Flavobacterium enshiense: LZF87_02965
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Entry
LZF87_02965 CDS
T08644
Name
(GenBank) T9SS type B sorting domain-containing protein
Organism
feh
Flavobacterium enshiense
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PKD_5
CHU_C
fn3
Cleaved_Adhesin
Ig_7
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UOK43089
LinkDB
All DBs
Position
complement(659682..666593)
Genome browser
AA seq
2303 aa
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DB search
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DBGET
integrated database retrieval system