Flavobacterium collinsii: TRV642_4084
Help
Entry
TRV642_4084 CDS
T08703
Name
(GenBank) protein of unknown function
KO
K11009
murine toxin
Organism
fcs
Flavobacterium collinsii
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
fcs00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02042 Bacterial toxins [BR:
fcs02042
]
TRV642_4084
Bacterial toxins [BR:
fcs02042
]
Not specified
Ymt
TRV642_4084
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Kelch_KLHDC2_KLHL20_DRC7
Kelch_6
Kelch_1
Kelch_2
NANM
Beta-prop_ATRN-LZTR1
Kelch_4
Kelch_5
Kelch_3
PLDc_2
PLDc
DUF1668
Beta-prop_KIB1-4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAI2768791
UniProt:
A0A9W4TJL3
LinkDB
All DBs
Position
TRV642:complement(4670104..4672917)
Genome browser
AA seq
937 aa
AA seq
DB search
MSQLYTPVIKQHLAAPVLPQPRYCGAGAIVDNYVYYVGGGTRGPREQTPNFFRLKLNDQF
TPSSDKWEVLADLPIPRVSVGSAVVGKKIYVFGGMYGKGTFSDDVHCYDTITNTWNVISS
MPTLRVDPACVAVGDFIYVIGGNSYLPAGSRSLTQGVGAGPIATCEVLNTLDNTWSVIPQ
MPQAKGEHACVAWENKLYAVGGSGASFVFDIATANWSTVPSPPLFEGSYETCTTAAISME
GWIYIFGACQTWGAYDNQCHLFDTTTNQWTILNGGNLNYAQALEGIACTVKDELGIVYLM
GGNTRMVNNEPTSGTEYFVVQLKPEKTFIDTVQAGVKNYFNHLSESVYIRMLDTPHVWGM
SFGKEIMSQAIIRQAEFERAIVEIVQKTKYRCDISSLNSPDPDWVRAIMGAIDTCLTARM
GRTQPVQFRFLFGITPTGILGDPANYVDFKAALIRLCRVRSSSWEVMPEIWMGKFSRLAD
GILSAIQLQVFGTAVIGSEDTKMTWNHSKIISMDGTEALVGGHNLNMDLFKSYPPVHDVS
IVVHGEAAYGAQLFLNQMWVCGTDLLAKESLRIDNLTWVNRNSDSNMPGDPLVQADVLAY
IKEKQSALITMHRSGVQTGTDPVYPSGEQPIASGIRDQDLQTLTDLQLEVFQERIVYNTY
AGFAEYKEATRMLTLGKYWNGPDQTTDFKKGSEIMKETLIKAAKNTIRMSQMDIVSAWKK
NWSDHKVCQWVLEALLANPNLEVQIVVSPLDAGAGAEGDQYSFGSGASRTFDLLKYYMTH
DVNTDAPLDDSNGARANALKRLHVAPLYYTDKVPADKTIEGDTYKWPDLSQDGYTATLKQ
PPLSQKPPEHGVIGSAALSVINASGYIYSKVPSAPGNHAKIMIVDDQVYVVGSDNLYPGY
LSEVDYIVEGVDAVNELITSYWNPLWQYSGPHSISGL
NT seq
2814 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctcaactgtacacacctgtaattaagcaacatcttgcggcccccgtacttccacaa
cctcgctactgtggcgcaggggcaatagtggataactatgtttactatgttggaggaggg
acaagggggccaagagagcagacacctaatttttttcgattaaaattaaatgatcaattt
accccatcttctgataaatgggaagtattggcagatttaccaataccgagagtatctgta
gggagtgcagttgttggaaaaaaaatatacgtttttggtgggatgtatggaaaggggact
ttttctgatgatgtacactgttatgacaccataacaaatacatggaatgtgattagttca
atgcctacactgagagtcgatcctgcttgtgttgctgtgggagattttatatacgttatt
ggcggcaacagttatcttccggcaggcagtaggagtcttacgcagggtgtgggggccggt
cctatcgcaacttgtgaagtattaaatactttagacaatacatggtccgttattcctcag
atgcctcaggcaaagggagaacatgcttgcgtagcttgggagaataagttgtatgcagta
ggaggctccggagcaagttttgtttttgatattgcaacagcaaactggagcactgttcca
agtcctccgctttttgaaggtagttatgagacatgcacaactgccgcaataagtatggaa
ggatggatatatatatttggtgcttgtcaaacatggggtgcatatgataatcaatgtcat
ctttttgatacaacaacaaaccaatggacgatattaaatggagggaatttgaattatgca
caggctcttgaaggtattgcttgtaccgtaaaggacgaactgggtattgtttatttaatg
ggaggaaatacgcggatggtaaataatgaaccaacaagtggtactgaatattttgttgta
caactcaaaccggagaaaacatttattgatacggttcaggctggtgttaaaaattacttt
aatcatcttagtgaaagtgtttacattagaatgttagatacaccacatgtttggggaatg
tcttttggtaaagaaattatgtcgcaagcaataattcgtcaggccgaatttgaaagggct
attgtggaaattgtgcaaaaaacaaaataccgttgtgatatatcatccctaaatagtcct
gatccggattgggtaagggctataatgggggctattgatacttgtttaacagctcgaatg
gggcgtactcagccggttcaatttagatttttgtttggtataacacccacaggtatttta
ggagacccggcaaattatgttgattttaaggcagctctcattcgtttatgcagagttcga
tcaagttcatgggaggttatgcctgagatatggatgggtaagttttctcgcctggctgac
ggaatattatctgctattcaattacaagttttcggaactgcggtcattggatctgaggat
actaaaatgacctggaaccatagtaaaataataagtatggatggaactgaggcattagta
ggcggccataatttaaacatggatttatttaaaagctatcctcctgttcatgatgtgtct
atagtagtacatggtgaagctgcatatggggcacagctttttttaaaccagatgtgggta
tgcggtactgatttgttagcaaaagagtcattgcgaattgataatctgacctgggttaat
cgcaacagcgacagtaatatgcctggtgatccgttggtacaggctgatgttcttgcttat
ataaaagaaaagcaatctgcacttataacgatgcatcggtcaggtgtacaaacaggaaca
gatcctgtttatccaagtggagaacagccaattgcgtcaggtattcgggaccaagattta
caaacgcttacagatttacaattagaagtgtttcaggaacgtattgtgtataacacttat
gctggttttgcagaatataaagaagctactcgtatgctgacattaggtaaatattggaac
ggacctgaccagactacagactttaaaaaaggctcggaaataatgaaagaaactcttatt
aaagcggctaaaaatacgattcgtatgtcacaaatggatattgtaagtgcatggaaaaaa
aattggtcagatcataaggtttgtcagtgggttttggaagcgttacttgcaaatcccaat
ttagaagttcagatagtagtatcgccattagatgcaggtgccggagctgaaggagatcag
tattcatttgggtcaggtgcctcaagaacatttgatttattaaagtattatatgacacac
gatgtaaatactgatgcaccactagatgatagtaatggcgcaagagcaaatgctttaaaa
aggttacatgttgccccgttatattatacggataaagtgcccgcggataaaacaattgaa
ggagatacatacaagtggccagatcttagtcaggacggatataccgctacattaaaacag
ccaccactttctcaaaaaccaccagaacatggtgtgattggtagtgccgctttatcggtt
ataaatgcgagtggctatatttattctaaggtcccgtctgctccgggaaatcatgctaaa
atcatgatcgtagacgatcaggtatatgttgttggatcagataatctttatcccggttat
ctttctgaagttgattatattgtggaaggggtcgatgcggtaaatgaattgattacttcg
tactggaatccgttatggcaatattcaggtcctcatagtatatcaggactctaa
DBGET
integrated database retrieval system
