Ferruginibacter albus: K9M53_15625
Help
Entry
K9M53_15625 CDS
T07524
Name
(GenBank) helix-turn-helix domain-containing protein
Organism
fei
Ferruginibacter albus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PIF1
HTH_40
HRDC
AAA_30
AAA_19
AAA_22
UvrD_C_2
AAA_24
Pif1_2B_dom
AAA_16
Viral_helicase1
AAA_18
SH3_13
ABC_tran
TsaE
NTPase_1
NACHT
DUF6115
Sigma54_activ_2
Helicase_RecD
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UAY52009
LinkDB
All DBs
Position
3657114..3659606
Genome browser
AA seq
830 aa
AA seq
DB search
MSLSFIVEHNEVFDLAFRFVTETSENIFLTGKAGTGKTTFLKYLKDNCAKNIVVAAPTGV
AAINAGGVTLHSLFQLPFHPFLPTANNKSELLSKLRFTGQRQQLLRKMELLVIDEISMVR
ADTLDAIDTILRSVRRNHDLAFGGVQLLCIGDLFQLPPVAQQHEWMILQEYYSSPFFFDS
LAIKEQMPLLIELNKIYRQKEESFVRLLNKVRTNNMDADDFEDLHLRYNPTFTPTEEEKY
ITLTSHNKQADAINEQQLNRIIAPAKTYKADIEGDFAENNFPAEAALVLKVGAQVMFLKN
DAVQKRYFNGKIGVVKNLEDERIIVECDGFDIDVRKETWENSRYVLNREDGKLEQETLGM
FTQYPLRLAWAITIHKSQGLTFEKVMIDAGASFSSGQVYVALSRCTSLDGIVLLSKLNAA
TLFNNDNVLKAQQSLAHKGSLAERFEGARKLFTQQLMQEIFSFTNILLALNSLEYHIKEQ
HLKLSDGSIEWIGNLKQNVISDKSVGEKFILLVNELLKEEGVIEKNPLLQKRINDAANHF
IPRSTQYLSSVKNTILSTEHKETSAVINEQLQNTAITIYTSLYFLEYCKNAFSIRDFLHY
KLKFVTPKFSINSYAGAKKETVTITDTANMALYDKLRIWRDNILKETGQPIYMVANKASL
MEICQYLPLTKKELQQIGGFGRAKVEKYGDEILDTVQQYCTENNLVSLINLKEPVTKKST
KTKATTEEKIDTKTLTLNLYKQGKTISEIAKDRSFTISTIEGHLAHFIQTGEINIDNLVS
IEKQIEIKAAIEKAGSENYKALFSELKGIMSYGEIRMVAASMNISQQATS
NT seq
2493 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcactttcatttatagtagaacataacgaggtctttgacctggcgtttcgatttgtt
actgaaaccagtgaaaatatttttcttaccggtaaagccgggacaggcaaaaccactttt
ttaaaatacctgaaagataattgtgcaaagaatattgtagttgctgcgccaacaggagta
gcagcgatcaatgcaggaggggttactttgcacagcttatttcaattgccgttccaccct
tttttaccaacggctaataataaatcagaattgttgtctaagcttcgttttacagggcaa
cggcaacaattgttacgtaaaatggaactgctggtcattgatgaaataagcatggtacgt
gcagataccttagatgctattgatacaatattaagaagtgtgcgtcgtaatcatgatctt
gcttttggcggtgttcagctattgtgcattggcgacctgtttcaattgccacccgttgca
caacaacatgaatggatgattttacaagagtattattcttcccctttcttttttgatagc
ctggcgataaaagaacaaatgcctttattgattgagttaaataaaatttatcggcagaaa
gaagaatcatttgtacgactattaaataaagtacgcaccaataatatggacgcagatgat
tttgaggacctgcatctgcgctataatcccaccttcacgccaactgaagaagagaaatat
attacacttacctcacacaataagcaagcagatgccattaatgagcaacaattaaacaga
ataattgcacctgcaaaaacatataaggcagatatagaaggagattttgcagaaaataat
tttcctgcagaagcagcattagttctaaaggttggagcacaagtaatgtttttaaaaaat
gatgcggtacaaaaaagatattttaatggtaagataggcgtagtgaaaaatttagaagat
gaacgaattattgtggaatgtgatggttttgatattgatgttcgaaaggaaacatgggaa
aacagtcgttatgtattaaatagggaagatgggaaattggagcaggaaacattgggcatg
tttacacaatatcctttgcgattggcatgggctattactattcataaaagccagggatta
acttttgaaaaagtaatgatagatgcaggcgcatcattcagcagcggacaggtatatgtt
gcattaagcagatgtaccagcctggatggtattgtattgttatctaaattgaatgctgct
acgctttttaataacgacaatgttttaaaagctcagcaatcattagcacataaaggctcg
ctggcagaacgttttgaaggagcaagaaaattatttacacaacagttaatgcaagagata
ttctcttttactaatattcttcttgctttaaactcattggaatatcatataaaagaacag
catcttaagttaagtgatggaagtattgaatggataggcaaccttaagcaaaatgttatt
tccgataaatctgttggggaaaaattcattttacttgtcaatgaactattaaaagaagaa
ggagtgattgaaaaaaaccctttgttacaaaagcgtattaatgacgcagccaatcacttt
attccaagatcgactcaatatcttagctcagtaaaaaatacaattcttagtacagaacat
aaagaaacctctgctgtaattaacgagcaattacaaaatacagcaataacaatttacact
tctctttactttttagaatattgtaagaatgctttttcgatcagggattttttgcattac
aaattgaaatttgtaacgcctaagttttctattaatagttatgccggcgcaaaaaaagaa
acagtaaccattacggatacagccaacatggctttatatgataaattacggatttggaga
gataatatattaaaagaaaccggtcagccaatatacatggttgccaataaagcttcttta
atggagatatgtcaatatcttcctttaacaaaaaaagagctgcagcaaattggcggcttt
ggaagagctaaggtagaaaagtacggcgatgagatacttgatacagtgcagcaatattgc
actgaaaataatttagtatctcttatcaatttaaaagagcctgttacaaaaaagagcacg
aaaaccaaagcaacaacagaagaaaagattgatacaaaaacgcttacattaaatttatac
aagcaaggaaaaacaattagcgaaattgctaaagaccggagctttacaataagcactatt
gaagggcacttagcacactttattcaaacaggggaaattaatattgataatttagtaagc
atagaaaagcaaattgaaattaaagcagccattgaaaaagcaggttccgaaaactataaa
gccttattcagcgaactaaaaggaattatgagttatggtgagatccgtatggtagctgcc
tctatgaatataagccagcaagcaacttcttaa
DBGET
integrated database retrieval system
