Flavobacterium collinsii: TRV642_1230
Help
Entry
TRV642_1230 CDS
T08703
Symbol
btuB
Name
(GenBank) Vitamin B12 transporter BtuB
Organism
fcs
Flavobacterium collinsii
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CarbopepD_reg_2
TonB_dep_Rec
CarboxypepD_reg
Plug
EMC7_beta-sandw
SdrD_B
SpaA
PEGA
CooC_C
Big_1
fn3_3
Ribosomal_L21p
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAI2766234
UniProt:
A0A9W4TE08
LinkDB
All DBs
Position
TRV642:1294788..1297427
Genome browser
AA seq
879 aa
AA seq
DB search
MKQQHSYLGILFLILCLISVPNHLFAQNKNTVSGKVLDESGQTIPGANVSLKGTDKNTIT
DENGRFVFSNVPAGDYTIVATNIGYKTFGKQITVKEGESLEVNLLLEGESQSLKEVVVTG
SSSPRSKLESSVAITTMGAKAIEDRAPASTAALLQTIPGFVVEASGGEIGNNLFARGIPS
AGAYEYVQIQEDGLPVFEDGALQFANADTFYRLDETVSKMEAVRGGSASIFANNAPGGII
NFISKTGQNDFQGRAKFSTSDYGMFRTDLNLSGALIQDKLFFNIGGFYRADNGVRNTGFT
ANKGGQIKGNITYKFDDNDYLRINFKHLDDRNTFYLPIPLKSNNGKIEGIPGFNPNYGTL
TSVNFSRLNVPQYGGGTFSADLEDGSHPIINSIGAEFKKKISEKVTFKNAFKQTSINLNY
NAIFPNGGPWTQSAYASGVQNTTASNLTYSYVDNGATLDPNALIMRADLWHIEKKMSNFA
NNFSFAFDLDPVKLTAGYYYSNWKSNQYWNWNSYLVGVSDNPRLLNVKDNTTGVNHTWNG
VERITWLERDAQTKGLLNDVYADAEIKATDNLTFNAGLRYNKDKYSGYRDNARFFAENLG
ILDNNTADDKVTTVKGNPYTYWRYDVSEWSYTAAGNYKFNDNIASYVRYSHGFRSPIEES
FYDNAADLSKLENTEVNQFELGYKYSNSFFNVNANLFHMGLKNVAFTDILSDGSSENKFA
DVNNIGLEVETNARYEMVKLNFTFTVQKPEYDNFTGTNADGSTFNFNGNTARRIPKFFCN
LRPEVDITKDFTAYVQFSYYDKKFTNQDNKQVLPAYKEVGAGLNYTYHNLRFAVDASNLF
NEIGLTEGDPRQTTSAASDVFMARPILGRAFRFSVAINF
NT seq
2640 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaacagcaacattcttatttaggcatattatttttgatattgtgcttaatctctgtt
ccaaaccatctgtttgctcagaataaaaataccgtttcgggaaaggtactcgatgagagt
ggccaaaccattccgggagccaatgtttcgcttaaaggaacagataaaaatactattact
gacgaaaacggaaggttcgtattctcgaatgttcccgcgggagattataccattgtggcg
actaatattggctataaaacctttggaaaacaaattacagtaaaagaaggagaatcttta
gaggtaaatttgcttctcgaaggagaatcccaaagtctgaaagaagttgtagtaacagga
tcttcaagtccgaggtctaaattagaatccagtgtggccattaccacaatgggggctaag
gccatcgaagacagagcgcctgcaagtacagcagctttattgcagacgattcccggattt
gtggtagaagcctcgggaggagaaattgggaataatctttttgcaagaggaatcccgtct
gcaggagcgtatgagtatgtacagattcaggaagacggattacctgtttttgaagatggt
gcactgcaatttgcaaatgctgatactttttacagattagacgaaacagtaagcaaaatg
gaggcggttcgtgggggctcggcatccatttttgccaataatgctccgggtggaatcatc
aatttcatttctaagacaggtcagaatgactttcagggaagggctaaattctcgacttca
gattacggaatgttccgaacagatctgaacttatcaggtgctttaatccaggacaaattg
ttctttaatattggaggtttttacagagccgataatggcgtaagaaataccggttttact
gctaataagggtggacagataaaaggaaacattacgtataagtttgatgacaacgattat
ttaagaattaactttaaacatcttgatgacagaaataccttctacctgccaattccgtta
aaaagtaataatggaaaaatcgaaggaattccgggctttaatcctaattatggaacactg
acttcagtaaatttcagtcgtttaaatgtgcctcaatacggtggcggaacttttagtgcc
gatttagaagacggttctcatccgataatcaactcgattggtgctgaatttaaaaagaaa
atatcggagaaagtgacttttaaaaatgcattcaaacaaacgagtatcaatttgaattac
aatgctatttttccaaatggaggtccgtggacacaaagcgcttatgcaagcggtgttcag
aatacaacggccagtaatcttacctattcttatgtagataacggcgcaacacttgatcca
aatgctttaatcatgagagcagatctttggcatatcgagaaaaagatgagcaattttgcc
aataacttctcttttgcatttgatttagatccggtaaaactaacagcagggtactattat
tcgaactggaaatcgaatcaatattggaactggaactcgtatttagtgggtgtttcagat
aatccaagattgttaaatgtaaaagacaatacaaccggagtaaatcatacctggaacggg
gtggaaagaattacatggttggaaagggatgcgcaaaccaaagggcttttgaatgatgtt
tatgccgatgccgaaatcaaagcaacagacaatctgacttttaatgccggtttacgatac
aacaaagacaaatattccggttacagagacaatgctcgtttttttgcagagaatttaggg
attttagataacaatacggccgatgataaggtaacaacggttaaaggaaatccttatacg
tactggagatatgatgtgagcgaatggtcgtataccgctgccggaaactacaaattcaat
gacaatatagcttcatatgtacgttacagtcatggtttcagatcgcctatcgaagagtct
ttttatgataatgcggccgatttgagcaaactggaaaataccgaggtgaatcagtttgag
ttggggtataaatattctaattctttctttaatgtgaatgccaatttgtttcacatgggc
ttaaaaaatgttgcctttacagatattttatcggatggatcttctgaaaataaattcgcc
gatgtaaataatattggtcttgaagtagaaacgaatgcgagatatgaaatggtaaaactg
aactttacgtttaccgttcaaaaaccggaatacgataattttacaggtacaaatgcagac
ggatctacatttaattttaacggaaatacggcacgaagaatccctaaatttttctgtaat
ttaagaccggaagtagacattacaaaagattttaccgcttatgttcagttttcgtactac
gataaaaagttcacgaatcaagacaacaaacaagttttaccagcgtataaagaagtggga
gcaggtttaaattatacctatcataatcttcgttttgcagttgatgcttcgaatttgttc
aatgaaattggtttaactgaaggtgatccaagacaaacaacatcagccgcaagcgatgta
tttatggcaagacctattttaggacgtgcttttagattttcggttgcgattaatttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
