Flavobacterium columnare: FCOL_00435
Help
Entry
FCOL_00435 CDS
T01653
Name
(GenBank) amino acid permease
KO
K03294
basic amino acid/polyamine antiporter, APA family
Organism
fco
Flavobacterium columnare
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
fco00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09193 Unclassified: signaling and cellular processes
99977 Transport
FCOL_00435
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
AA_permease_2
AA_permease
AA_permease_C
Spore_permease
DUF7027
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEW84942
UniProt:
G8X7C8
LinkDB
All DBs
Position
100170..101846
Genome browser
AA seq
558 aa
AA seq
DB search
MLLTRLFRKKSLDVILKQGGDGEHSGLNKVLTVKDLTFFGIAAIIGGGTFSAIGNACFSG
GPGVILLYIICAIACGFTAMCYAEFASRVPVSGSAYTYAYVSFGELFAWIIGWALLMEYS
IGNIYIAFSWSGYFTNLLESFGLHLPEWLTINYKSAHVAFLENKTGEGYLAWQNAPEIAG
LKIIFDMPAVLINVLITYLIYRGTSESKNVSNFMVYLKLVVIVLVIAVGAFYIDIDNWTP
FMPNGFKGVMAGVSAVFFAYIGFDAVSTLAEESKNPQHDLPRGMIYSLVVCTIVYIILAL
VLTGMVKYDLLGVSDPLAEIFALKGIKWMLFIVSIAAVAAMTSVMLVFQMGQPRIWMTMS
RDGLMPKQFASIHPKYKTPGFATIVTGIVVGLPIFFTDENFVLDFTSIGTLFAFVLVCGG
VLMLAPHNEKEANNPTKGKFRIPYINSKWIFPIIVVLSLGTINFLLPDYFSTTFSLNETN
LTTNLPFIVFFIFTLVMAVLSFLKNLSLIPLLGLISCCYLLTGMAVSNWKWFGVWLLIGL
VIYFSYGFKNSKLNKNSL
NT seq
1677 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttattaacacgattatttagaaaaaaatcactggacgtaatcttaaaacaaggaggt
gatggagaacactcgggattaaataaggtgttaacagttaaggatttaaccttttttggg
atagcagctattattggtggaggtactttttcggctataggcaatgcctgtttttcagga
ggcccaggtgtcattttgttatacattatttgtgctatagcctgtggttttacagctatg
tgttatgctgagtttgcttcaagagttcccgtttcaggtagtgcttatacgtatgcttat
gtttcttttggagaattgtttgcctggatcatcggttgggcattattaatggagtattca
ataggaaatatttatattgctttttcatggagcggatattttactaaccttttagaatcc
tttggattacatttacccgaatggttaacaataaactataaatcagcacatgtagctttt
ttagaaaataaaacaggagaaggatacttagcttggcaaaatgctccagaaatcgcaggg
ttaaaaattatttttgatatgccagctgtattaataaacgtattaataacctatttaatt
tatagaggaaccagcgaatcaaaaaatgtaagcaactttatggtatatctgaaattagtt
gttatagtactagtaatagcagttggtgcattttatatagatattgataattggactcct
tttatgcctaatggttttaaaggcgtcatggcaggagtttcagccgttttctttgcatat
ataggttttgatgccgtttctactttagcagaggaaagcaaaaacccgcaacatgatttg
cctagaggaatgatctattcattagtagtttgtaccatagtatatattattttagcacta
gtattgactggaatggtaaaatacgatctattaggggttagtgatcctttagctgaaatt
tttgccttaaaaggaataaaatggatgttgttcatcgtatcgattgctgcagtagctgca
atgactagcgttatgttagtttttcaaatgggccaacctcgtatctggatgactatgagt
cgtgatggattaatgcctaaacaatttgcttctatacatccgaaatacaaaacaccagga
tttgctaccatagtaacaggaatcgtagtcggattaccaatcttttttacagatgaaaat
tttgttctagattttactagtataggtactttgtttgcttttgtattagtttgtggaggc
gttctcatgttagcacctcataatgaaaaagaagcgaataatccaaccaaaggaaaattt
aggataccgtatataaattcaaaatggatttttccaatcatagttgttttgtctttagga
actataaactttttattgcctgattattttagtaccactttcagtttaaatgagactaat
ctaacaacaaacttaccttttatagtgttttttatatttactttagttatggctgttttg
tctttcttaaaaaatttatcacttataccattattaggattaatatcttgttgttatttg
ctaacagggatggctgtgtctaactggaaatggtttggtgtttggttactaataggatta
gtaatttatttttcatacggatttaaaaacagtaagctaaataaaaatagtttataa
DBGET
integrated database retrieval system
