Fragilariopsis cylindrus: FRACYDRAFT_192091
Help
Entry
FRACYDRAFT_192091 CDS
T04784
Name
(GenBank) eukaryotic release factor 1
KO
K03265
peptide chain release factor subunit 1
Organism
fcy
Fragilariopsis cylindrus
Pathway
fcy03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
fcy00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
FRACYDRAFT_192091
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
fcy03019
]
FRACYDRAFT_192091
03012 Translation factors [BR:
fcy03012
]
FRACYDRAFT_192091
Messenger RNA biogenesis [BR:
fcy03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Surveillance factors
Surveillance complex
FRACYDRAFT_192091
Translation factors [BR:
fcy03012
]
Eukaryotic type
Release factors
FRACYDRAFT_192091
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
eRF1_2
eRF1_3
eRF1_1
baeRF_family10
acVLRF1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
OEU11625
JGI:
192091
UniProt:
A0A1E7F0N8
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
470 aa
AA seq
DB search
MGGPTETSQEEMDKQIEMFKVKKLIKNLEAARGNGTSMISLIIPPGDQISRVNKMLSDEY
GTASNIKSRVNRLSVLSAITSTQQRLKLYNKCPPNGLVLYCGTVITEDGKERKVNIDFEP
FRSINTSLYLCDNKFHTQDLNELLMDDEAFGFIIMDGNGCLYGTVQGSSREILHKFSVDL
PKKHGRGGQSALRFARLRLEKRHNYVRKVAEMATQLFVTDGCKPNVQGIVLAGSADFKTE
LMRSDLFDPRLQKIVIKMVDVSYGGENGFNQAFELSADSLANVKLMKEKKLLQKYFDQIA
QDTGCYCFMVEDTLKGLEMGAVEDLIIWDNLTIERLVIRNSKTQEESVLHLTKEQAEDDK
YFRDEKGNELEIIDKMPLVEWFAENYKNYGCNLEFITDRSAEGTQFVKGFGGIGGILRWK
VDLAELNGYEEAATLDAGARSGGKDADGDSDDDDSDGSEEYGFEDGDFGF
NT seq
1413 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggtggtccaacagaaacaagtcaagaagaaatggataaacaaattgaaatgtttaaa
gtcaaaaaattaattaaaaatttagaagccgcacgtgggaatggtacgtcgatgatctcc
ttaattattccaccgggagatcagatctcacgtgtgaataaaatgttaagtgacgagtac
ggcacagcgtcgaatattaaaagtcgtgtcaatcgactgtcggtcttaagtgccattacg
tcgacacaacaacgtttgaagttgtataataaatgtccacccaatggactggtgttgtat
tgtggtacggtcattactgaagatggtaaagaacggaaagtcaatattgattttgaaccc
ttccgctctattaatacgtccttatacttatgtgataataaatttcatacacaagattta
aatgaattactgatggacgatgaagcgtttggatttattattatggatggtaatggatgt
ttgtatgggaccgtccaagggtccagtcgtgaaatattacataaatttagtgtcgatttg
ccgaagaaacatggtcgaggtggtcaatccgccttacgatttgcacgattgcgattagaa
aaacgacataattatgtccggaaggtcgctgaaatggccacacaattatttgtcaccgat
ggttgcaagcccaatgtccaaggaattgtgttggcaggatccgcagattttaaaacagaa
ttaatgcgttcggatttattcgatccccgattacaaaaaattgttattaagatggtcgat
gtaagttatggtggtgaaaatggtttcaatcaagcttttgaattatcggcagattcatta
gcgaatgtcaaattaatgaaagaaaaaaaattattacaaaaatactttgatcagatcgca
caagatactggatgttattgttttatggtcgaagatacactgaaaggattagaaatgggt
gccgtggaagatttaattatttgggacaacttaaccattgaacgtctcgtaatacgtaat
agtaaaacacaagaagaatcggtgttgcatcttactaaagaacaagcggaagatgataaa
tattttcgggatgaaaagggtaatgaattagaaattattgataaaatgcctttagtcgaa
tggtttgcagaaaattataaaaattatggttgtaatttagaattcattacggaccgctct
gcggaagggacacaatttgtcaaaggatttggtggtattggtggtattttacgatggaag
gtcgatttagcagaattgaatgggtatgaggaagcggcgacgttagatgctggtgcacgt
agtggtggtaaggatgcagatggtgattccgacgatgacgattcggatggttcggaagaa
tatggttttgaagatggtgattttggattttaa
DBGET
integrated database retrieval system