Flavobacterium commune: BIW12_04705
Help
Entry
BIW12_04705 CDS
T05006
Name
(GenBank) RagB/SusD family nutrient uptake outer membrane protein
KO
K21572
starch-binding outer membrane protein, SusD/RagB family
Organism
fcm
Flavobacterium commune
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
fcm00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
fcm02000
]
BIW12_04705
Transporters [BR:
fcm02000
]
Other transporters
Accessory factors involved in transport [TC:
8
]
BIW12_04705
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SusD_RagB
SusD-like_3
DUF6120
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AOZ98789
UniProt:
A0A1D9P8A0
LinkDB
All DBs
Position
1113701..1115647
Genome browser
AA seq
648 aa
AA seq
DB search
MKNYKKLYINLMLVATLGLSTSCSQDFLDEELTTGYNSGYLKTEEGILALSVGTYYQVFA
LDMNREVPLTANQSGTDEFHVGGDPSNGLWNSYASGFGSFVTVSNSNTVAANTNWDNLYI
GIGNANQLIESATAIASTNDAVKKIALGEGHFMRAYNYLKLVRQYGGVPIKLNTSNVVER
EFTRATSEEVLSQVIADFTQAYNLLSNTGGPNKITKDAAAHYLAKAYLTRASEINDAWNS
STKAADLQQVVTLSDQVIANHPLTSNYVNLWDFKAANGANEKLSELILSADFNSNQLTTG
GNQQHLYFLSTYDQLPQMIRNTAGGRPFSRLAPTYFTYDIYDKVNDSRFWKSFQTKSIVN
NAAAGSGYVNGDLGIMYVMNSPTDNRFALTRNDGTIIYSKTGKTIPRVFVAYAADNFGLM
KDVRFPSLSKYMDGSRLDFNATKGSRDIILARSAETYLMAAEAKIRLAKLGTGSYSDALS
YINTVRNRATYKSGEDRAAYTDGSAAWTTAVQGGRASSFIAENSYYESNNISNTTAATDL
TITGINALPAADQAVITKLGYTADYDRMLCLILNERTRELCGEFHRWEDLSRTKTLVARA
KEYNPEAKPNIQDYHNLRPIPQTFLDGVYVNGRPLTAAEKQEMQNPGY
NT seq
1947 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaattataaaaaactatatatcaacctaatgctggtagctacattaggacttagc
acctcttgcagccaggatttcctagacgaagaattaactactggttacaattcaggatat
ttaaaaacagaagaaggaatccttgccttatcagttggaacctactatcaggtttttgcc
ttagatatgaaccgagaagttccgcttacagcaaatcaatcaggaacagacgagttccat
gttggaggcgacccatctaacggattatggaattcttatgcttcaggatttggatcattt
gtaaccgtatccaactccaatacggttgctgctaataccaattgggacaacctatacatc
ggaataggaaatgccaatcaattaattgaatcggctactgcaattgcttccaccaatgat
gccgttaaaaaaatagccttaggagaaggtcattttatgagagcttacaattatttaaaa
ttagtaagacaatatggtggtgttccaataaaattaaacacaagcaatgtagtagaacga
gaattcaccagagcaaccagtgaagaagttttaagtcaggttatagctgatttcacccaa
gcatacaatttattaagtaatacaggaggtccaaataaaattaccaaagacgccgctgca
cattatctggcaaaagcctatttaacccgtgcaagcgaaattaacgatgcctggaattca
tccactaaagcagccgacttacagcaagtggttactttatccgaccaagttattgcaaat
cacccattaacatccaactatgttaacttatgggattttaaagctgccaatggagccaat
gaaaaattatctgaattaattttatcagccgattttaattctaatcaattaactacagga
ggaaaccaacaacatttgtatttcctttctacttatgatcaattacctcaaatgattcgt
aatacagccggaggacgaccatttagccgtttagcccctacctactttacttacgatata
tatgacaaggtaaacgactcgcgtttctggaaaagttttcaaactaaaagtattgttaat
aatgctgcagcaggaagcggatacgttaatggcgatctaggtatcatgtatgtaatgaat
agtccaacagacaatcgatttgccttaaccagaaacgatggaactataatctattccaaa
acaggaaaaactattcctcgcgtatttgtagcttatgctgcagacaattttggattaatg
aaagatgtacgattcccttcattaagtaaatacatggatggatccagacttgattttaac
gccacaaaaggaagtcgtgacatcatattagctcgttcagcagaaacctatttaatggca
gcagaagctaaaattcgtttagcaaaattagggactggctcttatagtgatgctttgagc
tacatcaacaccgttcgtaatcgtgctacctacaaatcaggtgaagacagagccgcttac
actgatggttcagctgcatggactactgctgtacaaggaggaagagctagttcttttata
gcggaaaactcttactatgagtcaaacaacatctcaaacacgacagctgctaccgattta
actattactggtattaatgcacttccggcagccgatcaggcagtaataaccaaattaggt
tacacggctgattatgaccgtatgctatgtttaatcctaaacgagcgcaccagagaactt
tgtggtgaattccaccgttgggaggatctaagcagaacaaaaacattggtagccagagct
aaagaatacaatcctgaagcaaaacctaatatacaagactaccacaacttacgccctata
cctcaaacgttcttagatggagtatacgtaaatggaagacctttaacggcagccgaaaaa
caagaaatgcaaaatcctggttattaa
DBGET
integrated database retrieval system
