Flavobacterium dauae: NU10_12480
Help
Entry
NU10_12480 CDS
T09251
Name
(GenBank) T9SS type A sorting domain-containing protein
Organism
fda
Flavobacterium dauae
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
SprB
NIDO_rel
Por_Secre_tail
Ig_7
fn3
MAM
DUF8694
FIDD
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WLD23512
LinkDB
All DBs
Position
2573332..2578416
Genome browser
AA seq
1694 aa
AA seq
DB search
MMKITQICVLIFLFCLGYGSKAQVASYAFTHQIGIFTPNSTSATNVAAVEADSGISAALP
IGFNFVYGTSAYTQFFMSSNGFISLGSTGNSLTTNNLSTANAPNRPIIAPLWDDLDGNAT
VNSNNVSKASYELTGTAPNRVLTVEWLNWEWRYNSDDPVISFQVKLYETTNVIDFVYRQE
SGSIATGSASIGINDATGNGNGSFLNLDTDLSIPTVTSTSSVTDIDEKPANNQVFTFTPP
VCLYKGAVTVTNVNIPTATLNLSIPAPVSMDFYITNGAIPTTSTTPTGTIAVGSTSLPLT
GLSASAIYTVYVKYACAALGAEWYNTLQFNTPCGVVSNLFEGFENTEIGSSTDNTYPYCW
SYIDTVTSSGYGYVSTSAEHNGNNGFYTYRSSTTSANYNGDVLLISPETNNLGNGTKQIR
FWAKVSSSSYINNHVFEVYSINGTTATATKTLLQGNIPLTDSWQEFIIPLPVTTDDYFAF
SFDRNGGAAYVYLDDIYYEDLETCFHPVNVTFTNITQSGADISWTASPQSTGGTGYEYEV
RSSGAPGSGATGLEVTGTTTSTNTTITGLDPNTEYNVYIRGLCGTATSRWNFNPVTFKTL
CAASSGFYENFDTTTVGSTSNESLPDCWSFIDDVVSSGYLYTYDASGGPQSGANYIRMYR
TNSSSNSSQELVLISPVTDNLGNGGKQIRFSVRSYSTTTYVNKLEILSMPTNTSTTGATV
IETLFPDQKTYQEYIVTLPASTDDYFGFRLAYNGVTTASAVAIDDIYYEDTPPPTLSTTQ
VDVLCNGASTGSATVTVTGGGLPLTYAWSPSGGTSDTATGLTAGTYTITVTDPVNRTATA
TVTITEPTAVVSNFIATNISCNGANDGSITIAPTGGVAPYTYLWNTNDTGTALTNLSPGT
YSVTITDANGCTLVEDITITEPDVLDATGTQTDVSTYLGSDGEVVLTVTGGTTPYTYAWS
PSGGTGDTASNLTAGTYTVLVTDANGCTTTEVFTITQPIPLMFQSVSKTNVKCNGGSDGT
ATVSVIGGNAPYTYLWTPTGGTNETATGLSAGTYTVEITDATPVTITHTFTITEPGVIVP
TISNKKDVLCNGAKNGSATVTVTGGIAPFTYIWSNGTTTTNATVNNLDVGTYTVMITDAN
GCSSVTPATVTITQPAAIVINSANTTNVSCYGQNDGSVTVSVSGGVGPYTYIWSNGQSGT
TISNLTKGNYTVTVTDVNNCSKTQSFTITEPPFVNTPVANNPNFCTGQNAKLSDIVISGS
NIKWYDAATGGNILPATTALVNGTTYYATQTVGTCESARTPIKVNISQTTPLTTTQLSVC
SNTRIQNMTIDGFNYTQLKWYSSATSTTPLASSQLLATQTYYISSVTGTCESSRQAIQVT
VAATVPAPTASAQTVCSNTTLNDLVVTKDPNATLNWYSSTQSMIPLANTTVVASGTYYVQ
QVIGNCESPRVAVAVQVNNVTTPTIASITICEGITIADFNLIGSTNYIWYTDNSTTTALP
DTYVITSGTYYIANELAGCISARKNVAVNVSTRPVSPTGQATQTFGPTKTVSDIKMDQPN
VSWFASYDDAVKQINEIAKTTQLQDQTTYYGILTNANGCGSMPTAVLIKIDLGVQELDLA
QLSYYPNPADSELNISYIEDINNVEIFTITGQKVLSKEFKSREVKVDLSGLSAGTYMVRI
QTEKASQFIKIIKK
NT seq
5085 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatgaaaattacgcagatttgcgtattaatatttctattttgtttggggtatggtagt
aaagcacaagtagcttcatacgcctttacacatcaaataggaatatttacgcctaattca
acaagtgcaactaacgtagctgccgttgaggcagattcaggcattagtgcggccttaccc
ataggctttaattttgtatatggcacaagtgcatatactcaattttttatgagtagtaat
gggtttatttcattaggttcaacaggaaattctcttactacgaataatttatctacagcg
aatgcaccaaacagacccattatagctcctctatgggatgatttggatggaaatgcaact
gtaaattcaaataatgtatcaaaagcatcttatgaacttacaggtactgctcctaatcgt
gttttaactgtagaatggctaaattgggaatggagatataatagtgatgaccctgttatc
tcgtttcaagtaaagttatatgaaacaacgaatgttatagattttgtttatcgtcaagaa
tcgggtagtatagcaacgggtagtgcttctataggaataaatgatgctacaggtaatggg
aatggttcattcttaaatttggatactgatttgtcaataccaacagtaacgagcacttct
tctgtaactgacattgatgaaaaaccagcaaacaatcaggtgtttacatttactcctcca
gtatgtttatataaaggtgcagtaactgtaacaaatgttaatatccctacagctacatta
aatctatctattcctgctccggtatctatggatttttatattacaaatggagcaattcct
acaacaagtactacacctacaggaaccattgcagtaggatcgacatctttaccgcttaca
ggactttcagcaagtgctatttacacggtctatgttaagtatgcgtgtgcagctttagga
gcagaatggtataacacacttcaatttaatactccttgtggagttgttagcaatctcttt
gaaggttttgagaatacagaaataggatcaagtacagataatacatatccttattgttgg
tcgtatatagatacagtaacgtcttcgggctacggttacgtaagtaccagtgcagaacat
aatggaaataacggattttatacataccgctcatctactacttcggctaattataacgga
gatgtattattaatatcacctgaaacaaacaatttaggaaacggaacaaaacaaattcgc
ttttgggcaaaagtgtcttcaagttcttatattaataaccatgtgtttgaagtgtactcc
ataaacggcactacagccacagctaccaaaacactattgcaaggaaatatcccgttgaca
gattcttggcaagagtttatcattccgttgccggttactaccgatgattactttgctttt
tcgtttgatcgcaacgggggggctgcttacgtatatttagatgatatttactacgaagat
ttagaaacgtgttttcaccctgtaaatgtaacatttactaatattacacaatctggagca
gatatttcatggaccgcttcaccacaatcaacaggtggtacaggttatgagtatgaagta
agaagttcaggagcaccgggttcaggagcaactggtttagaagtaacaggtacaaccact
tcaacaaacacaactatcacaggcttagatcctaatacggaatataatgtttatattcga
ggattatgtggaacagctactagtagatggaattttaatccagtaacatttaaaacctta
tgtgctgcttcaagtggtttttatgaaaattttgacactaccaccgttggtagtacttcg
aacgaatcattacctgattgttggagttttattgatgatgttgtttcttcagggtatcta
tatacttatgatgcctctggaggtcctcaatcaggcgcaaattacatcagaatgtataga
acaaattcctcttctaatagtagtcaagaattagttttaatttctcctgtaacagataat
ttaggtaatggaggtaaacaaattcgtttttctgtacgctcatatagcacaactacatat
gtaaataaattggaaatacttagtatgccaacaaatacgtcaactactggtgcaaccgta
atagaaactttatttccagatcaaaaaacgtatcaagaatacattgtaacgttacctgct
tcaacagatgattattttggttttagattagcttataatggagtaactactgcttcggca
gtagctatagacgacatatattacgaagatacgccaccaccaacattaagtaccacacaa
gttgatgtattgtgtaacggtgcgagtacaggtagtgctactgttaccgtaacaggtggt
ggattgcctttaacatatgcttggtctccatccggagggactagtgatacagcaactgga
ttaacagccgggacttataccattacagtaacagatcctgttaatcgaacagcaacggca
acggttacaattactgaacctacagcagtagtatctaacttcattgcaacaaatattagt
tgtaatggagcaaacgatggtagtatcactattgcaccaaccggaggtgtggcaccttat
acttatttgtggaacaccaatgatacaggtacggctcttacaaatttatcaccgggcacc
tattcggttaccattacagatgcaaatggttgtacattagtagaagatataacaatcaca
gaaccagatgttttagatgcaacaggtacacaaactgatgtaagcacttatttaggtagt
gatggtgaggttgttctaacagttaccggaggtacaactccttatacatacgcttggtca
ccatctggcggaactggtgatacagcatcaaacttaactgccggtacctacacagtattg
gtaacagatgcaaatggttgtacaacaacagaagttttcacaatcacgcagcctattccg
ttaatgttccaatccgtatcaaaaacaaatgtgaaatgtaacggaggaagtgatggaaca
gcaaccgtttcggttataggtggaaatgccccatatacctatttatggacaccaaccggc
ggaacaaatgaaacagctacaggcttatcagcaggaacttatactgttgaaataacagat
gccactccggttacaatcacacacacttttactattacagagcctggagtaattgttcca
acaatatctaataaaaaagatgtgctgtgtaatggagctaaaaacggaagtgccacagta
actgttacaggaggaatagcaccatttacctacatatggtctaatggaacaacaactaca
aatgctaccgttaataatttagatgtgggaacttatactgtaatgataaccgatgcaaat
ggttgtagttctgttacaccggcaacagtaaccattacacaacctgcagctatcgttatc
aatagtgcaaacacaacaaacgttagttgttatggtcaaaatgatggatctgtaaccgtt
tctgtttccggaggtgttggcccttatacttacatatggtcaaacggtcaaagtggaaca
acaatcagtaacttaacaaaaggtaattataccgtaactgtgaccgatgttaataactgt
tcaaaaacacaatcgtttaccattacagaaccgccatttgttaatacaccagttgccaat
aatccaaatttctgtactggtcaaaatgcaaaactttctgatattgtaatttcaggaagc
aacattaaatggtacgatgctgctacagggggtaatatattgcctgcaacaacagccttg
gttaatggaacaacatattacgcaacacaaacggtaggtacttgtgaaagtgcaagaacg
ccaattaaggtaaatatatctcaaacaactccgctaactaccacacaattgagtgtttgc
agcaatacaagaatccaaaatatgactattgacggatttaactatacacagttaaaatgg
tatagcagtgcaacaagtactactccgttagcatcaagccaattgcttgcaacacaaaca
tactacataagctcggttacaggaacctgtgaatcatcaagacaagcaatacaggtaacc
gttgcagctacagtaccggcaccaaccgcatcagcccaaacggtatgtagcaatacaacc
ctaaacgatttagttgttacaaaagatccaaatgcaaccttgaactggtattcgtctaca
caatctatgattccattggcaaataccaccgtagtagcttctggtacgtattatgtacaa
caagttatcggtaattgcgaatcacctcgtgttgctgttgcagtacaggtaaataatgtt
accacacctacgattgcatcaattacaatatgtgaaggtattaccattgcagatttcaat
cttattggttcaaccaattatatttggtacacagataacagtacaaccacggcattacct
gatacctacgtaattacatcgggtacttattacatagcaaacgagttagcaggatgtatt
tcggcaagaaaaaatgtagcagtaaatgtttctacccgacctgtaagtccaacagggcaa
gccacacaaacgtttggaccaactaaaacggtttcagatataaaaatggatcaacctaat
gtaagttggtttgcaagttatgacgatgcggtaaaacaaatcaacgaaattgctaaaact
actcagttgcaggatcaaacgacatactatggaatcttaacaaatgctaatggttgcggc
agtatgccaacagcagttttaataaaaattgacttaggtgttcaggagttagatctggca
cagttgagctactaccctaacccggctgattctgaattgaacataagctatattgaagat
atcaataacgtagaaatctttaccattaccggtcaaaaggtattaagtaaagaatttaaa
tcgcgtgaggttaaggtggatctttctggtttaagtgcaggaacttatatggtaagaatc
caaaccgaaaaggcttcgcaattcattaaaattattaaaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
