Flavobacterium crocinum: HYN56_09780
Help
Entry
HYN56_09780 CDS
T06596
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
fcr
Flavobacterium crocinum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SpvB
TcdB_toxin_midN
RHS_repeat
DUF6443
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AWK04505
UniProt:
A0A2S1YKA7
LinkDB
All DBs
Position
2129401..2139252
Genome browser
AA seq
3283 aa
AA seq
DB search
MKNRIIILVFLIGAFLFAANIGEYKITSLFSENKPEEKTVSVLDSTVVLKNENKTTKLFT
ADIQEGIIGADNPEDIDDAYDNVFHLKVDELPVQNENAYLEYELFGYDQAASISRSLNNQ
PSIGGQFLSHQKTWTTQSELLSEKSLRKGDNVLLFTAPEETANGYKIRNVRIVYKNGNQI
SDFTLLKTADKLYIKGANFPSQIKKMTIAGIVVDMNQPEFELVLDAQQAGESISVQKETV
SGVIVNEKIEVKHFSKVEGFRPIENAKERISKVINFETANSLEYKDFLAFFPAGSLKSNI
KVSVSGLRKIDIAPLNSAMVNVTAVNAGFRLLPHGTIFEKAVTLSLPYDKTTIPEGYTEK
DINVFYFDENKRLWQEVTKDSLDIKQGIIKAKTTHFTDFIAGIIKMPESPETSGYTPTSI
KDLKAASPLVGIQSIAPPSANGRGTMSTGFAIVIPNGRAGLQPSLNLQYDSDGGHSWAGM
GWDISVPAVSIETRWGAPRYDAVNETESYAVGGEALIPNSHRAEWIVRTSDKQFYPRRES
AFQQIIRKGSSPKNYYWVVKDKSGVASYYGGTQSGLATNSVLQDANGNIGHWALCLQVDL
KGNTVEYEYDKRDGELYLKKVYYTGFGSQKGNYSVTFVKNSDLGEANRPDAQVSARLGFK
QLNNQLLRKIEVRYKNDMIRSYELKFKEGAFKKTLLESISEYDSESKLFYTNTLDYFDDV
RDASGKYNPFGPEQNWSVPNDNLKNSSIPSFSDILFSGKHSLVSSSEGSTEGVSYRLGVG
LATNAGSLKGFTVGGHGGNSWGSSDVAVILEDLDGDGLPDKVFKTKSGVYYRKNLSASGQ
NSFGDLQQLNISDVGYSKSTSFNWGVDLNLKFGNIGYDEQRSTNKTKVYFMDFNGDGLTD
FVRNGQVYYNRLENGIPTFRNSSTGTPSPVFGGGNVTIPGYTTISAEEIEKQNPLHDVVR
MWEAPAKGIISVSHQYQLVQETTPERIKARAEYVNNAGDDKADGVRLYFQKGNQLIWNEA
IGATDYNLKNRQNASLSVEKGERLYFRVSSVKDGNFDTVIWDPVITYLQTKQYDRDLNGN
LAESDFTVPSALKDVNAYSLASYQASTDFFSSSLAGKVVPTAGNVLLKGILNKPVTSDHI
KLVITKSYLDQSNPSVVVFEKTFLANEVASFNLASVSLPSFEAETQISLALQTETNINWQ
TVSFAPTVTVPAYVGGVAEEVPIEVSHLLYNKREGNYNMPGVISTTGGKVKLSILPQDLI
LATPFQYPGNINNYNGEVIISAKQNNVLLARNRYQIAAGTMVLLNNAFDNSVNYPDAVLG
IPIQLEITVSNQQSITILKNYPKANALNIQVQVTDLKDIADLTDDVIWTKTTDDFAIYSL
LNTDERTLGLYYRNWGGFVINGNLATNTIDQTQLKQSDAYNTEPDLNNTDPENYDGKGYE
VANNYFVSLNPSYTKTKWEGLEEGIYIKGPTIGTSRLGEDDIADYTDFSLPNLQGGSTTA
LDMINESKSKSISAGVSAGQANIGYSKSIDGDSYVTQTMSDFNGDRFPDYIRGGNIQLTA
PVGKVSDEIINIGDNFSHSKTSSEGPNFGGSYSHGAPSNSLSVTVAKADVKEKSSEGTAS
KEAEKGGNSISVSASQGKGEDRSAMIHSDINGDGLPDKISENGDVYLNTGYGFLPAEKWN
FNTLNKGNSIDWSAGLGFSIKQGSISGGANYARSQSDSDESFMDINGDGLGDKIRYVGNT
MLVSLNLGNAFDAPVVYPRFPEMSQNKGVSYGINANVSIDIIAWLLRITPTIGGSKGWST
NRSEGTFTDIDGDGNLDYIVSKDDGHLTAQLSNIKRTNKLKSVKNGAGNSYVVDYELTKP
SYENPSAKWVLQSVDVFDGHTGDGIDHSIAKFRYEDGFQDRRERDFYGFGKVIQEQIDVA
DNSVFMTTVQEFYNQDYFRKSLLRHSYTLDKNGKMRQESENEYSFVDVATQASVPVSELN
LPSCDAKRIFIGLIHANQKVYEGGSEYLETNTFNTYDANGNIIQYEDLGNGSADDKVTAK
ISYYESTTPYYGGIPKQLEVFTTEGLKRKRATTINTTTAEVTQIKNYAAADKIAITDIEY
DTYGNLQKITGPSNHKAQRMTLEYVFDTENHQYMTEIKDAFGYQNKMEYDYRFGIPLKTT
DRNDQSTIYTLDGKGRIATIKAPYEIASGKPYTIAYEYFPEAKVPYAKTKNYDPEFDKDI
ETYTYTDGLGRALQVKKTASLFTQAGSADQEALIISGKTIYDGLGRATTSYYPTTTTTID
NNFSTAVSNVTPTKTEYDEVSRAVKVTLPDGSTNSTVFAIESYDGVPVLRTTQTDALNKT
TGTFTDATGQNLASMQNDLITKFETNALGEMIKVTDAMDHITQSSYDWLGRRVEFTHPDA
GTTKMEYDLAGNLTTRITQDIKNTVPNGGAIQYVYNYNRLESIKYPKNPQNNVQYNYGKA
DGTPSRRGRLWFVQDASGGQEFFYGKLGEIEKEIRTLRITPTDIQTYISQYEYDTWNRIQ
KMTYPDGEVVEYTYNRAGNLQSMQGKKESHTYDYIKQLSYDEFEQRKYLKYGNDTETNYT
YDPVMRRLQQLQVKSGTRQVMNNAYGYDLVGNVLSIKNTAPVVNNTLGGTSAHEYQYDDF
YRLKSAKAVYQGEFTKASYELNMSYNKMHNITKKDLIHTVNNEQKGYVLDYNYDNELHPN
APNKIAETGKAEPRQYVYDGNGNPTSYTEEKSFRKMTWDEDNRLMGINDNGRIHQYTYDA
GGERVIKSSGDSQNVAINGETAATIVHTDDYTGYVSPYFVISKGKFTKHYFEGAGRIVSK
LGNGAFAQPLKITAGGVNYGKLTAEQQKALDTYVKSLGLPPGPPTQQGIYATPEFTGDPY
PSEVIKPVEENQEPPEGWPRNPIFNAPGDVPGPPVQFGPPVEPTTVKGGEGFTGTGMPEN
DIFYFHPDHLGSTSYITTKNGSISQHVEYIAFGEILFEEHSSSFSSPYLFNGKELDRETN
LSYYSARYYDAKTSLWLSVDPKMEKYPDIGSYVFVANNPLNAVDPNGEDIVFFNNQGTEI
HRIKNDKVFETYVSNPKGIIYPGTSPFGTFVQVPMPKTIQSYTDGNGNTKNTTGSKYQKF
DYMIAALTYIFNQNKEKDIVPTTGGKMLSDASTKVPDLDPTIVKAIIMEETVMGSGKSRG
SNDPTQDIMQSNVYYSSTSNDWNSDKKQFGLTKGGGATPSQSIKAGIGILFQKGLRDPSN
KGYTQTKEWFGGENWENAIRDYNGSKRKEDYRDDVLKMINEAQ
NT seq
9852 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaatagaattataatattggtgtttttaataggtgcatttttgtttgccgcgaat
attggcgaatataaaattacatcgttattttctgaaaacaagccggaagaaaaaacagtt
tcagttttggattcgacggttgttctaaaaaatgaaaataaaaccacaaaattattcaca
gctgatatccaggaaggaattattggagcagataatcctgaagatattgatgatgcctac
gataatgtttttcatttaaaggttgatgaacttccggtacaaaatgaaaatgcttattta
gaatatgagttattcggttacgatcaggcggcttctatttcaagaagtttaaataaccag
cccagtattgggggacaatttttgtctcatcaaaaaacatggacaacacagtccgaatta
ttatctgaaaagtcattacgaaaaggcgacaacgtacttttatttactgctcctgaagaa
actgcaaatggatataagattagaaatgtacgaatagtatataaaaatggaaaccagatt
tctgatttcacactgttaaaaacagctgataaattatacatcaaaggagctaattttcct
tcgcagattaaaaaaatgactattgcaggaattgtggtagatatgaaccagccagaattt
gaattggttttggatgctcagcaagcgggagaatcaatatcggtacaaaaagaaacggtt
tcgggagttattgtaaatgaaaaaatagaagtaaagcatttttctaaagtagaaggtttc
agacctattgaaaacgcaaaagaacgtatttcaaaagtcatcaatttcgaaacagcgaat
tctttagaatataaagatttcctggcgttttttcctgctggatctttaaaaagcaatata
aaagtttctgtaagtggtttacgtaaaattgatattgcacctttaaactcggcaatggtt
aatgttacggctgtaaatgccggttttcgtttattgccacacggaactatttttgaaaaa
gccgtgacactttcgcttccatacgataaaacgaccattccggaagggtacacagagaaa
gatatcaatgtattttattttgacgaaaacaaacgtctttggcaggaagtaaccaaagat
tctcttgatattaaacagggaattattaaagccaaaacaacccattttaccgatttcatt
gcgggaattatcaaaatgcccgaatctcctgaaacttcaggttatacgccaacaagtatt
aaagatttaaaagcagctagtccgttagtaggaattcagtctattgcaccgccttcagca
aatggaagaggtacaatgagtactggttttgcgattgttattccgaacggaagagcaggt
ctacagccgtctttaaatttgcagtacgatagtgatggcggccacagttgggcaggaatg
ggctgggatatttcggttccggcagtaagtattgaaacccgttggggagcgccaagatat
gatgcggttaacgaaacagaaagttatgctgtgggaggagaagcgttgatcccaaactca
cacagagccgaatggattgtcagaacttcagataaacaattttatccaagacgagaaagt
gcttttcagcaaattatccgtaaaggatcatcacctaaaaattactattgggtggtaaaa
gataaaagtggtgtagcaagttattatggaggaacacaatccggacttgccacaaatagt
gttttacaagatgcgaatggaaatataggacattgggcactttgtcttcaggtagattta
aaaggaaatacagttgaatacgaatacgacaaacgcgacggagaactctatcttaaaaaa
gtatattataccggttttggttctcaaaaaggaaattacagcgttactttcgtaaaaaac
tcagatcttggagaagcaaaccgtccggatgctcaggtttcggctaggttgggttttaaa
cagctcaacaaccaattattacgaaaaattgaagttcgttacaaaaacgatatgattcgt
agttatgaattgaaatttaaggaaggtgctttcaaaaaaactttattagaatcgatttca
gaatacgattctgaatcaaaattattttatacgaatactttagattattttgatgatgtt
cgggatgcttcgggtaaatacaatccgtttggaccggagcagaattggagtgttcctaac
gataatctgaaaaacagttctattccgtcttttagtgatatacttttttcaggaaaacac
tctttggtaagcagttccgaaggttctacagaaggagtgagttacagacttggagttggt
ttggcaacaaacgcaggaagtttaaaaggctttacagttggaggacacggaggaaacagc
tggggttcgtctgatgttgccgtaattttagaagatcttgacggagacggacttccggat
aaagtatttaaaaccaaaagcggtgtgtattacagaaagaacttatctgcttcagggcaa
aattcttttggtgatttacaacagctgaacatcagtgatgttggatattccaaatcgact
tcatttaactggggtgtcgatttgaatttaaaatttggaaatattgggtatgacgaacag
cgttcgaccaataaaaccaaagtctattttatggattttaatggtgatggtctgacggat
tttgttcgcaacggacaagtgtattacaatcgtctggaaaacggaataccgacttttaga
aacagcagcacaggaactccttctcctgtatttggaggcggtaatgtaactattcccggt
tatactacgatttcggcagaagaaatagaaaaacaaaatccattgcacgatgtggttcgt
atgtgggaagcacctgcaaaaggaattatttctgtttcgcatcaatatcaattagttcag
gaaaccactcccgagcgaataaaagcacgtgcagaatatgtaaacaatgctggtgatgat
aaagcagacggagttcgcttgtattttcaaaaaggaaatcaactaatctggaatgaagca
attggagcaaccgattataatcttaaaaacaggcaaaatgcttcactttctgtcgagaaa
ggtgaacgattgtattttagggtaagttctgtaaaagacggaaattttgatactgtaatt
tgggatccggtcattacttatttacagaccaaacaatacgacagggatttaaacggtaat
cttgcagaaagtgattttactgtgccttcagctttaaaagatgttaacgcttattcactg
gcatcctatcaggcaagtaccgatttcttcagcagttctttggcaggaaaagtagttccg
acagccgggaatgttttactgaaaggtattttgaacaaaccggtaacttcagatcatatc
aaattagtgattactaaaagttatttggatcagagtaatccatctgttgtggtttttgaa
aagacatttttggcaaatgaagttgcgtcgtttaatttggcttctgtaagtctgccttca
tttgaagcagaaacgcagattagtttagccttacagacggaaaccaatatcaattggcag
accgtttcttttgcgccaacagtaacagttccggcttatgtaggcggagtagcagaagaa
gttccgatagaagtttctcatttgttgtacaataaaagagaaggaaattataatatgccc
ggagtaatttctactacaggcggaaaagtaaaactaagcattttaccgcaggatttaata
ttggcaaccccatttcagtatcccggaaatatcaataattacaatggagaggtaattatt
tcggctaaacaaaataatgttttactggctcgtaatcgttatcagattgcagcaggaact
atggtgttactaaataatgcttttgataattcagttaattatccggatgctgttttaggt
ataccaattcagttagaaataacggtatccaatcagcagtcgattacgattctaaagaat
tatccaaaagccaatgctttaaatattcaggttcaggtaaccgatttaaaagatattgca
gatcttacagatgatgtaatctggaccaaaacaacagatgattttgctatttacagcctt
ttaaatactgatgagagaacgttaggattgtattatagaaactggggcggatttgttatt
aacggaaatctggctaccaacactatagaccaaacacagttaaaacaatccgacgcttac
aataccgagccggatttaaataatacagatcctgaaaattacgatggtaaaggttatgaa
gtggccaataattattttgtgtcattaaatccatcttatactaaaaccaaatgggaaggt
ttagaagaaggaatttacattaaaggaccaacgataggaacttcaagacttggtgaagat
gatatcgccgattataccgatttttcgcttccaaatttacagggaggaagtacgactgca
cttgatatgattaacgaaagcaagagtaaaagtatttcagcgggagtttcggcaggtcag
gcaaacattggttacagcaaatccatagacggtgattcgtatgtaacgcagaccatgagc
gatttcaatggtgaccgtttcccggattatattcgtggaggaaacatacagctaacagct
cctgtaggaaaggtttcagatgaaataattaatattggagataatttcagtcattctaaa
acaagttctgagggaccaaattttggcggaagttacagtcacggagcaccttcaaactct
ttgagtgttaccgttgcaaaagcggatgtgaaagagaaatcctctgaaggaactgcttca
aaagaagccgaaaaaggaggaaacagcatttcggtaagtgcttcacaggggaaaggtgaa
gaccgttctgcaatgatacacagcgatattaacggtgacggacttccggataaaatctct
gaaaacggtgatgtttatttaaatacgggttatggttttttacctgctgaaaaatggaat
tttaatacgctgaataaaggaaattcaatcgactggagtgccggattaggatttagtatt
aagcaaggttctatttctggcggagcaaattatgccagatcacaatcggatagcgatgaa
tcttttatggatattaacggtgacggacttggcgataaaattcgatatgttggcaatacc
atgctagtttcattaaacttaggaaatgcttttgatgcgccggttgtatatccgagattt
ccagaaatgagtcaaaataaaggggtgagttacggaataaatgccaatgtttctattgat
ataattgcttggttattgcgtattacgccaacaattggaggaagtaaaggttggagtaca
aatcgttctgaaggaacttttacggatatcgatggtgatggaaacctggattatattgtt
tctaaagatgatggacatctgacagcacagctttctaacatcaaaagaaccaataaacta
aaaagcgttaaaaatggtgcaggaaacagctatgtggtagattacgaactgactaaacca
agctacgaaaatccatcagcaaaatgggttttacagtcggtagatgtttttgacggacat
accggagatggtattgatcattcgatagcaaaattcagatacgaagacggctttcaggat
cgtcgtgaaagagatttttacggattcggaaaagtgattcaggaacagattgatgttgcg
gataattctgtttttatgacgacagttcaggaattttacaatcaggattattttagaaaa
agtcttttaagacacagttatactttagacaaaaatggcaaaatgcgtcaggagtctgaa
aacgaatacagttttgttgatgtggcaactcaggcgagcgttccggtttcagaattaaat
ttaccttcctgtgatgctaaaagaattttcataggattaattcatgccaatcaaaaagta
tacgaaggaggaagtgagtatttagaaaccaatactttcaatacttatgatgccaacgga
aatattattcagtacgaagatttaggaaatggttctgcagatgataaagtaacggcaaaa
attagctattacgaaagtactacaccatattacggtggaatcccaaaacaactggaagta
tttacaacagaaggattaaagcgaaaaagagctacaacaatcaatactacaacggcagaa
gtaacacaaattaaaaattacgctgctgcagataaaattgcgattacggatattgaatat
gatacttacggaaacctgcaaaaaattacaggaccatcaaatcataaggcacagcgtatg
acattggaatatgtatttgatactgagaatcatcaatacatgaccgaaatcaaagatgca
tttggttaccagaataaaatggagtatgattaccgttttggaattccgttaaaaacaact
gatcgtaatgaccaaagcacgatttacacattagatggaaaaggtcgtatagcaactatt
aaagcaccttatgaaattgcttcgggtaaaccatacacgattgcgtatgaatattttccg
gaagccaaagtaccttacgctaaaaccaaaaattacgatccagagtttgacaaggatatt
gaaacctatacctataccgatggtttaggaagagctttgcaggttaaaaaaacagccagt
ttgtttactcaggcaggcagtgccgatcaggaagctcttatcatttcaggaaaaacaatt
tatgatggattgggaagagcaacaacaagctactacccaactacgacaacaacaatagat
aataatttcagtacagcagtatcaaacgtaacaccgactaaaacagagtacgatgaggta
agccgtgcagtaaaagtaacgttgccagacggaagtaccaattcgacagtttttgcaata
gaaagttatgatggagttcctgttttaagaacaactcaaaccgatgctttaaacaaaaca
actgggacttttaccgatgctacaggacaaaatttagccagtatgcagaacgatttgatc
acaaagtttgaaaccaatgcgctgggcgaaatgatcaaagtaaccgatgcgatggatcat
attacccaaagcagttacgactggttaggaagacgtgttgagtttacgcatccagatgca
ggaacaacaaaaatggaatacgatttggcaggtaacctgacgactcgtatcacacaggat
attaaaaatacagttcctaatggtggtgctatacaatatgtatacaattacaaccgtttg
gaaagcataaaataccctaaaaatccgcagaacaatgtacagtacaattacggaaaagca
gatggaaccccatctcgccgtggcagattatggtttgtacaggatgccagtggtggacag
gagtttttctatggaaaattaggcgagatcgaaaaagaaattagaacacttcgtattacg
ccaaccgatatacaaacctatatctcgcaatacgaatatgatacttggaaccgtatccaa
aaaatgacgtatcctgatggcgaagtggtcgagtatacctataaccgcgccggaaatttg
caaagtatgcagggtaaaaaagaaagccatacctatgattacatcaaacaattaagttat
gatgaatttgaacagcgcaaatatttaaaatacggaaacgacaccgaaaccaattatact
tacgatcctgttatgcgcagactacagcagttacaggtaaaaagcggcacaagacaagtc
atgaataatgcctacggttatgatttggtcggaaatgtattgagtataaaaaataccgcg
cctgtagtaaataatacattaggaggaacttctgctcacgaataccaatacgatgatttt
taccgattaaagtctgcaaaagcagtttatcaaggagagtttaccaaggcgagttatgag
ctgaatatgagctataacaaaatgcataatattaccaaaaaagatttaattcataccgta
aacaatgagcagaaaggttatgtgttagattacaattacgataacgaactgcatcctaac
gcgccgaataaaattgccgagacaggaaaagcagaaccaagacaatacgtttacgacgga
aacggaaacccaacaagttacaccgaagaaaaaagcttcagaaaaatgacatgggatgaa
gataatcgtttaatgggaatcaatgataatggaagaattcatcaatatacttatgatgca
ggaggagaaagagtaataaaaagctcaggagattctcagaatgtagccataaacggcgaa
actgcagcaacgattgtgcatactgatgattacacgggttatgtttctccgtattttgtg
attagtaaaggaaagtttaccaaacattattttgaaggtgcaggacgaattgtaagtaaa
ttgggcaatggagcatttgcacaacctttgaaaataacagcaggaggtgtcaattacggc
aaactaacggcagaacagcaaaaagcattagacacttatgtaaaaagcttaggattaccg
ccaggcccgccaacacaacaaggaatttatgcaaccccagaatttacgggtgatccgtac
cctagcgaagtcataaaaccggtagaagaaaaccaggaacctcccgaaggatggccaaga
aacccaattttcaatgctccgggtgatgtgccaggacctccagtacagtttggacctcct
gtagaacctacaacagtaaaaggcggagaaggttttaccggaacaggaatgccggaaaat
gatattttttattttcatccggatcatttgggaagtacttcgtatattacaaccaaaaac
ggaagcataagccagcatgtggagtatattgcttttggagagattttatttgaggagcat
tcatctagtttttcttcaccttatttgtttaatgggaaggagttggatagggaaacgaat
ttgagttattatagtgcgaggtattatgatgctaagactagtttgtggttaagtgttgat
ccaaaaatggaaaaatatccagatattggttcatatgtttttgtagccaataaccctctc
aatgctgttgatccaaatggggaagatatcgtcttttttaacaatcaagggactgagatt
caccgtataaaaaatgataaagtatttgaaacatatgtttcaaatccaaaaggtataatt
tatccaggaacatctccatttggaacttttgttcaggtaccaatgcctaagacaatacag
tcatatacagatggaaacggaaacactaaaaatacgacaggttctaaatatcagaaattt
gattatatgattgcagccctaacttatatttttaatcaaaacaaagaaaaagacatagtg
cctacaacaggagggaaaatgttgtcagatgcatcaactaaagtacctgacctagaccca
acaattgttaaggctataattatggaagagactgtaatgggaagtggtaaaagcagagga
agcaatgatcctacccaagacattatgcagtcaaatgtttattatagttcaacgagtaat
gattggaattctgataaaaagcaatttggattaacaaaaggagggggggcaacaccttcc
caaagtattaaggcaggtattggtattttgtttcaaaaaggtttaagagatcctagtaac
aagggttatactcaaacaaaagaatggtttggtggtgaaaattgggaaaatgctattcga
gactataatggctcaaaaagaaaagaggattatagggacgatgtattaaaaatgattaat
gaggcgcaatag
DBGET
integrated database retrieval system