Flavobacterium columnare: FCOL_08560
Help
Entry
FCOL_08560 CDS
T01653
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
fco
Flavobacterium columnare
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Peptidase_S9
Peptidase_S9_N
BD-FAE
Peptidase_S15
DPPIV_N
DLH
Abhydrolase_1
Abhydrolase_3
AXE1
Hydrolase_4
SGL
Abhydrolase_4
Abhydrolase_2
BAAT_C
Peptidase_S10
Esterase
DUF4362
DUF7790
DUF2920
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEW86527
UniProt:
G8X8S6
LinkDB
All DBs
Position
1983473..1985416
Genome browser
AA seq
647 aa
AA seq
DB search
MRKLPLQLFVLFLGIETIAQDKRNEVLPNENLITENIAPISKELLQKVKKYTETRSAGLS
AVHPIKDEVIVFTRFGSTNQLHKVTQPLGTRTQITFFEEPIANASYEPVKGEYLIYSRDA
GGNEFGQLYKLDLKTGQSTLLTDGGRSQNGNITWKKEGSGFYFSSTKRNGADRDIYYINP
NDPSSTRLVLEVKGGGWSITDISEDGKKLLITEGISANESHIWMLDTTTSKLTEITNRTD
KGIVQTNANFSKKADEIWFTTDRDNEFKRLALFNFQTKKISYLTSSIPWDVESYDLSEDK
TKLVFTTNEGGVHKLYLMETATKQFKAIPNIHNGLIGSVRFTKEGQNIFFSQSTADSSSD
VYKLNLKTQKITRWTESELGEMQKKDMSIPKQIEWKSFDGMKISGFYYPASQKFTGKRPV
LISIHGGPEGQSLASFLGANNYYTNEMGVALIYPNVRGSSGFGKTYLAKDNGFLREDSVK
DIGALLDWIAQQPDLDQDRIMIMGGSYGGYMTLATAFHYTDKIRCSVDVVGISNFNTFLK
NTENYRRDLRRVEYGDERDPKMYEFLDKISPLNNTDKIKKPMFIIQGTNDPRVPVTEATQ
MRDKLKAKGNVVWYLEAKDEGHGFRKKANIDFQRLAVIRYMEEYLLK
NT seq
1944 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagaaaattaccattacaattgtttgtactatttttaggtatagaaacaattgcacaa
gacaaaagaaatgaagtcctgcccaatgaaaacttgattacagaaaatattgcacccatt
tctaaagaattactacaaaaggtaaaaaaatatacagaaacaaggagtgctggtctatca
gccgtacatcctataaaagatgaagtaattgtttttacgcgctttggatcaacaaatcaa
ttacataaggtaacacagcctttgggtactcgtacccaaattactttttttgaagaacct
attgccaacgcatcttatgaaccagtaaaaggagaatacctaatctatagtcgtgacgca
ggaggaaatgaatttggacaattatataagttagacctaaaaacaggacagtccacctta
ttaacagatggaggacgttctcaaaatggaaacataacttggaaaaaagaggggtctgga
ttttacttttcttcaactaaacgcaatggggccgatcgtgacatttattatataaaccct
aatgatccttcatcaactcgattagttttagaagtaaaaggaggaggttggagtattacg
gatatttctgaagatgggaaaaaactgctcattacagaaggtatttcagctaacgaatca
catatttggatgctagacaccactacaagtaaactaacagagattactaacagaacagat
aaaggcattgtacaaacaaatgctaacttttcaaagaaagcagatgaaatttggtttaca
acggatcgagataatgaatttaaacgtttggcattatttaactttcaaaccaaaaaaata
tcgtatttaacctcctctattccatgggatgtagaaagctatgatttgagtgaagataaa
acaaaattagtttttacaaccaatgaaggaggagtccataaattgtatttgatggaaacg
gcaacaaaacaatttaaagcaattcctaatattcacaatggtttaataggaagtgtgcga
tttactaaagagggacaaaatattttcttttcacaatctacagctgattcttcttcggat
gtgtataaattaaatttaaaaacccaaaaaattacacgttggacagagagcgaactgggc
gaaatgcaaaaaaaagatatgtctattcctaaacaaattgaatggaaaagttttgacgga
atgaaaatttcaggtttttactatcctgcctctcaaaaatttacaggaaaaagacctgtt
ctgattagtattcatggaggacctgaaggacagtccttagcatcatttttaggagctaat
aattattatacaaatgaaatgggagtagccctaatttatcctaatgtaagagggtcttcg
ggatttggaaaaacctatttagctaaagataatggttttctaagagaggattccgttaaa
gatattggtgctttattagactggattgcgcaacagcccgatttagatcaggatcgtatt
atgattatgggaggaagctacggaggctatatgactttagcaacagcatttcattatact
gataaaattcgttgtagtgtagatgttgtaggaatttctaattttaatacatttctaaaa
aacacagaaaactatcgtcgtgatttacgtcgtgtagaatacggagatgaacgtgatcct
aaaatgtatgagtttttagataaaatatcacctttgaataatacagataaaattaaaaaa
ccaatgtttatcatccaaggaacaaatgatccacgtgtacctgtaaccgaagctactcaa
atgcgcgataagttaaaagcaaaaggaaatgtagtttggtatttagaagcaaaagatgaa
ggacacggattccgtaaaaaagcaaatattgattttcaacgtttagcagttatacgatac
atggaagaatatttgctaaaatag
DBGET
integrated database retrieval system
