Flavobacterium columnare: FCOL_09105
Help
Entry
FCOL_09105 CDS
T01653
Name
(GenBank) OmpA family outer membrane protein P60
Organism
fco
Flavobacterium columnare
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
OmpA
TSP_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEW86630
UniProt:
G8XAF9
LinkDB
All DBs
Position
2131310..2132716
Genome browser
AA seq
468 aa
AA seq
DB search
MKHVNKLFVSMMMIAGLGANAQSSDNPWAISFGVNSVDTRTSAGPEGAFDSKEGFLDKFA
GFRHFDRDQNIIPSVSYLSVTRNVGGNWSFGVIGSVNKITKFDYVDRNQSIQVANPDVMY
YGIDGKIGYSFKNLIGVKWFDPSLHLGGGYTFFGKASGGNANAGAGLTFWLTEQVGLSFS
TTYKKSFADRVDVPSVFQNMAGLTFQFGGKDTDNDGIYDKYDACPDVAGLKEFNGCPDTD
KDGIQDKDDACPDVAGLKELNGCPDGDGDGIADKDDACPEVKGLANLQGCPDADGDGVAD
NKDKCPNQAGPRDNAGCPWPDTDGDSVLDKDDKCPSVKGTVANNGCPEVSEEVVKKLNDY
AKTILFDTGKASFQQQTLPVLEAMSAILNEYPSSKFSIEGHTDNVGKKDKNLQLSKERAA
AVKSYLESKGIAVDRLTSEGYGDTKPVAPNTTKANKALNRRVEVKLVK
NT seq
1407 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaacatgttaacaaactttttgtttctatgatgatgattgctggtctaggtgctaat
gcacagagcagtgataatccatgggcgatatcattcggtgtgaattctgtagacactaga
acgagtgctggaccagagggagcttttgattctaaggaaggattcttagataaatttgct
ggttttagacattttgacagagaccaaaatattattccatctgtttcttatttatctgtt
actagaaacgtgggaggaaactggtcgtttggagtaatcggatctgttaacaaaatcacc
aagtttgactatgttgatagaaaccaatctatacaagttgctaatccagacgtgatgtat
tacggaattgatggtaaaattggttatagcttcaaaaacctaattggagtaaaatggttt
gacccatctttacacttaggtggtggatacactttctttggaaaagcatctggaggaaat
gcaaatgctggagcaggattaactttttggttaactgagcaggtaggtctttctttcagc
actacatacaaaaaatcttttgctgatagagttgatgttccttcagtattccaaaatatg
gcaggtttaactttccaatttggaggtaaagatacagacaatgacggtatctatgataaa
tatgatgcttgtccagatgtagctggtttaaaagaattcaacggttgtcctgatacagat
aaagacggtatccaagataaagacgatgcttgtccagatgtagctggtttaaaagaatta
aatggttgtcctgatggtgatggtgatggtatcgctgataaagacgatgcttgtccagaa
gttaaagggttagctaacttacaaggttgtcctgatgctgatggtgatggtgtagctgat
aacaaagataaatgtcctaaccaagcaggtcctagagataacgcaggttgtccttggcca
gatactgatggtgactcagttttagataaggacgataaatgtccatcagttaaaggtact
gtagctaacaatggttgtccagaagtaagcgaagaagttgttaaaaaattaaatgactac
gctaaaacaatcttattcgatacaggtaaagctagtttccaacaacaaacattaccagtt
ttagaagctatgtcagctatcttaaacgagtacccaagctctaaattctctatcgaaggg
catacagataacgtaggtaaaaaagataaaaacttacaattatctaaagaaagagcagca
gctgttaaatcttacttagaatctaaaggtattgcagttgatcgtttaacttcagaaggt
tatggtgatactaaaccagtagctcctaacactactaaagctaacaaagctttaaacaga
agagttgaagtaaaattagtaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system