Fragilariopsis cylindrus: FRACYDRAFT_205630
Help
Entry
FRACYDRAFT_205630 CDS
T04784
Name
(GenBank) ABC_tran-domain-containing protein
KO
K06158
ATP-binding cassette, subfamily F, member 3
Organism
fcy
Fragilariopsis cylindrus
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
fcy00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03012 Translation factors [BR:
fcy03012
]
FRACYDRAFT_205630
Translation factors [BR:
fcy03012
]
Eukaryotic type
Initiation factors
Initiation associated factors
FRACYDRAFT_205630
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_tran
ABC_tran_Xtn
SMC_N
AAA_22
AAA_21
RsgA_GTPase
NACHT
NB-ARC
AAA_29
AAA_30
AAA_19
FeoB_N
AAA_14
nSTAND3
NTPase_1
SRP54
AAA_16
AAA_24
AAA_23
MMR_HSR1
DLIC
ATP-synt_ab
ATPase_2
NdhM
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
OEU23415
JGI:
205630
UniProt:
A0A1E7FZ50
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
572 aa
AA seq
DB search
MDVNLQNISVNLDNGTCLMEKGDLKFTYQRRYAVVGENGVGKTTLLNNIANWEELEGFPK
HLRVLHVKQELNTENEETTVINAVLDADIERTQLIQREKQLTLKLEQNDNGEKEFTKDMK
ELKDVYDRLQLLGADTAQQRASAILTGLQFTDDMQNASIKSLSGGWRMRVALGAALLIEP
DILMLDEPTNHLDLEAVVWLEAYLQQYPHTIILVSHDRGFLNEVCTDTIEFKDKKLTYYK
GNYDTFVKLKTEQTKNAIREYDAYKSKRDHMMEFITKFRSNAKRATMVQSRVKTVEKMDV
DAPIKVEKEKFWRFTIPSSEPLGRPIIAINDVTFDYSYHVKDENGIDTTIKKPSAEYLLQ
KVNFGVDNSSKIALLGANGQGKTTLLNLIMGHIRPIGGSVTVNSGLRIGHFTQHHSERFD
LNLSAIENMLNLFNDKTQDDQIIRSFLGKFQIQGVDALKPMRLLSGGQKSRVSFAVLAYQ
KPHLLIIDEGSNHLSMDAVDALIQAIQQFKGGLLVVSHDQYFVNKLCNELWVIEDGKATR
FDGTFDEYKSQSAKRTKKRVEDSVKKLGNMNN
NT seq
1719 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatgtcaatttacaaaatatctctgtgaatttagataatggtacctgtttaatggaa
aaaggagatttaaaatttacctatcaaaggcgatatgctgtagttggtgaaaatggtgtt
ggtaaaacaacattattaaataatatagcaaattgggaagaattagaagggtttccgaaa
catctgagagtattacatgtcaaacaagaattaaatacagaaaatgaagaaacaaccgtg
attaatgctgtattagatgcggatatagaacgaacacaattaatacaacgtgaaaaacaa
ttaactctaaaattagaacaaaatgataatggtgaaaaagaatttacaaaagatatgaaa
gaattaaaggatgtatatgatcgattacaattattaggtgcagatactgcacaacaacgt
gcatcagctatattaactggattacaatttacagatgatatgcaaaatgcatccataaaa
agtttatcaggtggatggagaatgcgtgtcgcattaggtgcagcattactaatagaacct
gatatattaatgttagatgaacctaccaatcatttagatttagaagctgtcgtttggctc
gaagcatatttacaacaatatccacatactattatattagttagtcatgatcgtggtttt
ttaaatgaggtatgtactgataccatcgaatttaaagataaaaagttgacctattataaa
gggaattatgatacgtttgtaaaattaaaaacagaacaaactaagaatgcaataagagaa
tatgatgcctataaaagtaaacgtgatcatatgatggaatttattactaaatttagaagt
aatgccaaacgtgcaactatggtccaaagtcgtgtaaagacagttgaaaaaatggatgtt
gatgcaccaataaaagtcgaaaaagaaaaattttggagatttactataccatcgtcagaa
ccattaggacgaccaatcattgctataaatgatgtaacatttgattatagttatcatgtc
aaagatgagaatgggattgatacaacaataaagaaaccttctgcagaatacttactacaa
aaagttaattttggtgtagataattcatccaaaattgcattattgggtgcaaatggacaa
ggtaaaacaacattattaaatttaattatgggtcatatccgtccaattggtggtagtgtt
acagtgaatagtggattacgaattggacactttacacaacatcattccgaacgatttgat
ttaaatttatctgctatagaaaatatgttaaatctatttaatgataagacacaagatgat
caaattataagaagttttttaggtaaatttcaaatccagggtgtggatgcattgaagcca
atgcgtttattaagtggtggacaaaagagtcgagttagctttgctgttttagcctatcaa
aaaccacatttattaattattgatgaaggttcaaatcatttatcaatggatgcagtggat
gcattaatccaagcaatacaacaatttaaaggtggattgttagttgttagtcatgatcaa
tattttgtcaataaattatgtaatgaattatgggtgattgaggatggtaaagcaacacga
tttgatggtacatttgatgaatataaatcacaatcagcaaagagaactaaaaaacgtgtt
gaagatagtgttaagaaattaggtaatatgaataattaa
DBGET
integrated database retrieval system