Flavobacterium dauae: NU10_00705
Help
Entry
NU10_00705 CDS
T09251
Name
(GenBank) SNF2-related protein
Organism
fda
Flavobacterium dauae
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
SNF2-rel_dom
Helicase_C
ResIII
DEAD
SWIM
Consortin_N
PRORP
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WLD23943
LinkDB
All DBs
Position
142111..145779
Genome browser
AA seq
1222 aa
AA seq
DB search
MYKKNFAKYIRAHSTPFSINNAFYVYPRFMEQRGTLFIYEYLGGSKRPYVIEIKLDEKND
IHQTACSCPYDYKGICKHIVASVEDLADRLDKGSLATQTVFFDVAKQVKKLETSDVKLID
GEFDLENLRKRIQKKSITYGYVNYIDLNFAHIKSKIAAWNTNQYQQEIVLVKDQNKLETY
CNCSNELPFCEHRLFVFKDLADKFGKDFFKEGFLNQKIEKKLALYGLTPNDDYQEFFNVK
LSPKGILLEPKPFVKIDTYTNVFVNYAKETETSARLNLPVKKLQEEPVGLGLCVDFTSHY
SKKSFLNFYGIKGKLNKEETDFSAKIKRMFPEDLNQIIDEFSSADDFQFAMNAIRIERLL
GERSIRSRQQAIQIFDTFFTDDKDPLFFLHNSKDSYARKNLTRLEICTDPVKLHFQAADA
HKKYRVKVKVELSGTKYKIDSTKLIVTPLFIVLDTKVYFIKTPKLSFDLMHFVERPEMYF
YKKNAEYFYNEIILPLSKDYEVEFSEFKKSKIKIDENTLEKHLYISDLNEGYVVFKPFVK
YNEELIPLYSNEAITVTTGDKLKTISRNEAFEDNFLEELRKLHPDFQQQDAIFYLQPEQL
LENYWLMTAVEKMKNADIKVFRANDLKSFKFNVNKPTISVRVASDIDWFDVHIDVKFGDQ
TVNLKELQKSFIKQSNYVLLADGTTGILPKDWMQKFAVYFQSGEVKKNSIQLSNYQFGIL
DELYNELHEKPAFFEELYQKKQRLLNLKAIPNVQVPKEINATLRHYQQEGLNWLAFLDEN
KLGGCLADDMGLGKTLQTITFLQYLKNKNPETAPTLIIAPTSLIFNWQAEIEKFCPSLKA
LAFVGIDRKEHQKHFEKYDIILSTYGSLLNDITFLKDYTFNYIILDESQAIKNPTSKRYK
TVRLLNAKNRLVLTGTPIENNTFDLYAQLNFTNPGLLGTMTHFRKNFSDYIDKQNDVEVS
KTLGRIINPFVLRRTKEQVATELPEKIESVVYCEMDTSQRKVYDAFKNRFREYILNQIEE
NGVANSQMYILEGLTKLRQICNSTALINEEESYGNYSVKLDTLTETIKEKTGNHKILVFS
QFVGMLQLIKTRLESEQIVYEYLDGSTRNRQEKVDNFQNNADVRVFLISLKAGGTGLNLT
EADYVFIVDPWWNPAVENQAIDRSYRIGQHKTVMAYRMICKDTIEEKIVALQSKKKLVAN
TIISIDEQQKSFDVADIKRLFS
NT seq
3669 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtacaagaaaaattttgcaaaatatattagagcccacagtaccccattttctataaac
aatgctttttatgtgtatcctcgttttatggaacaacgagggacactttttatttatgaa
tatttaggaggttccaaacgcccctacgttatagaaattaaactggatgaaaaaaacgat
attcaccaaacagcctgctcttgcccttatgattacaaaggtatttgtaaacacattgta
gcaagtgttgaagatctggccgaccgtttagataaggggtcgttagccacacaaaccgtc
ttttttgatgttgcgaaacaggttaaaaaacttgaaaccagcgatgttaaacttatagat
ggcgaatttgatttggaaaatcttagaaaaagaattcaaaaaaaatctattacctacggc
tatgttaattatattgatttaaattttgctcacataaaaagtaaaattgcagcctggaat
accaatcaatatcagcaagaaatagtacttgttaaagaccaaaataaattagaaacgtat
tgtaactgttctaacgaattaccattttgcgaacatcgattgtttgtttttaaagatctt
gccgataaatttgggaaagatttctttaaagaaggatttttgaatcaaaaaattgaaaaa
aaactcgccttgtacggattgacaccgaatgatgattatcaagaattttttaatgtaaaa
ctttctcctaaaggtattctactggaacctaaaccatttgttaaaattgatacatacact
aatgtgtttgttaattatgctaaggaaacagaaacatcggcacggttaaatttaccggta
aaaaagcttcaggaagagcccgttggtttaggcttgtgcgttgattttacttcgcattat
tcaaaaaaaagctttttaaatttttatggtattaaaggaaagttaaataaagaagaaacc
gattttagcgccaaaattaaaagaatgtttccagaagatttaaatcaaatcattgatgaa
ttttcaagtgccgacgattttcagtttgctatgaacgctataagaattgaaagattgttg
ggcgaacgcagcattagatcaaggcagcaagccatacaaatttttgatacgttttttacc
gatgacaaagatcctttgtttttcttgcacaactcaaaagactcgtatgctcgaaaaaat
ctaacccggttagaaatttgtaccgatcccgttaaactgcactttcaggcagctgatgca
cacaaaaaatacagggtaaaagttaaagtagaactttcgggaacaaaatataaaatagac
agtaccaaactcattgtaacacctttgtttattgttttagataccaaagtttattttata
aaaacacctaaactttcttttgatttaatgcactttgtagaacgcccggagatgtatttc
tacaaaaaaaatgccgaatatttttacaacgaaattattttgcctttaagcaaagattat
gaggtagaatttagtgaatttaaaaaatcgaaaataaaaattgatgaaaataccttagaa
aaacatctgtatattagcgatttaaacgaagggtatgtggtgtttaaaccttttgtaaag
tataacgaagagctgatacctttatattctaacgaagctattactgtaacgaccggcgat
aaactaaaaaccattagccgcaacgaggcgtttgaagataattttttagaagaacttaga
aaattacaccccgattttcaacaacaagatgccattttttacctgcaacctgagcagttg
ttagaaaattactggctgatgacggcagttgaaaagatgaaaaacgccgatataaaagtg
tttagagccaacgatttaaaatcgtttaaatttaacgtaaacaaacctactatttctgtt
cgtgtagcatcggatatcgattggtttgatgtacacatcgacgtgaaatttggcgatcaa
actgtaaatttaaaagagttgcagaaatcgtttataaaacaaagtaattatgtgttgtta
gccgatggaaccacaggaattcttcctaaagattggatgcagaaatttgcggtttacttt
caatcgggcgaagtaaagaaaaacagtattcagttgtctaattatcagtttggtattctt
gacgaattgtacaacgaattacacgaaaaaccagcattttttgaagaactttaccaaaaa
aagcaacgtcttttaaatctaaaagctattccaaatgttcaggttccaaaagaaatcaac
gctacgttacgccattaccaacaagaaggcttaaattggttggcgtttttagatgaaaat
aaactgggaggttgccttgccgacgatatgggattgggaaaaacattgcaaacaattact
tttttacagtatctaaaaaacaaaaatccagaaacagccccaacgttgattatagcccca
acatcacttatttttaactggcaggccgaaattgaaaagttttgtccgtcattgaaagcc
ttagcttttgtgggcattgatagaaaagaacaccaaaaacattttgagaagtacgacatt
attttatctacctacggatctttgttaaacgatataacgtttttaaaagattacacgttt
aattacattattttagatgaaagccaggcaattaaaaaccctacatctaaacgctataaa
acggttcggttgctaaatgccaaaaaccggttggttcttacaggaacacctattgaaaac
aacacgtttgatttatatgcacaactaaattttacaaatccgggtctgttgggcacaatg
acacattttcgcaaaaatttctcggattatatcgataaacaaaatgatgtggaagtgtct
aaaacacttggcagaatcatcaatccatttgtgttaagacgaacaaaagaacaggtagcc
acagagttgccagaaaaaatagaaagtgttgtgtattgcgaaatggacacctcgcaacgc
aaagtgtatgatgcttttaaaaaccgattcagagaatatatcttaaaccagatcgaagaa
aacggcgtggcaaattcgcaaatgtatattttagaaggcctaactaaactccgtcaaata
tgcaattcaactgccttaatcaatgaggaagaaagttacggaaactattcggttaaatta
gatacgcttaccgaaaccattaaagaaaaaacaggtaatcacaaaattttagtgttttca
cagtttgtggggatgcttcaattgataaaaactcgattagaatcggaacaaattgtttat
gaatatttagatggaagtacccgaaatcgacaagaaaaagtggataattttcaaaataat
gccgatgtacgcgtgtttcttatcagcttaaaagccggtggtactgggttgaatcttaca
gaagccgattacgtttttattgtagatccgtggtggaatcctgccgtagaaaatcaagca
atagacagaagctatcgcattgggcaacataaaacagtaatggcttaccgaatgatttgc
aaagacaccatcgaagaaaaaattgttgcgttacaaagcaaaaagaaattggtagcaaat
acgattatttcaatagatgaacagcaaaaatcatttgatgttgccgatattaaacgcttg
ttttcataa
DBGET
integrated database retrieval system