Flavobacterium commune: BIW12_11440
Help
Entry
BIW12_11440 CDS
T05006
Name
(GenBank) protein translocase subunit SecDF
KO
K12257
SecD/SecF fusion protein
Organism
fcm
Flavobacterium commune
Pathway
fcm02024
Quorum sensing
fcm03060
Protein export
fcm03070
Bacterial secretion system
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
fcm00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03060 Protein export
BIW12_11440
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
03070 Bacterial secretion system
BIW12_11440
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
BIW12_11440
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02044 Secretion system [BR:
fcm02044
]
BIW12_11440
Secretion system [BR:
fcm02044
]
Sec (secretion) system
Prokaryotic Sec-SRP core components
BIW12_11440
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SecD_SecF_C
SecDF_P1_head
SecD_1st
Sec_GG
ACR_tran
MMPL
SelR
Cytochrom_C_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AOZ99991
UniProt:
A0A1D9PBR1
LinkDB
All DBs
Position
2722044..2725013
Genome browser
AA seq
989 aa
AA seq
DB search
MQNKGLIKFFAILFALVSIYQLTFTFVANNVKSEAKAFAGDNPDKELKYLDSISKESVLN
LGFTEFTYDEVKNKQLNKGLDLEGGINVILQISIKDVLKGLSNNSKNPVFNKSLADATAN
LEGNKTYLNKFFEAFEANSKGSVKLASPDIFANRSLQGEGGVDFQMTDAQVQKVIKRKVD
ESIESAFKVLRERIDKFGVTQPNIQKLGETGRILVELPGAKDVDRIKKLLGGKAQLEFWE
TYKVEEIGNFLMAANEALKKTEIAKVEKKAVVKDSLSALLTDTKDSTETKKGNNPLFDKM
LSQSGGGLGFYAPKDTAVINGYLKRADIKALLSPDQRYAKFVWGKATKLKDAKEKEVEAV
ELYALRGNRDNTPAMLGAVVTDAKDTFDQFGKPAVSMQMSPQGAKAWEELTGRAYTQKTN
IAIVLDNVVYSAPGVSSGPISGGRSEITGSFDITETQDLANVLNAGKLPASADIIQSTVV
GPSLGQASIDAGMLSSIVGFLLVCIWMVFYYGRAGWYANLALLLNLLFLFGIMASFGFVL
TLPGIAGIVLTLGTAVDANIIIYERAKEELRDGKSLLEAVTSSYGWHGAMRSIIDANVTH
VLTGAILFIFGTGPIKGFALTLLIGIVTSLFTSIFIARIFIDKNIVGKANLTFCTNITKN
WFTNFNYDFIKIKKITYIFSSIVVIVSLVSIFFGNGLDQGVDFVGGRTFQVKFEKPVDAV
VISEELSTAFGTPVEAKVLGDEDQLKITTKYKIKEDGIAVDKEVNEKLYAALAKYYPNTS
YDKFINTFDGKKVGVLQASKVGASISEDIKTNSYWAVLGALAVIFLYLMISFRKWQYSLG
AIAAVAHDVIFVLGIYSLCYKFMPFHMEMDQHFIAAILTVIGYSMNDTVIVFDRIREFIL
GKRKGSFEDIVNASINTTLSRTLNTSLTMILVLLTMFLFGGESIRGFIFAMLVGIIVGTY
SSLFIATPVLVDTISREEKTTVEKQHEAA
NT seq
2970 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcagaataaaggacttattaaatttttcgcaattctatttgcattggtaagtatttac
caactcacattcacttttgtggccaataatgtcaaaagtgaagccaaggcttttgcagga
gataatcctgataaagagttaaagtatttagattctattagtaaagaaagtgtgttgaat
cttggttttactgaattcacttatgatgaagtaaaaaataagcaacttaataaaggtctt
gacttagaaggaggaatcaacgtgattcttcaaatttctattaaagatgttttaaaagga
ttatctaataattctaaaaatcctgtatttaataagtcattagctgatgcaactgcaaat
ttagaaggaaataaaacgtatttaaataagttttttgaagcttttgaagctaattcaaaa
ggaagcgtaaaattagcttcgccagacatttttgcaaacagatctttgcaaggagaaggt
ggtgttgattttcaaatgacagacgctcaagttcaaaaagtaatcaaaagaaaagttgat
gaatcaatcgaaagtgcttttaaagtgctaagagagcgtatcgacaaatttggtgttaca
caacctaatatccaaaaattaggagaaacgggaagaattcttgtagaacttccgggggct
aaagatgtagataggattaaaaaattattaggtggaaaagcacaacttgagttttgggaa
acttataaagttgaagaaattggaaatttcttaatggctgctaatgaggcattgaaaaag
actgaaattgctaaagttgagaaaaaagcagtagttaaggattcattaagcgccttattg
accgatactaaagattcaacagagactaaaaaaggaaataatccactatttgataagatg
ttatctcaaagtggaggaggtttaggtttctatgctccaaaagatactgctgtaatcaat
ggttatttaaaaagagccgacattaaagctttgttgtctccggatcaacgttatgctaaa
tttgtttggggaaaagctactaaattaaaagatgctaaagaaaaagaagtagaagcagtt
gagctgtatgctttaagaggaaacagagacaatactccagctatgcttggtgctgtggtt
actgatgcaaaagatacttttgaccaattcggtaaaccggcagtttctatgcaaatgagt
ccgcaaggagctaaagcttgggaagaattaacaggtagagcttatactcaaaaaactaat
attgccattgttttggataacgtggtatattctgcaccgggagtttccagtggtcctatt
tcaggtggaagatctgaaattacaggttcatttgatattactgaaactcaggatttagcc
aatgtattaaatgctggtaaattacctgcttctgctgatattattcagtcaacagttgta
ggaccatccttaggacaggcttctattgatgctggtatgctgtcttcaattgttggattc
ttattggtgtgtatatggatggtgttctattatggcagagcaggttggtatgcaaacctt
gctttattattgaacttattgttcttattcggaattatggcaagttttggttttgtatta
acattaccgggaattgcaggtattgtattaacattgggtactgctgttgatgctaacatt
attatctatgaaagagcaaaagaagaattgcgtgatggtaaatctttactggaagcagta
acttcatcttacggatggcacggagcaatgcgttctattattgatgctaatgttacacac
gttttgactggagcgattttgtttatttttggaacaggaccaatcaaaggttttgcttta
acattacttattggtattgtaacatctttgtttacgtctatttttattgcccgaattttt
attgataaaaatattgttggaaaggctaatttaactttctgtacaaatattactaaaaat
tggtttactaattttaactatgattttatcaagattaagaaaatcacttatatcttctct
tcaattgtagtaattgtgagtttggtttccattttcttcggtaacggattggatcagggg
gttgactttgtagggggaagaacttttcaggttaaatttgaaaaaccagtagatgcagtt
gtgatttcagaagaattatctacagcttttggaactccggtagaagctaaggttttagga
gatgaagatcagttgaaaattacaactaaatacaaaatcaaagaagatggtattgctgtt
gataaggaagtaaatgagaagttatatgccgctttagctaagtattatccaaatacttct
tatgataaatttatcaacacttttgatggtaaaaaagtaggagttttacaagcgtctaaa
gttggagcttcaatctctgaagatattaaaacaaattcttactgggcggtattaggagca
ttagctgttattttcttatacttaatgatttcattccgtaaatggcaatattcattaggt
gctattgctgctgtagcgcatgacgtaatctttgtattaggaatttactctttatgttat
aaatttatgcctttccacatggaaatggatcagcacttcatagcggctattttgactgtt
attggttattcgatgaatgatacagtaattgtatttgatagaattagagagtttatacta
ggaaaacgtaaaggaagttttgaagatattgtaaatgcttctattaatactactttgtca
agaaccttaaatacttcattgacgatgattctggtattattgacaatgtttctttttggt
ggtgaatctatcagaggatttatttttgcaatgcttgtaggtattattgtaggaacttat
tcttcattgttcattgctactccggtactagtggatactatttccagagaagagaaaact
actgttgaaaagcaacacgaagcagcctaa
DBGET
integrated database retrieval system
