Fundicoccus culcitae: NRE15_13315
Help
Entry
NRE15_13315 CDS
T09401
Name
(GenBank) MATE family efflux transporter
KO
K26937
MATE family, multidrug efflux pump
Organism
fct
Fundicoccus culcitae
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
fct00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
fct02000
]
NRE15_13315
Transporters [BR:
fct02000
]
Solute carrier family (SLC)
SLC47: Multidrug and Toxin Extrusion (MATE) family
NRE15_13315
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MatE
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UUX33845
LinkDB
All DBs
Position
complement(2943424..2944770)
Genome browser
AA seq
448 aa
AA seq
DB search
MDTNQSALKTILQLAIPLIISNFIVQLYLLLENMLIGWTLGVHVLAGYTAALTIYYLFSN
LAVGLILGLTIHLSNAYGARDFHRLKRSVFINYFYVVILCLSITAIGHFFLDEMLAVLNI
AAESYAYAYDFLKIMFWGYSAQTIFVLLTYMFRGLGDSRTPSLFIILVSIINITLDYLAV
AIFDMGIQGIALAFLLANLLGVILCFVAVRKKWPILYINFSHRQFRVSEFIGHLKNSIPI
AVQSIIISIGAFFVQRSLNEIGSDAVAAQGIGARIDMFCIIGLSSIGLAMATFTAQNLGA
NQYARILEGVKVATILSIAIAGIFSIIFLFSGSYLVHFVSGADLSSAVVDYGTRYFLFHV
PFYWTLSLLFIYRYTLQGLGYSLFPSLAGMAEVLMRILAATVLYQFMGFNGVILGDGLAW
SAAALVCTINFLMIKDELQNQFNVSERV
NT seq
1347 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggataccaatcaatccgcacttaaaactattttacagcttgcaattcctttaataatc
agcaatttcattgttcagctttatctattgctcgaaaacatgttaattggctggacgctt
ggagtccatgttttagcaggttatacggctgctttaaccatctattacctatttagtaat
ttagccgttggtcttattctcggtttaaccattcatctatcgaacgcttacggtgcccgg
gactttcatcgcctaaagcgcagtgttttcattaattatttttatgtcgtcattttgtgt
ctgagtattacagccattggccatttctttttagatgagatgctggccgtcttaaatatt
gcagctgaatcctatgcctatgcttacgactttttaaaaataatgttttgggggtattct
gcgcaaactatttttgtgcttctcacctatatgtttcgaggcctaggtgattcgcgaaca
ccttccttgtttattattttagtctccataataaatatcaccttagactacctggctgtt
gctatcttcgatatgggtattcaaggaattgctttagcatttttactagctaatctgctt
ggcgttatcttatgttttgtagccgtaagaaaaaaatggccgattctatatattaatttt
agccatagacagtttagagtcagtgaatttattggccatctcaaaaattccatacccatc
gcagtccaatcaatcattatttcaatcggtgctttttttgttcaacgttccttaaatgaa
attggttcagatgccgtcgccgcacaagggattggtgctcgcattgatatgttttgtatt
attggtttatcttcaattggattagccatggctacttttacagctcaaaatttaggtgca
aatcagtatgcacgcattttagagggtgttaaagtggctactattttatcaatagctata
gccggcatattttcaattatctttttgttcagtggttcttatctcgttcattttgtctct
ggggcagatttatcctcagccgttgttgattatgggacaaggtattttttgtttcatgtt
cccttttattggaccttaagtttattatttatttatcgttatactttacaaggtttagga
tacagcctgtttccttcacttgccggcatggcagaagtccttatgcgaatactggctgcg
acggttttatatcaatttatgggatttaatggtgtcattttaggtgatggcctagcttgg
tcggctgccgcattggtctgtaccattaattttcttatgattaaagatgaactccaaaat
caatttaacgtgtcagaaagagtttaa
DBGET
integrated database retrieval system
