Ferruginibacter albus: K9M53_12005
Help
Entry
K9M53_12005 CDS
T07524
Name
(GenBank) T9SS type A sorting domain-containing protein
Organism
fei
Ferruginibacter albus
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
YDG
Por_Secre_tail
F5_F8_type_C_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UAY51311
LinkDB
All DBs
Position
complement(2794135..2798343)
Genome browser
AA seq
1402 aa
AA seq
DB search
MKQLSLSRFNGVLKFLFVVITFTSVQKTYATATTLAPGDIALLGINADNPDKFSVILLKD
IGSGTVINFTDNGFTSATAGRSNENYLIYTAPSDLKAGTILSWTNGMSVSGTGWNSGAPS
NFSFNASGDQLFIFQGTADDSHWTSQSGITLLYGINYGAALITKSSDATASTTFQPSTTL
LPSTYFLNFPSSSANDLYYAAGSSSSTKVSFFGSLSGLATELTTTSKFFATNSALTLPVY
IFAVGTLTAVNTTYGTASATPTSFQVTGTGLSGSISIAASTGFEYSTTSGGTYSSTLTLS
QASGIVNTSVFVRLAATTDVGTYSGNIGLSSSGAQSFNVVPVSSTVSAKSLSITAPAIAQ
KTYDGTTTAGTVTAGTLSNLVGTQTVGVSATAAAYSSANAGTYNNVVITYTLSNGTNGGK
ASNYSLAAGSATGVIKARDLSITAPAIAQKPYDGTTTAGAVTAGTLSNLVGTQTVGVSAT
AAAYSSANAGTYNNVVITYTLSNGTNGGNASNYNLVNGTATGVIGARSLTITAKNITKNY
GDALSDGTSSTAFTSNNLVSPETIGSVTVAYGSGAAATAAPGIYNNSITVSAATGGTFTA
SNYNIAYAQGNITVSIASTQWKTSNATTDWSSAGNWTNGLPTQYMLADIPVNASPYPELT
QNTSVYNLSLGGASTLTLGANTLTVNNNITGTGTLKGSSLSGLLLANDHVNPSLNFASGA
DTLYNLTLNDNATATLGSTLNLAARTNATPAKLTVGNSAVFNTQDGLTLISNNCNTAMIA
PVLGAITGKVTVQRYLRSDENSFYATGNPTTGSAKRAWRLMTAPVQNNGSPTIYESWQEG
GLIYSDNDASTHGKGTMITGPNASNGLESGVNGSYSMKFFNAATQKLENVANTNVAISQS
ANNGSAENTGYFIFVRGDRNPQTVNNPNSGTAPVDNTTLSVKGNLQTGKQEFSIVPSADF
TSQKYTLIGNPYAAPVDLNKLTFQGYGAGNIDVYTWDPSIGQVGAYVLLENSGSGFQTNA
TTGQNNFIQSSQAFFVLGTTNQCSVIFNESSKAGAQNNNLVFRPTGAPTNPYMIARLYKV
NNDNSVSVLDYNQTYFNDAYSIDPVLGEDAPKLANINETFSVMRDSVALFSDRRPRLRNL
DTVFFKLLRTNEQKYQIRFVDSLPDVNADAYLIDKYTGDSTKVSLTDSSTIVNFTVNSDS
ASKSPTRFVLFLRPQTTTPVRFTNVNAQPVIDNAIKVQWNVEEQSGIKYYEVERSNDNKT
FTTVATIAVQTSSGALQYSWIDNAAGAGNNYYRIKTVENSGTEAYSKIAMASINALNAEI
SIYPNPVKNGLLNISLKNISAGNYTIALRNAIGQEILRTIISHDGTNQVKNLQVNKKIAK
GMYQLTVEGLKNSINTINVVVE
NT seq
4209 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaacaattatccctttcaagatttaatggagttttaaaatttttattcgttgtaata
acatttacatctgtgcaaaaaacttatgccacagctacgacacttgctccgggcgatatt
gcattgcttggaataaatgcagataaccctgataagttttctgttatcctgttaaaagat
ataggatccggtaccgttataaattttactgataatggatttacaagcgctacagcagga
cgcagtaatgagaactatttaatttatactgctccttcagatcttaaagcaggaactatt
ttatcgtggacaaacgggatgagtgtaagcggcacaggatggaattcgggtgcaccaagc
aacttttcatttaatgcaagcggagatcaattatttatctttcaaggtactgctgatgat
tctcattggacaagccaatccggaattactttattgtatggcataaattatggagcagct
ttaataacgaagagcagtgatgcaacggcatcaactacttttcaaccaagtactacttta
ttgccatcaacctattttctaaattttccttcatcttctgcaaacgatctatattatgca
gccggtagttcttcttcaacgaaggtttctttttttggttctttgtcaggcctggcaaca
gagcttactactacctcaaaatttttcgctactaattctgcactaacattgcctgtatat
atatttgctgtaggtactttaactgctgtaaatactacatatggcactgcttctgcaaca
ccaacaagtttccaggtaaccggtaccggtctttcaggtagtatttcaatagcagcttca
accgggtttgaatattcaactacttccggaggaacatattcttctacattaacgctttca
caagcatcaggaattgttaatacttctgtatttgtaagattagctgcaacaacagacgta
ggaacctattcaggtaatatcgggctttcaagttcaggcgctcaatcatttaatgtagta
cctgtttctagcactgtgtcagcaaaaagtttatccataacagcacctgctatcgcacaa
aaaacatatgatggtacaacaacagcaggaacggtaacagcaggaaccttatcaaattta
gtaggaacacaaacggtaggtgtttcagcaacagccgcggcatatagcagcgcaaatgca
ggaacatataataatgttgtgatcacttatacattatctaacggaacgaatggcggcaaa
gcatccaattatagtttagcggcgggatccgctacaggagtaattaaagccagagattta
tccataacggcacctgcgatcgcacaaaaaccatatgatggtacaacaacggcaggagca
gtaacagcaggaacgttgtcaaatttggtaggaacacaaacggtaggtgtttccgcaaca
gccgcggcatacagcagtgcgaatgcgggaacatataacaacgttgtaattacttataca
ttatctaatggaacaaatggtggtaatgcatccaattataatttagtaaatggtactgct
acaggagttattggcgcaagatcattaacgataactgcaaaaaatattactaaaaattat
ggagatgcattgtctgatggaacgagttcaacagcatttacttcaaataatttggtgagc
cctgaaacgatcgggtcagtaacagtggcttatggttcaggggcagcagcaacggctgca
ccgggcatttataacaattcaattacagtttcagcagcaacgggtggaacatttacagca
agcaattataatattgcttatgcacaaggaaatattactgtatctatagcttctacgcaa
tggaaaacaagtaatgctactacagattggtcttctgcaggcaactggacaaatggtttg
cctacccaatatatgttggctgatattcctgtgaatgcttctccatatccggaacttaca
caaaacacttctgtatataatctttctttaggaggggcttcaactttaacacttggagca
aatacgcttactgttaataataatataactggaacgggtacactaaaaggatcatcgctt
tccggtttactattggcaaacgatcatgttaatccatcattgaattttgcttccggtgct
gatacgctatataacctgacattaaacgacaatgcaacagctactttgggaagcacttta
aatcttgctgccagaacaaatgctactccagctaaattaaccgttgggaatagtgctgtt
tttaacacgcaagacggattgacattaatatctaataattgcaatactgcaatgatagcg
cctgtgcttggtgccattaccggtaaagtaacagtgcaacgatatttaagaagtgatgaa
aatagtttttatgcaacaggcaatcctaccacaggtagtgcaaaacgagcatggaggttg
atgacagcgccagtgcaaaataatgggtcacctactatatacgagtcctggcaggaaggt
ggcttaatatattctgataatgatgcttccacgcatggcaaaggaaccatgatcaccggg
cctaatgcttctaatggattagagtcgggtgttaatggtagctattcgatgaaatttttt
aatgctgctacgcagaaattagaaaatgttgctaatacaaatgtggctatttctcaatct
gcaaataatggaagcgctgaaaatacaggttatttcatattcgtacgtggagatagaaat
ccgcaaacagttaataatcctaattcaggtactgcacctgttgataatactacattaagt
gtaaaggggaatttgcaaacaggcaaacaagagttttcaattgtaccatctgccgacttt
acttctcagaaatatacactcataggcaatccgtatgcagcacctgttgatctgaataaa
cttacatttcagggttatggggcaggtaatatagatgtatacacctgggatccttctata
ggacaggtaggagcatatgtgttgttggaaaattcaggttcaggttttcaaacaaatgca
acaacaggacaaaataatttcattcagtcctcacaggcattttttgttttaggaactacc
aatcagtgttccgtaatttttaatgagagcagcaaagcaggagcgcaaaataacaatttg
gtctttcgtccgacaggagccccaacaaatccgtatatgatcgcaagattgtataaagtg
aataacgataattcagtgagtgtgctggattataatcaaacttatttcaatgatgcttat
agtatagatcctgtattgggagaagatgctcctaagctggcaaacatcaatgaaacattt
tcggtaatgcgtgatagcgtggctttattctcagacagaagaccccgcttacgcaacctg
gatacagtgttttttaagttgcttcgcacaaacgaacaaaaatatcaaatacgttttgtt
gacagtttaccggatgttaacgcagatgcttacctgatagataagtatacaggagactca
actaaagtgtctcttacagattcttctactattgtaaattttacagtgaacagtgatagc
gcttcgaaaagccctacccgcttcgtcctgttccttcgcccgcaaactacaacgccggta
cgattcactaacgttaatgcacaacctgtaattgataatgccattaaagtgcagtggaat
gttgaagagcaatcgggtatcaagtactatgaagtggaacgatcaaatgataataaaaca
tttactacagtagctacaatagctgttcaaacatcatcaggagcattgcaatacagttgg
atagataacgcggcgggagcaggcaacaattattatcgtattaaaactgttgaaaacagt
ggaacagaggcatatagtaaaatagcaatggcatctatcaatgccttgaatgcagagatc
tcaatttatcctaatcctgttaaaaacggactactaaacatatctcttaaaaatatttca
gccggtaattatacaatagctcttcgtaatgcgattggtcaggaaatcctgagaacaatt
atatcacatgacggaacaaatcaagtaaagaatttacaggtgaataaaaagattgcgaaa
ggcatgtatcaattaacggtagaagggctgaagaattctataaatactatcaatgttgta
gttgagtaa
DBGET
integrated database retrieval system