Flagellimonas cixiensis: ABT310_13085
Help
Entry
ABT310_13085 CDS
T11190
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor domain-containing protein
Organism
fcx Flagellimonas cixiensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
OMP_b-brl_3
TonB_dep_Rec_b-barrel
CarbopepD_reg_2
Plug
CarboxypepD_reg
CILP
SpaA
DUF4634
OMP_b-brl
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XHB44352
LinkDB
All DBs
Position
complement(2954626..2957118)
Genome browser
AA seq
830 aa
AA seq
DB search
MHRIIIPLLVLTACIFQGQAQQRQKPITISGKVLDSDSGQPLEYATFVLQKADDPSSVTG
GITDLEGNFEIETAPGTYNISVEFISYKTYNLKGKTLNQDTNLGSISLSPDVAQLAEVEV
VGEKTTVEVRLDKKIYNVGKDITTSGGNVSDALGNIPSVSVDVEGAISLRGNDNVRILIN
GKPSALAGFGSTDALQQLPADAIERVEVITSPSARYDAEGTAGILNIVLKKEKTLGINGS
INLTGGVPFNARATTNFNIRTDKFNIFNTLGYYHRESPGGGYNDNTYLSEQSQFDRILED
RDISRNDDGFNINIGMEYFLTEKSSVTGSFFYRWSDENDLTENDNQRFANGAIDSRTFRT
EDQQENDNSRQISFNYTNNIDDNGQKLTADFQYSFDNEDRLTGIREDQIIPSDSLIALEN
IYEKQTQDDILAQIDYVLPMGDAQFEAGYRGTFEKEVNDYQLDTLDQGTGNFMTNDELTN
IFTYHENVNALYTQYGNKYGKISVLLGLRLENTELRGEVDATIDSQALQDLVGEDVDLNF
DKNYLGLFPTVNFVYEISETQNISLGYNRRINRPRGWFINPFPSRSSRTNVFQGNPDLDP
AFANAFDLGYMKRWKKLTFTSSVYYQRETQSFEFITENTGKFTSDGIQIIRRVPINLSTN
ERVGAEAGVIYSPFKWWRLNGSFNFFTFSSDGEFNGVDYGTTNSSYFARLSSKFTLPGKL
ELQANSFYMGPRQNAQTESDPMFSLNLAVSKDLFKDKATLSLNVSDLFNSRKRRSFTQTP
TFTSDSEFQWRQRQVNLSFIYRFNQPKERQRGGRPQNGGGDDEGEGQYQG
NT seq
2493 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcacaggataattattcctttgttggttttgaccgcatgtatttttcagggtcaggcg
caacaaagacaaaaacccatcacaatttctgggaaagtattggattcagattccggacaa
cccctggaatacgccacatttgtactgcaaaaggccgatgaccctagtagtgttactgga
ggaattaccgatttggaaggtaactttgaaattgagactgctcctggcacctacaacatc
agtgtagaatttatttcgtacaaaacatataacttaaaaggtaaaacccttaaccaagac
accaatttaggttccatttctttgtctccagatgttgcccaactcgcagaagtagaagtt
gttggtgaaaaaacgaccgtagaggttcgtttagacaaaaaaatatataatgttggaaag
gatattaccacaagtggtggtaacgtaagtgatgcactagggaatataccttctgtttcg
gttgatgtagaaggagccattagtttaagagggaacgacaacgttcgcatccttattaat
ggaaaaccatcggccttggccggttttggttctaccgatgcattgcaacaacttcctgcc
gatgctatagaaagagttgaggttattactagtccttctgcccgatatgatgctgaaggt
accgcaggtatacttaatattgttcttaagaaagaaaaaaccttgggaatcaacggttcc
attaaccttacaggaggtgttccgttcaatgctagagctactacaaacttcaatatcaga
acagataagttcaatatttttaacaccttggggtattatcacagagagtctccgggtgga
ggttataacgacaacacttatttgtccgaacagagtcaatttgatagaattttggaggat
agggacatcagcagaaatgatgatggtttcaatattaatattggaatggagtatttcctt
accgaaaaatcttcagttaccggtagttttttctatagatggtcggatgagaacgatttg
accgaaaacgacaaccaacgttttgccaatggcgctatagacagtagaacttttagaact
gaggatcagcaagaaaacgacaatagccgtcaaatctctttcaactataccaataacatt
gatgataatggtcagaaattgacagcagattttcaatactcttttgataatgaggatagg
ctaaccggaattcgtgaagaccaaattattcctagcgacagtttaattgccttggaaaac
atctatgaaaaacaaacccaagatgatattttggcccaaatcgactatgtattgcctatg
ggcgatgcccagttcgaggcaggttaccgcggtacctttgaaaaagaagtgaacgattac
caattggataccttggaccaaggaactggcaatttcatgaccaacgatgaacttacgaac
atatttacgtaccatgaaaatgtaaatgcgctttacacccagtacggcaacaaatacggt
aaaatatcggtgctacttgggctgcgtttggaaaataccgagttacgaggtgaagtggat
gcaaccatagatagtcaagccctacaggatttagtgggagaagatgttgaccttaatttt
gacaagaactatttaggtcttttcccaacggtaaactttgtgtacgaaatatcggaaact
caaaatatttcattggggtataacagaaggatcaacagaccaagaggatggtttataaat
ccttttccatctagatcaagtagaaccaacgtttttcaagggaatccagatttggaccct
gcatttgccaatgcatttgaccttgggtacatgaaaagatggaaaaagttgacattcaca
tcttctgtttattatcaacgtgaaacacaatcttttgaatttattaccgaaaacactggg
aaattcacctcagatggtatccagattattagaagggttcctatcaacctctctaccaat
gagcgtgtcggtgcagaagctggtgttatttacagtcctttcaaatggtggagattgaac
ggtagtttcaacttctttaccttctcctcggatggagagttcaatggagttgattatgga
accactaattcgagctattttgcccgattgagttctaagttcacattgccagggaaattg
gaattacaagccaattccttctacatgggcccaagacagaatgctcaaacagaatctgac
cctatgttttcgttaaacttggcagtgagcaaggatttgtttaaagacaaggctacactt
tcgttaaatgtaagcgacttgttcaattccagaaagcgtagatcatttacccaaactcca
acatttacttccgatagtgaattccaatggagacaacgtcaggtaaacctatcattcatc
tatagattcaatcagcctaaagaacgtcagcgtggtggaagaccacaaaatggcggaggt
gatgacgaaggcgaagggcagtatcaaggctaa
DBGET
integrated database retrieval system
