Flavobacterium enshiense: LZF87_11110
Help
Entry
LZF87_11110 CDS
T08644
Name
(GenBank) T9SS type A sorting domain-containing protein
Organism
feh
Flavobacterium enshiense
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_4
Por_Secre_tail
DUF11
CHU_C
DUF3124
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UOK41854
LinkDB
All DBs
Position
complement(2484006..2486693)
Genome browser
AA seq
895 aa
AA seq
DB search
MKKIYFALMALCLFPTANAQIVNFPDANFKAQLLLATPSNYIAYNLGNTPFKIDANSNGE
IEVAEAQMVSKLIVPHTNIFSLEGIRYFTNLRELNCSYTQITTLNLSGLTNLRELNCEGS
QLTSINLEGLTNLEVFSCSENQLSSLNLTGLTSLKNFVCSGNQLSSLNLAGLTNLYSLRC
ENNQLTSLNLSGLSNLDEAYCGSNQLTSLTLNGLPNLRNLNCRNNQFTSLDLSGLTDLIG
LYCGGNRLTSLNLNVLPNLVNLECDNNQFTSLNLSSLTNLAYMDCSNNQFTSLNLNGLTN
LGLLHCHHNQLTSLDFNGHPNLYYLDCSDNQITSLNLINAANLTELLCENNQLTSLDLND
LASLYNLNCSNNPLEYLFLKNNSDEYYVDYDDPANDSPIFRFNNIPNLRYICADDFQVNA
IQNKVNEYGYTNCHVNTYCSFVPGGEFYTIQGNYKFDGNNNGCDVSDSAFQNLKFRISDG
TNSGTFISDTSGNYTVAVQAGTHTITPILENPAYFNVSPSLVNVTFPTQASPFTQDFCVT
ANGVHPDLEVTFLPLRPARPGFDAKYKLVYKNKGNQTQSGSVNLTFNDDVLDLVTVNPVT
TNQTVNNLIWDFTNLKPYETREITITLNVNSPTETPAVNNGDVLNYTATITSAATDETPN
DNTFALNQKVVNSFDPNDKTCLQGAAIAPSGVGKYVHYLIRFENTGTFPAENIVVKDIID
TSKFDINSLVPMKGSHPFVTNITSGNKVEFIFENINLPFDDANNDGYLVFKIKTKPTLAV
GNTFTNKASIYFDYNFPIVTNTATTAIQALSTQDFSFATYFMLYPNPVKDVLNIETKQTI
EVSSINIYNQLGQLVLVVPNAQNVSKVDVSSMASGNYFIKINSDKGTSNTKFIKK
NT seq
2688 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagaaaatttactttgcactgatggctttgtgcctttttcctactgctaacgcacag
attgttaactttccggatgctaattttaaggcacaactattattagccactccttcaaat
tatattgcatataatctggggaatactccttttaaaattgatgcaaatagcaatggagaa
attgaagttgcagaagcacaaatggtttcaaagttgattgtgcctcatacaaatatcttt
agtttagaaggtataagatattttactaatctacgagagttaaattgttcgtatacacaa
attaccacactgaatttgagtggtcttacaaatttaagagaattgaactgtgagggtagt
caattgacatcaatcaatttagaaggtcttacaaatttagaggttttttcttgttccgaa
aatcaattatcatcgcttaatttgactggtcttacaagcttgaagaattttgtttgttct
ggcaaccaattgtcatcattaaatttggctggtcttacaaatctatattcattgcgttgt
gaaaataaccagttgacatcattaaatttaagtggtttgtcaaatttggatgaagcatat
tgtggttctaaccaattaacatcacttactttgaacggtcttccaaatttaaggaatttg
aattgtcgtaacaatcaattcacatcactggatttaagcggtcttaccgatttaataggt
ttgtattgcggaggtaaccggttaacatcactgaatttgaatgtccttccaaatttagtt
aatctggaatgtgataataaccaattcacatcactaaacctaagtagtcttacaaatttg
gcttatatggattgtagtaataatcaattcacctcattaaatctaaatggacttacaaat
ttaggacttttgcattgtcatcataatcaattaacgtcgttagatttcaatggtcatcca
aatttatattatttggattgtagtgacaatcaaatcacatcattaaatttgattaacgct
gcaaatttaactgaattgctttgtgaaaataatcagttaacgtcattggatttaaatgat
cttgccagtttatataatttgaattgtagtaataatccgttagaatacttgtttttaaaa
aataattctgatgaatattatgtggattatgatgatccagcaaatgattctcccatattt
aggtttaataatataccaaatttaagatatatctgtgcagatgattttcaagtaaatgct
attcaaaacaaagtcaacgaatatggatatacaaattgtcatgtaaacacttactgttca
ttcgttcccggaggtgaattttatactatccaaggaaattataaatttgatggtaataat
aatggttgtgatgtttcggattcagcatttcaaaacctaaagttccgcatttccgatgga
acaaatagcggaacttttatctcagatacttcaggaaattacacagtcgctgttcaggct
ggtacacatactataactccaattttagaaaatccagcatatttcaatgtctccccatca
ttggtgaatgtaacttttccaacacaagcaagcccattcacacaggatttttgtgtgaca
gccaatggtgtccatcccgatttagaagttacttttttgcctttacgtccggcaagacca
ggttttgatgcaaaatataaattggtttataagaacaaaggaaatcaaacacaatcaggt
tcggttaacttaacttttaatgatgacgttttagatttagtaacggttaatccagttacg
acaaatcaaactgttaataatcttatttgggattttaccaatttgaaaccttatgaaacc
agagaaattactataaccttaaacgtaaattccccaacagaaactccggctgtaaataac
ggagatgttttgaattatactgcaaccattacttcggcagcaacagacgaaacgccaaat
gataacacatttgcattaaatcaaaaggtagttaattctttcgatccaaatgacaaaacc
tgtctccaaggagcagcgattgcaccgagcggagtagggaagtacgtgcattaccttatc
cgttttgaaaatacaggaactttcccagctgaaaatattgtggtgaaagacattattgat
acgagcaagtttgatatcaattcgcttgttccgatgaaaggaagtcatccgtttgtaact
aatatcacttcaggtaacaaagtggaattcatttttgaaaacattaatttaccgtttgat
gatgccaataacgatggttatttggtgtttaaaatcaaaacaaaaccaaccttggctgtc
ggaaatacatttactaataaggcaagcatttattttgattacaacttcccgattgtaacc
aatactgcgaccaccgcaatccaggcattaagcactcaggattttagttttgcgacttat
tttatgttgtatccaaatccggtgaaagatgttttgaacatcgaaaccaagcaaactatc
gaagtaagttcaataaatatctacaatcaattgggacagttggtgttggtggttccaaac
gcacagaatgtttcgaaagtggatgtttccagtatggcttcggggaattatttcatcaaa
atcaattcggataaaggaacatcgaataccaagtttattaagaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
