggcacagccacgattgatggacaaccgacagaagtcgtgaaa
gcggctgatggtaagtactataagaaatcagatatcgatcctacaacaggtcttccattt
gttgatccaaagtcaaatcaaccaagagcggatatcacaccactaaccgatgatcaagtt
gcaaccattaaaaacaatggtaatggtttagtgacgggtcacaaagtggcagaagcgttg
caaaaatcaggttggacagtaggtaaagcagaggctgaagaagcatttgaagtcacttat
actaatgcagatgaaaaagtgaacccgaatgataatgttcgctttgcagatggtaaaaac
acagtagcgtctttaggtactgtgaagaaattagatgcggatggcaaagttgttactacg
actgttgtgaaagtggatgtcgatttaccagttgatttcaaatataccgatgcgacaggc
aaagagtatgtgaaagcaaacgatggtaagttctatgcgaaaaatgaagtaggtgttgat
ggcttcccaagcatcagtgctcaaccactcacagatgaccaagtttctgagttgaagaaa
ggtgctcagcttactgatggggtaaatgcaaatggtcaaccaaacaatggttatactgca
caagatccaattcaagtagcagtagaaaaagcagccaaagatgctgttgcgaaaacattg
caagacaacccacaagctactccagagcaaattgcagctgcagtaaaaacagcaacggat
agagcgcgtgttgatgcgattaaagcaaatcctgaagcgaaagatacggtgactgcaggt
acaggtggtgtgaacttggataatgttgcatgggcagaaaaacctgaccaagcggtgaac
aaagaccagttagatcaaactgtcaacaaatcaggcttctttgtagagcaaaacggtgag
tcaactatcgcaggtaaaccaactgagaaagtcacaccaaacgacacggtaaactttgca
aatggtgcgaatacccttgtgacagcagaaaccaagcgtgatgaagcaacgggtgctgat
aagacaacagttacagtcaatgtaaacggcttaccacttacttacacgaccaaagatgca
acaggcaaagatgtacctgtggcgaaagtgggtgacaagttctaccaagtgggagcagat
ggcaaaccagatatgaccaaaccagcggatgtgaattcattaagcactaacttagtgaat
ccagctgcaccgaatggtgagattggtaaaccatcacaattaggtaatgttgcaaatggt
gcaaacacctttgatgcaccagttgttgacggtgagaaaattaaactcgctaacgacggt
aaatggtacaaagaaagtgatgttggagctaacggtaaaccaacagataccgcaaccgct
attgacccagcgaaagcagcagaagcacttaaggcaacacctaatggtggtttagtagat
ttcgagaaatctaacccgaacaatgcggcgacagttggtgatttacaaaatcttggtttt
aacattggtgcatcagaaaatggttataccgaccaagttcgtaacaatgccaaagtagac
tttgttggcgataagaaatttatcaatgtagaaggtgcaactaaagcggatggcacacgt
gaaatcaagatttccttgaaagaaggtgacgttatcaagccaaacgaaggcattgcaacc
attgatggtcaaaaaacggaagtagtgaaaaccccagatggtaactactacaaaaaatca
gacattgacccaacaacaggtgagccaaaagcgggggcaacaccattaacacaagcacag
aaagacactgtggtaaacaatggtgatggcttagtgactggtcacaaagtcgcagaagcg
ttgcaaaaatcaggctggacagtcggtaaagcggatgcagcagaagcggcaaacgtggac
tataacaacaagtctgaaaaagtgaaccctgatgataaagttagttttgctgacggtaaa
aatactcaagtatcattgggtacagtgaagcaagaagacaaagacggtaaagtagtaacg
acgacgactgtaaaagtggatgtggatttaccaattgacttcaaatacaccgacgcaacg
ggcaaagagtttgtgaaagcaaacgacggcaagatctatgctaaagatcaagttggagca
gatggcaaaccaaacggtaatgcaacaccattagcagatgctgaagttgcaaaactgaac
aaaggtgcgcagctcactaacggtcttggtaaagaaacgccgaagtatgaagtgaaagac
ccaattgcagctgcagctgaaaaagcggtcgcagacactttggctgctaacccacaagca
acgccagcggacatcttaaaagcagtagatgcagcgaaagcagccgcaatcaaagcaaat
ccaaatgctaaagatgaaatcaccaaaggtacaggtggtgtgaacttggataatgttgcc
tgggcagaaaaacctgaccaagcggtgaacaaagatcaattagatcaaacagttaacaaa
tcaggcttctttgtacaacaaaatggtgagtccaccaacggtaagggtaaaccgactgaa
aaagtgaccccgaacgatgtggttgatttcaccaatggtgcaaatacggttgtaacagca
gaaacaacacgtgatgaaaaaacaggtgtggatacaaccaaagtttctgtacacgtaaat
ggtttaccacttacctacacaactaaagatgcaagtggtaaagatgtgcctgtagcgaaa
gtgggagacaagttctaccaagtgggtgcagatggcaaaccagatatgactaaacctgcg
gatgtgaatgcattaagcactaacttagtgaacccagctgcaccgaatggtgaaattggt
gcaccatcacaattaggtaatgttgcaaatggtgcaaacacctttgttgcgccgcaagta
gatggcaaagacatcaaacttgctaacgatggtaaatggtatgcagcagatcaagttgat
ccaaacggttctgcaaaagcgaatgcaaaagccattgatgcagcaaaagcgaaagatgct
ttaggtacagcaggtaacggtggtttagcggattttgcaaactctaacccgaacaatgtg
gcgaccgtgggtgatttacaaaacttaggctttgtgattggcacagcagatgacaaatac
aaagatcaagtgcgtaataacagccgtgttgaatttgcaagtggcaacaaaaatgcaacg
gtcacaggttcaacgctggctgatggcacacgtcaagtgaaagtaaccatttcggacaac
ccagtatttaacaccattcaagttggtggggataaagggccgaaagtaggttcaacttca
acgggtgacttaaaagtgagtaaggcagatggttctgctgcacgcattactaacgttgct
cctggtgttgataacaatgatgcagtaaatgttggacaattaaaaggtgcagtaaataac
atcaataaccacgtgaataaaatcaacaaagatcttcgtgctggtattgctggtgcaact
gcaatctccttcttacaacgtccaaatgaagctggcaagagcatcatttccgtcggtatg
ggttcatacaaagctgaatcagccgttgcggtaggatactcaagaaactctgataacaac
aaaatctcaatcaaagtcggagcgggcttgaactctcgcggtgatgtcaactttggtggt
agtgttggttatcaatggtaa
DBGET
integrated database retrieval system