Fragilariopsis cylindrus: FRACYDRAFT_238563
Help
Entry
FRACYDRAFT_238563 CDS
T04784
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
fcy
Fragilariopsis cylindrus
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
zf-C2H2
New_glue
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
OEU18129
JGI:
238563
UniProt:
A0A1E7FIW9
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
749 aa
AA seq
DB search
MSDSSIRSSSRRRRQIMPKLKTPSFSSEDDDEEDNDDNTNKNEFVCNDCGSEFGTQVGLS
VHQSRWCKGSKAKEEEEEEEDENEEEEEEEEEGDDVADDGKTTISDDDDVGDEAYDDDVV
VNGNNKKVVVTTSTQDEDQDSQDLQDSQDDDDSLFDNEAAFELHYYVFNLLYMIGFMLHC
RKYIDYNIVITMIHILFFISTSSSTSSMSSMSTSSSSNSTTSSSSSSSTLIFLNKIKIVF
HELTFTSFLGFVIYTTYDTSPFNANHHNVMGILSMLLLPQQLKRFLVVVTVQLPPALLFL
QKKSSSGDSHNKNTKKSSDTTSTSTTSARIARIASQVTTKDGLNSARIAIIIMYFMAGFH
KINTDFLFNPKVSCAYDMMWKYLPLINIDDLEDLEPYITATSWGVMKYLPFMALFVELVP
PILLAIPSSKIQKLGIGMLLLLHLLLLPTGFVDFGSIAQSFLWLFISPTTIFGTTTDSSA
SNTTFQNFMNDIALCLCFLEFCAVVCTWQFDYTDPPFIEEEFGMVLMSFFIMWSYIIRRI
ILVLNNTTGNTTTGTGGTEVELEAELEAEADADLVRIYIPKSIITKCSIFLFLFYTMNPY
LGLRTTGCVNMFSNLRTEGLIGNHLLLGSNRIKFWSYQEDIITILDWDDRAAFYLSTEHV
HLDSNYYKDEYDLYDKPVNVYMKYLYQGVIYETIDLYYCTTFYKQFIVDMENYGDLQLIS
PWYIYKYFDFRDIQPDYNDTENSAQECVW
NT seq
2250 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagcgatagtagcatcagaagtagtagtagacgtcgtcgtcagattatgccaaagtta
aaaactccgtctttttcttcggaagatgatgatgaagaagacaatgatgacaataccaat
aagaatgagttcgtatgtaatgattgtggtagtgaatttggtacacaggttggtcttagt
gtgcatcaatcacgatggtgcaaaggtagtaaagcaaaagaagaggaagaagaagaagaa
gacgaaaatgaggaggaggaggaggaagaggaagaaggcgacgacgtcgctgacgatggc
aaaaccactatctccgacgacgacgacgttggtgacgaagcttatgatgatgatgtcgtt
gtgaatggaaacaacaagaaggtcgtcgtcactactagtactcaagatgaagaccaagac
tctcaagatctccaagattcacaagatgatgatgattcattatttgataatgaagcagca
tttgaattacattattatgtatttaatttactatatatgattggttttatgttacattgt
cgtaaatatattgattataatattgttatcactatgatacatattctattctttatttct
acgtcgagttcaacgagttcaatgagttcaatgagtaccagttccagctcaaactcaacg
acttcaagctcaagctcaagctcaactttaatttttttaaacaagataaagatcgtattc
catgaactaacatttacatcatttcttggatttgtcatatatacaacctatgatacatca
ccatttaatgcgaatcatcataatgtgatgggtatactttcgatgttattattaccacaa
caattaaaacgttttttggtggtagttacagtacaactaccaccggcgttgttgttcttg
cagaagaaatcatcatctggtgatagtcacaacaagaacacgaagaaatcatcagatact
acgtctacatccacaacaagtgcaaggattgcaaggattgcaagtcaggtaaccaccaag
gatggattgaattctgcacggattgcaattataatcatgtattttatggctggatttcat
aaaatcaatacagattttttatttaatcccaaagttagttgtgcttatgatatgatgtgg
aagtacttaccacttataaatatagacgatttggaggacttggaaccatatattaccgca
acgtcgtggggagtcatgaaatatttaccattcatggcattgtttgtggaattagtacca
ccaattctactagcaataccatcctcgaaaatacaaaaattaggtattggtatgttacta
ttattacatttactactactaccaactggatttgtggattttggttcgattgcacaatcc
tttttatggttatttatatcaccaacaactatatttggtactactactgatagtagtgct
agtaatacgacctttcaaaatttcatgaatgatatagcattatgtttatgttttttagaa
ttttgtgctgtagtatgtacatggcaatttgattatactgatccaccatttattgaagaa
gaattcggtatggtattaatgtcattctttattatgtggtcctatataattagacgtatc
atactcgtattgaataatactactggtaatactactactggtactggtggtacagaagta
gaattagaagcagaattagaagcagaagcagacgcagatttagtacgtatatatatacca
aaatcaattattaccaaatgtagtatcttcttatttttattttataccatgaatccctat
cttggtttaagaactaccggatgtgtgaatatgtttagtaatttacgtaccgaaggttta
attgggaatcatttattattaggatccaatcggattaaattttggtcttatcaagaagat
attatcacaatattagattgggatgatcgtgccgcattttatctaagtactgaacatgtc
catttagattcgaattattataaagacgaatatgatctatatgataaacccgtgaatgtc
tatatgaaatatttatatcaaggtgtcatctatgaaactattgatctatattattgtacc
acattctataaacaatttattgtcgatatggaaaattatggcgacttacaattaatatca
ccatggtatatctataaatattttgattttcgtgatatacaaccggattataatgatact
gaaaactcagcccaagaatgtgtatggtaa
DBGET
integrated database retrieval system
