Flavobacterium columnare: FCOL_09335
Help
Entry
FCOL_09335 CDS
T01653
Name
(GenBank) tonb-dependent receptor plug
KO
K16089
outer membrane receptor for ferrienterochelin and colicins
Organism
fco
Flavobacterium columnare
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
fco00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
fco02000
]
FCOL_09335
Transporters [BR:
fco02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
FCOL_09335
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
CarbopepD_reg_2
CarboxypepD_reg
PEGA
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEW86676
UniProt:
G8XAK5
LinkDB
All DBs
Position
complement(2190171..2192429)
Genome browser
AA seq
752 aa
AA seq
DB search
MKFIHLLIFYFYSLTSFSQAYIEGIVRTENIALSSIQILINKKQITQTDTHGYFKSTALE
IGNYDIEINENGFQEFKKNIRITNNIPIVLTINLIPTKEKQNDLEEVVITGTLKPVSRLD
SAVPVEVFKPSFFKKNPVSNIFEGLQNINGVRPQLNCSICNTGDIHINGLEGPYTFVLID
GMPIVSGLSTVYGLSGIPNSLIERIEIIKGPASSLYGSEAIGGLINIITKNPKNVPIISL
DGFSTSWGEANLDFGFKFNLKKTSVLTGINYFNYSNPIDNNKDHFTDVTLQDRISVFQKW
NFERNSKKMLSLAGRYFYEDRWGGETQWNKSFRGGNQVYGESIYTKRYEILGLYELPIRE
KMKIHFSYTNHNQNSAYGKTLYLAQQNIGFGQLTWDKVIKKHNLLFGLATRYQFYEDNTP
ATLSEDTNWISSVFLQNEIKLNDYHTILLGTRYDFNKNHGVIFTPRFAYKWKPNNNTVAR
LNAGTGFRIVNLFTEEHSALTGARNLIIAENLKPEQSYNGNLNVLHKWYLKNGSFISWEN
SIWYTYFTNSILPDYETDGNAIIYKNLDGFAESKGISSNLDLILGSGLKVSLGATFMDVS
KTSKGIQTRQLLTERFSGTWSISYAFPKWFLSFDYTGNLYGPMKLPILNNTDPRKPNSPT
YSIQNIQCTINKIKNLEIYLGIKNLLNWTPNKGNPFIIARSDDPFDTNVQYDTNGNAIAT
PDNPYALTFDPTYIYGPNQGIRSFIGIRYFMN
NT seq
2259 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaatttatacacttattaatattttatttttactccctaacaagcttctctcaagcc
tacatagaaggtattgtgcgtacagaaaatatagccttatcttctatacaaattctaata
aataaaaaacaaattacgcaaacagacacccatggttattttaaatcaaccgctttagaa
attggaaattatgacatagaaattaacgaaaacggctttcaagaattcaagaaaaacatc
cgtataaccaacaacattcccattgtcttaactataaatcttattcctactaaagaaaaa
caaaatgacttagaagaagtggttattacaggcactttaaaacccgtaagccgattagat
agtgcggtgcctgttgaagtatttaaaccttctttttttaaaaaaaatcccgtttctaat
atttttgaaggattgcaaaacattaacggtgttcggcctcaactcaactgtagcatttgt
aatacaggagacattcatatcaatggtttagaaggtccttacacattcgtattaatagac
ggaatgcctattgtaagtggtctatcgacagtctatgggctttctggaattcctaattca
ttaatagaacgtatagaaattataaaaggtcccgcctcttcattgtatggcagcgaagca
ataggaggattaataaatatcatcactaaaaaccctaaaaatgtacctataatatcttta
gatggattttcaacaagttggggggaagcaaatttagattttggatttaaattcaacctt
aaaaaaacttccgtactaactggaattaattattttaattactccaatccaatagataac
aataaagatcacttcactgatgttaccttacaagatcgcatttccgtttttcaaaaatgg
aattttgaaagaaattcaaaaaaaatgctttcccttgcgggtcgatatttttatgaagac
agatggggaggtgaaacacagtggaataagtcatttagaggaggcaatcaagtatatggc
gaaagtatttataccaaacgctatgaaatactaggtttatacgaactccctataagggaa
aaaatgaaaatacatttttcttacaccaatcataatcaaaattcagcttatggaaaaaca
ttatatttagcacaacaaaatattggatttgggcaactaacttgggataaggttatcaaa
aaacataatttactctttggcctagccacacgttatcaattctatgaggacaacacgcct
gctacgctttcagaagacacaaactggatttcaagtgtttttttacaaaacgagataaag
ctgaatgattatcatactatattattagggacacgatatgattttaataaaaatcatgga
gtcatatttacccctaggtttgcctacaaatggaaacctaataacaatacagtagccaga
cttaatgcaggaactggttttagaattgtaaatctttttactgaagaacactccgcttta
acaggcgctagaaacctaattatcgctgaaaacctaaaacctgaacaatcatataatggc
aacttaaatgtactacacaaatggtatttaaaaaacgggagtttcattagctgggaaaac
tctatttggtatacttattttaccaatagtattttaccagattatgaaactgatggtaat
gctattatttataaaaatttagatggttttgccgaatcaaaaggaataagtagcaacctt
gatctaattcttggcagcggattaaaagtaagtttaggggctacttttatggacgtatct
aaaacctcaaaaggcattcaaacaaggcaattattgactgaacgtttttcaggaacatgg
tctatatcttatgcctttcctaaatggtttttatcatttgactacactggaaatttatat
ggccctatgaaattgccgattttaaacaacacagatccaagaaaaccaaattcgccaacc
tatagcattcaaaacattcaatgtaccattaacaaaattaaaaatctagaaatttattta
ggaatcaaaaatttattaaactggacacctaacaaagggaatccttttattattgctcgt
tcagatgatccttttgatactaatgttcaatatgacacgaatggtaatgcaatagcaact
cctgacaacccatacgcacttacatttgatcctacttatatctacggtccgaatcaaggc
attagaagctttataggaattagatatttcatgaattaa
DBGET
integrated database retrieval system