Flavobacterium davisii: JJC05_07345
Help
Entry
JJC05_07345 CDS
T10287
Name
(GenBank) T9SS type A sorting domain-containing protein
Organism
fdv Flavobacterium davisii
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PA
Sortilin-Vps10
Por_Secre_tail
DUF3244
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QYS89953
UniProt:
A0A8G0KVU6
LinkDB
All DBs
Position
complement(1508751..1511639)
Genome browser
AA seq
962 aa
AA seq
DB search
MIRGDATGNTVVAGGVSGGLWRNNNIASSTSSWTKIDTFPEHVNVQNIAIDPNNSNVWYV
GTGESYVFGDVNGNGIWKTTDRGVTWTRVYGGGAVSSTVKNLQNLEIVAPSAAATIRTYS
TGSATWPGGAIKNVFTAPIVLMDDGVAPTDDACSATTQNYAGKIVLIRRGTCSFESKAVI
AQNAGAVGVIIMNNAAGGAVFNMSEDAAIVGTIPSIMISKEDGDLLIANLANLTGTIKPS
GPLEFSGLEVSGVQFVNDLVIKNNGGTSEIYAAMGDGQYSESRNGTLFNASNFGLYKSTN
GGSTWTKLNLPTSVAGHPTCPNDIELGADGDIWVSSTDSWTYGDGGGRVFQSTDNGNTFN
LRHTIVAEGGGKRVEIEASNTTPDKIYVLSQLKDDPNTATQVEIQLALTTNGFNTSPTIL
SLPAGNESRETTYGFTGQQAFYDMMIESDPVDDKILYVGGIDLYRTANATGPAVTWSTIS
NWTTNVHSDQHAMVFKPGNSNVALFGNDGGVYYTSNAASTTTPATARNTGFNVTQFVGVA
VMPNGITGVAGDFFVAGAQDNGSQYYSGSSTAANSTLGAAAGVNNTFRVQGGDGGKPLFD
QGSDKYYITNYVYNDSMILRNVGSTTTKTLNDSTSGAGLFYPAMTLDSTNDILYADFTLN
GTYQVRRYSNIKGNTQVSRTNLSNALLTGYATALATGKGTPTTLYIGTMNGKLLKVTGAN
GSAPVWSNISAPNFVGSVSDIEFGVNDNQIFLTMHNYGVNNIWYTSNGGTNWYQLDGNLP
DLPVKAILQNPLNTAEVMIGTDLGVWYVSNFNSAATSDQALNWKQAYNGMRNVKVTDLDL
QANSPTAPNAYKVYAATYGRGVFSGSLTAALGAKTAELLVEKINTIKVYPTVSEGNVKLT
SSNNYGKTKIEVFDITGKRILENSIIVDGNTNELDLSSLTPGNYILKMSGDHFEETEKIV
IQ
NT seq
2889 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgatccggggagatgctacaggaaatactgtcgtagcaggaggtgttagtggtggatta
tggagaaataataacattgctagttctacttcatcatggacaaaaattgatacttttcct
gaacatgtaaacgttcaaaacatagcgatagatcctaacaactccaatgtttggtatgta
ggtacaggagagtcgtatgtttttggagatgtaaatggaaatggaatttggaaaacaacg
gatagaggcgttacatggaccagagtttatggaggtggagcggtatcatcaaccgtgaag
aatttacaaaatctagaaattgttgcgccttctgctgctgctacaataagaacatattct
actggttctgctacatggccaggtggagctataaaaaatgtgtttacagcaccaatcgtt
ttaatggatgatggagtagctcctacagatgatgcgtgtagtgcaaccactcagaattac
gcaggtaaaatagttctaataagaagaggaacttgttcttttgaatcaaaggcagtaata
gctcaaaatgctggtgcagttggagttattataatgaataatgctgctggaggtgctgtt
tttaatatgtcagaagatgcagctattgtaggaacaattcctagtattatgatttctaaa
gaagatggcgatttgcttattgctaacttagcaaatttaacaggtactataaaaccttct
ggacctcttgagttttctggtttagaagtttcgggtgttcagtttgtaaatgatctagtt
atcaaaaataatggagggacttctgaaatttatgctgctatgggagacggacaatattca
gaatctcgaaatggtaccttatttaacgcatctaattttggtttatataaatctaccaat
ggaggtagtacttggactaaattaaatttacctacttcagtagcgggacatccaacatgt
cctaatgatattgaattaggggcagatggtgatatttgggtttcttctactgatagttgg
acttatggcgatggtggcggtcgagtatttcaatcaacagataatggaaatacttttaat
ttacgtcatacaattgtcgctgaaggaggaggaaagcgtgtggaaattgaagcatctaat
accactccagataaaatttatgtattatcacaattaaaagatgatcctaatacggcaaca
caagtagagatacaattggctctaacaacgaatgggtttaacacgtctcctacaattctc
tcattacctgctggaaatgaatcacgtgagactacttatggatttacaggacaacaggct
ttttatgatatgatgattgagtcagatcctgtagatgataagatcttatatgtaggcggt
atagatctttatagaacagctaatgctacgggacctgctgtaacatggagtactatttct
aattggactaccaatgttcattctgatcagcatgctatggtgtttaaacccggtaatagc
aacgtagctctttttggaaatgatggaggagtatattacacaagtaatgctgctagtacc
acaactcctgctacagctagaaatacaggttttaacgttactcaatttgtaggagtggcc
gtaatgccaaatggtattacaggtgtagctggcgatttttttgtagcaggtgctcaagat
aatggctctcaatattattcgggatcttctactgcagctaattctactttaggagctgct
gctggagttaataatacttttagagtccaaggtggtgatgggggaaaaccattatttgat
caaggatctgataaatattacattacaaactatgtatataatgatagcatgatccttaga
aatgtaggaagtactacaactaaaactttaaatgatagtacttctggtgcaggtttattt
taccctgctatgactctagattctacaaatgatattttatatgctgattttactttaaat
ggaacttatcaagtaagaagatattctaatatcaaaggaaacacacaagtatctcgaact
aatttatcaaatgctttattaacgggttatgcaaccgcattagctaccggaaaaggaaca
cctactaccttatatataggtactatgaatggtaaattactaaaagttactggagccaat
ggatctgctcctgtatggtctaacataagtgctccgaactttgttgggagtgtgtccgat
atagaatttggagttaatgataatcaaatcttcttaacaatgcacaactatggtgtaaac
aatatttggtacacgtcaaatggaggtactaattggtatcagttagatggtaatttacca
gatttacctgtaaaagctattttgcaaaatcctcttaatacagctgaagttatgattgga
actgacttaggggtttggtatgttagcaattttaatagtgcggcaactagtgatcaagca
ttaaattggaagcaagcttataacggcatgagaaatgtaaaagttacagatttagatctt
caagcaaattcaccaacagctcctaatgcttataaagtatatgctgctacttatgggaga
ggtgttttttcaggaagtttaaccgccgctttgggagcaaaaacagctgaattattagta
gaaaaaataaatacaattaaagtttatcctacggtttcagaaggaaatgtaaaattaact
tcttctaataattatggtaaaacaaaaattgaagtgtttgatattaccggtaaacgaatt
ttagaaaattcgattatagttgatggtaatacaaatgagttggatttatcaagtttaact
cccgggaattatatattaaagatgtcgggtgaccattttgaagaaaccgaaaagattgta
attcaataa
DBGET
integrated database retrieval system
