Flavobacterium commune: BIW12_02590
Help
Entry
BIW12_02590 CDS
T05006
Name
(GenBank) LuxR family transcriptional regulator
Organism
fcm
Flavobacterium commune
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Y_Y_Y
Reg_prop
GerE
Sigma70_r4_2
SusR_C
CCDC186_middle
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AOZ98407
UniProt:
A0A1D9P731
LinkDB
All DBs
Position
complement(623070..625871)
Genome browser
AA seq
933 aa
AA seq
DB search
MKTKITFLFFIFSIAVFSQDLPPIVKYVPSSYGAGNQNWMISQDQNQFVFFANNEGLLEF
NGSYWKLYPSPNETIIRSVKVIGDRIYTGSYMEFGFWKRKSDGLLAYKSLSAAIKSKILD
DEQFWNILSYDYWVVFQSLNRIYIYDTQNNSFKIIAPSANIIKAFKTKNAFYYQTNNEGL
FEIEGGKSKLISAHPDLKKNRIVNVFEQGDELLILTQGAGFYTLSEKELKKFPTEIDVNF
ADESVYSCESLSNGGYVIGTVSNGIFIITKEGKKKYHISQKKGLSNNTALSLFEDKEKNL
WIGLDNGINCINLNSPIQSYVDDSGVLGTVYTSQLYNGKLYVGTNQGLFYKDYQSNDEFQ
FISGTKGQVWSLYLYDGTLFCGHDLGTFVVTNGIVKNIFSKSGTWNFVRVPGNKNLLLQG
NYYGVSVLEKKNNEWVFRNKIRGFDYSSKYFAITKGFEIYVSHEYKGVFRLETDAKLQEV
RRNFAYKNPKKGKNASLVQFNNVIYYANKEGVFKLNNATKEFYKEPVLSSVFEKDEYTSG
KMIVDNSNKIWLFSKNYISYYASNKLINKLKRNSIPIPASLTNSMLGYENITQLSPSTYF
FGTTDGYYTMNINELAFENYKVSISNISSNTLNGSVKTNPILEEGRFPHDENNLTFSYTV
AEYNKYINVEYQYILEGFQDQWSDWNVRPSVNFKNLPSGDYVFKVKAKLANSNLENTVTY
HFTILKPWYATNLAIVIYILLGFLSIRLIHKEYNKYYQRQKEKLIEENNLLLEIKELENE
QQLMRLKNEQLSHDVDEINKELAASAMSLHSKNELLAFIQKDLKNNEESDSRSIKTVIST
INKNITGKDSWSVFQEAFNKTDKDFLKKMKEAHPSLTANDLRLCAYLRLNLSSKEIAPLL
NISVRSVEIKRYRLRKKMDLSHEQGLVEYILTV
NT seq
2802 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgaaaacaaaaattactttcttattttttattttttctattgccgttttctcacaagat
ttgcctcctattgtgaaatacgttcctagtagttatggggcaggaaatcaaaactggatg
atttcacaagatcaaaatcagtttgtgttttttgccaacaatgaaggacttttagagttt
aatggttcgtattggaaattgtacccttctccaaatgaaactattatcaggtcagtaaaa
gtaattggagatcgaatttatacaggtagttatatggaatttggtttttggaagcgaaaa
tcagatggtttgttagcatataagtctttaagtgctgccataaaatctaagattttagat
gatgagcaattttggaatatattaagttatgattattgggttgtttttcagtctttgaat
cggatttatatttatgatacacaaaataatagttttaaaattattgcgcccagtgctaat
attattaaagcttttaaaacaaagaatgctttttattatcaaactaataatgaaggatta
tttgaaattgaaggaggaaagagcaaattaatttcagctcatcctgatttgaaaaaaaat
cggattgtaaatgtttttgaacaaggagatgaacttttaattttaactcaaggggctggt
ttttatactctttcagagaaagaattaaagaaattcccaaccgaaattgatgttaatttt
gccgacgaaagtgtctatagttgtgagtcattgtctaatggcggctatgttataggaacg
gtttcaaacggtatttttatcataaccaaggaaggaaaaaagaaataccatatctctcaa
aagaaaggtttgagcaataataccgccttatcattgtttgaggataaagaaaaaaatctc
tggattggtcttgataatgggattaactgcatcaatctcaattcgcctatacagagttat
gtggatgattccggggttttaggtacagtttatacttcgcaattgtacaatggaaaatta
tatgtaggaactaatcaggggttgttttacaaggattatcaaagtaacgatgaatttcaa
tttataagtggtacaaaagggcaggtttggtccttgtatttgtatgatggtaccttgttt
tgcggacatgatttaggaacttttgtggtaacaaatggaattgtgaagaatattttttcc
aaatcaggaacctggaattttgttagagttcccggaaataaaaatcttttgttacaaggg
aattattatggtgtttcggttttagagaaaaaaaataacgaatgggtttttagaaataaa
atcagaggttttgattattcttctaaatattttgctattactaaaggtttcgaaatctat
gtaagccacgaatacaaaggggtttttagattagaaaccgatgctaaacttcaggaagtc
agaaggaattttgcctataaaaatcccaaaaaagggaaaaatgccagtttggttcagttt
aacaacgtaatctattatgctaataaagaaggggtttttaaattaaataatgcaacaaaa
gagttttataaagagccggttttgagttctgtttttgaaaaagacgaatatacttcgggt
aaaatgattgtagataattctaataaaatatggttgttttccaagaattatattagttat
tatgcttctaataagttgattaataagctaaaaagaaacagtattcctattcctgcttca
ttgacaaattccatgttaggctatgagaatattactcaattatcgccttctacttatttt
tttggaactacggatggttattatacaatgaatattaacgaattggctttcgaaaattat
aaagtttctatttcaaatattagtagtaatacgctaaatgggtcagtgaaaactaatcca
attcttgaggaaggtcgatttccacatgatgaaaacaaccttactttttcatacaccgta
gccgagtacaataaatatattaatgtggagtaccaatatattttagaaggttttcaggat
caatggagtgattggaatgtaaggccctcagttaattttaagaatttaccatcaggggat
tatgtttttaaagtgaaggcaaaattggctaattcgaatctggaaaacacagtaacttat
cattttaccattttaaaaccttggtatgctactaatttggctattgttatttatattctt
ttaggatttttatccattcgattaattcataaagaatacaataaatattatcaacgtcag
aaagaaaaactgattgaagaaaataatttgttgttagagataaaagagttggaaaatgaa
caacaattaatgcgtttaaaaaatgaacaattatctcatgatgtggatgaaatcaataaa
gagcttgctgcttctgctatgagtttgcatagtaaaaatgaattattagcctttatccag
aaagatttaaaaaacaatgaagaaagtgatagccgaagtattaaaaccgtaatttctact
atcaataagaatattacaggaaaagattcctggagtgtttttcaggaagcttttaataaa
acagataaggatttcctgaaaaaaatgaaagaggcacacccttccttaactgcaaatgat
ttgcgattatgtgcttacttaagactcaatttgtcttcaaaagaaatagctccattgtta
aatatatcggtacgaagcgttgagataaaaagataccgtttgcgtaaaaaaatggattta
tcacatgaacaaggcttggttgagtatattttgactgtatag
DBGET
integrated database retrieval system
